FAM25A在胰腺癌中临床价值及潜在机制的生物信息学分析

目的:通过生物信息学方法,探究FAM25A对胰腺癌的诊断、预后价值,分析其与免疫浸润相关性,并对该基因在胰腺癌中发生发展的潜在作用机制进行阐述。方法:从TCGA、GTEx和GEO数据库获取胰腺癌数据集,Rstudio用于数据分析和可视化。明确FAM25A的表达差异,采用K-M分析FAM25A的表达与胰腺癌总生存时间的关系,Cox回归分析FAM25A表达与胰腺癌预后因素的相关性,分析FAM25A表达与免疫细胞浸润的相关性。根据WGCNA将与FAM25A和肿瘤纯度最相关的模块基因导入STRING构建PPI网络并获取GO和KEGG,采用GSEA分析FAM25A高低表达的富集通路,利用Cytoscape中MOCDE聚类子网络获取显著相关的节点,综合以上信息分析FAM25A在胰腺癌中的潜在机制。结果:差异分析提示FAM25A在胰腺癌中高表达具有统计学意义(P<0.01);K-M分析结果显示FAM25A高表达患者的生存期明显短于低表达患者;对胰腺癌预后相关因素进行Cox回归分析,结果提示FAM25A为胰腺癌的独立危险因素(HR=2.4,95%CI=1.614-3.592);免疫细胞浸润相关性分析显示FAM25A可以降低T淋巴细胞水平;GO、KEGG、GSEA和MCODE结果表明FAM25A主要在细胞与细胞间相互作用、细胞间信号产生与转导、趋化因子及免疫反应等相关途径中发挥作用。结论:FAM25A在胰腺癌中过表达是胰腺癌一个独立的不良预后因子,FAM25A异常表达可以作为胰腺癌诊断和判断预后的生物标志物,其生物学效应可能是通过促进胰腺癌的增殖、侵袭和转移实现的。