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Associations of Single Nucleotide Polymorphisms in the Bovine <i>FADS</i>6 Gene with Fatty Acid Composition in Hanwoo (Korean Cattle)
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作者 Krishnamoorthy Srikanth Anam Kwan +3 位作者 Eunjin Lee Seonkwan Kim Youngjo Lim Hoyoung Chung 《Open Journal of Genetics》 2015年第4期137-144,共8页
The bovine fatty acid desaturase (FADS) gene cluster consists of FADS1, FADS2, FADS3, and FADS6, which acts as key enzymes in fatty acid metabolism. Of these, the genetics effects of variants in FADS1, FADS2 and FADS3... The bovine fatty acid desaturase (FADS) gene cluster consists of FADS1, FADS2, FADS3, and FADS6, which acts as key enzymes in fatty acid metabolism. Of these, the genetics effects of variants in FADS1, FADS2 and FADS3 have been previously studied. However, the genetic effects of variants of FADS6 gene have not been studied. The aim of this study was to identify genetic variants in the bovine fatty acid desaturase 6 (FADS6) gene and study their association with fatty acid composition in Hanwoo cattle. Six genetic variants were observed, three each in intron 2 and exon 6 by DNA sequencing analyses. The association of genetic variants with fatty acid composition was evaluated in 90 Hanwoo steers. The variants were confirmed and the animals were genotyped by RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) and AS-PCR (Allele Specific PCR) analyses. The analysis revealed that palmitoleic acid (C16:1n7) was associated with g.3391G > A, g.3660A > C and g.15657C > T, and stearic acid (C18:0) showed highly significant association with g.3660A > C segments. Both g.3391G > A, g.3660A > C also had strong additive and dominance effect for Palmitoleic acid, while g.3660A > C also had a strong dominance effect for stearic acid. These results could be useful for modulating fatty acid composition in beef and produce meat with higher monounsaturated fatty acid to saturated fatty acid ratio (MUFA/SFA), which had been shown to have positive health effect in humans. 展开更多
关键词 Fatty Acid Composition BEEF fads6 Genetic Association SNP
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亚麻籽油和豆油替代鱼油对大黄鱼肝脏和肌肉脂肪酸组成及Δ6Fad基因表达的影响 被引量:9
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作者 李经奇 李学山 +3 位作者 姬仁磊 徐玮 康森艾 艾庆辉 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期232-239,共8页
为了研究亚麻籽油(LO)和豆油(SO)完全替代鱼油(FO)对大黄鱼(Larimichthys crocea)肝脏和肌肉脂肪酸组成及Δ6Fad(Δ6 Fatty acid desaturase)基因表达的影响。实验用豆油和亚麻籽油替代鱼油制备了3种等氮等脂的精制饲料,在海水浮动网箱... 为了研究亚麻籽油(LO)和豆油(SO)完全替代鱼油(FO)对大黄鱼(Larimichthys crocea)肝脏和肌肉脂肪酸组成及Δ6Fad(Δ6 Fatty acid desaturase)基因表达的影响。实验用豆油和亚麻籽油替代鱼油制备了3种等氮等脂的精制饲料,在海水浮动网箱中进行了为期10周的养殖实验。实验结果表明:(1)鱼油组的增重率、饲料效率和特定生长率均显著高于亚麻籽油组和豆油组(P<0.05),但对成活率,肝体指数和脏体指数没有显著影响(P>0.05);(2)亚麻籽油和豆油完全替代鱼油显著改变了鱼体肝脏和肌肉的脂肪酸组成,降低了肝脏和肌肉LCPUFA(Long chain-polyunsaturated fatty acid)的相对含量(P<0.05),在亚麻籽油组(LO)和豆油组(SO)中没有显著差异(P>0.05),在各处理组中,肌肉的n-3LC-PUFA的相对含量显著高于肝脏(P<0.05);(3)亚麻籽油和豆油显著上调了肌肉和肝脏中Δ6Fad基因的表达量(P<0.05),其表达量在肝脏中分别升高了7.6和6.5倍,在肌肉中分别上升了2.2和2.8倍。结果表明,在实验条件下亚麻籽油和豆油完全替代鱼油对大黄鱼生长具有不利影响,亚麻籽油和豆油替代鱼油降低了肝脏和肌肉中LC-PUFA的含量,提高了Δ6Fad基因的表达量。 展开更多
关键词 大黄鱼 A6Fad 脂肪酸 亚麻籽油 豆油
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低温和摄食对虹鳟脂肪酸合成基因表达的影响 被引量:2
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作者 刘骋跃 周演根 +2 位作者 孙大江 高勤峰 董双林 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期63-71,共9页
通过分析低温和摄食对虹鳟(Oncorhynchus mykiss)脂肪酸生物合成相关基因表达的影响,探究其低温适应机制,为虹鳟的成功越冬提供一定的理论依据。本实验设定了正常温度摄食组(NF)、正常温度不摄食组(NU)、低温摄食组(CF)和低温不摄食组(C... 通过分析低温和摄食对虹鳟(Oncorhynchus mykiss)脂肪酸生物合成相关基因表达的影响,探究其低温适应机制,为虹鳟的成功越冬提供一定的理论依据。本实验设定了正常温度摄食组(NF)、正常温度不摄食组(NU)、低温摄食组(CF)和低温不摄食组(CU)4个实验处理,分别测定了虹鳟肝脏和肌肉在1、3、5、7和14d时硬脂酰辅酶A去饱和酶(Stearoyl-Coenzyme A desaturase,SCD)、Δ6-去饱和酶(Δ6fatty acid desaturase,Δ6Fad)和延长酶2(Elongation of very long chain fatty acids like 2,Elovel2)3个基因的相对表达水平。实验表明:摄食显著影响虹鳟肝脏对脂肪酸的生物合成,在营养供给充足的情况下,主要通过脱酰和重酰化作用(替代作用)来满足机体对单一不饱和脂肪酸(Monounsaturated fatty acid,MUFA)和多不饱和脂肪酸(Polyunsaturated fatty acid,PUFA)的需求;在营养供给不足时,可以通过相关脂肪酸生物合成通路合成MUFA和PUFA。虹鳟肌肉中有大量脂肪沉积,因而短时间的不摄食对其影响较小。当周围环境温度降低时,SCD、Δ6Fad和Elovel2三个基因的表达量均显著上升,表明虹鳟为了适应低温,生物膜磷脂脂肪酸中不饱和脂肪酸的比例上升,虹鳟肝脏和肌肉中MUFA和PUFA生物合成量增加。此外,虹鳟肝脏SCD mRNA的表达量在CF组较低,这可能是因为摄食可以在一定程度上补充MUFA。虹鳟在正常营养条件下,大约在5~7d可适应低温;在长时间的饥饿和低温胁迫下,虹鳟机体内的脂肪酸生物合成会受到影响。 展开更多
关键词 虹鳟 温度 摄食 肌肉 肝脏 SCD Δ6Fad Elovel2
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杜氏盐藻DsFAD2基因的鉴定及缺氮胁迫下表达分析 被引量:2
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作者 宋亚楠 安茜 +4 位作者 岳敏 赵熙宁 刘宝玲 薛金爱 李润植 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第3期23-29,共7页
[目的]w-6脂肪酸去饱和酶2(FAD2)催化油酸(18∶1)去饱和形成亚油酸(18∶2),是多不饱和脂肪酸合成过程中的第一个关键酶。为了探究DsFAD2在盐藻油脂合成积累中的作用。[方法]本文以运城盐湖分离的富油杜氏盐藻(Dunaliella salina)株系(YC... [目的]w-6脂肪酸去饱和酶2(FAD2)催化油酸(18∶1)去饱和形成亚油酸(18∶2),是多不饱和脂肪酸合成过程中的第一个关键酶。为了探究DsFAD2在盐藻油脂合成积累中的作用。[方法]本文以运城盐湖分离的富油杜氏盐藻(Dunaliella salina)株系(YC-011)为材料,利用高保真PCR技术克隆盐藻DsFAD2基因,并对DsFAD2编码蛋白进行了跨膜区、高级结构及氨基酸序列比对等一系列生物信息学分析。应用qRT-PCR检测DsFAD2基因在氮(N)胁迫培养条件下的表达模式。[结果]DsFAD2蛋白定位于内质网中,有5个跨膜区,具有典型膜结合蛋白的结构特征。此外,DsFAD2也具有所有FAD2蛋白家族所特有的3个组氨酸保守区和芳香族氨基酸序列。系统发育分析发现杜氏盐藻DsFAD2与莱茵衣藻CrFAD2、团藻VcFAD2亲缘关系最近。qRT-PCR表明,与正常培养的杜氏盐藻相比,缺N培养显著诱导DsFAD2上调表达,N胁迫8d时DsFAD2的表达量是未胁迫对照的2.8倍。[结论]DsFAD2参与杜氏盐藻N胁迫响应,促进多不饱和脂肪酸形成,增强藻细胞抗逆性。本研究为进一步解析N胁迫条件下藻细胞油脂富集及响应分子机制提供了科学参考。 展开更多
关键词 杜氏盐藻(Dunaliella salina) ω-6脂肪酸去饱和酶2(FAD2) 不饱和脂肪酸 缺氮胁迫
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黄斑蓝子鱼Δ6Δ5 Fads2蛋白重组表达和多克隆抗体的制备
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作者 陈翠英 程宇 +5 位作者 王懿 范春兰 钟文杰 陈创思 李远友 王树启 《汕头大学学报(自然科学版)》 2022年第3期50-57,共8页
黄斑蓝子鱼(Siganus canaliculatus)是首个被发现具有长链多不饱和脂肪酸(LC-PUFA)合成能力的海水鱼类,而脂肪酸去饱和酶(Fads2)是内源性合成LC-PUFA的关键限速酶.为深入研究鱼类Δ6Δ5 Fads2的生物学功能及其表达调控机制,本研究选取... 黄斑蓝子鱼(Siganus canaliculatus)是首个被发现具有长链多不饱和脂肪酸(LC-PUFA)合成能力的海水鱼类,而脂肪酸去饱和酶(Fads2)是内源性合成LC-PUFA的关键限速酶.为深入研究鱼类Δ6Δ5 Fads2的生物学功能及其表达调控机制,本研究选取黄斑蓝子鱼Δ6Δ5 fads2基因的编码区序列长255 bp,通过限制性内切酶EcoR I和BamH I双酶切,将其插入质粒pGEX-6p-1,获得Δ6Δ5 fads2基因的重组表达载体,经IPTG诱导表达获得大量重组表达蛋白.以纯化后的Δ6Δ5 Fads2重组蛋白为抗原注射免疫KM小鼠后提取血清,并进行Western blot鉴定产生多克隆抗体的特异性.结果表明,本研究成功构建了pGEX-6p-1-Δ6Δ5 Fads2原核表达载体,表达纯化后获得大小约35.4 ku的Δ6Δ5 Fads2重组表达蛋白,利用KM小鼠得到的多克隆抗体特异性好,其效价约为1∶3.2×104.该抗体可为深入研究鱼类Δ6Δ5 Fads2的生物学功能及其表达调控机制提供基础条件,从而有助于研发提高鱼体内源性LC-PUFA合成能力的方法,降低养殖鱼类饲料中鱼油添加比例,促进养殖业的健康发展. 展开更多
关键词 黄斑蓝子鱼 Δ6Δ5 Fads2 诱导表达与纯化 多克隆抗体 Western blot
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马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)Pm-Δ6FAD基因的克隆及其对温度胁迫的响应
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作者 刘雅 郑哲 +3 位作者 王庆恒 焦钰 李利二 杜晓东 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期4244-4252,共9页
本实验利用RACE技术克隆获得了马氏珠母贝Δ6-脂肪酸去饱和酶(Pm-Δ6FAD)基因,并对其进行生物信息学分析,同时采用荧光定量PCR技术分析了该基因在不同组织的表达模式及不同温度下的时序表达模式。序列分析表明,Pm-Δ6FAD c DNA序列全... 本实验利用RACE技术克隆获得了马氏珠母贝Δ6-脂肪酸去饱和酶(Pm-Δ6FAD)基因,并对其进行生物信息学分析,同时采用荧光定量PCR技术分析了该基因在不同组织的表达模式及不同温度下的时序表达模式。序列分析表明,Pm-Δ6FAD c DNA序列全长为1 491 bp,其中开放式阅读框1 125 bp,5'UTR 225 bp,3'UTR 141 bp,编码374个氨基酸,理论蛋白分子量为42.72 kD,理论等电点为8.27。SMART软件分析显示Pm-Δ6FAD蛋白具有Δ6FAD典型的脂肪酸去饱和酶结构域FA_desaturase,以及3个组氨酸簇和6个跨膜区。多序列比对结果表明Pm-Δ6FAD与虾夷扇贝Δ6FAD同源性最高,为63%;系统进化分析发现,Pm-Δ6FAD与软体动物聚为一支。组织表达定量分析结果显示,Pm-Δ6FAD在马氏珠母贝多个组织中均有表达,在性腺中表达量最高;对不同温度下鳃组织中Pm-Δ6FAD的时序表达分析发现,在处理后各时间点低温组(17℃)基因表达水平最高,且均显著高于高温组(32℃)。以上结果表明Pm-Δ6FAD可能参与马氏珠母贝的低温胁迫响应。该研究为进一步探索Pm-Δ6FAD在马氏珠母贝在温度适应性中的作用提供了基础资料。 展开更多
关键词 马氏珠母贝 温度适应 Pm-Δ6FAD 基因克隆 表达分析
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