用一种新的信息离散性度量方法,即Function of Degree of Disagreement(FDOD),从蛋白质原始序列出发区分同源二聚体、同源三聚体、同源四聚体和同源六聚体.该方法用蛋白质原始序列的子序列分布来描述氨基酸序列,从而充分考虑了蛋白质序...用一种新的信息离散性度量方法,即Function of Degree of Disagreement(FDOD),从蛋白质原始序列出发区分同源二聚体、同源三聚体、同源四聚体和同源六聚体.该方法用蛋白质原始序列的子序列分布来描述氨基酸序列,从而充分考虑了蛋白质序列的信息.随着子序列长度的增加,两个数据集上自检验和jack-knife检验的各个分类指标都有快速增加的趋势,实验表明残基顺序对同源寡聚蛋白质的识别起重要作用,FDOD方法是同源寡聚蛋白质分类的简单而有效的工具.这也进一步证实了蛋白质原始序列包含着四级结构信息.展开更多
基金Natural Science Foundation of the Education Department of Henan Province,China(2006520022)Youth Foundation of Zhoukou Normal University(ZKNUQN200615)
文摘用一种新的信息离散性度量方法,即Function of Degree of Disagreement(FDOD),从蛋白质原始序列出发区分同源二聚体、同源三聚体、同源四聚体和同源六聚体.该方法用蛋白质原始序列的子序列分布来描述氨基酸序列,从而充分考虑了蛋白质序列的信息.随着子序列长度的增加,两个数据集上自检验和jack-knife检验的各个分类指标都有快速增加的趋势,实验表明残基顺序对同源寡聚蛋白质的识别起重要作用,FDOD方法是同源寡聚蛋白质分类的简单而有效的工具.这也进一步证实了蛋白质原始序列包含着四级结构信息.