FCHSD2:肺鳞状细胞癌潜在的预后生物标志物

目的:探讨Fer/Cip4同源性(Fer/Cip4 homology,FCH)和双Src同源性3(Src homology 3,SH3)结构域2(FCH and double SH3 domains 2,FCHSD2)在肺鳞状细胞癌(squamous cell lung cancer,LUSC)中的表达情况,并分析其与患者预后的关系。方法:采用肿瘤免疫评估资源2(Tumor Immune Estimation Resource 2,TIMER2)进行泛癌分析,发现FCHSD2的表达差异。用Kaplan-Meier绘图仪评估FCHSD2对LUSC的预后价值,使用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据进行确认。并通过定量RT-PCR检测4种NSCLC细胞系和人支气管上皮样细胞中FCHSD2信使RNA(messenger RNA,mRNA)的表达情况。通过Coexpedia肿瘤数局库分析了FCHSD2共表达的前100个基因,对其功能进行富集分析,并在Sangerbox 3.0平台探究FCHSD2表达与免疫微环境的关系,最终预测FCHSD2的调控微RNA(microRNA,miRNA),并利用RNA相互作用百科全书(Encyclopedia of RNA Interactomes,ENCORI)平台建立LUSC潜在的miRNA-mRNA调控网络。结果:生存分析显示FCHSD2 mRNA水平的降低与LUSC患者OS的降低显著相关。用GO进行功能注释富集分析和KEGG通路富集分析,得到与磷酸转移酶活性、肝素结合等结果相关。且浸润水平随着FCHSD2表达的变化而变化,呈正相关。最终预测出了FCHSD2的调控miRNA,并构建了潜在的miRNA-mRNA调控网络。结论:FCHSD2基因有望成为新型LUSC预后标志物,为LUSC精准治疗策略选择提供重要依据。