期刊文献+
共找到5篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
Molecular phylogeny of Bactrocera species (Diptera: Tephritidae) inferred from mitochondrial 16s rDNA sequences
1
作者 ZHANG Bin LIU Ying-hong +1 位作者 WANG Ze-le ZHAO Lan-lan 《Journal of Agricultural Science and Technology》 2009年第6期24-28,共5页
The fruit flies of the Bactrocera (Diptera: Tephritidae) are one of the major economically important insects in Asia. So far, there are at least seven species found in Chongqing, China. By using mitochondrial 16s r... The fruit flies of the Bactrocera (Diptera: Tephritidae) are one of the major economically important insects in Asia. So far, there are at least seven species found in Chongqing, China. By using mitochondrial 16s rDNA sequences, the phylogenetic relationships among seven Bactrocera species, Bactrocera cucurbitae (Coquillett), B. tau (Walker), B. diaphora (Hendel), B. caudata (Fabricius), B. scutellata (Hendel), B. dorsalis (Hendel), and B. minax (Enderlein) were investigated. Nucleotide diversity within species ranged from 0.3% to 10.9%. According to the result, B. cucurbitae (Coquillett), B. tau (Walker), B. diaphora (Hendel), and B. caudata (Fabricius) have no enough sites to be distinguished among the other species in the 347bp nucleotide sequences of the 16s rDNA gene. At the same time, excluding B. scutellata (Hendel) and B. minax (Enderlein), the other species recognition sites are not only too little but also discontinuous. Phylogenetic trees calculated from both maximum parsimony and neighbor-joining phylogenetic analysis methods showed that B. cucurbitae and B. tau were closely related, B. diaphora (Hendel) and B. caudata (Fabricius) also had a close relationship. B. minax (Enderlein) has a furthest relationship from the other 6 species. From the results, we can infer that the our data supports previous classification of Bactrocera based on morphological characters in other words, but the Bactrocera subgenera, Zeugodacus is polyphyletic. 展开更多
关键词 Bactrocera spp 16s rdna mitochondrial dna molecular phylogeny
下载PDF
基于16SrDNA部分序列探讨中国近海30种石斑鱼类的分子系统进化关系 被引量:39
2
作者 丁少雄 王颖汇 +4 位作者 王军 庄轩 苏永全 尤颖哲 李祺福 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第3期504-513,共10页
石斑鱼因其种类繁多、分布广泛及缺乏显著的形体特征,使其系统分类的研究颇为困难。为探讨中国近海石斑鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属30个种类的线粒体16SrDNA基因片段序列。采用多个生物软件对序... 石斑鱼因其种类繁多、分布广泛及缺乏显著的形体特征,使其系统分类的研究颇为困难。为探讨中国近海石斑鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属30个种类的线粒体16SrDNA基因片段序列。采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura2parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,并结合GenBank石斑鱼属的同源序列,以多纹长尾(Pronotogrammusmultifasciatus)和皮氏叫姑鱼(Johniusbelengerii)为外群构建NJ、MP和ML系统树。根据所得分子依据并结合形态学特征,推论如下:1)在本研究的30种石斑鱼中,鳃棘鲈属(Plectropomus)最先分化,并呈明显单系性;九棘鲈属(Cephalopholis)是一个单系群,并且较石斑鱼属(Epinephelus)原始;侧牙鲈属(Variola)的进化地位介于鳃棘鲈属与九棘鲈属之间;2)宽额鲈(Promicropslanceolatus)可以归入石斑鱼属,而驼背鲈(Cromileptesaltivelis)也与石斑鱼属有很近的亲缘关系,甚至可能是石斑鱼属内的特化类群;3)石斑鱼属内部存在两个平行进化的姐妹分支,分支内部的种类组成与地理分布无关,暗示了石斑鱼属早期的分化模式。 展开更多
关键词 石斑鱼亚科 16s Rdna 系统进化
下载PDF
基于16S rRNA部分序列探讨12种鲹科鱼类的分子系统进化关系 被引量:20
3
作者 郑文娟 朱世华 +2 位作者 邹记兴 杨迎春 沈锡权 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期847-854,共8页
通过PCR扩增获得了中国海域的鲹科(Carangidae)8属9种的线粒体16S rRNA序列片段约598bp碱基,结合来自GenBank的3种鲹科鱼类的相应片段序列,并以大斑石鲈为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA version3.0软件分析序列的碱基组... 通过PCR扩增获得了中国海域的鲹科(Carangidae)8属9种的线粒体16S rRNA序列片段约598bp碱基,结合来自GenBank的3种鲹科鱼类的相应片段序列,并以大斑石鲈为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA version3.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比和转换/颠换值等,应用最大简约法和邻接法构建系统树。结果显示:(1)鲹科鱼类的16S rRNA序列片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入和缺失,共有146bp变异位点,转换/颠换值为2.17,表明基因序列的突变未达到饱和,碱基平均差异为8.22%;(2)支持鲹科下设四个亚科(鲹亚科,亚科,鲳鲹亚科,鲹亚科)阶元的分类系统;(3)鲹亚科鲹属下不宜设亚属分类阶元;(4)及达副叶鲹与丽叶鲹亲缘关系近,16S rRNA序列片段碱基只有1.07%的差异,未达到分属水平。 展开更多
关键词 鲹科 线粒体dna 16s RRNA序列 系统发育
下载PDF
基于16S rRNA部分序列探讨部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系 被引量:6
4
作者 张源真 王伟 +1 位作者 姜志强 张钊 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期89-95,共7页
通过PCR扩增获得了3科5属6种中国黄渤海海域的鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体16S rRNA基因序列片段约669bp碱基,结合来自GenBank的5种鳚亚目其他科鱼类的相应基因片段,并以眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus)为外群,生成供系统... 通过PCR扩增获得了3科5属6种中国黄渤海海域的鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体16S rRNA基因序列片段约669bp碱基,结合来自GenBank的5种鳚亚目其他科鱼类的相应基因片段,并以眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus)为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建系统发育树。结果显示:在鳚亚目鱼类的16S rRNA片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象,共有207 bp变异位点,转换/颠换值为0.8,碱基平均差异为3.36;支持绵鳚(Enchelyopus elongates)归于鳚亚目绵鳚科(Zoarcidae),鳚(Azuma emmnion)归于鳚亚目线鳚科(Stichaeidae);方氏云鳚(Enedriasfangi)和云鳚(Enedrias nebulosus)种间遗传距离只有0.01,亲缘关系最近。 展开更多
关键词 鳚亚目(Blennioidei) 线粒体dna 16s RRNA基因序列 系统发育
下载PDF
基于核糖体DNA联合序列的天牛总科高阶元分子系统学研究 被引量:2
5
作者 魏子涵 尹新明 +3 位作者 安世恒 苏丽娟 李京 张鸿飞 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期710-720,共11页
【目的】利用核糖体DNA联合序列探讨天牛总科高阶元分子系统发育。【方法】本研究采用分子标记技术,分析测定了63种天牛核糖体28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区的DNA序列,并采用邻接法、最大似然法和贝叶斯推论法分别构建了天牛... 【目的】利用核糖体DNA联合序列探讨天牛总科高阶元分子系统发育。【方法】本研究采用分子标记技术,分析测定了63种天牛核糖体28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区的DNA序列,并采用邻接法、最大似然法和贝叶斯推论法分别构建了天牛总科2科6亚科63种的分子进化系统。【结果】序列联合比对分析,最终得到1 404 bp的联合数据组,其中可变位点446个(32.0%),保守位点958(68.0%),转换/颠换的平均值(R值)为1.73。28S rDNA和18S rDNA以及联合序列的饱和度分析显示碱基突变未达到饱和,说明这些序列适合于分子进化树的构建。利用不同系统发育重建方法得到进化树具有相似拓扑结构,结果支持沟胫天牛亚科、花天牛亚科和天牛亚科为单系群,这与形态学分类结果相似;狭胸天牛独立成为亚科得到了支持。【结论】利用28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区联合序列成功构建出了天牛总科高阶元的系统发育树。研究表明联合序列分析是探讨天牛高阶元分类的有效的方法。 展开更多
关键词 天牛总科 高级阶元 核糖体dna 18S Rdna 分子系统发育
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部