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基于生物信息学研究EIF3D在肝癌中对靶标RNA非修饰区的结合调控作用机制
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作者 刘子瑶 刘思远 +4 位作者 陈衣强 戴知言 李晶晶 沈洁 谢正尧 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2024年第8期779-785,共7页
目的基于生物信息学方法在公共数据库中探索真核翻译起始因子3亚基D(EIF3D)基因在肝癌中的靶标结合模式和转录水平的调控机制。方法通过肿瘤公共数据库获取EIF3D在肝癌组织中的表达情况和生存差异。利用公共数据库对EIF3D在肝癌HepG2细... 目的基于生物信息学方法在公共数据库中探索真核翻译起始因子3亚基D(EIF3D)基因在肝癌中的靶标结合模式和转录水平的调控机制。方法通过肿瘤公共数据库获取EIF3D在肝癌组织中的表达情况和生存差异。利用公共数据库对EIF3D在肝癌HepG2细胞株的联合增强紫外交联免疫共沉淀(eCLIP)数据进行分析,获取靶标结合位点,HOMER注释并统计学筛选后得到靶标结合区域占比和靶基因集,对该基因集进行基因本体论/京都基因和基因组百科全书(GO/KEGG)分析和PPI分析。对EIF3D敲降后的RNA-seq数据进行差异分析获取差异基因集,对该基因集进行GO/KEGG分析和PPI分析及下游个性化数据库分析。结果公共数据库数据显示,肝癌组织中EIF3D的表达水平显著升高(P<0.001),EIF3D高表达人群的生存率显著低于低表达人群(P<0.001)。EIF3D在正常肝组织的胆管细胞中未见表达,在肝细胞中弱表达;EIF3D在肝癌细胞的细胞质和胞膜上中度表达。在肝癌HepG2细胞株中,EIF3D倾向于结合在靶标的外显子区域,通过调控RNA靶标参与细胞分化、周期进程和mRNA代谢等过程。EIF3D敲降后表达下调的靶基因集参与有丝分裂、细胞周期和DNA修复等过程,该基因集中存在一个互作网络:ATAD2-TOP2A-TPX2-KNTC1-FANCA,其在肝癌中显著上调并对预后造成不良影响。结论EIF3D可能通过结合靶标基因网络的RNA非修饰区在转录水平进行调控,从而促进肝癌进展。 展开更多
关键词 肝癌 真核翻译起始因子3亚基d 生物信息学 RNA结合蛋白
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Eukaryotic Translation Initiation Factors Shape RNA Viruses Resistance in Plants 被引量:2
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作者 Jannat Shopan Xiaolong Lv +2 位作者 Zhongyuan Hu Mingfang Zhang Jinghua Yang 《Horticultural Plant Journal》 2020年第2期81-88,共8页
Viruses are representative of a global threat to agricultural production. Genetic resistance is the preferred strategy for the control of viral infection and against loss of crop yield. Viral protein synthesis require... Viruses are representative of a global threat to agricultural production. Genetic resistance is the preferred strategy for the control of viral infection and against loss of crop yield. Viral protein synthesis requires host cellular factors for translating their viral RNAs, and for regulating their replication and cell to cell systemic movement. Therefore, the viruses are dependent on cellular translation factors. Mutations in the gene encoding eIF4E and eIF4G or their isoforms, eIFiso4 E, eIFiso4 G and eIF2Bβ have been mapped as a source of plant potyvirus while other genus of plant virus recessive resistance genes in many species are originated from these loci. Some of other plant translation factors, such as eIF3,eIF4 A-like helicases, eEF1A and eEF1B, which are required in interacting with viral RNAs and regulating various aspects of the infection cycle,have also been identified. Here, we summarized the mechanisms utilized by RNA viruses of eukaryotic plants and the essential roles of e IFs in virus infection. Moreover, we discussed the potential of e IFs as a target gene in the development of genetic resistance to viruses for crop improvement. This review highlighted newly revealed examples of abnormal translational strategies and provided insights into natural host resistance mechanisms that have been linked to 3 cap-independent translational enhancer activity. 展开更多
关键词 eukaryotic translation initiation factor genome EdITING 3 cap-independent translationAL ENHANCER virus RESISTANCE
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ARID1A Inactivation Increases Expression of circ0008399 and Promotes Cisplatin Resistance in Bladder Cancer
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作者 Yang-kai JIANG Yu-jun SHUAI +7 位作者 Hua-min DING Hui ZHANG Chao HUANG Liang WANG Jia-yin SUN Wen-jie WEI Xing-yuan XIAO Guo-song JIANG 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2023年第3期560-571,共12页
Objective Cisplatin(CDDP)-based chemotherapy is a first-line,drug regimen for muscle-invasive bladder cancer(BC)and metastatic bladder cancer.Clinically,resistance to CDDP restricts the clinical benefit of some bladde... Objective Cisplatin(CDDP)-based chemotherapy is a first-line,drug regimen for muscle-invasive bladder cancer(BC)and metastatic bladder cancer.Clinically,resistance to CDDP restricts the clinical benefit of some bladder cancer patients.AT-rich interaction domain 1A(ARID1A)gene mutation occurs frequently in bladder cancer;however,the role of CDDP sensitivity in BC has not been studied.Methods We established ARID1A knockout BC cell lines using CRISPR/Cas9 technology.IC50 determination,flow cytometry analysis of apoptosis,and tumor xenograft assays were performed to verify changes in the CDDP sensitivity of BC cells losing ARID1A.qRT-PCR,Western blotting,RNA interference,bioinformatic analysis,and ChIP-qPCR analysis were performed to further explore the potential mechanism of ARID1A inactivation in CDDP sensitivity in BC.Results It was found that ARID1A inactivation was associated with CDDP resistance in BC cells.Mechanically,loss of ARID1A promoted the expression of eukaryotic translation initiation factor 4A3(EIF4A3)through epigenetic regulation.Increased expression of EIF4A3 promoted the expression of hsa_circ_0008399(circ0008399),a novel circular RNA(circRNA)identified in our previous study,which,to some extent,showed that ARID1A deletion caused CDDP resistance through the inhibitory effect of circ0008399 on the apoptosis of BC cells.Importantly,EIF4A3-IN-2 specifically inhibited the activity of EIF4A3 to reduce circ0008399 production and restored the sensitivity of ARID1A inactivated BC cells to CDDP.Conclusion Our research deepens the understanding of the mechanisms of CDDP resistance in BC and elucidates a potential strategy to improve the efficacy of CDDP in BC patients with ARID1A deletion through combination therapy targeting EIF4A3. 展开更多
关键词 AT-rich interaction domain 1A hsa_circ_0008399 eukaryotic translation initiation factor 4A3 cisplatin resistance bladder cancer
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RIP3/MLKL通过激活4EBP1-eIF4E通路诱导程序性坏死 被引量:1
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作者 王树超 徐玫丽 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期979-985,共7页
目的:程序性坏死是一种由受体相互作用蛋白3(receptor interacting protein 3,RIP3)和混合谱系激酶域样蛋白(mixed lineage kinase domain-like protein,MLKL)介导的细胞死亡形式,有研究指出哺乳动物雷帕霉素靶蛋白通路可能参与程序性... 目的:程序性坏死是一种由受体相互作用蛋白3(receptor interacting protein 3,RIP3)和混合谱系激酶域样蛋白(mixed lineage kinase domain-like protein,MLKL)介导的细胞死亡形式,有研究指出哺乳动物雷帕霉素靶蛋白通路可能参与程序性坏死的调控,真核细胞翻译起始因子4E结合蛋白1(eukaryotic translation initiation factor 4Ebinding protein 1,4EBP1)-真核起始因子4E(eukaryotic initiation factor 4E,eIF4E)通路是哺乳动物雷帕霉素靶蛋白最重要的下游分子通路之一,然而此通路是否参与程序性坏死的发生,目前尚无相关研究。本研究旨在探索4EBP1-eIF4E通路在程序性坏死中是否发生改变。方法:首先向小鼠上皮样成纤维细胞系L929细胞中加入程序性坏死诱导剂TSZ(TNF-α/SM-164/Z-VAD-FMK),在光学显微镜下观察细胞坏死情况;进一步向敲除RIP3和MLKL基因的L929细胞中加入TSZ,采用碘化丙啶(propidium iodide,PI)染色观察细胞坏死情况,实时荧光定量聚合酶链反应和蛋白质印迹法检测4EBP1和eIF4E的mRNA和蛋白质表达水平。结果:野生型L929细胞用TSZ处理后,坏死细胞增加,4EBP1的mRNA和蛋白质表达水平明显下调且磷酸化的4EBP1(phosphorylated 4EBP1,p-4EBP1)/4EBP1值增加(P<0.05或P<0.01),eIF4E的mRNA表达水平明显上调且磷酸化的eIF4E(phosphorylated eIF4E,p-eIF4E)/eIF4E值增加(均P<0.01);在敲除L929细胞中的RIP3和MLKL基因后,PI阳性坏死细胞明显减少,4EBP1的mRNA和蛋白质表达水平明显上调且p-4EBP1/4EBP1值下降(P<0.05或P<0.01),eIF4E的mRNA表达水平明显下调且p-eIF4E/eIF4E值下降(均P<0.01)。结论:4EBP1-eIF4E通路在RIP3/MLKL介导的程序性坏死中发生活化。 展开更多
关键词 程序性坏死 受体相互作用蛋白3 混合谱系激酶域样蛋白 真核细胞翻译起始因子4E结合蛋白1 真核起始因子4E
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eIF4E3与肝细胞癌患者预后的关联性及其作用机制分析 被引量:1
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作者 祖玲 李万里 刘天奇 《中国临床新医学》 2023年第6期601-608,共8页
目的分析真核翻译起始因子4E家族成员3(eIF4E3)与肝细胞癌(HCC)患者预后的关联性及其作用机制。方法通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库、癌症基因集分析(GSCA)数据库、肝细胞癌整合分子数据库(HCCDB)以及UALCAN数据库分析eIF4E3在HCC... 目的分析真核翻译起始因子4E家族成员3(eIF4E3)与肝细胞癌(HCC)患者预后的关联性及其作用机制。方法通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库、癌症基因集分析(GSCA)数据库、肝细胞癌整合分子数据库(HCCDB)以及UALCAN数据库分析eIF4E3在HCC和正常肝组织中的表达差异。应用UALCAN数据库分析eIF4E3的转录水平与HCC患者临床病理特征的关系。应用GSCA数据库和Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析。应用Linked Omics数据库对eIF4E3的共表达基因进行探索,对其共表达基因作基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。通过肿瘤免疫相互作用数据库(TISIDB)和Sanger Box平台分析eIF4E3与肿瘤微环境中免疫浸润的关系。结果HCC组织中eIF4E3的表达水平显著低于正常肝组织(P<0.05)。在HCC患者中,eIF4E3低表达组的总生存期(OS)、无病生存期(DFS)、无病进展生存期(PFS)和无疾病间隔(DFI)均较eIF4E3高表达组显著缩短(P<0.05)。功能富集分析结果显示,eIF4E3的功能主要富集于细胞黏附、细胞周期以及免疫反应(P<0.05)。eIF4E3表达水平与初始CD4+T细胞、静息自然杀伤(NK)细胞、单核细胞、静息肥大细胞及嗜酸性粒细胞的浸润丰度呈显著负相关(P<0.05),与静息CD4记忆T细胞、活化CD4记忆T细胞、M1巨噬细胞、活化树突状细胞、静息树突状细胞及中性粒细胞浸润丰度呈正相关(P<0.05)。结论eIF4E3是一种潜在的抑癌基因,可能通过影响HCC肿瘤微环境的免疫浸润状态来影响患者预后,有作为HCC免疫治疗靶点的应用前景。 展开更多
关键词 真核翻译起始因子4E家族成员3 预后 免疫浸润 肝细胞癌 肿瘤微环境
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eIF3b和METTL3通过m 6A介导促进宫颈癌进展的作用机制及研究进展
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作者 范香 王逸斐 +1 位作者 杨霓(综述) 朱鹏峰(审校) 《医学研究与战创伤救治》 北大核心 2023年第9期1000-1004,共5页
真核翻译起始因子3(eIF3)是由13个亚基组成的复合物,是目前已发现的eIFs中最大的真核翻译起始因子。eIF3b作为其关键亚基,在翻译起始的调控中具有举足轻重的作用。甲基转移酶样3(METTL3)是一种已知的具有催化活性的甲基转移酶,是甲基转... 真核翻译起始因子3(eIF3)是由13个亚基组成的复合物,是目前已发现的eIFs中最大的真核翻译起始因子。eIF3b作为其关键亚基,在翻译起始的调控中具有举足轻重的作用。甲基转移酶样3(METTL3)是一种已知的具有催化活性的甲基转移酶,是甲基转移酶复合体的关键成分,其负责对N6-甲基腺苷(m^(6)A)进行甲基化修饰。近年来越来越多的研究表明,eIF3b、METTL3在多种人类恶性肿瘤中高表达,可通过m^(6)A介导产生联系。且研究发现eIF3b、METTL3均在宫颈癌中高表达,可促进宫颈癌细胞的增殖、侵袭、迁移,抑制细胞凋亡。文章主要就eIF3b、METTL3通过m^(6)A介导在宫颈癌发展中的具体作用机制以及研究进展进行综述。 展开更多
关键词 真核翻译起始因子3b 甲基转移酶样3 N6-甲基腺苷 宫颈癌
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EIF3h在结直肠癌组织中的表达及临床病理意义 被引量:9
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作者 吴继华 张建中 +5 位作者 崔彦 冯凯 周金莲 景青萍 尚乐 丁华野 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第23期2582-2585,共4页
目的探讨真核翻译起始因子3h(eukaryotic translation initiation factor 3 subunit h,EIF3h)在结直肠癌组织中的表达及其临床病理学意义,并分析在结直肠癌组织中EIF3h和Ki-67表达的关系。方法应用免疫组化EnVision法检测76例结直肠癌... 目的探讨真核翻译起始因子3h(eukaryotic translation initiation factor 3 subunit h,EIF3h)在结直肠癌组织中的表达及其临床病理学意义,并分析在结直肠癌组织中EIF3h和Ki-67表达的关系。方法应用免疫组化EnVision法检测76例结直肠癌组织、35例结直肠腺瘤组织、20例距癌10 cm的肠黏膜组织中EIF3h的表达水平。结果 EIF3h在结直肠癌组织、腺瘤组织、距癌10 cm的肠黏膜组织中表达的阳性率分别为86.84%(66/76)、31.43%(11/35)、10.00%(2/20),3组间差异有统计学意义(P<0.01)。EIF3h的表达与肿瘤浸润深度、有无淋巴结转移相关(P<0.01);与患者的性别、年龄、肿瘤大小和分化程度无关(P>0.05)。结直肠癌组织中EIF3h与Ki-67的表达呈正相关(r=0.42,P<0.01)。结论 EIF3h在结直肠癌组织中呈高表达,提示其可能与结直肠癌的发生、发展密切相关。联合检测EIF3h和Ki-67在结直肠癌中的表达,有助于结直肠癌的诊断和预后的评估。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 EIF3h 免疫组化
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基于数据库分析人EIF3C在头颈鳞状细胞癌中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 赵谦 任婉丽 +5 位作者 李宏慧 戴皓 白艳霞 张少强 姚小宝 邵渊 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第21期3789-3793,共5页
目的:通过研究真核翻译起始因子3C(eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C,EIF3C)在头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)组织中的表达,阐明EIF3C基因的表达与HNSCC临床病理特征和预后的关系... 目的:通过研究真核翻译起始因子3C(eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C,EIF3C)在头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)组织中的表达,阐明EIF3C基因的表达与HNSCC临床病理特征和预后的关系以及其相互作用蛋白参与的生物学过程。方法:采用GEPIA数据库分析HNSCC和对照组织中EIF3C基因的表达差异以及HNSCC患者中EIF3C基因表达的高低与预后之间的关系。采用LinkedOmics数据库分析EIF3C基因的表达与HNSCC的病理分级以及TNM分期之间的关系。采用The Human Protein Atlas数据库分析EIF3C蛋白在正常和HNSCC组织中的表达水平。采用STRING数据库分析EIF3C相互作用的蛋白以及参与的生物学过程。结果:EIF3C的表达水平在HNSCC中显著增高(P<0.01),与HNSCC的病理分级相关(P=0.026 6),且分别与HNSCC的T分期(P=0.261 8)、N分期(P=0.358 8)和M分期(P=0.3413)不相关。EIF3C基因表达的高低与HNSCC的总生存率(P=0.24,HR=1.2)和无病生存率(P=0.66,HR=0.93)无显著性差异。免疫组化结果显示EIF3C蛋白在正常组织中呈中等水平表达,而在HNSCC组织中呈中、高等水平表达。EIF3C主要与其他EIFs蛋白相互作用,主要参与细胞的翻译起始调控。结论:HNSCC中EIF3C的表达显著增高且与临床病理分级相关,可为后续EIF3C的功能研究提供重要的理论基础。 展开更多
关键词 真核翻译起始因子3C 头颈鳞状细胞癌 数据库分析 预后
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长链非编码RNA LINC00641通过微小RNA-181d-5p靶向真核细胞翻译起始因子4A2抑制宫颈癌细胞增殖的研究 被引量:1
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作者 张杨 王刚 +3 位作者 陈侠 张云志 秋彤 高飞 《中国性科学》 2022年第2期117-122,共6页
目的观察长链非编码RNA(LncRNA)LINC00641(LINC00641)在宫颈癌细胞中的表达特征,探讨LINC00641通过微小RNA-181 d-5p(miR-181 d-5p)/真核细胞翻译起始因子4A2(EIF4A2)对宫颈癌细胞增殖的调节作用。方法选择宫颈癌Hela细胞株,建立空白对... 目的观察长链非编码RNA(LncRNA)LINC00641(LINC00641)在宫颈癌细胞中的表达特征,探讨LINC00641通过微小RNA-181 d-5p(miR-181 d-5p)/真核细胞翻译起始因子4A2(EIF4A2)对宫颈癌细胞增殖的调节作用。方法选择宫颈癌Hela细胞株,建立空白对照组,构建转染pc-DNA3.1的无关序列组、转染pc-DNA3.1-LINC00641的pc-DNA-LINC00641组、转染pc-DNA3.1-LINC00641-siRNA的si-LINC00641组,转染miR-181 d-5p inhibitor的miR-181 d-5p inhibitor组、转染miR-181 d-5p mimic的miR-181 d-5p mimic组、转染siRNA-EIF4A2的si-EIF4A2组。采用CCK-8实验检测细胞增殖活性,采用双荧光素酶报告基因实验观察LINC00641和miR-181 d-5p、miR-181 d-5p、EIF4A2的靶向关系。选取2019年12月至2021年1月陕西中医药大学第二附属医院诊治的45例宫颈鳞癌且未行术前新辅助放、化疗的女性患者作为研究对象,留取其术后肿瘤组织(宫颈鳞癌组织)。另选取45例因子宫肌瘤行子宫全切术,且经病理确诊为慢性宫颈炎的患者,留取其宫颈组织(慢性宫颈炎组织)。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)法检测LINC00641和miR-181 d-5p的表达,采用免疫组化SP法检测EIF4A2和Ki67的表达,采用Pearson检验分析其相关性。结果生物信息分析显示,LINC00641与miR-181 d-5p、miR-181 d-5p、EIF4A2具有可能的结合位点。与空白对照组和无关序列组比较,pc-DNA-LINC00641组、miR-181 d-5p mimic组、si-EIF4A2组细胞增殖活性下降,si-LINC00641组、miR-181 d-5p inhibitor组细胞增殖活性升高。双荧光素酶报告基因实验显示,LINC00641与miR-181 d-5p、miR-181 d-5p、EIF4A2具有靶向关系。挽救实验显示,沉默EIF4A2可部分逆转沉默LINC00641和沉默miR-181 d-5p对细胞增殖的促进作用。与慢性宫颈炎组织比较,宫颈鳞癌组织中LINC00641、miR-181 d-5p低表达,EIF4A2高表达(P<0.05)。Pearson相关分析显示,LINC00641与miR-181 d-5p、EIF4A2、Ki67呈正相关性,miR-181 d-5p与EIF4A2呈负相关性。结论LINC00641通过miR-181 d-5p/EIF4A2抑制宫颈癌细胞的增殖,调控肿瘤的形成和进展。 展开更多
关键词 长链非编码RNA LINC00641 宫颈癌 增殖 微小RNA-181 d-5p 真核细胞翻译起始因子4A2 调控
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肾消康对糖尿病大鼠肾组织基因eIF3s8表达的影响
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作者 王兵 乔羽 +8 位作者 白玉宾 解颖 陈飞 刘春红 柳成刚 常佳怡 高恩宇 韩洁茹 姜德友 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期62-64,共3页
目的观察中药复方肾消康对糖尿病肾病大鼠的防治作用及对肾脏基因表达的影响,探讨糖尿病肾病(DN)的发病机制,揭示中药复方肾消康防治DN的作用机理,筛选药效作用靶点,为临床推广应用提供科学依据。方法采用链脲佐菌素(STZ)加高热量饮食... 目的观察中药复方肾消康对糖尿病肾病大鼠的防治作用及对肾脏基因表达的影响,探讨糖尿病肾病(DN)的发病机制,揭示中药复方肾消康防治DN的作用机理,筛选药效作用靶点,为临床推广应用提供科学依据。方法采用链脲佐菌素(STZ)加高热量饮食建立糖尿病大鼠肾脏损伤模型。运用放免、生化、光镜、电镜及美国Affymetrix公司的基因表达谱芯片、RT-PCR等先进检测手段和方法,观察了多项指标,尤其是通过聚类分析寻找和DN有重要相关性的基因,并进一步采用实时荧光定量RT-PCR法做验证实验研究。结果真核生物翻译起始因子3,8亚基(eIF3s8),在糖尿病大鼠肾脏表达下调,肾消康治疗组表达上调。结论应用Affymetrix Rat2302.0基因表达谱芯片检测糖尿病大鼠肾脏基因的表达,eIF3s8是筛选出的肾脏差异表达基因和药效靶点之一,并对该基因做荧光定量RT-PCR测序分析。这在国内外尚属首次。基因功能分析表明,在糖尿病状态下,eIF3s8表达下调,与糖尿病肾脏损伤有重要相关性,而经肾消康治疗后大鼠肾脏组织中eIF3s8表达上调,可见肾消康对eIF3s8基因表达具有良性调节作用,其作用机制还有待于进一步研究。 展开更多
关键词 肾消康 糖尿病 肾脏损伤 基因表达谱 真核生物翻译起始因子3 8亚基
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EIF2AK3基因相关Wolcott-Rallison综合征1例并文献复习
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作者 张惠洁 王世彪 +3 位作者 郭晓峰 翁斌 林玲 郝燕 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期176-179,共4页
患儿,女,1个月29 d。因抽搐6 d、发现血糖增高5 d入院。血糖波动于正常或增高,糖化血红蛋白因过高无法检测,尿糖+~++++,空腹C肽0.19 ng/mL,胰岛素11.68μIU/mL。遗传性内分泌疾病基因Panel(检测基因412个,包含已知糖尿病相关基因49个)... 患儿,女,1个月29 d。因抽搐6 d、发现血糖增高5 d入院。血糖波动于正常或增高,糖化血红蛋白因过高无法检测,尿糖+~++++,空腹C肽0.19 ng/mL,胰岛素11.68μIU/mL。遗传性内分泌疾病基因Panel(检测基因412个,包含已知糖尿病相关基因49个)高通量测序发现患儿EIF2AK3基因存在新发c.2731_2732delAG和c.2980G>A复合杂合突变,均位于基因的激酶结构域。该婴儿被确诊为Wolcott-Rallison综合征(WRS)。WRS是一种罕见的常染色体隐性遗传疾病,以新生儿糖尿病、多发性骨骺发育不良和肝脏疾病为特征,新生儿糖尿病是WRS诊断的必备条件,EIF2AK3基因是WRS的致病基因。 展开更多
关键词 Wolcott-Rallison综合征 真核翻译始动因子2-α激酶3基因 新生儿糖尿病 基因检测
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维生素D对糖尿病大鼠模型主动脉中层厚度的影响及其作用机制
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作者 关连颖 李书瑞 +1 位作者 康凯宁 张绍义 《中国医学装备》 2021年第8期197-201,共5页
目的:探究维生素D(Vit-D)对糖尿病(DM)大鼠模型主动脉中层厚度的影响及其蛋白激酶受体样内质网激酶(PERK)和真核翻译起始因子2α(eIF2α)(PERK/eIF2α)通路的作用机制。方法:选用30只Sprague-Dawley(SD)雄性大鼠,采用随机数表法将其分... 目的:探究维生素D(Vit-D)对糖尿病(DM)大鼠模型主动脉中层厚度的影响及其蛋白激酶受体样内质网激酶(PERK)和真核翻译起始因子2α(eIF2α)(PERK/eIF2α)通路的作用机制。方法:选用30只Sprague-Dawley(SD)雄性大鼠,采用随机数表法将其分为对照组、DM组和DM+Vit-D组,每组10只。通过给每只大鼠腹腔注射链脲佐菌素建立大鼠DM模型,DM+Vit-D组大鼠使用活性形式的Vit-D3灌胃(0.1μg·kg^(-1)·d^(-1))。比较各组大鼠的血糖水平、主动脉损伤情况、血清一氧化氮(NO)和内皮素(ET)水平,并采用Westernblot检测主动脉组织中PERK/eI F2α通路中的蛋白表达水平。结果:DM模型大鼠的血糖水平均>16.7 mmol·L^(-1),干预后DM组和DM+Vit-D组的尾静脉空腹血糖(FBG)水平差异无统计学意义。DM组的收缩压和脉搏波传导速度(PWV)显著高于对照组,其差异有统计学意义(t=5.263,t=4.956,P<0.05);DM+Vit-D组的收缩压和PWV显著低于DM组,其差异有统计学意义(t=5.016,t=4.332;P<0.05)。DM组大鼠的主动脉中层厚度[(103.24±4.98)μm]显著高于对照组[(90.15±3.24)μm],DM+Vit-D组的主动脉中层厚度[(96.74±4.21)μm]显著低于DM组[(80.25±2.86)μm],差异有统计学意义(t=3.521,t=3.852;P<0.05)。DM组的NO水平为(51.49±6.85)μmol·L^(-1)显著降低、ET水平为(110.28±11.39)pg·ml^(-1)显著升高,与对照组比较差异有统计学意义(t=4.585,t=5.677;P<0.05);DM+Vit-D组的NO水平[(61.18±8.21)μmol·L^(-1)]显著升高,ET水平[(101.44±11.32)pg·ml^(-1)]显著降低,与DM组比较差异有统计学意义(t=5.029,t=5.881;P<0.05)。DM组大鼠的PERK和eIF2α蛋白水平显著高于对照组,差异有统计学意义(t=3.612,t=4.083;P<0.05);DM+Vit-D组的PERK和eIF2α蛋白水平显著低于DM组,差异有统计学意义(t=3.506,t=3.892;P<0.05)。结论:Vit-D可通过抑制DM大鼠的主动脉中PERK/eIF2α通路水平,缓解主动脉损伤和血管内皮功能。 展开更多
关键词 糖尿病 主动脉 维生素d(Vit-d) 蛋白激酶受体样内质网激酶(PERK) 真核翻译起始因子2α(eIF2α) 通路
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人真核翻译起始因子3C基因的克隆及表达
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作者 赵谦 孙潇 +2 位作者 罗真真 董怡萍 韩苏夏 《西部医学》 2019年第9期1328-1333,共6页
目的构建人真核翻译起始因子3C(Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 Subunit C,EIF3 C)编码区全长的真核表达载体,转染FaDu人下咽鳞癌细胞系,为探讨EIF3C的生物学功能奠定基础。方法从人下咽鳞癌细胞系中提取总RNA,反转录成cDN... 目的构建人真核翻译起始因子3C(Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 Subunit C,EIF3 C)编码区全长的真核表达载体,转染FaDu人下咽鳞癌细胞系,为探讨EIF3C的生物学功能奠定基础。方法从人下咽鳞癌细胞系中提取总RNA,反转录成cDNA后用特异性引物PCR扩增EIF3C基因编码区全长(NM_001037808.2),双酶切后将EIF3C基因编码区全长克隆到载体pCMV-Blank上,构建真核表达载体pCMV-EIF3C。转染FaDu细胞系,real-timePCR和Westernblot检测EIF3C表达水平。将未加质粒转染FaDu细胞作为未加质粒转染组,加质粒pCMV-Blank作为pCMV-Blank转染组,以及加质粒pCMV-EIF3C作为pCMV-EIF3C转染组。分别将pCMV-EIF3C转染组EIF3C的mRNA和蛋白表达水平与未加质粒转染组、pCMV-Blank转染组进行比较,以及比较未加质粒转染组和pCMV-Blank转染组。通过生物信息学网站和软件分析人EIF3C氨基酸序列的理化性质、磷酸化位点、二级结构和三维结构。结果测序结果表明构建的真核表达载体pCMV-EIF3C中人EIF3C序列正确。转染实验表明载体pCMV-EIF3C转染组EIF3C的mRNA水平相比载体pCMV-Blank转染组升高7.08倍,未加质粒转染组升高8.02倍(P<0.001),且载体pCMV-EIF3C转染组蛋白表达水平相比于载体pCMV-Blank转染组和未加质粒转染组也显著升高(P<0.05)。EIF3C蛋白质由913个氨基酸组成,预测含有27个磷酸化位点,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。结论成功构建真核表达载体pCMV-EIF3C,并使EIF3C在下咽鳞癌细胞系中过表达。 展开更多
关键词 真核翻译起始因子3C 人下咽鳞癌细胞 基因克隆 真核表达
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真核翻译起始因子3在结直肠癌发生、发展过程中的作用
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作者 殷玉婷 何清莲 +3 位作者 龙嘉莉 雷雪 李紫琪 朱伟 《广东医科大学学报》 2021年第1期1-3,9,共4页
真核翻译起始因子3(eIF3)是最大、最复杂的哺乳动物起始因子,由13个亚基(eIF3a-m)组成,在蛋白质合成中发挥重要作用。虽然eIF3在许多恶性肿瘤发生、发展过程中起关键作用,但其在结直肠癌发生、发展过程中作用研究较少。eIF3d、eIF3e、eI... 真核翻译起始因子3(eIF3)是最大、最复杂的哺乳动物起始因子,由13个亚基(eIF3a-m)组成,在蛋白质合成中发挥重要作用。虽然eIF3在许多恶性肿瘤发生、发展过程中起关键作用,但其在结直肠癌发生、发展过程中作用研究较少。eIF3d、eIF3e、eIF3i、eIF3m在结直肠癌组织中高表达,eIF3g可能是结直肠癌耐药性的靶向调节剂,抑制eIF3a表达可能是肠上皮细胞分化的先决条件。 展开更多
关键词 真核翻译起始因子3 结直肠癌
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Effect of siRNA-mediated knockdown of eIF3c gene on survival of colon cancer cells 被引量:3
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作者 Ning SONG Yan WANG +2 位作者 Xiao-dong GU Zong-you CHEN Liu-bin SHI 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2013年第6期451-459,共9页
Eukaryotic initiation factor subunit c(eIF3c) has been identified as an oncogene that is over-expressed in tumor cells and,therefore,is a potential therapeutic target for gene-based cancer treatment.This study was foc... Eukaryotic initiation factor subunit c(eIF3c) has been identified as an oncogene that is over-expressed in tumor cells and,therefore,is a potential therapeutic target for gene-based cancer treatment.This study was focused on investigating the effect of small interfering RNA(siRNA)-mediated eIF3c gene knockdown on colon cancer cell survival.The eIF3c gene was observed to be highly expressed in colon cancer cell models.The expression levels of the gene in eIF3c siRNA infected and control siRNA infected cells were compared via real-time polymerase chain reaction(PCR) and western blotting analysis.Cell proliferation levels were analyzed employing 3-(4,5-dimethylthiazol 2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide(MTT) and colony formation assays.Furthermore,the effects of eIF3c gene knockdown on the cell cycle and apoptosis were analyzed using flow cytometry.The results showed that suppression of eIF3c expression significantly(P<0.001) reduced cell proliferation and colony formation of RKO colon cancer cells.The cell cycle was arrested by decreasing the number of cells entering S phase.Further,apoptosis was induced as a result of eIF3c knockdown.Collectively,eIF3c deletion effectively reduced the survival of colon cancer cells and could be used as a therapeutic tool for colon cancer therapy. 展开更多
关键词 eukaryotic initiation factor subunit c(eIF3c) COLON cancer RKO cells Small interfering RNA(siRNA)
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真核翻译起始因子3与肿瘤 被引量:3
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作者 褚丽莎(综述) 宋向阳 曹江(审阅) 《医学分子生物学杂志》 CAS CSCD 2010年第1期86-89,共4页
真核翻译起始因子3是由多个亚基组成的,在真核翻译起始中发挥重要作用,近年来的研究表明其多个亚基在多种肿瘤细胞中存在异常表达的现象且与肿瘤的侵袭性、转移能力、分化程度及预后相关,使其有望成为肿瘤治疗的新靶点。
关键词 真核翻译起始因子3 肿瘤 表达
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真核翻译始动因子2-α激酶3基因突变致Wolcott-Rallison综合征1例 被引量:2
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作者 桑艳梅 刘敏 +3 位作者 杨文利 闫洁 朱逞 倪桂臣 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期585-587,共3页
目的对Wolcott-Rallison综合征的临床特征及遗传发病机制进行研究。方法选取临床诊断为Wolcott-Rallison综合征的患儿及其父母为研究对象,运用PCR技术扩增患儿家系真核翻译始动因子2-α激酶3(EIF2AK3)基因的17个外显子区,用DNA直接测序... 目的对Wolcott-Rallison综合征的临床特征及遗传发病机制进行研究。方法选取临床诊断为Wolcott-Rallison综合征的患儿及其父母为研究对象,运用PCR技术扩增患儿家系真核翻译始动因子2-α激酶3(EIF2AK3)基因的17个外显子区,用DNA直接测序技术,对患儿家系EIF2AK3基因的17个外显子进行基因突变分析。结果在患儿及其父亲EIF2AK3基因的第9外显子区发现了1个杂合突变(1798A/T),氨基酸序列分析显示这个突变是一种无义突变,可导致EIF2AK3第532位C氨基酸残基形成终止密码子(C532STOP),形成1个532氨基酸残基组成的截短蛋白。患儿母亲EIF2AK3基因未发现相应突变(1798T/T)。结论在中国儿童中,EIF2AK3基因突变可导致Wolcott-Rallison综合征发生。 展开更多
关键词 Wolcott-Rallison综合征 真核翻译始动因子2-α激酶3基因 糖尿病 婴儿 新生
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小檗碱对糖尿病db/db小鼠骨骼肌蛋白质代谢的影响及机制研究 被引量:1
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作者 王会玲 丁婷婷 +1 位作者 胡兆永 张金元 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期319-324,共6页
目的探讨小檗碱对糖尿病/胰岛素抵抗模型db/db小鼠骨骼肌蛋白质代谢及肌萎缩蛋白Fbox-1(Atrogin-1)表达的影响。方法db/db小鼠为研究对象,以野生型为对照组。予小檗碱(5mg·kg-1·d-1)腹腔注射3周,观察体重和食量;3... 目的探讨小檗碱对糖尿病/胰岛素抵抗模型db/db小鼠骨骼肌蛋白质代谢及肌萎缩蛋白Fbox-1(Atrogin-1)表达的影响。方法db/db小鼠为研究对象,以野生型为对照组。予小檗碱(5mg·kg-1·d-1)腹腔注射3周,观察体重和食量;3周末处死,分离胫骨前肌和腓肠肌。胫骨前肌冰冻切片行层黏连蛋白免疫组化染色,荧光显微镜下观察并拍照,测量肌纤维横截面积并计算肌纤维面积分布图;同位素[14C].苯丙氨酸掺入法检测肌肉蛋白合成,[3H]-酪氨酸释放率分析检测肌肉分解代谢;Northern印迹检测腓肠肌Atrogin-1和肌环指蛋白1(MurF-1)转录水平,Western印迹检测蛋白翻译水平。结果小檗碱能明显降低db/db小鼠血糖水平[(18.55±3.79对26.32±4.02)mmol/L,P〈O.01],降低脂肪重量[(2.75±0.30对3.77±0.52)g,P〈O.05],使胫骨前肌的肌重/胫骨长度比值及肌纤维横截面积下降,肌纤维面积分布图明显左移;小檗碱使野生型小鼠和db/db小鼠的蛋白质合成率下降18%~22%;蛋白质分解率升高24%~26%,使肌肉特异性的Atrogin-1、MurF-1转录和翻译水平增高,同时使真核转录因子3调节亚基(eIF3-f)蛋白水平降低。结论小檗碱具有降糖降脂作用,但可引起骨骼肌蛋白质合成下降,促进蛋白质分解代谢,加剧糖尿病的骨骼肌消耗,其机制与上调Atrogin-1和MurF-1表达,同时下调eIF3-f有关。 展开更多
关键词 糖尿病 实验性 小檗碱 骨骼 ATROGIN-1 肌环指蛋白1 真核转录因子3调节亚基
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eIF3各亚基和肿瘤相关性的研究进展 被引量:2
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作者 张辉 陈萍 《肿瘤学杂志》 CAS 2015年第9期768-772,共5页
真核细胞起始因子3(eukaryotic translation initiation factor 3,e IF3)是相对分子量最大和最复杂的一个真核细胞翻译起始因子。e IF3在真核细胞翻译起始进程中起着核心作用。最近的国内外研究也发现,e IF3的多个亚基在各种肿瘤中的表... 真核细胞起始因子3(eukaryotic translation initiation factor 3,e IF3)是相对分子量最大和最复杂的一个真核细胞翻译起始因子。e IF3在真核细胞翻译起始进程中起着核心作用。最近的国内外研究也发现,e IF3的多个亚基在各种肿瘤中的表达有增高或降低等异常现象,从相关研究来看,e IF3的多个亚基与肿瘤的发生、进展、预后是密切相关的。文章主要对e IF3各亚基和肿瘤相关性研究进行综述。 展开更多
关键词 真核细胞起始因子3(eIF3) 亚基 肿瘤
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