基于生物信息学分析FBXO45蛋白在胰腺导管腺癌中的表达及其临床意义

目的探讨FBXO45蛋白变异对胰腺导管腺癌预后的影响,FBXO45蛋白参与胰腺导管腺癌发生发展的可能作用机制。方法GEPIA数据库在线分析FBXO45 mRNA在不同肿瘤中的表达,UALCAN在线分析FBXO45 mRNA在胰腺导管腺癌中与正常胰腺组织中的表达差异,进一步GEPIA数据库扩大正常胰腺组织对比标本数目,分析FBXO45 mRNA在胰腺导管腺癌中与正常胰腺组织中的表达差异,分析FBXO45基因表达与胰腺导管腺癌患者无病生存期(Disease-free survival,DFS、总生存期(Overall Survival,OS)的关系。Human Protein Atlas数据库中确定FBXO45蛋白在细胞中的定位表达,并检索FBXO45蛋白在胰腺导管腺癌与正常胰腺组织中的表达差异,分析FBXO45蛋白的表达与胰腺导管腺癌患者生存的关系。在cBioPortal数据库中检索FBXO45基因在胰腺癌中的改变,并分析FBXO45基因变异与胰腺导管腺癌预后的关系。从String数据库中分析FBXO45蛋白在信号转导中关系密切的蛋白网络,探讨可能的作用机制。结果GEPIA数据库在线分析FBXO45 mRNA在24种恶性肿瘤中的表达不同,胰腺导管腺癌组织FBXO45基因的表达明显高于正常胰腺组织(P<0.05),FBXO45 mRNA表达水平与胰腺癌患者的无病生存期(DFS)、总生存期(OS)显著相关(P<0.05)。Human Protein Atlas数据库分析结果显示,FBXO45蛋白主要表达于细胞的细胞质中,FBXO45蛋白在胰腺癌组织中显著表达增高(P<0.05),通过生存分析进一步证明高表达FBXO45蛋白的胰腺导管腺癌患者总生存期较差(P<0.05)。在cBioPortal数据库中分析显4%(7/175)的胰腺导管腺癌患者表现出FBXO45基因改变,FBXO45基因变异的患者总生存预后较差(P<0.05)。String数据库显示在PPI网络中与FBXO45蛋白相互作用的蛋白有MYCBP2、TP73、SKP1、CUL1、SPRYD3、KCTD6、MAP3K12、MPP3、UNC13A、UNC13B等。结论FBXO45蛋白在胰腺癌组织中呈现高表达,与患者预后显著相关。FBXO45基因变异的患者总生存预后较差。FBXO45基因变异的患者总生存预后较差,与FBXO45相互作用比较密切的前3位蛋白有MYCBP2、TP73、SKP1,FBXO45蛋白参与蛋白质泛素化途径,是蛋白质修饰的一部分,推测FBXO45通过基因变异、促进蛋白泛素化,在胰腺癌的发生发展中起重要作用,影响其预后。

胃癌组织中FBXO45和SKP1蛋白表达及其临床预后意义

为了探讨胃癌组织中FBXO45与S期激酶相关蛋白1(SKP1)蛋白表达及其临床预后意义,选取2013年5月至2014年5月该院进行胃癌手术的60例患者作为研究对象。收集其癌组织标本及对应的癌旁组织标本,并采用免疫组化染色法检测其中FBXO45与SKP1蛋白的表达水平,采用χ^2检验分析FBXO45与SKP1表达情况与胃癌临床病理特征的关系,多因素Cox回归分析探讨FBXO45与SKP1表达情况与预后的相关性。胃癌组织FBXO45、SKP1阳性表达率分别为33.33%,65.00%;癌旁组织FBXO45、SKP1阳性表达率分别为68.33%,30.00%,胃癌组织与癌旁组织中FBXO45、SKP1阳性表达比较存在明显差异(P<0.05)。TNMⅢ~Ⅳ期、低分化、出现淋巴结转移患者的FBXO45阴性表达率、SKP1阳性表达率均上升(P<0.05)。经单因素分析得出:TNMⅢ~Ⅳ期、低分化、出现淋巴结转移、FBXO45阴性表达、SKP1阳性表达的胃腺癌患者生存时间均显著缩短(P<0.05)。经多因素分析显示:TNMⅢ~Ⅳ期(HR=3.50,95%CI:2.32~5.29)、淋巴结转移(HR=3.13,95%CI:2.16~4.54)、肿瘤低分化(HR=3.76,95%CI:2.47~5.72)、FBXO45阴性表达(HR=2.69,95%CI:1.99~3.64)、SKP1阳性表达(HR=4.11,95%CI:2.51~6.74)均为影响胃癌预后的独立危险因素(P<0.05)。FBXO45在胃癌组织中表达水平降低,而SKP1表达在胃癌组织中表达水平升高,FBXO45表达阴性与SKP1表达阳性均为胃腺癌患者预后危险因素,二者可作为判断胃癌预后的生物标志物。