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东湖杂交羊产羔性状的GWAS分析及候选基因GRID 2的验证
被引量:
1
1
作者
赵雪洋
李丹妮
+8 位作者
王钰晨
郭磊
王丽
黄杰
焦仪强
安小鹏
张希云
张磊
宋宇轩
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期4625-4635,共11页
旨在研究影响东湖杂交羊产羔性状的关键基因并挑选关键基因的变异位点进行验证,以期为东湖杂交奶绵羊多羔性状的选育提供分子标记。本研究从西北农林科技大学金昌奶绵羊试验示范基地采集身体健康无疾病的东湖杂交二代奶绵羊168只进行全...
旨在研究影响东湖杂交羊产羔性状的关键基因并挑选关键基因的变异位点进行验证,以期为东湖杂交奶绵羊多羔性状的选育提供分子标记。本研究从西北农林科技大学金昌奶绵羊试验示范基地采集身体健康无疾病的东湖杂交二代奶绵羊168只进行全基因组重测序,GEMMA和SnpEff软件进行全基因组关联分析,KOBAS 3.0数据库对注释的基因进行富集分析,LDBlockShow软件对显著性最强SNPs周边的连锁区域进行连锁不平衡分析。使用竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术对GRID 2基因进行SNP的分型检测,统计该基因两个多态位点的遗传多样性参数,并将其与产羔性状进行关联分析。结果显示,全基因组关联分析确定了6号染色上1163个达到显著性水平的SNPs位点,通过对候选位点的注释,确定与产羔性状相关的候选基因BMPR 1B、PDLIM5、PDHA2、UNC 5C、GRID2、NFKB1、TSPAN5、STPG2、PPP 3CA。同时结合已有报道和最强关联区域的注释,选择GRID 2上的两个SNPs(g.35685218A>G和g.35685499C>T)作为候选位点。通过统计学分析发现,本研究中涉及的两个位点均处于P>0.05的哈代-温伯格平衡状态,表明这两个位点均没有受到过强选择,并且这两个位点与东湖杂交羊的产羔性状有显著关联,两个位点的野生型均处于优势状态,且两个位点在胎次增加时均值也增加。综上所述,GRID 2基因2个SNPs对东湖杂交奶绵羊产羔性状有显著影响,可以作为分子标记辅助选择的候选位点。本研究为提高东湖杂交奶绵羊产羔率,促进奶绵羊的遗传育种进展提供了坚实的理论依据。
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关键词
东湖杂交奶绵羊
产羔数
全基因组关联分析
GRID
2基因
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职称材料
东弗里升与湖羊杂交后代生产性能分析
被引量:
2
2
作者
李义海
张效生
+7 位作者
李玉鹏
冯婧
姚大为
郭晓飞
张金龙
王娟
王彪
董春晓
《草食家畜》
2021年第4期8-13,共6页
本研究旨在探讨舍饲条件下东弗里升与湖羊杂交F1代及湖羊的生产性能。试验将舍饲条件相同,健康状况良好的东弗里升与湖羊进行杂交,选择东弗里升公羊与湖羊母羊杂交一代头胎产羔母羊22只为试验组(F1组);同时随机选择湖羊头胎产羔母羊22...
本研究旨在探讨舍饲条件下东弗里升与湖羊杂交F1代及湖羊的生产性能。试验将舍饲条件相同,健康状况良好的东弗里升与湖羊进行杂交,选择东弗里升公羊与湖羊母羊杂交一代头胎产羔母羊22只为试验组(F1组);同时随机选择湖羊头胎产羔母羊22只为对照组(T组);F1代母羊与湖羊公羊杂交产生F2代,随机选取38只羔羊为F2组,分别测定3组羊的生产性能。结果表明:东湖F1代的泌乳量显著高于湖羊(P<0.05);F1组乳品质与对照组相比,除乳脂率差异不显著外(P>0.05),乳脂、乳蛋白、乳糖均差异显著(P<0.05)。F1、F2以及T组出生重,两两对比,差异均为极显著(P<0.01);F1羔羊日增重极显著(P<0.01)高于湖羊与F2;F2羔羊日增重与湖羊对比,差异显著(P<0.05);F1的体尺测定结果显著优于湖羊(P<0.05)。因此,通过湖羊与东弗里升杂交,能够提高湖羊生产性能。
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关键词
东湖杂交羊
出生重
日增重
体尺
下载PDF
职称材料
东弗里升羊与湖羊杂交选育提升湖羊泌乳性能的研究
被引量:
2
3
作者
李义海
张效生
+6 位作者
张金龙
李玉鹏
冯婧
郭晓飞
王娟
王彪
董春晓
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第19期69-73,共5页
为了提高湖羊的泌乳性能,给湖羊导入东弗里升羊血统,提高湖羊的泌乳量,试验对比了东湖杂交F1代(F1组)与纯种湖羊(T组)的泌乳量、带单羔与双羔对泌乳量的影响、乳成分变化及催乳素与泌乳量的关联性。结果表明:东湖杂交F1代的第7~56天总...
为了提高湖羊的泌乳性能,给湖羊导入东弗里升羊血统,提高湖羊的泌乳量,试验对比了东湖杂交F1代(F1组)与纯种湖羊(T组)的泌乳量、带单羔与双羔对泌乳量的影响、乳成分变化及催乳素与泌乳量的关联性。结果表明:东湖杂交F1代的第7~56天总泌乳量显著高于湖羊(P<0.05);F1组带单羔母羊泌乳量比带双羔多,分别为44.67,39.48 kg,但差异不显著(P>0.05);T组带双羔的母羊泌乳量比带单羔多,分别为32.54,30.63 kg,但差异不显著(P>0.05)。催乳素含量与泌乳量呈弱相关性。两个组除乳脂肪含量差异不显著(P>0.05)外,第7~56天乳蛋白、全固形物含量均差异显著(P<0.05),乳糖含量差异极显著(P<0.01)。说明通过湖羊与东弗里升羊杂交,能够提高湖羊的泌乳量。
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关键词
东湖杂交羊
泌乳量
催乳素
单双羔泌乳量
乳成分
原文传递
题名
东湖杂交羊产羔性状的GWAS分析及候选基因GRID 2的验证
被引量:
1
1
作者
赵雪洋
李丹妮
王钰晨
郭磊
王丽
黄杰
焦仪强
安小鹏
张希云
张磊
宋宇轩
机构
西北农林科技大学动物科技学院
永昌县畜牧兽医站
甘肃元生农牧科技有限公司
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期4625-4635,共11页
基金
科技创新2030一重大项目资助(2022ZD0401403)
陕西省畜禽育种“两链”融合重点专项(2022GD-TSLD-46-0202)
陕西省重点研发项目(2023-YBNY-130)。
文摘
旨在研究影响东湖杂交羊产羔性状的关键基因并挑选关键基因的变异位点进行验证,以期为东湖杂交奶绵羊多羔性状的选育提供分子标记。本研究从西北农林科技大学金昌奶绵羊试验示范基地采集身体健康无疾病的东湖杂交二代奶绵羊168只进行全基因组重测序,GEMMA和SnpEff软件进行全基因组关联分析,KOBAS 3.0数据库对注释的基因进行富集分析,LDBlockShow软件对显著性最强SNPs周边的连锁区域进行连锁不平衡分析。使用竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术对GRID 2基因进行SNP的分型检测,统计该基因两个多态位点的遗传多样性参数,并将其与产羔性状进行关联分析。结果显示,全基因组关联分析确定了6号染色上1163个达到显著性水平的SNPs位点,通过对候选位点的注释,确定与产羔性状相关的候选基因BMPR 1B、PDLIM5、PDHA2、UNC 5C、GRID2、NFKB1、TSPAN5、STPG2、PPP 3CA。同时结合已有报道和最强关联区域的注释,选择GRID 2上的两个SNPs(g.35685218A>G和g.35685499C>T)作为候选位点。通过统计学分析发现,本研究中涉及的两个位点均处于P>0.05的哈代-温伯格平衡状态,表明这两个位点均没有受到过强选择,并且这两个位点与东湖杂交羊的产羔性状有显著关联,两个位点的野生型均处于优势状态,且两个位点在胎次增加时均值也增加。综上所述,GRID 2基因2个SNPs对东湖杂交奶绵羊产羔性状有显著影响,可以作为分子标记辅助选择的候选位点。本研究为提高东湖杂交奶绵羊产羔率,促进奶绵羊的遗传育种进展提供了坚实的理论依据。
关键词
东湖杂交奶绵羊
产羔数
全基因组关联分析
GRID
2基因
Keywords
east friesian and hu crossbred sheep
litter size
genome-wide association studies
GRID 2 gene
分类号
S826.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
东弗里升与湖羊杂交后代生产性能分析
被引量:
2
2
作者
李义海
张效生
李玉鹏
冯婧
姚大为
郭晓飞
张金龙
王娟
王彪
董春晓
机构
天津市农业科学院畜牧兽医研究所
出处
《草食家畜》
2021年第4期8-13,共6页
基金
天津市科委种业专项(l8ZXZYNCOO180)。
文摘
本研究旨在探讨舍饲条件下东弗里升与湖羊杂交F1代及湖羊的生产性能。试验将舍饲条件相同,健康状况良好的东弗里升与湖羊进行杂交,选择东弗里升公羊与湖羊母羊杂交一代头胎产羔母羊22只为试验组(F1组);同时随机选择湖羊头胎产羔母羊22只为对照组(T组);F1代母羊与湖羊公羊杂交产生F2代,随机选取38只羔羊为F2组,分别测定3组羊的生产性能。结果表明:东湖F1代的泌乳量显著高于湖羊(P<0.05);F1组乳品质与对照组相比,除乳脂率差异不显著外(P>0.05),乳脂、乳蛋白、乳糖均差异显著(P<0.05)。F1、F2以及T组出生重,两两对比,差异均为极显著(P<0.01);F1羔羊日增重极显著(P<0.01)高于湖羊与F2;F2羔羊日增重与湖羊对比,差异显著(P<0.05);F1的体尺测定结果显著优于湖羊(P<0.05)。因此,通过湖羊与东弗里升杂交,能够提高湖羊生产性能。
关键词
东湖杂交羊
出生重
日增重
体尺
Keywords
east
friesian
×
hu
crossbred
sheep
birth weight
daily gain
body size
分类号
S813.22 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
东弗里升羊与湖羊杂交选育提升湖羊泌乳性能的研究
被引量:
2
3
作者
李义海
张效生
张金龙
李玉鹏
冯婧
郭晓飞
王娟
王彪
董春晓
机构
天津市农业科学院畜牧兽医研究所
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第19期69-73,共5页
基金
天津市科委种业专项(18ZXZYNC00180)
天津市科技计划项目(18ZXBFNC00320,19ZXZYSN0030)
+2 种基金
天津市自然科学基金项目(20JCQNJC00630)
天津市农业科学院青年科研人员创新研究与实验项目(2020013)
天津市“131”创新型人才培养工程项目。
文摘
为了提高湖羊的泌乳性能,给湖羊导入东弗里升羊血统,提高湖羊的泌乳量,试验对比了东湖杂交F1代(F1组)与纯种湖羊(T组)的泌乳量、带单羔与双羔对泌乳量的影响、乳成分变化及催乳素与泌乳量的关联性。结果表明:东湖杂交F1代的第7~56天总泌乳量显著高于湖羊(P<0.05);F1组带单羔母羊泌乳量比带双羔多,分别为44.67,39.48 kg,但差异不显著(P>0.05);T组带双羔的母羊泌乳量比带单羔多,分别为32.54,30.63 kg,但差异不显著(P>0.05)。催乳素含量与泌乳量呈弱相关性。两个组除乳脂肪含量差异不显著(P>0.05)外,第7~56天乳蛋白、全固形物含量均差异显著(P<0.05),乳糖含量差异极显著(P<0.01)。说明通过湖羊与东弗里升羊杂交,能够提高湖羊的泌乳量。
关键词
东湖杂交羊
泌乳量
催乳素
单双羔泌乳量
乳成分
Keywords
east
friesian
×
hu
crossbred
sheep
lactation yield
prolactin
single-double lamb milk productio
milk composition
分类号
S826.94 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
东湖杂交羊产羔性状的GWAS分析及候选基因GRID 2的验证
赵雪洋
李丹妮
王钰晨
郭磊
王丽
黄杰
焦仪强
安小鹏
张希云
张磊
宋宇轩
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
东弗里升与湖羊杂交后代生产性能分析
李义海
张效生
李玉鹏
冯婧
姚大为
郭晓飞
张金龙
王娟
王彪
董春晓
《草食家畜》
2021
2
下载PDF
职称材料
3
东弗里升羊与湖羊杂交选育提升湖羊泌乳性能的研究
李义海
张效生
张金龙
李玉鹏
冯婧
郭晓飞
王娟
王彪
董春晓
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021
2
原文传递
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