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基于多数据库分析肝细胞癌组织FAM49B基因水平及其临床意义
被引量:
1
1
作者
崔喆
徐兰
《实用肝脏病杂志》
CAS
2020年第3期413-418,共6页
目的利用多数据库分析肝细胞癌(HCC)组织FAM49B基因水平及其临床意义。方法利用Oncomine和GEPIA数据库分析HCC组织与正常肝组织FAM49B基因水平,从TCGA获取临床病例资料,应用SPSS 21.0软件统计分析不同临床和病理学特征的HCC组织FAM49B...
目的利用多数据库分析肝细胞癌(HCC)组织FAM49B基因水平及其临床意义。方法利用Oncomine和GEPIA数据库分析HCC组织与正常肝组织FAM49B基因水平,从TCGA获取临床病例资料,应用SPSS 21.0软件统计分析不同临床和病理学特征的HCC组织FAM49B基因水平的异同。自Kaplan Meier Plotter数据库分析不同FAM49B基因水平的HCC患者预后的异同,自MethHC数据库分析FAM49B启动子区甲基化水平,利用String数据库分析与FAM49B相互作用的蛋白网络,采用基因集富集分析(GSEA)预测FAM49B在HCC发病过程中可能的信号调控通路。结果对Oncomine和GEPIA数据库分析显示HCC组织FAM49B基因水平显著高于正常肝组织(P均<0.01);不同性别(P=0.001)、有无肝硬化(P=0.003)、不同肿瘤分化程度(P=0.004)的HCC组织FAM49B基因水平显著不同,而不同年龄、肿瘤大小、病理学分期、甲胎蛋白水平和有无脉管侵犯者无显著性差异(P均>0.05);与FAM49B低水平患者比,FAM49B高水平患者总体生存期显著缩短,具有统计学意义(HR=1.8,P=0.0012);与正常肝组织相比,HCC组织FAM49B启动子区甲基化水平显著降低(P<0.005);与FAM49B相互作用的蛋白有SERPINA1、ISLR和FERMT3;在FAM49B mRNA高水平组织富集到细胞凋亡、细胞周期、调节自噬和P53信号通路等相关基因集(P均<0.05)。结论FAM49B在HCC组织呈高水平,其基因水平与HCC恶性程度和患者不良预后相关,可能作为癌基因在HCC发生发展过程中发挥作用,有望成为HCC诊断及预后评估的新靶点。
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关键词
肝细胞癌
fam49b
数据库
癌基因
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职称材料
题名
基于多数据库分析肝细胞癌组织FAM49B基因水平及其临床意义
被引量:
1
1
作者
崔喆
徐兰
机构
中国医科大学肿瘤医院/辽宁省肿瘤医院检验科
出处
《实用肝脏病杂志》
CAS
2020年第3期413-418,共6页
文摘
目的利用多数据库分析肝细胞癌(HCC)组织FAM49B基因水平及其临床意义。方法利用Oncomine和GEPIA数据库分析HCC组织与正常肝组织FAM49B基因水平,从TCGA获取临床病例资料,应用SPSS 21.0软件统计分析不同临床和病理学特征的HCC组织FAM49B基因水平的异同。自Kaplan Meier Plotter数据库分析不同FAM49B基因水平的HCC患者预后的异同,自MethHC数据库分析FAM49B启动子区甲基化水平,利用String数据库分析与FAM49B相互作用的蛋白网络,采用基因集富集分析(GSEA)预测FAM49B在HCC发病过程中可能的信号调控通路。结果对Oncomine和GEPIA数据库分析显示HCC组织FAM49B基因水平显著高于正常肝组织(P均<0.01);不同性别(P=0.001)、有无肝硬化(P=0.003)、不同肿瘤分化程度(P=0.004)的HCC组织FAM49B基因水平显著不同,而不同年龄、肿瘤大小、病理学分期、甲胎蛋白水平和有无脉管侵犯者无显著性差异(P均>0.05);与FAM49B低水平患者比,FAM49B高水平患者总体生存期显著缩短,具有统计学意义(HR=1.8,P=0.0012);与正常肝组织相比,HCC组织FAM49B启动子区甲基化水平显著降低(P<0.005);与FAM49B相互作用的蛋白有SERPINA1、ISLR和FERMT3;在FAM49B mRNA高水平组织富集到细胞凋亡、细胞周期、调节自噬和P53信号通路等相关基因集(P均<0.05)。结论FAM49B在HCC组织呈高水平,其基因水平与HCC恶性程度和患者不良预后相关,可能作为癌基因在HCC发生发展过程中发挥作用,有望成为HCC诊断及预后评估的新靶点。
关键词
肝细胞癌
fam49b
数据库
癌基因
Keywords
Hepatocellular carcinoma
Family with sequence similarity 49 member B
Data mining
Oncogene
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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作者
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1
基于多数据库分析肝细胞癌组织FAM49B基因水平及其临床意义
崔喆
徐兰
《实用肝脏病杂志》
CAS
2020
1
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