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福建省2011年病毒性脑炎暴发病原Echo30分子流行病学分析 被引量:22
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作者 杨秀惠 严延生 +6 位作者 翁育伟 何爱华 张红榕 陈炜 许江阳 林其财 周勇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期265-269,共5页
目的了解福建省2011年病毒性脑炎暴发的病原特点及福建省近10年Echo30分子流行病学特征。方法应用细胞培养法获得病毒株,微量血清中和试验或RT-PCR序列分析鉴定Echo30血清型,提取病毒RNA核酸,逆转录为cD-NA,分段扩增VP1基因序列全长,测... 目的了解福建省2011年病毒性脑炎暴发的病原特点及福建省近10年Echo30分子流行病学特征。方法应用细胞培养法获得病毒株,微量血清中和试验或RT-PCR序列分析鉴定Echo30血清型,提取病毒RNA核酸,逆转录为cD-NA,分段扩增VP1基因序列全长,测定并分析扩增产物的序列。结果 2011年4月1日-6月2日,从福建省4个县(市)区病毒性脑炎病例标本中分离的病毒经鉴定均为Echo30;VP1基因序列分析显示,泉州市安溪和德化两地流行株高度同源(核苷酸与氨基酸序列同源性分别为99.0%和99.6%),同福安和厦门流行株(核苷酸与氨基酸序列同源性分别为98.5%和100%)核苷酸差异约9%,3个位点氨基酸出现了变异。近10年福建省Echo30分子流行病学分析显示,2011年泉州流行株并非由2005年当地流行株进化而来,而与2008年河南省分离株(HQ625646-Henan/04/2008)同源性最高;近10年福建省Echo30存在多基因型、多谱系的同时传播,并在2006年发现了两株第III新基因型病毒。结论造成2011年福建省病毒性脑炎暴发的病原为Echo30,且至少存在两条不同传播链病毒同时流行。Echo30福建株呈多基因型、多谱系分布流行特点。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 echo30 VP1基因 分子流行病学
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一起传染病暴发中肠道病毒血清型鉴定和ECHO30基因特征分析 被引量:30
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作者 王海岩 许文波 +6 位作者 徐爱强 朱贞 杨会利 李岩 纪峰 崔爱利 张勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期106-112,共7页
2003年5~9月,山东省泰安市发生了由肠道病毒(Enterovirus,EV)感染所致的传染病暴发,临床症状以手足口病(HFMD)为主,同时有心肌炎和无菌性脑膜炎等中枢神经系统症状患者也占较大比例。131份病人(粪便、咽拭子、脑脊液)标本中共分离到EV6... 2003年5~9月,山东省泰安市发生了由肠道病毒(Enterovirus,EV)感染所致的传染病暴发,临床症状以手足口病(HFMD)为主,同时有心肌炎和无菌性脑膜炎等中枢神经系统症状患者也占较大比例。131份病人(粪便、咽拭子、脑脊液)标本中共分离到EV62株,其中ECHO1939株,EV716株,ECHO304株,其它肠道病毒13株。4株ECHO30病毒中的2株分离自2个患者的粪便标本,但用WHO肠道组合血清中和试验未能定出型别。另外2株分离自同一患者的粪便和脑脊液标本。病原学分析表明,ECHO30是引起该患者无菌性脑膜炎的病原。抗E-CHO30标准株的血清中和这4株病毒的滴度低于标准株5~20倍。VP1区全基因序列测定和同源性比较分析表明,4株ECHO30分离株病毒核苷酸同源性在98.0%~98.5%,氨基酸同源性在98.9%~99.3%,提示这4株病毒来源于同一传播链,2003年5-9月ECHO30在该地区可能有局部流行。系统进化树分析表明,ECHO30病毒可以划分为6个基因型,其中基因型1~5为GenBank中已发表的ECHO30分离株,山东分离株与其它5个基因型成员核苷酸差异分别在9.4%~24.4%,在进化树上形成了较独立的分支,是一个新基因型,将其划分为第6基因型。 展开更多
关键词 患者 肠道病毒 暴发 无菌性脑膜炎 传染病 脑脊液 基因型 分离株 血清型鉴定 粪便
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连云港市一起ECHO_(30)病毒性脑膜炎爆发流行病学调查 被引量:11
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作者 朱磷扬 张廷禄 +4 位作者 朱凤东 许雷 孙波 潘红星 赵玉良 《疾病监测》 CAS 2007年第6期384-387,共4页
目的分析2006年江苏省连云港市病毒性脑膜炎爆发的流行特征、影响因素和病因。方法采用统一的流行病学调查表对病例进行调查,收集2004年以来全市各县区病毒性脑膜炎住院病例资料,采用1:2配比病例对照研究的方法分析流行因素;24份脑脊液... 目的分析2006年江苏省连云港市病毒性脑膜炎爆发的流行特征、影响因素和病因。方法采用统一的流行病学调查表对病例进行调查,收集2004年以来全市各县区病毒性脑膜炎住院病例资料,采用1:2配比病例对照研究的方法分析流行因素;24份脑脊液标本送江苏省疾病控制中心检测,并进行病毒分离。结果2004-2005年全市各县区病毒性脑膜炎病例呈现散发状态;2006年1~7月份共查出病例数为968例,从6月份起出现疫情上升,1县2区出现爆发,7月份达高峰,爆发病例为473例,占全市总病例数的48.86%;主要累及15岁以下儿童,占94.44%;男性多于女性,男女比为2.65:1;主要临床表现为发热、头痛、呕吐、脑膜刺激征阳性、脑脊液有核细胞增多。饭前洗手与多吃瓜果为保护因素,说明该病与不良卫生习惯有关系。23份脑脊液经PCR检测,16份ECHO_(30)肠道病毒阳性。结论2006年夏季江苏省连云港市病毒性脑膜炎出现一次爆发并波及1县2区,致病病原体为埃可30型肠道病毒(Echovirus 30,ECHO_(30))肠道病毒,不良卫生习惯可能是导致该病发生流行的危险因素。 展开更多
关键词 echo30 脑膜炎 爆发 流行病学调查
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我国新分离ECHO30病毒VP1序列分析 被引量:7
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作者 赵雅男 姜庆五 +3 位作者 姜仁杰 沈进进 陈胤忠 汪华 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期101-105,共5页
测定了引起2003年苏北地区无菌性脑膜炎暴发流行的病因病毒FDJS03分离株的VP1基因序列,并与国外同型流行毒株做比较,以了解本流行株的分子生物学特点及遗传变异规律。随机选取FDJS03分离毒株中的4株,用肠道病毒VP1序列的特异性引物008/... 测定了引起2003年苏北地区无菌性脑膜炎暴发流行的病因病毒FDJS03分离株的VP1基因序列,并与国外同型流行毒株做比较,以了解本流行株的分子生物学特点及遗传变异规律。随机选取FDJS03分离毒株中的4株,用肠道病毒VP1序列的特异性引物008/011进行RT—PCR,扩增产物经凝胶纯化后测序。将序列输入GenBank,用BLAST程序进行核苷酸和氨基酸序列比对;选取32株不同地区不同年代的ECHO30分离毒株,在PHYLIP3.573c和TREE—PUZZLE5.0中构建进化树,比较它们完整VP1序列(876nt)的进化关系。核苷酸和氨基酸同源性比较结果证明:4株分离病毒均为ECHO30。进化树分析显示:本次FDJS03分离株与欧美20世纪70、80年代流行株亲缘关系最近,但自成一簇,与国外毒株仍然有地区差别。ECHO30的VP1基因进化有时间效应,但存在地区差异。本次流行的病原可能是单一基因型的ECHO30病毒。 展开更多
关键词 VP1基因 病毒 流行株 BLA 分离毒株 无菌性脑膜炎 核苷酸 分离株 扩增产物 遗传变异
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上海市人群Echo30病毒性脑膜炎隐性感染调查 被引量:5
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作者 高洁 赵雅男 姜庆五 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期121-124,共4页
为了了解上海市不同年龄组人群的Echo30病毒隐性感染情况及IgG抗体阳性率分布。采集上海市412份不同年龄组人群血清,用间接酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中的Echo30IgG抗体。发现受检普通人群血清中Echo30IgG抗体阳性率为25.8%。其中... 为了了解上海市不同年龄组人群的Echo30病毒隐性感染情况及IgG抗体阳性率分布。采集上海市412份不同年龄组人群血清,用间接酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中的Echo30IgG抗体。发现受检普通人群血清中Echo30IgG抗体阳性率为25.8%。其中1岁以下婴幼儿中未见抗体阳性者,15岁以下儿童抗体阳性率较低(10%~16.7%),15岁以上人群抗体阳性率水平明显升高(45.0%~46.7%)。孕妇与普通人群抗体阳性率无显著性差异。研究结果提示上海市人群中存在隐性感染者,人群通过自然感染获得免疫保护,15岁以下儿童为Echo30感染及发病的高危人群,母体传递给婴幼儿的抗体水平较低,不能为婴幼儿提供先天性免疫保护。 展开更多
关键词 埃可病毒30型(echo30) 无菌性脑膜炎 肠道病毒 隐性感染
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一起ECHO 30病毒引发游泳队脑炎爆发调查 被引量:2
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作者 曾士典 章显权 +1 位作者 贾俐挺 谢海滨 《疾病监测》 CAS 2007年第3期170-171,共2页
目的分析ECHO30病毒性脑炎在冬季体校游泳队爆发的特征。方法应用流行病学描述方法,对体校学生进行筛查;采集典型病例脑脊液(CSF)、血液样本和泳池水样进行实验室检测。结果病例均为体校游泳队学生,共发病37例,罹患率25.18%,性别间罹患... 目的分析ECHO30病毒性脑炎在冬季体校游泳队爆发的特征。方法应用流行病学描述方法,对体校学生进行筛查;采集典型病例脑脊液(CSF)、血液样本和泳池水样进行实验室检测。结果病例均为体校游泳队学生,共发病37例,罹患率25.18%,性别间罹患率差异无统计学意义(x2=0.03,P>0.50),流行9d;游泳池水污染严重,6份CSF样本肠道病毒核糖核酸阳性,2份分离到ECHO30肠道病毒。结论游泳池循环净水和消毒设备应正常运转,日常监督监测应加强。 展开更多
关键词 echo 30 病毒性脑炎 爆发
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ECHO30所致无菌性脑膜炎暴发的病原学检测分析 被引量:3
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作者 李岩 徐爱强 +6 位作者 王海岩 纪峰 宋立志 张丽 李震 张济 董薇 《预防医学论坛》 2007年第12期1059-1061,共3页
[目的]明确引起无菌性脑膜炎暴发的病原体,从病原学角度探讨引起暴发的原因。[方法]按照WHO规定的标准方法进行病毒的分离、型别鉴定以及血清中和抗体试验;采用传统的技术测定分离株的生物学特性。[结果]43份大便标本共分离19株肠道病... [目的]明确引起无菌性脑膜炎暴发的病原体,从病原学角度探讨引起暴发的原因。[方法]按照WHO规定的标准方法进行病毒的分离、型别鉴定以及血清中和抗体试验;采用传统的技术测定分离株的生物学特性。[结果]43份大便标本共分离19株肠道病毒阳性株,阳性率44.12%,型别鉴定均为ECHO30;分离株具备强毒株的"D"特征;76.92%双份血清抗体呈4倍升高。[结论]2003年济南章丘市无菌性脑膜炎暴发的病原体为具备强毒株特征的ECH-O30。 展开更多
关键词 echo30 无菌性脑膜炎 暴发 病原学
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2003年美国ECHO病毒9和30相关无菌性脑膜炎暴发及肠道病毒监测的初步报告 被引量:1
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作者 屠宇平 杨小平 《疾病监测》 CAS 2004年第1期35-36,共2页
关键词 2003年 美国 echo病毒9 暴发 肠道病毒 监测 无菌性脑膜炎 echo病毒30
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低浓度戊二醛对无菌性脑膜炎暴发病原Echo30毒株的杀灭效果评价
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作者 赵雅男 高洁 +3 位作者 姜仁杰 陈东来 陈胤忠 姜庆五 《中国卫生检验杂志》 CAS 2007年第5期796-797,909,共3页
目的:评价低浓度(<2%)戊二醛消毒剂对2003年苏北儿童无菌性脑膜炎暴发病原Echo30-FD JS03-102分离株病毒的灭活效果。方法:用悬液法测定Echo30-FD JS03-102接触0.05%,0.1%,0.2%戊二醛前后病毒滴度对数值的改变情况。观察不同pH环境... 目的:评价低浓度(<2%)戊二醛消毒剂对2003年苏北儿童无菌性脑膜炎暴发病原Echo30-FD JS03-102分离株病毒的灭活效果。方法:用悬液法测定Echo30-FD JS03-102接触0.05%,0.1%,0.2%戊二醛前后病毒滴度对数值的改变情况。观察不同pH环境下病毒灭活率的差别。结果:25℃pH 7.2条件下,戊二醛对Echo30-FD JS03-102的灭活速度随浓度增加而升高。pH8.3的弱碱性环境能够提高低浓度戊二醛的消毒效果。结论:Echo30-FD JS03-102对低浓度戊二醛具有一定的抵抗力;但在合适的条件下戊二醛仍能达到满意的消毒效果。 展开更多
关键词 戊二醛 埃可病毒30 脑膜炎 无菌性
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Genetic characterizations and molecular epidemiology of human echovirus 30 isolated from Ningxia,China 被引量:1
10
作者 Fang Yuan Xinfeng Wei +10 位作者 Xueping Ma Jiangtao Ma Xuemin Ma Xiaoqiang Sun Min Cao Juan Zhou Wei Zhang Hui Chen Rui Wang Jichen Li Qiang Sun 《Biosafety and Health》 CAS CSCD 2023年第6期346-354,共9页
In October 2017,a small outbreak of echovirus 30(E30)associated with aseptic meningitis in nine cases occurred at a primary school in the Ningxia Hui Autonomous Region.That year,we observed a significant increase in E... In October 2017,a small outbreak of echovirus 30(E30)associated with aseptic meningitis in nine cases occurred at a primary school in the Ningxia Hui Autonomous Region.That year,we observed a significant increase in E30 levels in an acute flaccid paralysis(AFP)case surveillance system.To investigate their phylogenetic relationships,we determined the whole genomic sequences of 12 strains isolated from aseptic meningitis cases,AFP cases,and healthy children.We found that the E30 strains circulating in Ningxia belong to two lineages(H and J).The strains isolated in 2010,2012,and 2016 belonged to the H lineage.In 2017,a new lineage,J,emerged as the dominant lineage.Phylogenetic trees were constructed based on the whole genome andP1,P2,andP3 regions;clustering with other types of enterovirus species B was found,suggesting that recombination events had occurred.The recombination sites were mainly in regions2B,2C,and3D.This study confirmed that the E30 strains in Ningxia in 2010,2012,and 2016 had different recombination patterns and were recombined with different enteroviruses.The 2017 epidemic E30 originated from another new lineage with a complex recombination pattern and formed an independent transmission chain in Ningxia. 展开更多
关键词 echovirus 30(E30) Complete genome sequence Molecular epidemiology
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间接免疫荧光试验在人群埃可30型肠道病毒IgG抗体检测中的应用 被引量:2
11
作者 高洁 赵雅男 +3 位作者 姜仁杰 唐宇轩 陈胤忠 姜庆五 《检验医学》 CAS 北大核心 2006年第6期602-605,共4页
目的建立埃可30型肠道病毒(Echovirus30,Echo30)国内流行株血清特异性IgG抗体检测的间接免疫荧光法(IFA),了解人群既往感染情况。方法采用由爆发人群分离得到的病毒株感染人胚肺二倍体细胞(MRC-5)制备抗原片,探讨IFA检测血清Echo30 IgG... 目的建立埃可30型肠道病毒(Echovirus30,Echo30)国内流行株血清特异性IgG抗体检测的间接免疫荧光法(IFA),了解人群既往感染情况。方法采用由爆发人群分离得到的病毒株感染人胚肺二倍体细胞(MRC-5)制备抗原片,探讨IFA检测血清Echo30 IgG抗体的方法,并初步用于检测苏北病毒性脑膜炎爆发后收集的该地区儿童血清中Echo30 IgG抗体。结果建立了Echo30肠道病毒血清特异性IgG抗体的IFA检测方法。在44份健康儿童血清中筛检到28份(63.6%)Echo30 IgG抗体阳性,3份患者血清Echo30 IgG抗体均为阳性。结论Echo30国内流行株IgG抗体的IFA操作简便、经济,可用于血清流行病学调查。爆发地区儿童中存在大量的无症状感染者。 展开更多
关键词 间接免疫荧光法 肠道病毒 埃可病毒30 抗体
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章丘市埃可病毒30型致无菌性脑膜炎暴发后健康儿童血清流行病学分析 被引量:1
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作者 董微 张济 +5 位作者 赵小东 胡艳霞 刘翀 周志中 杨华 韩晓辉 《中国预防医学杂志》 CAS 2006年第3期188-191,共4页
目的 了解章丘市ECH030型致无菌性脑膜炎暴发1年后≤15岁健康儿童埃可病毒30型(ECH030)的人群感染情况。方法中和抗体检测技术测定血清抗体水平。结果章丘市存在ECH030所致无菌性脑膜炎的暴发,≤15岁健康人群中和抗体几何平均滴度(... 目的 了解章丘市ECH030型致无菌性脑膜炎暴发1年后≤15岁健康儿童埃可病毒30型(ECH030)的人群感染情况。方法中和抗体检测技术测定血清抗体水平。结果章丘市存在ECH030所致无菌性脑膜炎的暴发,≤15岁健康人群中和抗体几何平均滴度(GMT)为1:53.08,显著高于非流行区的GMT(1:32.45)。流行区中和抗体滴度集中分布在1:64—1:256(36.52%),年龄别抗体水平有差异,≥3岁人群随着年龄的增长,抗体水平呈下降趋势。非流行区人群血清中和抗体水平无年龄别差异。结论ECH030所致疾病流行后,人群具有一定的免疫力;非流行区未出现该毒株所致疾病的流行。 展开更多
关键词 埃可病毒30 无菌性脑膜炎 血清流行病学 分析
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一种高效分离埃可病毒30型病毒颗粒及其晶体培养方法的建立 被引量:1
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作者 何娅玲 《中外医疗》 2018年第27期15-17,共3页
目的建立高效培养,分离纯化埃可病毒30型(echovirus 30, EC30)的有效方法并筛选优化病毒晶体生长条件,为后续病毒疫苗开发及病毒结构功能研究建立基础。方法先利用人胚胎横纹肌肉瘤细胞系(human embryonic rhabdomyosarcoma cell,RD)培... 目的建立高效培养,分离纯化埃可病毒30型(echovirus 30, EC30)的有效方法并筛选优化病毒晶体生长条件,为后续病毒疫苗开发及病毒结构功能研究建立基础。方法先利用人胚胎横纹肌肉瘤细胞系(human embryonic rhabdomyosarcoma cell,RD)培养、生产在2010年广西手足口病疫情中分离到的埃可病毒30型毒株;而后使用蔗糖密度梯度离心法分离纯化病毒颗粒;再用透射电镜观察病毒颗粒的形态;最后使用Hampton晶体试剂盒筛选并优化病毒晶体适宜生长条件。结果经透射电镜验证获得完整形态病毒颗粒并在p H 4.6的醋酸钠溶液中培养得到高质量的病毒颗粒晶体。结论通过RD细胞培养结合蔗糖密度梯度离心法可获得高纯度病毒颗粒;利用试剂盒筛选可获得高质量的病毒蛋白晶体。 展开更多
关键词 埃可病毒30 蔗糖密度梯度离心 透射电镜 晶体生长条件筛选
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Seroepidemiology of echovirus 30 in Korean children
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作者 Joo Young Lee Yumi Seo +2 位作者 Ui Yoon Choi Jong-Hyun Kim Jin Han Kang 《World Journal of Pediatrics》 SCIE CAS CSCD 2017年第6期611-614,共4页
Background:Although aseptic meningitis associated with echovirus type 30 has emerged as a global public health concern,no data have been reported on children's immune status against echovirus type 30.The current s... Background:Although aseptic meningitis associated with echovirus type 30 has emerged as a global public health concern,no data have been reported on children's immune status against echovirus type 30.The current study aimed to investigate the seropositivity among Korean children for antibodies against echovirus 30.Methods:Two hundred and fifty residual serum samples were collected at St.Paul's Hospital.Individuals were categorized by age into four groups:group 1 (3 months-2 years),group 2 (3-6 years),group 3 (7-10 years) and group 4 (11-15 years).Neutralizing antibodies against echovirus 30 were measured.Results:Seroprotective neutralizing antibodies against echovirus 30 were detected in 129 (49%) individuals.Seropositivity rates were 23%,48%,55% and 73% in groups 1-4,respectively.For antibody titers,1:256-1:512 was the highest neutralizing antibody titer range in group 2,while 1:1024-1:2048 in group 3 and 4.Among the seropositive individuals in group 3 and 4,6% and 12% had neutralizing antibody titers of 1:2048,respectively.Conclusions:The seropositivity rate increased significantly with age..The distribution of neutralizing antibody titers varied by age group,and higher ranges of neutralizing antibody titers were observed in higher age groups.These findings suggest high susceptibility to echovirus 30 infection in children younger than 2 years old.Echovirus 30 infection in childhood may have contributed to increased neutralizing antibody titers with age. 展开更多
关键词 echovirus 30 Korea SEROEPIDEMIOLOGY
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苏北地区2003年病毒性脑膜炎爆发病原分离株Echo30的序列分析 被引量:19
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作者 赵雅男 姜庆五 +3 位作者 姜仁杰 沈进进 陈胤忠 汪华 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期282-285,共4页
目的测定2003年苏北地区无菌性脑膜炎爆发的病毒分离株部分基因序列,了解该流行株的分子生物学特点及遗传变异规律。方法随机选取3株分离的病毒株,用能特异性扩增肠道病毒VP1区3’段序列的两对引物012/011、040/011进行逆转录聚合酶链反... 目的测定2003年苏北地区无菌性脑膜炎爆发的病毒分离株部分基因序列,了解该流行株的分子生物学特点及遗传变异规律。方法随机选取3株分离的病毒株,用能特异性扩增肠道病毒VP1区3’段序列的两对引物012/011、040/011进行逆转录聚合酶链反应,扩增产物经凝胶纯化后测序。将序列输入GenBank用BLAST程序进行核苷酸和氨基酸序列比对;选取部分肠道病毒序列,经CLUSTALX1.83对齐后,在PHYLIP3.5c中构建进化树,了解分离毒株Echo30的进化关系。结果3株病毒测序结果均为Echo30型肠道病毒。进化树分析显示分离的Echo30毒株与国外1999年和2000年分离株的亲缘关系最近;但3株分离株自成一簇,与国外毒株存在地区差别。结论利用VP1区3’段序列可以快速正确区分肠道病毒分离株的型别,分离株与国外同型流行株在比较区段的遗传变异规律类似。 展开更多
关键词 2003年 苏北地区 病毒性脑膜炎 序列分析 爆发 逆转录聚合酶链反应 分子生物学特点 病毒分离株 病原 无菌性脑膜炎 肠道病毒 变异规律 2000年 1999年 基因序列 扩增产物 序列比对 进化关系 分离毒株 亲缘关系 地区差别
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无菌性脑膜炎暴发中Echo30病毒的基因特征及分子进化分析 被引量:19
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作者 王海岩 徐爱强 +5 位作者 朱贞 李岩 纪峰 张勇 张丽 许文波 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期793-797,共5页
目的了解引起无菌性脑膜炎暴发的Echo30病毒的基因特征,分析其遗传变异规律及进化来源。方法对2003年济南章丘市无菌性脑膜炎暴发中分离到的Echo330病毒进行了VP1区全基因序列测定,与国内外报道的Echo30病毒VP1区序列进行同源性比较,并... 目的了解引起无菌性脑膜炎暴发的Echo30病毒的基因特征,分析其遗传变异规律及进化来源。方法对2003年济南章丘市无菌性脑膜炎暴发中分离到的Echo330病毒进行了VP1区全基因序列测定,与国内外报道的Echo30病毒VP1区序列进行同源性比较,并通过构建进化树分析其遗传进化规律。结果济南章丘市Echo30分离株VP1区核苷酸同源性在98.9%~99.5%之间,与同年山东省泰安市Echo30分离株同源性最高(98.5%~99.0%),与浙江、江苏两省的Echo30分离株同源性在98.2%~98.9%,而与1997年法国分离株(89.1%~89 7%)和2001年台湾省分离株(87.4%~87.6%)的同源性相差较大,与原型株Bastianni株同源性最低,在82.4%~82.8%。进化树分析显示,中国大陆近几年无菌性脑膜炎Echo30分离株独处一支,呈单源性发生关系。结论2003年,Echo30病毒在山东省部分地区发生了一定程度的传播,并导致了无菌性脑膜炎的局部流行,进化树分析表明,中国大陆Echo30分离株与国外早期的分离株相比,其抗原性不完全相同,已形成新的基因亚型。 展开更多
关键词 无菌性脑膜炎 echo30病毒 基因特征 分子进化
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2011~2014年中国福建龙岩市Echo 30型病毒分子流行病学特征分析 被引量:2
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作者 陈前进 曹春远 +6 位作者 张彦锋 杨秀惠 吴水新 何云 廖亦红 何春荣 罗招福 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期727-732,共6页
了解中国福建省龙岩市2011-2014年病毒性脑炎散发病例中Echo 30分子流行病学特征。收集病毒性脑炎或中枢神经系统感染脑脊液标本,细胞培养分离病毒,RT-PCR扩增VP1基因序列全长以鉴定Echo 30血清型及遗传特征分析。2011-2014年共从608例... 了解中国福建省龙岩市2011-2014年病毒性脑炎散发病例中Echo 30分子流行病学特征。收集病毒性脑炎或中枢神经系统感染脑脊液标本,细胞培养分离病毒,RT-PCR扩增VP1基因序列全长以鉴定Echo 30血清型及遗传特征分析。2011-2014年共从608例监测病例中分离到168株肠道病毒,其中60株为Echo 30;60例Echo 30相关病例分析显示,Echo 30流行高峰为6-8月;波及年龄范围广,以小于10岁高发(65%);临床症状以发热、头痛和呕吐为主,脑脊液清,细胞和蛋白含量检测多增加。VP1区分析显示,2011-2014年龙岩流行株均属于h基因型,但有两个传播链共同循环;与2011年导致福建省病毒性脑炎暴发毒株高度同源,但2014年龙岩株均在VP1蛋白I 120V出现新氨基酸变异。福建省2011年暴发流行株仍流行于龙岩市,且两个传播链病毒仍共同循环,但2014年病毒株出现了新的变异,持续监测将有利于早期发现病毒变异积累和评估疾病流行的风险。 展开更多
关键词 echo 30型病毒 病毒性脑炎 VP1 分子流行病学
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一起无菌性脑膜炎疫情中埃可病毒30型的全基因组分析
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作者 冯微宏 韩毅 +1 位作者 王雅静 肖勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期133-143,共11页
对引起一起无菌性脑膜炎的埃可病毒30型(Echovirus 30,E30)毒株进行全基因组测序,并分析其遗传变异和分子进化特征。提取病毒RNA,荧光RT-PCR确定为肠道病毒,再扩增其VP1区,测序确定为E30,设计针对E30全基因组的引物,RT-PCR扩增和序列测... 对引起一起无菌性脑膜炎的埃可病毒30型(Echovirus 30,E30)毒株进行全基因组测序,并分析其遗传变异和分子进化特征。提取病毒RNA,荧光RT-PCR确定为肠道病毒,再扩增其VP1区,测序确定为E30,设计针对E30全基因组的引物,RT-PCR扩增和序列测定获得全基因序列。利用DNAMAN 9.0、MEGA X、RDP 5和SimPlot 3.5.1软件分析全基因序列。E30无锡株基因组全长7 425 bp个核苷酸(nt),5′端和3′端分别为743 nt和97 nt的UTR,二个UTR之间为一个6 585 nt长的开放阅读框,编码一个含2 195个氨基酸(aa)的多聚蛋白。与GenBank中基因组序列比对,最同源的是毒株USA/2017/CA-RGDS-1048 (基因登录号:MN153801),核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为99.1%。VP1基因进化树分析显示,E30无锡株属于h型,并可归类于h型下分的基因簇GroupⅣ。种系进化分析和同源性分析提示E30无锡株可上溯到中国江苏毒株FDJS03毒株。分析还发现E30无锡株在非结构区存在重组,重组序列可能来自E30毒株(KY888274)和E18毒株(MN815813)。E30无锡株归类为h型E30,它是一个包含了E30毒株和E18毒株序列的重组病毒。 展开更多
关键词 埃可病毒30 全基因组 序列分析 重组
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2009年云南省 Echo30分离株 KM/A363/09全基因组序列分析 被引量:1
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作者 白巍 陈俊英 +4 位作者 潘玥 朱艳菊 邵聪文 刘建生 马绍辉 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期388-392,共5页
目的:对2009年从中国云南省1名脑炎患儿粪便标本中分离到的Echo30云南分离株KM/A363/09进行全基因组测序和分析,了解该株病毒的遗传特性。方法设计针对Echo30引物,提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列,利用Gen... 目的:对2009年从中国云南省1名脑炎患儿粪便标本中分离到的Echo30云南分离株KM/A363/09进行全基因组测序和分析,了解该株病毒的遗传特性。方法设计针对Echo30引物,提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列,利用Geneious和Mega5.1软件进行核苷酸、氨基酸序列比对及其系统进化分析,应用RDP3和SimPlot3.5.1重组软件对序列进行重组分析。结果该分离株全基因组核苷酸序列长度为7425 bp,编码2194个氨基酸。其核苷酸和氨基酸序列与其原型株Bastianni的同源性分别为81.2%和95.8%;与其他Echo30型毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为81.2%~88.6%和95.8%~97.8%;进化分析发现KM/A363/09毒株属于中国Echo30分支中的一支。而且发现KM/A363/09株基因序列在非结构区可能存在重组事件。结论云南分离株KM/A363/09属于中国Echo30分支中的一支,而中国分离株已经发生一定的进化。 展开更多
关键词 echo30 全基因序列 序列分析 echovirus 30
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引起甘肃省一起病毒性脑炎疫情的ECHO30全基因组序列分析 被引量:1
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作者 陈建华 张勇 +2 位作者 武海卓 李煜山 于德山 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期617-623,共7页
为了解引起2015年甘肃省酒泉市瓜州县病毒性脑炎疫情的ECHO30的基因特点,分析其重组变异和进化规律,对从患者脑脊液标本中分离到的3株ECHO30进行全基因序列测定和分析,采用Simplot3.5.1软件进行重组分析,并利用MEGA6.0软件构建系统进化... 为了解引起2015年甘肃省酒泉市瓜州县病毒性脑炎疫情的ECHO30的基因特点,分析其重组变异和进化规律,对从患者脑脊液标本中分离到的3株ECHO30进行全基因序列测定和分析,采用Simplot3.5.1软件进行重组分析,并利用MEGA6.0软件构建系统进化树。结果表明,本次疫情中分离到的ECHO30与E30/SD/2010/CHN株的相似度最高(92%~99%)。重组分析表明甘肃ECHO30株在非结构蛋白区P2区和P3区出现了多处重组现象。由于对当地流行的肠道病毒谱不清楚,虽然发现此次流行的病毒存在重组,但是对重组片段的来源尚不明确,因此需要加强对甘肃省流行肠道病毒的本底调查工作和遗传背景的研究工作。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 echo30 全基因组序列分析 重组
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