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麝鼠香腺Elovl1基因生物信息学分析及表达研究
被引量:
1
1
作者
雷行
李天峰
+2 位作者
李嘉昊
满欣
白素英
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第4期1201-1212,共12页
【目的】测定麝鼠超长链脂肪酸延伸酶1(elongase of verylong chain fatty acid 1,Elovl1)基因序列并进行生物信息学分析,探讨其在麝鼠香腺发育和泌香过程中的作用。【方法】使用TRIzol法提取成年雄性麝鼠香腺总RNA,采用转录组测序技术...
【目的】测定麝鼠超长链脂肪酸延伸酶1(elongase of verylong chain fatty acid 1,Elovl1)基因序列并进行生物信息学分析,探讨其在麝鼠香腺发育和泌香过程中的作用。【方法】使用TRIzol法提取成年雄性麝鼠香腺总RNA,采用转录组测序技术获得麝鼠香腺Elovl1基因序列并测序;在GenBank数据库中下载啮齿目不同物种的Elovl1基因及其多转录本CDS序列并构建系统进化树;通过在线工具对Elovl1基因编码蛋白的理化性质及结构进行预测与分析;利用实时荧光定量PCR技术分析成年雄性麝鼠香腺发育周期内香腺组织中Elovl1基因的表达水平。【结果】Elovl1基因在麝鼠香腺中表达2个转录本,能编码2个不同的蛋白,分别由313和279个氨基酸组成。Elovl1基因2个转录本在2~9月末的麝鼠香腺中均有表达,且表达量整体呈先上升后下降的趋势。Elovl1基因编码的2个蛋白均为稳定的亲脂性、非分泌蛋白,具有7个跨膜螺旋区,亚细胞定位均主要位于内质网。在啮齿目动物中,Elovl1基因进化与物种进化基本一致,仓鼠科与鼠科亲缘关系较近,麝鼠与水鼠平亲缘关系最近;同一物种Elovl1基因的不同转录本间相对保守,均按物种聚在一起且置信值普遍较高,旱獭例外。【结论】Elovl1基因表达规律与麝鼠香腺的发育、萎缩及泌香周期相吻合,提示Elovl1与麝鼠香分泌相关,并参与了香腺细胞发育。
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关键词
麝鼠
香腺
elovl1基因
表达
生物信息学分析
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职称材料
ELOVL1基因变异致IKSHD 1例临床及基因分析
2
作者
杨磊
张广宇
+3 位作者
陈功勋
李三松
王明梅
朱登纳
《临床儿科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期847-850,共4页
目的探讨鱼鳞病样角化症、痉挛、髓鞘形成障碍和面部畸形(IKSHD)的临床特点及其致病基因。方法回顾分析1例IKSHD患儿的临床资料,并复习相关文献。结果患儿男性,1岁7个月,肘、膝、踝关节及小腿背侧皮肤鱼鳞病样角化症,痉挛性截瘫,眼球震...
目的探讨鱼鳞病样角化症、痉挛、髓鞘形成障碍和面部畸形(IKSHD)的临床特点及其致病基因。方法回顾分析1例IKSHD患儿的临床资料,并复习相关文献。结果患儿男性,1岁7个月,肘、膝、踝关节及小腿背侧皮肤鱼鳞病样角化症,痉挛性截瘫,眼球震颤伴斜视,面部畸形,听力障碍。头颅磁共振示脑白质髓鞘化障碍。全外显子测序结果显示患儿ELOVL1基因c.464G>C杂合突变,家系验证患儿父母均为野生型,该突变位点未见报道。根据ACMG指南评级为可能致病变异,结合患儿临床表现诊断为IKSHD。结论确诊患儿为IKSHD,新发现c.464G>C错义突变位点,基因检测有助于临床确诊。
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关键词
鱼鳞病样角化症
痉挛
髓鞘形成障碍
elovl1基因
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职称材料
题名
麝鼠香腺Elovl1基因生物信息学分析及表达研究
被引量:
1
1
作者
雷行
李天峰
李嘉昊
满欣
白素英
机构
东北林业大学野生动物与自然保护地学院
国家林业和草原局野生动植物检测中心
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第4期1201-1212,共12页
基金
国家林业和草原局野生动物保护项目(2020070209)。
文摘
【目的】测定麝鼠超长链脂肪酸延伸酶1(elongase of verylong chain fatty acid 1,Elovl1)基因序列并进行生物信息学分析,探讨其在麝鼠香腺发育和泌香过程中的作用。【方法】使用TRIzol法提取成年雄性麝鼠香腺总RNA,采用转录组测序技术获得麝鼠香腺Elovl1基因序列并测序;在GenBank数据库中下载啮齿目不同物种的Elovl1基因及其多转录本CDS序列并构建系统进化树;通过在线工具对Elovl1基因编码蛋白的理化性质及结构进行预测与分析;利用实时荧光定量PCR技术分析成年雄性麝鼠香腺发育周期内香腺组织中Elovl1基因的表达水平。【结果】Elovl1基因在麝鼠香腺中表达2个转录本,能编码2个不同的蛋白,分别由313和279个氨基酸组成。Elovl1基因2个转录本在2~9月末的麝鼠香腺中均有表达,且表达量整体呈先上升后下降的趋势。Elovl1基因编码的2个蛋白均为稳定的亲脂性、非分泌蛋白,具有7个跨膜螺旋区,亚细胞定位均主要位于内质网。在啮齿目动物中,Elovl1基因进化与物种进化基本一致,仓鼠科与鼠科亲缘关系较近,麝鼠与水鼠平亲缘关系最近;同一物种Elovl1基因的不同转录本间相对保守,均按物种聚在一起且置信值普遍较高,旱獭例外。【结论】Elovl1基因表达规律与麝鼠香腺的发育、萎缩及泌香周期相吻合,提示Elovl1与麝鼠香分泌相关,并参与了香腺细胞发育。
关键词
麝鼠
香腺
elovl1基因
表达
生物信息学分析
Keywords
muskrat
scent gland
elovl
1
gene
expression
bioinformatics analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
ELOVL1基因变异致IKSHD 1例临床及基因分析
2
作者
杨磊
张广宇
陈功勋
李三松
王明梅
朱登纳
机构
郑州大学第三附属医院儿童康复科
出处
《临床儿科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期847-850,共4页
基金
河南省医学科技攻关联合共建项目(No.2018020182)
河南省医学科技攻关省部共建项目(No.SBGJ2018047)。
文摘
目的探讨鱼鳞病样角化症、痉挛、髓鞘形成障碍和面部畸形(IKSHD)的临床特点及其致病基因。方法回顾分析1例IKSHD患儿的临床资料,并复习相关文献。结果患儿男性,1岁7个月,肘、膝、踝关节及小腿背侧皮肤鱼鳞病样角化症,痉挛性截瘫,眼球震颤伴斜视,面部畸形,听力障碍。头颅磁共振示脑白质髓鞘化障碍。全外显子测序结果显示患儿ELOVL1基因c.464G>C杂合突变,家系验证患儿父母均为野生型,该突变位点未见报道。根据ACMG指南评级为可能致病变异,结合患儿临床表现诊断为IKSHD。结论确诊患儿为IKSHD,新发现c.464G>C错义突变位点,基因检测有助于临床确诊。
关键词
鱼鳞病样角化症
痉挛
髓鞘形成障碍
elovl1基因
Keywords
ichthyotic keratoderma
spasticity
hypomyelination
elovl
1
gene
分类号
R725.9 [医药卫生—儿科]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
麝鼠香腺Elovl1基因生物信息学分析及表达研究
雷行
李天峰
李嘉昊
满欣
白素英
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
2
ELOVL1基因变异致IKSHD 1例临床及基因分析
杨磊
张广宇
陈功勋
李三松
王明梅
朱登纳
《临床儿科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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职称材料
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