国产磁珠结合自动化工作站批量提取生物检材DNA的应用

目的建立国产磁珠结合自动化工作站批量提取案件中生物检材DNA的方法。方法采用国产磁珠结合Bio-Robert Universal System自动化工作站对案件中常见的生物样本进行DNA提取,检测Identifiler系统16个STR基因座,在ABI3130XL遗传分析仪上进行STR分型。其中210份样品同时在ABI7500型荧光定量PCR仪上进行定量。结果9100份10类生物检材应用国产磁珠结合自动化工作站,大部分可提取到足够的DNA进行STR检验。STR检验成功率最高的为口腔拭子、肌肉,达100%,接触细胞检材的成功率较低,为50.0%。结论国产磁珠结合自动化工作站可用于案件中常见的大部分生物样本的DNA提取。

应用自动化工作站提取常见生物样本DNA

目的建立使用自动化工作站提取法医案件生物样本DNA的方法。方法选用Biomek 3000自动化工作站,采用DNA IQTM系统及Chelex法对法医案件中常见生物样本进行DNA提取,荧光定量技术进行定量,PCR扩增16个STR基因座并与手工提取方法比较。结果与手工提取方法进行比较,选用自动化工作站结合使用DNAIQTM系统及Chelex法提取DNA可获得满意的STR检验结果。结论自动化工作站可用于法医案件中常见生物样本的DNA提取。

DNA提取方法和PCR循环次数对STR扩增成功率的影响

目的探讨常见载体上的微量血痕DNA的提取方法、PCR循环次数对STR扩增成功率的影响。方法分别应用Chelex-100法及Chelex-100结合纯化法对8种载体上不同大小的血痕样本进行DNA提取,并采用28次、30次及34次PCR循环进行STR扩增,分别观察其扩增成功率。结果经28次、30次及34次PCR循环,Chelex-100法提取DNA后的STR扩增成功率分别为0.2917,0.3333,0.4583,Chelex-100结合纯化法的STR扩增成功率分别为0.3750,0.4583,0.8750。结论用Chelex-100结合纯化法提取DNA,用34次循环扩增可提高STR基因座的检测成功率。

DNA IQ磁珠法结合Maxwell^(TM) 16自动仪提取接触DNA

目的研究DNA IQ磁珠法结合MaxwellTM 16自动仪对接触DNA提取的应用价值。方法 151份案件接触DNA检材95℃裂解后,采用DNA IQ磁珠法结合MaxwellTM 16自动仪提取DNA,然后进行DNA定量和STR分型检测,统计各种类型的接触DNA含量I、PC CT值和STR分型成功率。结果 151份案件接触DNA检材中,除果核平均DNA获得量为9.51ng以外,其它接触检材的平均DNA获得量均大于10ng,烟蒂检验成功率最高为93%,果核检验成功率较低,为60%。所有DNA样品的IPC CT值均在27左右,纯度高。结论大部分接触DNA检材采用DNA IQ磁珠法结合MaxwellTM 16自动仪可提取到足以进行STR分型的DNA。

DNA提取自动化工作站在法医学领域的应用

自动化工作站是指运用生化技术对生物性检材进行批量处理分析的全自动化工作平台,它可在短时间内批量进行移液,加样,混合等操作,特别适合用于大量生物性检材的PCR模板的制备。本文仅对DNA提取自动化工作站的基本模式、基本方法、法医学应用等进行综述,以期使该技术在法医DNA分析中得到更广泛的应用。

DNA数据库9个STR基因座比中认定亲权的可靠性分析

目的探讨Profiler plus试剂盒9个常染色体STR基因座用于DNA数据库中双亲亲缘关系比中结果认定亲权的可靠性。方法在DNA数据库中搜集无关个体与已知母子(或父子)在9个STR基因座不排除亲缘关系的比中记录54例,组成54例假定的三联体家庭,计算其PI值与RCP值;应用Identifiler试剂盒加做到15个常染色体STR基因座,观察其排除情况。结果在54例假定三联体中PI值最低为178.598597(RCP=99.443203%),最高为97318.085812(RCP=99.998972%)。加做到15个STR基因座后,54例假定三联体中每个三联体至少出现2个基因座排除,最多5个基因座出现排除的现象,平均排除基因座数为3.52个。结论Profiler plus试剂盒9个STR基因座用于亲缘关系鉴定可能出现错误结论;单纯利用RCP值来认定亲缘关系是不安全的;建议应用16个或更多的基因座建设DNA数据库和进行亲缘关系判定。

DNA数据库建设中批量样品不同DNA提取方法的比较

目的比较和选择自动化工作平台提取DNA的方法,并用于DNA数据库建设。方法用手工Chelex-100法、Biomek3000自动化工作平台结合Chelex-100法及DNA-IQTM磁珠法对实验室收集的建库滤纸血样进行DNA提取,荧光定量技术对上述3种方法提取的模板DNA进行测定;扩增产物用3100基因分析仪检测并用基因分析软件分析。结果手工Chelex-100法、自动化Chelex-100法及DNA-IQTM磁珠法提取的DNA模板浓度分别为0.593ng±0.131ng/μl、0.579ng±0.096ng/μl、0.447ng±0.056ng/μl;成功率分别为100%、98.9%、99.5%。结论本文建立的自动化Chelex-100法可用于大规模DNA数据库建设。

人类线粒体DNA异质性研究进展及在法医学中的应用

线粒体DNA(mtDNA)异质性的存在使其在法医学应用变得复杂。本文对mtDNA异质性形成的可能原因、异质性的分布和遗传特点、异质性的筛查和定量方法、异质性对法医学的影响以及异质性的研究和展望等方面进行综述,探讨异质性在法医学上的应用价值。

DNase-I纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA

目的研究脱氧核糖核酸酶I(DNase-I)纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA的方法在法医学中的应用。方法收集79份性犯罪案件混合斑检材,分别用DNase-I纯化结合碱性裂解法和差异裂解法提取精子DNA,采用STR荧光标记复合扩增体系进行16个STR基因座分型,并比较检验结果。结果应用DNase-I纯化结合碱性裂解法提取精子DNA,64例检材分型成功;应用差异裂解法提取精子DNA,57例检材分型成功;两种方法比较结果存在显著性差异(P=0.039),DNase-1纯化结合碱性裂解法提取精子DNA的STR分型成功率更高,成本低廉。结论DNase-I纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA可提高检验成功率,操作简便,快速,易于自动化,适于法医学个体识别鉴定。

Chelex-100提取生物检材DNA实时PCR定量研究

目的研究Chelex-100法提取的生物检材DNA用量与复合STR分型成功率的关系。方法113份各种生物检材采用Chelex-100法提取DNA，应用Quantifiler人类DNA定量试剂盒在ABI 7500荧光定量PCR仪上进行实时PCR定量，同时用Identifiler复合扩增系统在ABI 3100遗传分析仪上对这些DNA样品进行STR分型。结果各种生物检材提取的DNA浓度分别为：37份滤纸、纱布血痕0．042～5．28ng／μl，16份口腔拭子1．15—4．21ng／μl，18份烟头0．016～1．46ng／μl，10份肋软骨0．531—14．40ng／μl，8份肌肉5．75—24．80ng／μl，7份指甲0．788—11．50ng／μl，17份精斑0．79～99．50ng／μl。在建立的8μl扩增体系中，根据上述结果，调整用于复合STR扩增的DNA模板量在0．5—3ng之间，大部分样品可获得完全的STR分型。结论Chelex-100法提取的检材DNA模板用量在0．5—3ng之间可得到有效STR扩增，浓度为0．5ng／μl以上的DNA样品，用小体积模板（1μl）比大体积（3μl）模板扩增效果好。

3种提取胶带粘面汗潜指印中DNA的方法比较

目的比较胶带粘面汗潜指印中DNA提取的方法。方法分别采用硅珠法、QIAMicrokit法、硅珠-QIAMicrokit法提取胶带粘面的汗潜指印中DNA,STR复合扩增,荧光电泳检测。结果用QIAMicrokit法、硅珠-QIAMicrokit法提取胶带粘面汗潜指印中DNA,检测成功率分别为21%和36%。硅珠法检测未获成功。结论硅珠-QIAMicrokit法提取胶带粘面汗潜指印中的DNA比QIAMicrokit法,检验时间更短,检测成功率更高。

中国蒙古族群体mtDNA测序的聚类分析及其法医学意义

目的建立一种既节省模板、又能延长测序长度的m tDNA单倍型（群）分析方法,构建中国蒙古族mtDNA单倍型类型关系树。方法用复合扩增、巢式PCR对201名中国蒙古族m tDNA样本进行D-环区、3010～3460、4640～5204、10171～10659和14478～15204编码区域的测序分析,部份样品进行L3953/H4508等区域的测序;根据其多态界定各样本单倍型并进行聚类分析。结果L15996/H107等巢式PCR扩增产物经测序检验结果互不干扰,其分型以A等东亚人群常见的单倍型（群）为主,包括部份HV、K、J、I和U等欧洲人群优势单倍型（群）,23个单倍群和共53个单倍型全部归为欧亚人群特有的M和N两大类单倍类群并呈巢式聚类。结论本研究选取的测序区域适用于构建我国各民群的m tDNA单倍型（群）;复合扩增、巢式PCR法既节省模板DNA,又延长测序的长度,适用于法医学、考古学研究中的微量样本的检测。

中国广东汉族群体mtDNA控制区的多态性

目的 探讨线粒体DNA控制区(包括HVⅠ区、HVⅡ区和HVⅢ区)的多态性。方法 采用PCR扩增和末端标记荧光循环测序的方法，对100名广东汉族无关个体进行了序列分析。结果 共观察到147个变异位点，序列变异包括了碱基转换、颠换、插入、缺失等各种类型。其中在HV Ⅰ区(nt16，024～nt16，365)内观察到88个变异位点，91种单倍型，基因多样度为0.9964；在HVⅡ区(nt73～nt340)观察到42个变异位点，67种单倍型，基因多样度为0.9861；在HVⅢ区(nt438～nt574)观察到9个变异位点，15种单倍型，基因多样度为0.8760。联合3个高变区域的序列，可观察到98种单倍型，基因多样度为0.9996。结论 本研究为线粒体DNA在法庭科学中的应用提供了较系统的实验依据。结果还表明，对于mtDNA等单倍型遗传标记，增加其检测范围，可提高该系统的个体识别能力，使其在法庭科学领域充分发挥作用。

后丽盲蝽属作为属级分类单元的DNA分子证据

用蛋白酶K消化法提取并正反链双向测得半翅目盲蝽科盲蝽族 (Mirini)中后丽盲蝽属 (Apolygus)和草盲蝽属 (Lygus) 9个种的线粒体DNA细胞色素b基因片段的序列 ,应用Mega计算该两个属 7个种 11个Cytb 4 32bp片段序列的碱基组成、核苷酸的种间变异率、所编码的 14 4个氨基酸的变异率。其核苷酸变异率 :后丽盲蝽属内小于 0 0 2 ,草盲蝽属内小于 0 0 8(个别种例外 ) ;两个属种类之间平均变异率都大于 0 10 ,平均为 0 15。氨基酸变异率 :后丽盲蝽属内种间无变异 ,而草盲蝽属内只有L gemellatus与其他种间有 13个氨基酸变异 ,仅占 9 0 3% ;两属各种类间却存在 8～ 11个氨基酸的变异。表明在分子水平上两属之间较之于属内种间具有明显的差异 ,支持将后丽盲蝽从亚属提升为属级分类单元的分类观点。

美国法庭科学DNA标准物质

美国国家标准和技术研究所(NIST)的标准物质(SRM)目录中提供了5种人类DNA标准物质(SRM2390,2391,2391 a,2392,2395),这5种DNA标准物质可以为法庭科学DNA鉴定提供参考标准。本文介绍这5种DNA标准物质的组成和产生,以期为我国进行相关研究提供借鉴和参考。

微量接触类生物检材的游离DNA问题分析

目的探究接触类生物检材的游离DNA问题,游离DNA和细胞内DNA含量的比例问题,以及游离DNA在法医检验中的影响。方法对手部、面部和足部的皮肤及口腔粘膜进行模拟微量接触类检材的制备,对模拟检材进行浸泡,对游离DNA进行定量和STR扩增,对剩余检材使用常规程序进行DNA提取、定量和STR扩增,并对结果进行分析和讨论。结果实验观察到,78.55%的样品检测到了游离DNA,其中,手部模拟检材的游离DNA检测率为82.1%,脸部模拟检材的游离DNA检测率为82.1%,口腔模拟检材的游离DNA检测率为96.4%,足部模拟检材的游离DNA检测率为53.6%,微量接触类检材中游离DNA量占DNA总量的12.9%。结论接触类生物检材中提取到的DNA,除了包括细胞内DNA,还存在一定比例的细胞外游离DNA,这为微量接触类检材的DNA有效提取和检验提供了新的理论依据。

基于事实型数据的科技评价与预测方法研究：以DNA测序技术为例

基于事实型数据的科技评价与预测研究方法,将定性和定量方法有机地结合,能够更加精确地分析科学技术的发展过程、现状及其未来趋势。本文以DNA测序技术为例进行实证研究,以展示基于事实型数据的科技评价与预测方法的研究思路及过程。

国际刑警组织DNA技术的应用和数据交换

国际刑警组织为了对各成员国的DNA检验工作提供技术支持 ,促进DNA技术的广泛应用 ,设立了DNA组。DNA专家组是DNA组的主要咨询机构 ,负责推荐DNA采样和证据采集、DNA数据库、质量控制、DNA技术培训等方面的指导原则。国际刑警组织还定期召开国际DNA用户大会 ,开展地区性DNA技术培训 ,以促进DNA技术的普及、应用和发展。本文主要介绍国际刑警组织在DNA技术方面开展的工作及推荐的一些指导原则。

中国法医学会物证专业委员会法医DNA分析的若干建议

中国法医学会法医物证学专业委员会与国际法医遗传学会中文专委会于2006年10月在成都召开学术会议。我们的讨论强调有必要将国际法医遗传学会的信息及时传递到中国。因此,按照国际法医遗传学会的指南,我们推荐混合斑分析,法医DNA数据库及新遗传标记选择标准供同行参考。

DNA数据库建设中批量样本直接扩增检验法的应用

目的研究批量样本直接扩增法在DNA数据库建设中的应用。方法打孔机打取血滤纸600份,剪取芝麻大小的口腔拭子300份,放入96孔扩增板,加入扩增试剂后直接扩增,并对其中200份血滤纸用磁珠法,100份口腔拭子用96孔板Chelex-100法,经DNA提取后扩增检验进行比较。结果血滤纸采用直接扩增法及磁珠法STR检测成功率均为100%;口腔拭子采用直接扩增法的成功率为95%,采用96孔板Chelex-100法的成功率为94%。结论血滤纸和口腔拭子通过直接扩增均能获得很好的DNA分型结果,该方法省时省力,可用于DNA数据库建设。