期刊文献+
共找到18篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
Expression of genes involved in progesterone receptor paracrine signaling and their effect on litter size in pigs
1
作者 Xiao Chen Jinluan Fu Aiguo Wang 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期30-42,共13页
Background: Embryonic mortality during the period of implantation strongly affects litter size in pigs. Progesterone receptor(PGR) paracrine signaling has been recognized to play a significant role in embryonic imp... Background: Embryonic mortality during the period of implantation strongly affects litter size in pigs. Progesterone receptor(PGR) paracrine signaling has been recognized to play a significant role in embryonic implantation. IHH,NR2F2, BMP2, FKBP4 and HAND2 were proved to involve in PGR paracrine signaling. The objective of this study was to evaluate the expression of IHH, NR2F2, BMP2, FKBP4 and HAND2 in endometrium of pregnant sows and to further investigate these genes' effect on litter size in pigs. Real-time PCR, western blot and immunostaining were used to study target genes/proteins expression in endometrium in pigs. RFLP-PCR was used to detect single nucleotide polymorphisms(SNPs) of target genes.Results: The results showed that the m RNA and protein expression levels of IHH, NR2F2 and BMP2 were up-regulated during implantation period(P 〈 0.05 or P 〈 0.01). All target proteins were mainly observed in luminal epithelium and glandular epithelium. Interestingly, the staining of NR2F2 and HAND2 was also strong in stroma. SNPs detection revealed that there was a-204 C 〉 A mutation in promoter region of NR2F2 gene. Three genotypes were found in Large White, Landrace and Duroc sows. A total of 1847 litter records from 625 sows genotyped at NR2F2 gene were used to analyze the total number born(TNB) and number born alive(NBA). The study of the effect on litter size suggested that sows with genotype CC tend to have higher litter size.Conclusions: These results showed the expression patterns of genes/proteins involved in PGR paracrine signaling over implantation time. And the candidate gene for litter size was identified from genes involved in this signaling. This study could be a resource for further studies to identify the roles of these genes for embryonic implantation in pigs. 展开更多
关键词 expression implantation litter size pigs snps
下载PDF
Characterization of Porcine Matrix Metalloproteinase 23 (pMMP-23) Gene and Its Association with Litter Size Traits 被引量:2
2
作者 NIU Bu-yue LAN Xiao-ming +5 位作者 YAN Xiao-hong DI Sheng-wei WANG Yang LI Hai-tao XIONG Yuan- zhu WANG Xi-biao 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2013年第1期103-109,共7页
The matrix metalloproteinase 23 (MMP-23), which might play a role in ovulation in mammals, was one of the promising candidate genes for litter size traits in pigs. In the present research, partial sequence of porcin... The matrix metalloproteinase 23 (MMP-23), which might play a role in ovulation in mammals, was one of the promising candidate genes for litter size traits in pigs. In the present research, partial sequence of porcine MMP-23 (pMMP-23) gene, including exons 2-8 (GenBank: EU360790), was obtained. Real-time PCR analysis revealed that pMMP-23 gene was highly expressed in ovary. PCR-Sau3A I-RFLP and PCR-Acc II-RFLP assay were established to detect a C/T mutation in exon 3 (EU360790: g. 269C〉T) and an A/G mutation in exon 4 (EU360790: g. 505A〉G), respectively. Association study for these two SNPs with litter size was assessed in three independent populations (Minzhu, Landrace I and Landrace II). Statistical analysis demonstrated that for second and subsequent litters, TT sows produced more TNB than CC pigs in Landrace breed (P〈0.05) at g. 269C〉T locus, and the additive effect was significant (P〈0.05); GG sows produced more TNB and NBA than AA pigs in Minzhu (P〈0.01) and Landrace breeds (P〈0.05) at g. 505A〉G locus, and the additive effect was significant (P〈0.01 or P〈0.05). Our study suggested that the pMMP-23 gene might be a novel candidate gene for litter size traits, and g. 505A〉G locus might be a useful molecular marker for marker assisted selection (MAS). 展开更多
关键词 PIG MMP-23 molecular cloning expression litter size
下载PDF
绵羊FGF 7基因组织表达及其多态性与产羔数之间的关系 被引量:28
3
作者 周梅 曹晓涵 +8 位作者 贺小云 孙庆 狄冉 胡文萍 王翔宇 张效生 张金龙 刘秋月 储明星 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期525-533,共9页
旨在探究绵羊FGF7基因组织表达水平及其多态性与产羔数之间的关系。本研究利用半定量反转录-聚合酶链式反应(sqRT-PCR)和实时荧光定量PCR(qPCR)技术对绵羊FGF7基因在多羔小尾寒羊和单羔苏尼特羊以及小尾寒羊FecB不同基因型(BB、B+、++)... 旨在探究绵羊FGF7基因组织表达水平及其多态性与产羔数之间的关系。本研究利用半定量反转录-聚合酶链式反应(sqRT-PCR)和实时荧光定量PCR(qPCR)技术对绵羊FGF7基因在多羔小尾寒羊和单羔苏尼特羊以及小尾寒羊FecB不同基因型(BB、B+、++)各组织中的表达水平进行研究,同时采用Sequenom MassARRAY~?SNP技术,对多羔绵羊品种(小尾寒羊380只)和单羔绵羊品种(滩羊、苏尼特羊、萨福克羊、杜泊羊和草原型藏羊共380只)FGF7基因g.57842893C>T位点多态性进行检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果表明,FGF7基因在单、多羔绵羊的心和肺中高表达,在其它各组织呈中等或低丰度表达;FGF7基因在多羔小尾寒羊绝大部分组织中的表达量均高于单羔苏尼特羊,但差异均不显著(P>0.05),FGF7在小尾寒羊FecB不同基因型中的表达并无明显差异。g.57842893C>T位点共存在CC、CT和TT 3种基因型,且基因型频率和等位基因频率在单、多羔品种间差异均达到显著水平(P≤0.05);g.57842893C>T位点在苏尼特羊、萨福克羊和杜泊羊中表现为中度多态(0.25<PIC<0.50),在其它品种中表现为低度多态(PIC<0.25);g.57842893C>T位点仅在苏尼特羊、萨福克羊以及杜泊羊3个品种中均处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05);g.57842893C>T位点与小尾寒羊第1、2以及第3胎产羔数均无显著关联(P>0.05),但CC型各胎产羔数均高于TT型。综上表明,FGF7基因的表达水平与绵羊产羔数可能存在一定程度的正相关,虽然可能不是影响绵羊产羔数的关键基因,但g.57842893C>T位点对绵羊产羔数性状的选育具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 绵羊 FGF7基因 组织表达 SNP分型 产羔数
下载PDF
MTNR1 A基因对大白猪和长白猪产仔数的影响 被引量:4
4
作者 王晓凤 王爱国 +3 位作者 傅金恋 李宗进 韩丽萍 杨淑明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期805-809,共5页
根据MTNR1A基因在GenBank中的已知DNA序列设计了2对引物,采用PCR-SSCP技术在一个大白猪和长白猪群体中进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)检测,发现了一个SNP位点,并对其不同基因型个体PCR回收产物进行测序。测序... 根据MTNR1A基因在GenBank中的已知DNA序列设计了2对引物,采用PCR-SSCP技术在一个大白猪和长白猪群体中进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)检测,发现了一个SNP位点,并对其不同基因型个体PCR回收产物进行测序。测序结果发现该SNP是由于在+159碱基处(GenBank中序列)发生了G→A的同义突变而引起的。并对该SNP与产仔数进行了关联分析,结果表明该SNP对产仔数的影响不显著。 展开更多
关键词 产仔数 MTNR1A 单核苷酸多态性
下载PDF
猪产仔数的全基因组关联分析 被引量:1
5
作者 付言峰 赵为民 +4 位作者 李辉 李碧侠 程金花 徐小波 任守文 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第4期232-238,共7页
为筛选猪总产仔数和产活仔数性状关键SNP分子标记或候选基因,采用Illumina porcine 50K芯片对同一猪场186头加系大白猪能繁母猪开展了全基因组SNP扫描,后又对扫描结果进行了质量控制、Beagle填充和SNP基因型分型,结合这些试验猪的表型... 为筛选猪总产仔数和产活仔数性状关键SNP分子标记或候选基因,采用Illumina porcine 50K芯片对同一猪场186头加系大白猪能繁母猪开展了全基因组SNP扫描,后又对扫描结果进行了质量控制、Beagle填充和SNP基因型分型,结合这些试验猪的表型性状测定和群体结构分析结果,进行全基因组关联分析(GWAS)。群体结构分析结果表明,试验所用的加系大白猪样本未出现群体分层现象;在18对(36条)常染色体上一共得到36867个有效SNP标记,用于试验猪的GWAS分析。GWAS结果表明,这些加系大白猪所有胎次总产仔数共显著关联到2个SNP,分别为seq-rs323899658和seq-rs329781338,其中seq-rs329781338 SNP又注释到3个基因,分别为SSBP1、WEE2和KIAA1147。产活仔数共显著关联到7个SNP,分别为seq-rs81238474、seq-rs321377412、seq-rs340736313、seq-rs80782154、seq-rs81244816、seq-rs81467772和seq-rs329781338,这7个SNP中有5个SNP有基因注释,共注释到22个基因,分别为EphA1、TAS2R60、FAM131B、CLCN1、CASP2、TMEM139、TRBV21OR9-2、PRSS2、TRBV19、TRBV24-1、U6、SSBP1、WEE2、KIAA1147、NKX2-8、ALKBH3、HSD17B12、U6、HOMER2、WHAMM、FSD2和SCARNA15。候选基因GO功能和KEGG通路分析结果表明,这些基因GO功能中最显著的生物学过程为多生物过程的调控、分子功能为非跨膜/跨膜蛋白酪氨酸激酶活性,KEGG通路为错配修复。结合GWAS和基因功能注释结果,WEE2和EphA1基因可作为提高加系大白猪总产仔数和产活仔数的关键候选基因。 展开更多
关键词 全基因组关联分析 产仔数 SNP 芯片
下载PDF
绵羊SMAD1基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析 被引量:10
6
作者 田志龙 汤继顺 +4 位作者 孙庆 王玉琴 张效生 张金龙 储明星 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期755-766,共12页
【目的】绵羊产羔数是一个极其复杂的性状,受诸多因素影响。绵羊排卵数是最重要的因素之一,而SMAD蛋白在哺乳动物卵泡发育和颗粒细胞生长分化过程中发挥着重要作用。因此本文基于前期绵羊基因组重测序数据,深入研究SMAD家族成员1 (SMAD ... 【目的】绵羊产羔数是一个极其复杂的性状,受诸多因素影响。绵羊排卵数是最重要的因素之一,而SMAD蛋白在哺乳动物卵泡发育和颗粒细胞生长分化过程中发挥着重要作用。因此本文基于前期绵羊基因组重测序数据,深入研究SMAD家族成员1 (SMAD family member 1, SMAD1)基因在不同繁殖力小尾寒羊组织表达模式,并探讨其多态性与绵羊产羔数的关系,以揭示其影响产羔数的机制,为绵羊分子育种提供科学依据。【方法】首先,采用反转录PCR技术检测SMAD1基因在不同繁殖力小尾寒羊群体大脑,小脑,下丘脑,垂体,子宫,卵巢,输卵管,心脏,肝脏,脾脏,肺脏,肾脏,肾上腺,甲状腺,大肠,小肠,胰腺,瘤胃,肾脂19种组织的表达模式,然后利用实时荧光定量PCR技术检测SMAD1基因在不同繁殖力小尾寒羊下丘脑,垂体,子宫,卵巢,输卵管5种繁殖组织的相对表达量。随后采用Sequenom MassARRAY?SNP技术对SMAD1基因5个单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism, SNP)位点在小尾寒羊(n=380)、湖羊(n=101)、苏尼特羊(n=21)、草原型藏羊(n=161)、策勒黑羊(n=52)、滩羊(n=22)6个绵羊品种中进行基因型检测,计算其群体遗传学指标,利用SPSS19.0软件分析5个SNPs与小尾寒羊产羔数的相关性。【结果】PCR结果显示,SMAD1基因在不同繁殖力小尾寒羊全身性组织均有表达,在小尾寒羊单羔群体卵巢的表达量极显著高于多羔群体(P<0.01),小尾寒羊单羔群体下丘脑、垂体的表达量显著高于多羔群体(P<0.05);基因分型结果表明,g.12485895A>G,g.12487558G>A和g.12487190G>T位点在单、多羔绵羊品种中基因型和等位基因频率均差异显著(P<0.05);而g.12508874T>C和g.12487467A>G位点在单、多羔绵羊品种中基因型和等位基因频率均差异不显著(P>0.05);群体遗传学分析表明,g.12485895A>G、g.12487558G>A、g.12508874T>C、g.12487467A>G、g.12487190G>T位点在小尾寒羊、湖羊、策勒黑羊、苏尼特羊、草原型藏羊中均为中度多态(0.25<PIC<0.5),g.12508874T>C位点在滩羊群体表现为低度多态(PIC<0.25);卡方适合性检验表明,g.12485895A>G和g.12487467A>G位点在小尾寒羊和草原型藏羊中处在Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),g.12487558G>A在小尾寒羊和湖羊群体处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),g.12487190G>T位点在草原型藏羊处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。其他位点在6个绵羊品种中均处在Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);关联分析表明,g.12485895A>G,g.12487558G>A,g.12508874T>C和g.12487467A>G位点与小尾寒羊产羔数无显著关联。g.12487190G>T位点TT基因型母羊前三胎的产羔数均显著高于GT和GG基因型母羊(P<0.05)。将该位点与小尾寒羊FecB(A746G)不同基因型进行组合后发现,AA-GG、AA-GT、AA-TT型母羊产羔数显著低于其他组合基因型母羊(P<0.05)。【结论】SMAD1与小尾寒羊繁殖密切相关,g.12487190G>T可作为小尾寒羊产羔性状选育的潜在分子标记。 展开更多
关键词 绵羊 SMAD1基因 组织表达 SNP分型 产羔数
下载PDF
猪精子黏合分子1(SPAM1)基因在白色杜洛克×二花脸F_2资源群体中的遗传变异及其与母猪产仔数的关联性 被引量:3
7
作者 吴延博 陈从英 +2 位作者 张志燕 郭源梅 高军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期2111-2117,共7页
【目的】猪精子黏合分子1(SPAM1)基因在精卵结合过程中发挥重要作用,是影响产仔数的重要候选基因。本试验分析SPAM1基因的遗传变异及其与母猪产仔数的相关性。【方法】以305头白色杜洛克×二花脸资源群体F2母猪为材料,记录连续3胎... 【目的】猪精子黏合分子1(SPAM1)基因在精卵结合过程中发挥重要作用,是影响产仔数的重要候选基因。本试验分析SPAM1基因的遗传变异及其与母猪产仔数的相关性。【方法】以305头白色杜洛克×二花脸资源群体F2母猪为材料,记录连续3胎的产仔性状,利用PCR-RFLP检测intron1 g298C>T、intron1 g357C>T和intron3 g380C>T共3个SNP位点在F2群体中的多态性,构建单倍型,分析各SNP基因型和单倍型与母猪产仔数、产活仔数、产死胎数的相关性。【结果】intron1 g298C>T位点CC型母猪的总产仔数显著低于CT、TT型母猪(P<0.05),CT基因型母猪产死胎数显著多于TT型(P<0.05)。intron1 g357C>T位点CT基因型母猪产死胎数显著多于CC、TT基因型(P<0.05)。intron3 g380C>T位点CC基因型母猪产活仔数显著低于CT型,产死胎数显著高于CT型(P<0.05)。在6种单倍型中,TTT单倍型母猪的总产仔数和产活仔数明显高于其它5种(P<0.05);TCT、TTC单倍型母猪产死胎数显著低于CTC、TTT和TCC(P<0.05)。【结论】SPAM1基因与母猪产仔数存在显著相关性。 展开更多
关键词 SPAM1基因 snps 单倍型 产仔数
下载PDF
绵羊KISS1基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析 被引量:7
8
作者 安雪姣 赵生国 +4 位作者 潘章源 文禹粱 田志龙 蔡原 储明星 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2019年第6期45-50,共6页
为研究 KISS1基因在常年发情的小尾寒羊和季节性发情的草地型藏羊中的表达模式,以及 KISS1基因多态性与绵羊繁殖之间的关系,实验采用 qPCR技术对比分析 KISS1基因在 2个品种绵羊的 10种繁殖相关组织中的表达差异,同时利用 Sequenom Mass... 为研究 KISS1基因在常年发情的小尾寒羊和季节性发情的草地型藏羊中的表达模式,以及 KISS1基因多态性与绵羊繁殖之间的关系,实验采用 qPCR技术对比分析 KISS1基因在 2个品种绵羊的 10种繁殖相关组织中的表达差异,同时利用 Sequenom MassARRAY SNP 技术对常年发情绵羊(小尾寒羊、策勒黑羊和湖羊)和季节性发情绵羊(滩羊、苏尼特羊和草地型藏羊)KISS1基因 2 个 SNPs 位点多态性进行检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。qPCR 结果显示:KISS1基因在小尾寒羊下丘脑、大脑、垂体和甲状腺中的表达量高于草原型藏羊(P<0.05);分型结果表明,g.1317523C>T 位点基因型频率和等位基因频率在常年发情和季节性发情绵羊品种间差异均达到极显著水平(P<0.01);群体遗传学分析表明,g.1317523C>T 位点在 6 个绵羊群体中均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5);卡方适合性检验表明,g.1317523C>T 位点在小尾寒羊、滩羊、苏尼特羊和湖羊中均处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05),g.1311578G>T 位点在苏尼特羊和湖羊中处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05);关联分析表明,这 2个 SNPs位点与小尾寒羊前 3胎产羔数均无显著关联(P>0.05),但 g.1311578G>T 位点 TT 型各胎产羔数均大于 GT 和 GG 型。综上, KISS1基因与绵羊的季节性繁殖密切相关,并且 g.1311578G>T 位点对绵羊产羔性状有潜在调控作用。 展开更多
关键词 绵羊 KISS1基因 组织表达 SNP 分型 季节性繁殖 产羔数
下载PDF
apoE基因对大白猪和长白猪产仔数的影响研究 被引量:3
9
作者 房文宁 卢靖 +2 位作者 孙恬妍昕 傅金銮 王爱国 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2010年第15期1-5,共5页
根据载脂蛋白E(apoE)基因在GenBank中的已知序列设计了8对引物,采用PCR-SSCP的方法在1个大白猪和长白猪群体中对apoE基因的全部编码区序列及部分5′-调控区的序列进行SNP检测。结果表明:在外显子3发现了1个T1826C突变,在5′-调控区-512^... 根据载脂蛋白E(apoE)基因在GenBank中的已知序列设计了8对引物,采用PCR-SSCP的方法在1个大白猪和长白猪群体中对apoE基因的全部编码区序列及部分5′-调控区的序列进行SNP检测。结果表明:在外显子3发现了1个T1826C突变,在5′-调控区-512^-544位置处发现33 bp长度的片段缺失。对这2个突变位点与产仔数进行了关联分析,表明该SNP和缺失突变的基因型效应对总产仔数和产活仔数影响均不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 APOE基因 产仔数 SNP
下载PDF
SIX1基因表达及其多态性与绵羊季节性繁殖和产羔数的关联分析 被引量:3
10
作者 李春艳 狄冉 +8 位作者 张彦 任春环 张子军 刘秋月 胡文萍 王翔宇 张效生 张金龙 储明星 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2018年第12期36-40,共5页
为探究繁殖组织中SIX1基因的表达水平及其多态性与绵羊季节性繁殖和产羔数之间的关系,本实验通过实时荧光定量PCR(qPCR)研究SIX1基因在不同产羔数(单羔组和多羔组)小尾寒羊卵巢、子宫体、输卵管组织中的表达情况,同时利用Sequenom MassA... 为探究繁殖组织中SIX1基因的表达水平及其多态性与绵羊季节性繁殖和产羔数之间的关系,本实验通过实时荧光定量PCR(qPCR)研究SIX1基因在不同产羔数(单羔组和多羔组)小尾寒羊卵巢、子宫体、输卵管组织中的表达情况,同时利用Sequenom MassARRAY?SNP技术检测多羔品种(小尾寒羊、湖羊、策勒黑羊共560只)和单羔品种(滩羊、苏尼特羊、草地型藏羊共204只)中SIX1基因g.69738971 T>G的多态性,并与其中有产羔数记录的380只小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果表明:SIX1基因在小尾寒羊卵巢、子宫体、输卵管组织中均表达,且单羔组的子宫体中SIX1基因表达量显著高于多羔组(P<0.05);分型结果表明,SIX1基因g.69738971 T>G位点共存在TT、GT和GG 3种基因型,且基因型频率和等位基因频率在单、多羔品种(即高、低繁殖性能的母羊)间差异均极显著(P<0.01);卡方适合性检验表明,该位点在6个绵羊品种中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);该位点多态性与小尾寒羊第1、2及第3胎产羔数均显著相关(P<0.05),即野生型(TT)各胎产羔数均显著高于突变型(GT和GG)。综上,SIX1基因表达与绵羊繁殖有关,该基因表达水平与绵羊产羔数可能存在一定程度的负相关,其g.69738971 T>G位点可作为控制绵羊季节性繁殖和产羔数性状的一个潜在分子标记位点。 展开更多
关键词 绵羊 SIX1基因 表达 SNP分型 季节性繁殖 产羔数
下载PDF
猪PGRMC2基因启动子区多态性的生物信息学分析 被引量:2
11
作者 金娉婷 王爱国 +5 位作者 刘莉莉 叶健 蒋尧 王晓梅 张士媛 傅金銮 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2016年第11期15-19,共5页
本研究以大白猪的基因组DNA为模板,通过混池测序鉴定PGRMC2基因启动子区的多态位点(SNPs),以分析该基因启动子区突变前后转录因子结合位点和Cp G岛的变化。运用生物信息学软件预测其核心启动子区域、转录因子结合及Cp G岛。结果表明:在... 本研究以大白猪的基因组DNA为模板,通过混池测序鉴定PGRMC2基因启动子区的多态位点(SNPs),以分析该基因启动子区突变前后转录因子结合位点和Cp G岛的变化。运用生物信息学软件预测其核心启动子区域、转录因子结合及Cp G岛。结果表明:在220头大白猪个体中,检测到PGRMC2基因启动子区存在2个SNP位点,分别为C-1283 T和T-372 C。且这2个SNP均导致PGRMC2基因的转录因子结合发生改变。C-1283 T突变导致1个转录因子结合位点消失(即ASP-CYP21);T-372C突变导致1个转录因子结合位点消失(AP-1-DNA_polyme),9个新的转录因子结合位点产生(E1A-BS5、Trex/MEF3compo、E-box CS、Myo D-MCK-right、NFkappa E1site、NF-mu-E1CS、kappa-E2CS1、lambda5-site F、m TDT-site F等)。由此,推测SNPs可能对PGRMC2基因表达调控发挥重要作用。 展开更多
关键词 猪PGRMC2基因 SNP 转录因子结合位点预测 基因表达 产仔数
下载PDF
绵羊PER3基因组织表达及多态性与季节性繁殖的相关性研究 被引量:2
12
作者 向光明 刘秋月 +6 位作者 王翔宇 狄冉 胡文萍 马琳 曾宪垠 曹晓涵 储明星 《家畜生态学报》 北大核心 2020年第8期12-19,共8页
为了探究PER3基因的组织表达水平及其多态性与绵羊季节性繁殖的关系,为绵羊育种提供理论基础,该试验通过实时荧光定量PCR(qPCR)研究PER3基因在季节性发情的苏尼特羊和常年发情的小尾寒羊松果体、下丘脑、垂体、卵巢、输卵管以及子宫组... 为了探究PER3基因的组织表达水平及其多态性与绵羊季节性繁殖的关系,为绵羊育种提供理论基础,该试验通过实时荧光定量PCR(qPCR)研究PER3基因在季节性发情的苏尼特羊和常年发情的小尾寒羊松果体、下丘脑、垂体、卵巢、输卵管以及子宫组织中的表达情况,同时利用SequenomMassARRAY^■ SNP技术对季节性发情绵羊品种(草原型藏羊、苏尼特羊、滩羊共204只)和常年发情绵羊品种(小尾寒羊、湖羊、策勒黑羊共564只)PER3基因的13个SNPs进行分型检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果表明:PER3基因在绵羊的松果体、下丘脑、垂体、卵巢、输卵管以及子宫组织中均有表达,且其在季节性繁殖的苏尼特羊的表达均高于常年发情的小尾寒羊(卵巢组织除外),在松果体和子宫组织中达到显著差异水平(P<0.05);分型结果表明,在该实验室前期通过重测序得到的PER3基因13个SNPs中,g.43657503A>G、g.43670012T>C、g.43670807A>G、g.43677259T>C和g.43707227G>A 5个SNPs在季节性发情和常年发情绵羊品种之间的基因型频率、等位基因频率均达到显著差异水平(P<0.05);关联分析结果表明,PER3基因的13个SNPs与小尾寒羊产羔数并无显著关联(P>0.05)。该研究表明,PER3基因在松果体、下丘脑和垂体等繁殖相关组织的表达,在苏尼特羊中均高于小尾寒羊,暗示着较高水平的PER3的表达可能与绵羊的季节性发情调控有关。 展开更多
关键词 绵羊 PER3基因 组织表达 季节性发情 SNP分型 产羔数
下载PDF
猪DKK2基因的多态性与母猪产仔数性状的关联分析 被引量:2
13
作者 周佳伟 乔木 +4 位作者 吴俊静 王孝忠 刘贵生 梅书棋 彭先文 《湖北农业科学》 2020年第20期138-140,共3页
母猪的繁殖性状是猪重要经济性状之一,但由于其遗传力低,导致母猪繁殖性状常规选择进展缓慢。通过SANGER测序的方法检测DKK2基因内SNP位点,并与产仔数性状进行关联分析。结果表明,在DKK2基因第二内含子存在一个新SNP位点,根据SNP命名方... 母猪的繁殖性状是猪重要经济性状之一,但由于其遗传力低,导致母猪繁殖性状常规选择进展缓慢。通过SANGER测序的方法检测DKK2基因内SNP位点,并与产仔数性状进行关联分析。结果表明,在DKK2基因第二内含子存在一个新SNP位点,根据SNP命名方法将其命名为8:g.114967878A>G,且该SNP位点与产活仔数性状显著相关。猪DKK2基因的新SNP位点8:g.114967878A>G对猪的产活仔数性状存在潜在的调控作用。 展开更多
关键词 DKK2 SNP 产仔数
下载PDF
绵羊DIO2基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析 被引量:1
14
作者 安雪姣 赵生国 +5 位作者 潘章源 张仁森 田志龙 马琳 蔡原 储明星 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期134-142,共9页
[目的]本试验旨在探明Ⅱ型脱碘酶(DIO2)基因在常年发情的小尾寒羊和季节性发情的草地型藏羊中的表达模式,并探讨其多态性与绵羊季节性繁殖和产羔数之间的关系。[方法]通过荧光定量PCR(qPCR)检测DIO 2基因在不同品种绵羊的10种组织中的表... [目的]本试验旨在探明Ⅱ型脱碘酶(DIO2)基因在常年发情的小尾寒羊和季节性发情的草地型藏羊中的表达模式,并探讨其多态性与绵羊季节性繁殖和产羔数之间的关系。[方法]通过荧光定量PCR(qPCR)检测DIO 2基因在不同品种绵羊的10种组织中的表达,同时利用SNP技术对3个常年发情绵羊品种(小尾寒羊、策勒黑羊和湖羊)和3个季节性发情绵羊品种(滩羊、苏尼特羊和草地型藏羊)的DIO 2基因2个SNP位点多态性进行检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。[结果]qPCR结果显示,DIO2基因在小尾寒羊和草地型藏羊各组织中广泛表达,其中草地型藏羊下丘脑、垂体、卵巢、子宫和输卵管组织中的表达量显著高于小尾寒羊(P<0.05)。基因分型结果表明,绵羊DIO2基因g.88484603G>C位点基因型频率和等位基因频率在季节性发情和常年发情绵羊品种间差异均达到极显著水平(P<0.01)。群体遗传学分析表明,绵羊DIO 2基因g.88484594T>C位点在滩羊和策勒黑羊中表现为中度多态(0.25<PIC<0.5),在其他4个群体中均表现为低度多态(PIC<0.25);g.88484603G>C位点在这6个绵羊群体中均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5)。卡方适合性检验结果表明,g.88484594T>C位点在这6个群体中均处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05),g.88484603G>C位点在这6个绵羊品种中均处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05)。生物信息学分析表明,g.88484603G>C位点突变前、后的mRNA二级结构发生了改变,而且其最小结构自由能降低,结构稳定性增强,蛋白质二级结构没有发生变化,但三级结构有一些变化。关联分析表明,这2个SNP位点与小尾寒羊前3胎产羔数均无显著关联(P>0.05)。[结论]DIO 2基因与绵羊的季节性繁殖密切相关,其g.88484603G>C位点对绵羊季节性繁殖性状有一定的调控作用。 展开更多
关键词 绵羊 DIO 2基因 组织表达 SNP分型 季节性繁殖 产羔数
下载PDF
PER2基因组织表达及多态性与绵羊季节性繁殖的相关性研究 被引量:1
15
作者 向光明 刘秋月 +6 位作者 王翔宇 狄冉 胡文萍 马琳 曾宪垠 曹晓涵 储明星 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2019年第11期74-78,83,共6页
为探究PER2基因在绵羊繁殖相关组织中的表达水平及其多态性与绵羊繁殖性状的关系,本实验通过实时荧光定量PCR(qPCR)检测PER2基因在季节性发情的苏尼特羊和常年发情的小尾寒羊松果体、下丘脑、垂体、卵巢、输卵管以及子宫组织中的表达情... 为探究PER2基因在绵羊繁殖相关组织中的表达水平及其多态性与绵羊繁殖性状的关系,本实验通过实时荧光定量PCR(qPCR)检测PER2基因在季节性发情的苏尼特羊和常年发情的小尾寒羊松果体、下丘脑、垂体、卵巢、输卵管以及子宫组织中的表达情况,同时利用Sequenom MassARRAY■SNP技术检测季节性发情绵羊品种(草原型藏羊、苏尼特羊、滩羊共204只)和常年发情绵羊品种(小尾寒羊、湖羊、策勒黑羊共564只)PER2基因g.2852655T>C位点的多态性。结果表明:PER2基因在绵羊的松果体、下丘脑、垂体、卵巢、输卵管以及子宫组织中均有表达,且在季节性繁殖的苏尼特羊卵巢和子宫组织中的表达均显著高于常年发情小尾寒羊(P<0.05),而在输卵管组织中则相反(P<0.05);分型结果表明,PER2基因的g.2852655T>C位点存在3种基因型,该位点的基因型频率和等位基因频率在发情性状不同的绵羊品种之间具有显著差异。综上,PER2基因在季节性发情苏尼特羊卵巢组织中的表达量显著高于常年发情小尾寒羊,初步推测卵巢中较高水平PER2基因的表达通过抑制LHR受体的表达及孕酮的分泌,进而影响绵羊的季节性发情,且较高水平PER2基因表达可能在卵子受精和胚胎发育过程中也起到重要调控作用。 展开更多
关键词 绵羊 PER2基因 组织表达 季节性发情 SNP分型 产羔数
下载PDF
猪胚胎附植期Eph A4的组织表达及其多态性对产仔数的影响 被引量:4
16
作者 付言峰 王爱国 +5 位作者 李兰 傅金銮 方晓敏 王学敏 李碧侠 任守文 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期128-137,共10页
为研究Eph A4对猪繁殖性能的影响,在猪妊娠第13天(附植前期)、第18天(中期)和第24天(后期),用PCR-SSCP方法检测了7个品种的950头母猪群中Eph A4基因的多态性,检测了Eph A4基因在大白猪子宫内膜等组织中的mRNA和蛋白表达量,并与猪的产仔... 为研究Eph A4对猪繁殖性能的影响,在猪妊娠第13天(附植前期)、第18天(中期)和第24天(后期),用PCR-SSCP方法检测了7个品种的950头母猪群中Eph A4基因的多态性,检测了Eph A4基因在大白猪子宫内膜等组织中的mRNA和蛋白表达量,并与猪的产仔数进行了关联分析。结果表明:Eph A4基因在子宫内膜附着点的mRNA表达量要高于任何其他组织的,且妊娠第13、18和24天的表达量差异不显著,但妊娠猪极显著低于空怀猪的(P<0.01);Eph A4的蛋白表达量在附植前、中和后期的表达量两两间差异均显著(P<0.05),且妊娠第18天最高,妊娠第24天最低。Eph A4基因第3外显子上检测到了2个突变位点EphA4_1和EphA4_2。EphA4_1是一个A→G的突变,使谷氨酸变成了赖氨酸,G为优势等位基因,且GG基因型关联的产仔数显著高于AG或GG基因型的(P<0.05);EphA4_2是一个T→C的突变,C为优势等位基因,且CC基因型关联的产仔数显著高于TC或TT基因型的(P<0.05)。上述结果表明,Eph A4的表达对猪的胚胎附植发挥着一定的调控作用,EphA4_1位点GG基因型和EphA4_2位点CC基因型可以作为产仔数性状的标记基因型。 展开更多
关键词 EphA4 胚胎附植 表达 多态性 产仔数
原文传递
绵羊ESR2基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析 被引量:4
17
作者 田志龙 王玉琴 +6 位作者 刘秋月 王翔宇 狄冉 胡文萍 张效生 张金龙 储明星 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期553-560,共8页
为了探究雌激素受体2 (Estrogen receptor 2, ESR2)基因在绵羊各组织的表达及其多态性与产羔数之间的关系,本研究利用半定量PCR和实时荧光定量PCR技术检测ESR2基因在不同繁殖力小尾寒羊群体组织中的相对表达量,同时采用Sequenom MassAR... 为了探究雌激素受体2 (Estrogen receptor 2, ESR2)基因在绵羊各组织的表达及其多态性与产羔数之间的关系,本研究利用半定量PCR和实时荧光定量PCR技术检测ESR2基因在不同繁殖力小尾寒羊群体组织中的相对表达量,同时采用Sequenom MassARRAY誖SNP技术对多羔品种绵羊(小尾寒羊,湖羊,策勒黑羊)和单羔品种绵羊(苏尼特羊,草原型藏羊,滩羊) ESR2基因g.73324006C>T位点进行检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。半定量PCR表明,ESR2基因在单、多羔小尾寒羊子宫中高表达,在其它组织中等或低丰度表达;单羔群体、多羔群体间荧光定量PCR表明,ESR2基因在单羔小尾寒羊垂体表达量显著高于多羔小尾寒羊(p<0.05);群体遗传学分析表明,g.73324006C>T在小尾寒羊群体中表现为低度多态(PIC<0.25),在滩羊群体中处于中度多态(0.25<PIC<0.5);卡方检验表明:g.73324006C>T在小尾寒羊群体处于哈代温伯格平衡状态(p>0.05);关联分析表明,g.73324006C>T位点多态性与小尾寒羊第一胎、第二胎、第三胎产羔数及平均产羔数均显著关联(p<0.05),CC型各胎产羔数均高于TC型。与FecB (A746G)基因组合后发现,GG-CC和AG-CC基因型母羊产羔数显著高于AA-TC、AA-CC、AG-TC基因型组合(p<0.05)。综上,ESR2与小尾寒羊产羔数密切相关,g.73324006C>T可作为绵羊产羔性状选育的潜在分子标记。 展开更多
关键词 绵羊 ESR2基因 组织表达 SNP分型 产羔数
原文传递
香猪5个单核苷酸位点的多态性与产仔数的关联分析 被引量:1
18
作者 梅子凌 王洋 +5 位作者 刘畅 牛秋锦 谢玲玲 牛熙 王嘉福 冉雪琴 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1129-1136,共8页
为了寻找影响猪产仔数的功能基因,本研究选取5个候选SNP位点CASI0003452、DIAS0001380、ALGA0071919、MARC0052565和ALGA0045832,采用等位基因特异PCR方法对候选位点的多态性变化进行群体研究。结果表明:香猪群体中C^(452)位点以BB基因... 为了寻找影响猪产仔数的功能基因,本研究选取5个候选SNP位点CASI0003452、DIAS0001380、ALGA0071919、MARC0052565和ALGA0045832,采用等位基因特异PCR方法对候选位点的多态性变化进行群体研究。结果表明:香猪群体中C^(452)位点以BB基因型为主,低产群的B等位基因频率明显高于高产群(p<0.05),两个香猪群体的B等位基因频率明显高于大白猪(p<0.05)。D^(380)位点,两个香猪群的A等位基因频率低于于大白猪,且与乳头数呈弱的正相关;香猪和大白猪群体中A^(919)和M^(565)位点在香猪和大白猪群体中的基因型均为CC型,没有多态性;A^(832)位点两个香猪群A等位基因频率明显低于大白猪(p<0.05)。经测序证实D^(380)位点处于C1GALT1基因外显子1中,属于同义密码子突变(GCC→GCU),存在密码子偏好性,可能影响香猪C1GALT1基因的表达,可能与香猪的性早熟有关。C^(452)位于PDIA4基因内含子4中,已知PDIA4基因直接影响繁殖的主效基因ER的结构和功能,推测C^(452)位点的多态性有可能影响PDIA4蛋白的表达,进而干扰卵母细胞成熟、受精及胚胎的早期发育等生理过程。 展开更多
关键词 香猪 产仔数 单核苷酸多态性 C1GALT1基因 PDIA4基因
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部