鼻咽癌癌变前后ADAM23、MIMT1、FAM150B、GRIN2A、LRRC4甲基化研究

目的:研究鼻咽癌变前后ADAM23、MIMT1、FAM150B、GRIN2A、LRRC4甲基化特征。方法:12例鼻咽癌10例鼻咽炎作为研究对象,抽提鼻咽组织DNA,以特异识别5-甲基胞嘧啶的抗体免疫沉淀DNA,实时荧光定量PCR分别检测5个基因含量,并设置不用5-甲基胞嘧啶抗体(非MeDIP-qPCR实验)及使用非特异性抗体IgG进行免疫沉淀作为双重对照。结果:无论鼻咽癌还是鼻咽炎患者,5个基因在使用非特异性抗体IgG实验时均未检验到甲基化,非MeDIP-qPCR实验显示5个基因在鼻咽癌及鼻咽炎荧光定量值无明显差异(P>0.05);MeDIP-qPCR实验显示,鼻咽癌5个基因均呈现明显的甲基化,ADAM23、MIMT1、FAM150B、GRIN2A、LRRC45在鼻咽癌校正值分别为:3.39±2.28、6.03±3.93、3.68±1.81、7.12±3.17、3.10±1.94,在鼻咽炎分别为0.00±0.00、0.01±0.01、0.25±0.49、0.20±0.20、0.00±0.00(均P<0.01)。结论:ADAM23、MIMT1、FAM150B、GRIN2A、LRRC4 5个基因甲基化为鼻咽癌变的重要特征。

FAM150B甲基化致低表达与鼻咽癌气虚癌变研究

目的:采用甲基化芯片及免疫组化研究FAM150B甲基化及其蛋白的表达。方法:3例鼻咽癌发病前后配对患者,采用甲基化芯片技术检测FAM150B甲基化,随机选择100例患者,包括鼻咽癌和鼻咽炎各50例及气虚质44例和正常质56例。采用免疫组化方法检测FAM150B蛋白的表达。结果:FAM150B在鼻咽癌为高甲基化,FAM150B蛋白在鼻咽炎为高表达,在鼻咽癌为低表达,其表达值分别为(0.995±0.511,0.257±0.392);FAM150B蛋白在正常质为高表达,在气虚质为低表达,其表达值分别为(0.765±0.615,0.449±0.498)。结论:FAM150B甲基化致其低表达为鼻咽癌及气虚质的特征,FAM150B为鼻咽癌气虚癌变的分子指标。

卵巢癌发生发展关键基因的生物信息学筛选

目的筛选影响卵巢癌发生发展的关键基因,并分析其作用机制。方法利用高通量基因表达(GEO)数据库、癌症基因图谱(TCGA)数据库及KMplot数据库筛选卵巢癌关键基因,分析其与患者临床病理学特征的关系,同时使用GESA进行信号通路聚类分析,并使用TIMER数据库确定与之密切相关的基因,通过STRING数据库绘制互作网络图,预测其作用机制。结果通过筛选共得到13个差异基因,其中ARX和FAM150B与患者预后有关,且其表达量越低,患者总生存期越短(P<0.01)。进一步分析发现ARX和FAM150B的表达量还与IL-6、PIK3R2、PIK3CD、VAV1、PIK3CA、RAC2、PIK3R1及MAPK1的表达量相关(P<0.05)。使用STRING数据库分析发现ARX和FAM150B通过TUBA1A、EGFR、PLXNA2对以上基因进行调控。结论ARX和FAM150B在卵巢癌组织中呈低表达状态,它们的表达量和患者的预后密切相关。ARX和FAM150B可对一系列基因进行调控,从而减弱机体的抗肿瘤免疫反应,促进卵巢癌的发生发展。