内吞适配蛋白Epsin3在乳腺癌中的表达及预后分析

目的 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库,分析内吞适配蛋白Epsin3(EPN3)在乳腺癌中的表达及临床意义。方法 应用TCGA数据库门户网站UALCAN、c Bio Portal、Oncomine等分析EPN3在乳腺癌中的表达变化及预后关系;应用癌症多组学分析数据平台Linked Omics分析在乳腺癌中EPN3的表达变化与临床指标的关系。结果 乳腺导管癌中EPN3基因表达较正常乳腺组织显著上调(P<0.01)且EPN3高表达不利于患者预后;乳腺癌中EPN3的表达受组织学类型、病理阶段、病理T阶段、病理N阶段、原癌基因人类表皮生长因子受体、雌激素受体、孕激素受体、PM50类型、患者种族、肿瘤纯度、年龄和淋巴结数量的影响(P<0.05)。结论 EPN3高表达不利于乳腺癌预后,可作为筛选和治疗乳腺癌的相关靶点。

Epsin3在结直肠癌中的差异表达及生物信息学分析

目的探讨介导内吞作用的衔接蛋白epsin 3(EPN3)在结直肠癌中的表达及意义,为深入研究EPN3的调控模式提供实验依据。方法分别运用GEPIA和GEDS数据库分析EPN3在结直肠癌组织和细胞中的表达情况,并通过SMART和cBioPortal数据库分析EPN3基因甲基化和拷贝数变异与其表达水平的关系;利用Metascape数据库对EPN3相关的共表达基因集进行GO富集和通路分析;运用BioPlex蛋白互作数据库分析EPN3在HCT116细胞中的蛋白作用网络。为了对EPN3进一步验证,我们收集13对结直肠癌癌旁组织和癌组织标本,用Real-time PCR检测EPN3 mRNA表达;并通过敲减EPN3观察其对肿瘤细胞增殖、集落形成和迁移能力的影响。结果GEPIA、GEDS、SMART和cBioPortal等数据库分析显示,EPN3在结直肠肿瘤组织中高表达(P<0.01)。其表达水平与甲基化和拷贝数变异相关。EPN3相关基因的富集结果显示主要与细胞黏附相关。EPN3与UBB、CCDC130、TNFAIP1、PHGDH、EPN2等构成的蛋白相对作用网络与蛋白泛素化有关。Real-time PCR结果显示,EPN3在癌组织中高表达(P<0.05)。通过沉默EPN3可以抑制HCT116和HT29细胞的增殖、集落形成和迁移能力。结论EPN3在结直肠癌组织中高表达,且与细胞黏附和蛋白泛素化等生物学过程有关,敲低EPN3可抑制结直肠癌细胞系HCT116和HT29的增殖、集落形成和迁移等过程。