芡实颗粒结合淀粉合成酶Ⅰ基因克隆及其生物信息学分析

目的:克隆芡实颗粒结合淀粉合成酶EfGBSSⅠ基因并对其进行生物信息学分析。方法:以芡的成熟种子为材料,采用RT-PCR方法克隆芡实EfGBSSⅠ基因,通过在线软件及工具对其进行生物信息学分析。结果:获得EfGBSSⅠ基因全长1893 bp,编码区全长1587 bp,编码528个氨基酸,不存在跨膜区及信号肽,为稳定的亲水性蛋白。系统进化分析表明,该序列与同科植物睡莲亲缘关系较近,并预测出8类顺式作用元件和28种具偏好性的密码子。结论:克隆得到预期芡实EfGBSSⅠ基因,掌握了EfGBSSⅠ基因编码氨基酸序列及蛋白质结构和功能等生物信息学特征,为深入研究该基因的功能及培育芡实优良品种提供了理论依据。