油桐VfFATB1基因的克隆及其功能的初步分析

以油桐转录组数据中FATB1基因的cDNA片段为模板,通过RACE技术克隆获得该基因的CDS,命名为Vf FATB1,并进行了生物信息学分析,同时通过Real-time PCR和亚细胞定位对该基因的表达模式和表达部位进行了研究分析。结果表明Vf FATB1是一个由8个α-螺旋和10个β-折叠组成"hot-dog"折叠结构的二聚体,与JcFATB1相似度高达92%;该基因有FAT重要催化作用的半胱氨酸活性位点Cys320和3个保守的组氨酸位点His140/285/345;该基因在油脂合成后期种仁中的表达量最高,是幼根的30倍左右,且在油脂合成过程中一直是上调状态;该基因定位于叶绿体中。综上所述,Vf FATB1是一个位于叶绿体中且含有多个催化功能结构的蛋白,表达模式与油脂积累相同,因此它可能与油脂合成有着密切的关系,这为油桐的遗传改良提供了潜在的基因资源。