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西藏尼玛县羊传染性脓疱病毒B2L和F1L基因的遗传进化分析
被引量:
2
1
作者
四朗玉珍
周群
+5 位作者
旦增卓嘎
杨夺
格桑卓嘎
富国文
樊月圆
吴玉江
《动物医学进展》
北大核心
2020年第5期74-78,共5页
为研究西藏尼玛县羊传染性脓疱病毒遗传进化现状,采集了西藏尼玛县内某养殖户中疑似患羊传染性脓疱的患羊唇部分泌物,采用病毒分离、PCR、基因克隆、测序等技术,将分离株的B2L、F1L和ORF020基因与GenBank公布的部分流行株相应序列进行...
为研究西藏尼玛县羊传染性脓疱病毒遗传进化现状,采集了西藏尼玛县内某养殖户中疑似患羊传染性脓疱的患羊唇部分泌物,采用病毒分离、PCR、基因克隆、测序等技术,将分离株的B2L、F1L和ORF020基因与GenBank公布的部分流行株相应序列进行对比分析。结果显示,B2L基因在核苷酸水平显示96.4%~98%的同源性,与吉林分离株(MG712417)的同源性最高,为98%,与广东分离株(KY053526)的亲缘关系最近,同源性为97.9%;F1L基因在核苷酸水平显示95.3%~97.5%的同源性,与陕西分离株(KJ139957)的亲缘关系最近,同源性为97.5%;ORF020基因在核苷酸水平显示95.1%~99.5%的同源性,与陕西分离株(KJ139958)亲缘关系最近,同源性为99.5%。基于B2L、F1L、ORF020遗传进化分析表明,CPDV在不同地理环境和宿主中存在基因差异,但总体表现出保守性,同时表明西藏尼玛县境内CPDV流行的复杂性,研究结果可为该地区CPDV防控等相关研究提供参考。
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关键词
羊传染性脓疱病毒
B2L基因
F1L基因
遗传进化
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职称材料
羊口疮病毒贵州株F1L基因克隆及生物信息学分析
被引量:
10
2
作者
刘嫒
杨钰
+4 位作者
鲜思美
刘宗胜
吴健
罗波
陈永翠
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2015年第1期53-60,共8页
为分析羊口疮病毒贵州株(ORFV-GZ株)F1L基因的分子特点,预测编码蛋白的生物学功能,本试验对ORFV-GZ株F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学相关软件及方法,对ORFV-GZ株F1L基因进行列分析并对其编码蛋白进行了二级结构、...
为分析羊口疮病毒贵州株(ORFV-GZ株)F1L基因的分子特点,预测编码蛋白的生物学功能,本试验对ORFV-GZ株F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学相关软件及方法,对ORFV-GZ株F1L基因进行列分析并对其编码蛋白进行了二级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽预测。结果显示,F1L基因PCR扩增产物大小为1 029bp,编码342个氨基酸;与OV-SA00株、NZ2株、OV-IA82株和D1701株相应序列核苷酸同源性分别为98.4%、97.9%、97.8%和96.8%,氨基酸的同源性分别为98.3%、97.6%、97.3%和95.3%;系统进化树显示,ORFV-GZ株F1L基因与FJ-GT株亲缘关系最近;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲所占比例较大,预测此蛋白可能存在7个B细胞优势抗原表位,两个跨膜区域,无信号肽区域。本试验结果将为贵州省ORFV免疫诊断及核酸疫苗研究提供理论依据。
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关键词
羊口疮病毒
F1L基因
克隆
生物信息学分析
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职称材料
口疮病毒XC13株的分离鉴定
被引量:
2
3
作者
邓宇
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期469-473,共5页
采用MDBK细胞对西昌市某山羊场疑似患有口疮的山羊病料进行分离培养,经动物回归试验、PCR、遗传进化分析等对分离毒株进行鉴定。结果表明,病料在MDBK细胞上产生致细胞病变;接种病料的山羊出现典型的传染性脓疱;PCR从分离毒株中扩增出F1...
采用MDBK细胞对西昌市某山羊场疑似患有口疮的山羊病料进行分离培养,经动物回归试验、PCR、遗传进化分析等对分离毒株进行鉴定。结果表明,病料在MDBK细胞上产生致细胞病变;接种病料的山羊出现典型的传染性脓疱;PCR从分离毒株中扩增出F1L基因片段,该基因片段序列与口疮病毒(ORFV)参考株FJ-SL2、FJ-SL1的核苷酸序列的同源性分别为99.8%、99.5%,亲缘关系较近,遗传进化分析处于同一分支上。本研究从疑似口疮病料中成功分离鉴定出1株口疮病毒,遂将其命名为ORFV XC13。
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关键词
口疮病毒
分离鉴定
F1L基因
原文传递
题名
西藏尼玛县羊传染性脓疱病毒B2L和F1L基因的遗传进化分析
被引量:
2
1
作者
四朗玉珍
周群
旦增卓嘎
杨夺
格桑卓嘎
富国文
樊月圆
吴玉江
机构
西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所
云南农业大学动物医学院
西藏自治区兽医生物药品制造厂
出处
《动物医学进展》
北大核心
2020年第5期74-78,共5页
基金
藏兽药抗羊传染性脓疱病研究与应用项目(XZ201801NB17)
西藏科技厅“十三五”重大科技专项(XZ201801NA03)
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-39-32)。
文摘
为研究西藏尼玛县羊传染性脓疱病毒遗传进化现状,采集了西藏尼玛县内某养殖户中疑似患羊传染性脓疱的患羊唇部分泌物,采用病毒分离、PCR、基因克隆、测序等技术,将分离株的B2L、F1L和ORF020基因与GenBank公布的部分流行株相应序列进行对比分析。结果显示,B2L基因在核苷酸水平显示96.4%~98%的同源性,与吉林分离株(MG712417)的同源性最高,为98%,与广东分离株(KY053526)的亲缘关系最近,同源性为97.9%;F1L基因在核苷酸水平显示95.3%~97.5%的同源性,与陕西分离株(KJ139957)的亲缘关系最近,同源性为97.5%;ORF020基因在核苷酸水平显示95.1%~99.5%的同源性,与陕西分离株(KJ139958)亲缘关系最近,同源性为99.5%。基于B2L、F1L、ORF020遗传进化分析表明,CPDV在不同地理环境和宿主中存在基因差异,但总体表现出保守性,同时表明西藏尼玛县境内CPDV流行的复杂性,研究结果可为该地区CPDV防控等相关研究提供参考。
关键词
羊传染性脓疱病毒
B2L基因
F1L基因
遗传进化
Keywords
Contagious pustular dermatitis virus
B2Lgene
f1lgene
genetic evolution
分类号
S852.659.1 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
羊口疮病毒贵州株F1L基因克隆及生物信息学分析
被引量:
10
2
作者
刘嫒
杨钰
鲜思美
刘宗胜
吴健
罗波
陈永翠
机构
贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室
贵州大学动物科学学院
毕节市动物产品质量安全监督检验所
毕节市七星关区农牧局草地中心
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2015年第1期53-60,共8页
基金
贵州省科学技术基金项目[黔科合J字(2010)2260]
贵州省科学技术基金项目[黔科合LH字(2014)7667]
+2 种基金
毕节市科技局项目:贵州黑山羊羔羊口疮病防治技术攻关[毕科合字(2012)24号]
贵州大学"SRT计划"项目(贵大SRT字[2012]075号)
贵州大学2014年大学生创新创业训练计划项目[2014(016)]
文摘
为分析羊口疮病毒贵州株(ORFV-GZ株)F1L基因的分子特点,预测编码蛋白的生物学功能,本试验对ORFV-GZ株F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学相关软件及方法,对ORFV-GZ株F1L基因进行列分析并对其编码蛋白进行了二级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽预测。结果显示,F1L基因PCR扩增产物大小为1 029bp,编码342个氨基酸;与OV-SA00株、NZ2株、OV-IA82株和D1701株相应序列核苷酸同源性分别为98.4%、97.9%、97.8%和96.8%,氨基酸的同源性分别为98.3%、97.6%、97.3%和95.3%;系统进化树显示,ORFV-GZ株F1L基因与FJ-GT株亲缘关系最近;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲所占比例较大,预测此蛋白可能存在7个B细胞优势抗原表位,两个跨膜区域,无信号肽区域。本试验结果将为贵州省ORFV免疫诊断及核酸疫苗研究提供理论依据。
关键词
羊口疮病毒
F1L基因
克隆
生物信息学分析
Keywords
Orf virus(ORFV)
f1lgene
clone
bioinformatics analysis
分类号
S858.26 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
口疮病毒XC13株的分离鉴定
被引量:
2
3
作者
邓宇
机构
西昌学院动物科学学院
出处
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期469-473,共5页
基金
西昌学院博士基金项目(13BQZ05)
攀西动物疫病检测与防控四川省高校重点实验室基本科研业务经费项目(纵341B)
文摘
采用MDBK细胞对西昌市某山羊场疑似患有口疮的山羊病料进行分离培养,经动物回归试验、PCR、遗传进化分析等对分离毒株进行鉴定。结果表明,病料在MDBK细胞上产生致细胞病变;接种病料的山羊出现典型的传染性脓疱;PCR从分离毒株中扩增出F1L基因片段,该基因片段序列与口疮病毒(ORFV)参考株FJ-SL2、FJ-SL1的核苷酸序列的同源性分别为99.8%、99.5%,亲缘关系较近,遗传进化分析处于同一分支上。本研究从疑似口疮病料中成功分离鉴定出1株口疮病毒,遂将其命名为ORFV XC13。
关键词
口疮病毒
分离鉴定
F1L基因
Keywords
orf virus
isolation and identification
f1lgene
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西藏尼玛县羊传染性脓疱病毒B2L和F1L基因的遗传进化分析
四朗玉珍
周群
旦增卓嘎
杨夺
格桑卓嘎
富国文
樊月圆
吴玉江
《动物医学进展》
北大核心
2020
2
下载PDF
职称材料
2
羊口疮病毒贵州株F1L基因克隆及生物信息学分析
刘嫒
杨钰
鲜思美
刘宗胜
吴健
罗波
陈永翠
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2015
10
下载PDF
职称材料
3
口疮病毒XC13株的分离鉴定
邓宇
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
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