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郏县红牛FGF13基因拷贝数变异及其与生长性状关联性分析 被引量:2
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作者 蔡含芳 徐瑶 +3 位作者 许会芬 黄永震 李明 陈宏 《中国牛业科学》 2021年第5期27-29,共3页
本研究旨在检测郏县红牛成纤维生长因子13(fibroblast growth factor 13,FGF13)基因的拷贝数变异(copy number variation,CNV)及其与生长性状之间的相关性分析。本研究利用实时定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)技术,以57头郏... 本研究旨在检测郏县红牛成纤维生长因子13(fibroblast growth factor 13,FGF13)基因的拷贝数变异(copy number variation,CNV)及其与生长性状之间的相关性分析。本研究利用实时定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)技术,以57头郏县红牛为研究对象,检测FGF13基因CNV,并利用皮尔逊相关分析进行FGF13基因拷贝数与郏县红牛生长性状的关联分析。结果表明,郏县红牛FGF13基因的相对拷贝数高于对照组秦川牛(P<0.05),在郏县红牛群体中,FGF13基因CNV位点存在拷贝数增加Gain,拷贝数正常Normal和拷贝数减少Loss三种类型;关联分析结果显示,FGF13基因的相对拷贝数与郏县红牛的体斜长呈显著的正相关(P<0.05)。该研究结果表明,FGF13基因的CNV位点与郏县红牛的生长性状显著相关,可作为分子标记应用于郏县红牛的分子标记辅助选择育种工作中。 展开更多
关键词 郏县红牛 fgf13基因 拷贝数变异 生长性状 关联分析
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FGF13VY腺病毒过表达载体的构建及其鉴定
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作者 董梅 陈宇峰 +5 位作者 孙如梦 华乐 杨甫 孟丹琳 杨晶 王川 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2018年第12期1956-1959,共4页
利用PCR技术扩增目的基因FGF13VY亚型,经酶切、连接等反应将目的基因插入穿梭载体p Shuttle-CMV中,进而转化至含有Ad Easy质粒的大肠杆菌中,进行重组。将所产生的腺病毒载体转染在HEK-293细胞中,进行腺病毒的包装、分泌和扩增,将所获得... 利用PCR技术扩增目的基因FGF13VY亚型,经酶切、连接等反应将目的基因插入穿梭载体p Shuttle-CMV中,进而转化至含有Ad Easy质粒的大肠杆菌中,进行重组。将所产生的腺病毒载体转染在HEK-293细胞中,进行腺病毒的包装、分泌和扩增,将所获得的腺病毒在背根神经节中进行过表达,可检测到腺病毒携带的绿色荧光蛋白表达在背根神经节神经元,q PCR检测到FGF13VY mRNA的表达明显升高。FGF13VY腺病毒过表达载体的成功构建,为研究其在DRG神经元中作用奠定了基础。 展开更多
关键词 fgf13VY 腺病毒载体 绿色荧光蛋白 背根神经节
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鸡FGF13基因生物信息学及组织表达分析 被引量:3
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作者 邢伟杰 赵东伟 +3 位作者 李尚民 范建华 蒋一秀 金波 《中国家禽》 北大核心 2019年第21期11-16,共6页
研究使用多种生物信息学分析软件和多种在线生物信息分析工具,探究鸡成纤维细胞生长因子13(FGF13)基因及其编码蛋白的序列结构及遗传学特性,并分析其组织表达情况。结果显示:鸡FGF13基因编码区DNA序列长582 bp,共编码氨基酸193个;同源... 研究使用多种生物信息学分析软件和多种在线生物信息分析工具,探究鸡成纤维细胞生长因子13(FGF13)基因及其编码蛋白的序列结构及遗传学特性,并分析其组织表达情况。结果显示:鸡FGF13基因编码区DNA序列长582 bp,共编码氨基酸193个;同源性分析发现,鸡FGF13基因具有较高的保守性,其核苷酸序列及其编码的氨基酸序列与鸟类中鸽和火鸡的同源性均达95%以上;氨基酸序列分析发现,该蛋白为不稳定的水溶性蛋白,分子质量为21.65 ku,理论等电点为9.33,无信号肽序列;亚细胞定位主要为细胞核内,属于非分泌蛋白;预测含有30个磷酸化位点,3个糖基化位点,具有FGF结构域;二级结构主要以无规则卷曲和β折叠为主,三级结构为卷曲状折叠结构;该基因在鸡早期生长过程中随周龄的增大在腿肌中的表达量呈下降模式。研究结果为FGF13基因功能的进一步分析,以及该基因在鸡生长发育及其他方面调控作用研究提供了更充分的分子生物学基础信息和理论依据。 展开更多
关键词 成纤维细胞生长因子13 序列分析 结构预测 表达模式
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FGF13敲低的肺癌A549细胞株构建及转录组学分析
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作者 唐铖铖 雷静静 +4 位作者 刘天宇 路宏朝 王令 王珊珊 曾文先 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1796-1807,共12页
本研究的目的是探究成纤维细胞生长因子13(fibroblast growth factor13,FGF13)影响非小细胞肺癌发生发展的分子机制。通过构建干扰FGF13的真核表达载体并进行慢病毒包装,获得FGF13敲低的肺癌A549细胞株。利用转录组测序(RNA Sequencing,... 本研究的目的是探究成纤维细胞生长因子13(fibroblast growth factor13,FGF13)影响非小细胞肺癌发生发展的分子机制。通过构建干扰FGF13的真核表达载体并进行慢病毒包装,获得FGF13敲低的肺癌A549细胞株。利用转录组测序(RNA Sequencing,RNA-seq)技术检测基因表达谱并筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对差异基因进行GO和KEGG富集分析,对部分DEGs的表达水平进行验证。采用STRING在线数据库筛选DEGs编码的蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)中的关键基因,并通过UALCAN数据库对关键基因进行预后分析。与对照组细胞相比,FGF13敲低的肺癌A549细胞株共筛选出1114个DEGs(P≤0.05,差异倍数≥2),其中表达上调和下调的DEGs分别有672和442个。实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)验证CXCL10和SELE等6个基因与测序结果一致。GO富集分析显示,DEGs与细胞凋亡、细胞迁移、氧化还原等生物学过程有关。KEGG富集分析显示,DEGs与p53信号通路、TNF信号通路、PI3K-AKT信号通路等有关。在DEGs编码蛋白的相互作用网络中,CXCL10、CCL5、IL6、DDX58、BST2、CSF2、CCL4、IFIH1、CMPK2和CXCL1作为FGF13调控的潜在关键基因,其中的DDX58、IFIH1等与患者的预后显著相关。本研究经转录组测序分析揭示了FGF13在肺癌A549细胞中调控的DEGs及其参与的相关信号通路和生物学过程,为后续研究FGF13在肺癌细胞中的生物学功能及其分子机制提供科学依据。 展开更多
关键词 fgf13基因 转录组测序 肺癌 差异表达基因
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Autism-related protein MeCP2 regulates FGF13 expression and emotional behaviors 被引量:1
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作者 BO Yuan Tian-lin Cheng +2 位作者 Kan Yang Xu Zhang Zilong Qiu 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期63-66,共4页
Methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) has a crucial role in transcriptional regulation and neural development (Ausi6 et al., 2014). Loss of function mutations of MECP2 in human lead to Rett syndrome (RTT), a seve... Methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) has a crucial role in transcriptional regulation and neural development (Ausi6 et al., 2014). Loss of function mutations of MECP2 in human lead to Rett syndrome (RTT), a severe neurodevelopmental disorders (Amir et al., 1999), whereas individuals with the chromosomal duplications containing the MECP2 locus showed severe autism-like symptoms (Ramocki et al., 2009). 展开更多
关键词 FGF Autism-related protein MeCP2 regulates fgf13 expression and emotional behaviors microRNAs
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FGF13 suppresses acute myeloid leukemia by regulating bone marrow niches
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作者 Ran Li Kai Xue Junmin Li 《Frontiers of Medicine》 SCIE CSCD 2022年第6期896-908,共13页
Fibroblast growth factor 13(FGF13)is aberrantly expressed in multiple cancer types,suggesting its essential role in tumorigenesis.Hence,we aimed to explore its definite role in the development of acute myeloid leukemi... Fibroblast growth factor 13(FGF13)is aberrantly expressed in multiple cancer types,suggesting its essential role in tumorigenesis.Hence,we aimed to explore its definite role in the development of acute myeloid leukemia(AML)and emphasize its associations with bone marrow niches.Results showed that FGF13 was lowly expressed in patients with AML and that its elevated expression was related to prolonged overall survival(OS).Univariate and multivariate Cox regression analyses identified FGF13 as an independent prognostic factor.A prognostic nomogram integrating FGF13 and clinicopathologic variables was constructed to predict 1-,3-,and 5-year OS.Gene mutation and functional analyses indicated that FGF13 was not associated with AML driver mutations but was related to bone marrow niches.As for immunity,FGF13 was remarkably associated with T cell count,immune checkpoint genes,and cytokines.In addition,FGF13 overexpression substantially inhibited the growth and significantly induced the early apoptosis of AML cells.The xenograft study indicated that FGF13 overexpression prolonged the survival of recipient mice.Overall,FGF13 could serve as an independent prognostic factor for AML,and it was closely related to the bone marrow microenvironment. 展开更多
关键词 acute myeloid leukemia fgf13 PROGNOSIS immune-related genes bone marrow niches
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一级亲属伴有代谢异常疾病的PCOS患者易感基因研究 被引量:3
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作者 林琳 李明明 +2 位作者 肖兵 穆巴热科·阿迪力 肖金宝 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2021年第1期17-22,共6页
目的:探讨基因单核苷酸多态性(SNP)与多囊卵巢综合征(PCOS)的相关性。方法:收集2018年1月至2019年12月就诊于新疆医科大学第一附属医院妇科的289例PCOS患者的临床资料。选取其中一级亲属患有代谢异常性疾病的35例PCOS患者和41例健康人... 目的:探讨基因单核苷酸多态性(SNP)与多囊卵巢综合征(PCOS)的相关性。方法:收集2018年1月至2019年12月就诊于新疆医科大学第一附属医院妇科的289例PCOS患者的临床资料。选取其中一级亲属患有代谢异常性疾病的35例PCOS患者和41例健康人群作为研究对象,采用Infinium Asian Screening BeadChip Array芯片检测全基因组SNP。通过KEGG富集分析和PPI分析确定易感基因和候选SNP位点,候选SNP位点进行群体遗传学分析。结果:芯片检测总差异SNP位点1141个(P≤0.001),生物信息学分析筛选出的易感基因和SNP位点为GNAO1(rs2587885),PIK3CD(rs6541017)和FGF13(rs527687、rs683357和rs7060413)。群体遗传学分析结果显示,rs527687位点A等位基因、rs683357位点G等位基因、rs6541017位点A等位基因、rs2587885位点C等位基因、rs7060413位点G等位基因在PCOS组中的频率显著低于对照组(P<0.05,OR<1且95%CI<1)。在共显性、显性、隐性遗传模型中rs527687、rs683357、rs6541017、rs2587885、rs7060413不同的基因型跟一级亲属有代谢性疾病的PCOS发病有相关性。结论:一级亲属患有代谢性疾病的PCOS患者rs2587885、rs6541017、rs527687、rs683357和rs7060413 SNP位点多态性与PCOS的发病风险具有相关性。 展开更多
关键词 多囊卵巢综合征 单核苷酸多态性 易感基因 GNAO1 PIK3CD fgf13
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成纤维细胞生长因子FGF11、13、18对小鼠毛囊第一生长周期作用的研究 被引量:4
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作者 曹校瑞 高淑媛 +2 位作者 牛姝 程笳琪 赫晓燕 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2019年第3期33-38,I0003,共7页
为了探究成纤维生长因子家族(Fibroblast growth factor families,FGFs)中,FGF11、13、18对毛囊的生长发育的作用,本研究以3/5/8/13/16/18/20/23日龄小鼠背部皮肤为试验样本,利用免疫组织化学技术、实时荧光定量PCR和蛋白免疫印迹技术检... 为了探究成纤维生长因子家族(Fibroblast growth factor families,FGFs)中,FGF11、13、18对毛囊的生长发育的作用,本研究以3/5/8/13/16/18/20/23日龄小鼠背部皮肤为试验样本,利用免疫组织化学技术、实时荧光定量PCR和蛋白免疫印迹技术检测FGF11、FGF13、FGF18基因及蛋白在小鼠背部皮肤的分布和表达情况。定位结果显示:FGF11、FGF13、FGF18在皮肤真皮乳头、毛基质、内根鞘、外根鞘和皮脂腺表达,而FGF13在膨大部、基底层和表皮也表达,FGF18也表达在膨大部和表皮。定量结果均显示:FGF11的表达没有一定的规律;FGF13在13日龄表达量最低,从16日龄开始上升;FGF18从3日龄表达量开始降低,16日龄降到最低,18日龄开始上升。提示:FGF11对小鼠毛囊第一生长周期可能没有明显和特定的调节作用;FGF13可能对毛囊的自我更新有一定的作用,诱导毛囊从静止期向再生长期过渡,促进毛囊生长;而FGF18在毛囊生长周期中从静止期向生长期过度有一定的作用,可促使毛囊从静止期进入再生长期。 展开更多
关键词 小鼠毛囊 第一生长周期 FGF11、fgf13、FGF18
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FGF13通过ROS介导抑制乳腺癌细胞MCF7凋亡
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作者 莫莎 唐铖铖 +3 位作者 刘怡 路宏朝 马海东 曾文先 《生物技术》 CAS 2024年第2期210-216,236,共8页
[目的]探究成纤维细胞生长因子13(Fibroblast growth factor 13,FGF13)对乳腺癌细胞MCF7凋亡的调控作用。[方法]Western Blotting和免疫组织化学染色检测FGF13的表达;构建干扰和超表达FGF13的MCF7细胞株;TUNEL法和Western Blotting检测... [目的]探究成纤维细胞生长因子13(Fibroblast growth factor 13,FGF13)对乳腺癌细胞MCF7凋亡的调控作用。[方法]Western Blotting和免疫组织化学染色检测FGF13的表达;构建干扰和超表达FGF13的MCF7细胞株;TUNEL法和Western Blotting检测细胞凋亡;DCFH-DA荧光探针法检测细胞内活性氧(Reactive oxygen species, ROS)。[结果]与正常乳腺细胞相比,FGF13在乳腺癌MCF7细胞中表达升高(0.16±0.01 vs 3.89±0.23,P<0.001)。干扰FGF13后,MCF7细胞凋亡率升高(2.20%±0.10%vs 10.79%±0.69%,P<0.001),促凋亡蛋白Bax(0.99±0.02 vs 2.56±0.02)、Caspase 3(1.00±0.01 vs 1.70±0.01)和p53(0.98±0.01 vs 2.22±0.03)的表达上调(P<0.001),而抗凋亡蛋白Bcl-xl(0.99±0.01 vs 0.29±0.01)、Bcl-2(0.99±0.01 vs 0.27±0.01)的表达下调(P<0.001)。相反,超表达FGF13后,细胞凋亡率和促凋亡蛋白的表达均降低(P<0.001),而抗凋亡蛋白的表达均升高(P<0.001)。而且,干扰FGF13的表达引起细胞内ROS水平升高(1 552.00±51.37 vs 2 714.00±55.19,P<0.001),而超表达则导致ROS减少(2 102.83±65.29 vs 1 111.67±63.53,P<0.001)。[结论]FGF13可能通过ROS介导抑制乳腺癌MCF7细胞凋亡。 展开更多
关键词 乳腺癌 细胞凋亡 成纤维细胞生长因子13 活性氧 抗凋亡蛋白 促凋亡蛋白 基因表达 半胱天冬酶
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成纤维细胞生长因子13通过ROS/Caspase-3通路调控非小细胞肺癌A549细胞的凋亡 被引量:2
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作者 刘天宇 唐铖铖 +4 位作者 冯光 雷静静 孙晨皓 王令 路宏朝 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期451-459,共9页
目的:探讨成纤维细胞生长因子13(fibroblast growth factor 13,FGF13)对非小细胞肺癌A549细胞活性氧(reactive oxygen species,ROS)的生成和凋亡的影响及其调控机制。方法:WB法检测FGF13在人正常肺上皮细胞BEAS-2B和肺癌A549、H460细胞... 目的:探讨成纤维细胞生长因子13(fibroblast growth factor 13,FGF13)对非小细胞肺癌A549细胞活性氧(reactive oxygen species,ROS)的生成和凋亡的影响及其调控机制。方法:WB法检测FGF13在人正常肺上皮细胞BEAS-2B和肺癌A549、H460细胞中的本底表达量。采用FGF13过表达载体转染BEAS-2B和A549细胞;设计两组靶向FGF13的shRNA序列,构建慢病毒干扰载体,包装病毒后侵染A549细胞,采用qPCR和WB法检测干扰效果,DCFH-DA探针结合荧光酶标仪分析敲减FGF13对A549细胞内ROS水平的影响,MitoSOX与WB法检测对线粒体ROS水平及烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶4(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate oxidase 4,NOX4)蛋白表达量的影响,Annexin V-FITC-PI双染法检测对细胞凋亡和Caspase-3及Cleaved Caspase-3蛋白表达的影响。结果:与BEAS-2B细胞相比,FGF13蛋白在两种肺癌细胞中均高表达(均P<0.05)。成功构建FGF13过表达、低表达的A549细胞系。过表达FGF13后,BEAS-2B和A549细胞内ROS水平显著降低(P<0.05);敲减FGF13表达后,A549细胞内ROS水平显著升高(P<0.05);然而过表达及干扰FGF13对A549细胞内线粒体ROS水平无显著影响,但NOX4蛋白表达量显著下调(P<0.05)及显著上调(P<0.05)。FGF13干扰后A549细胞凋亡率显著升高(P<0.01),Caspase-3及Cleaved Caspase-3蛋白表达量显著上调(P<0.05)。结论:FGF13可能通过NOX家族途径调控ROS的生成,并通过ROS/Caspase-3通路调控A549细胞凋亡。 展开更多
关键词 成纤维细胞生长因子13 A549细胞 活性氧 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶4 CASPASE-3 凋亡
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人成纤维细胞生长因子13基因在酵母细胞中的表达
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作者 孙蒙 于永利 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第8期401-403,共3页
目的 :用酵母细胞表达重组人成纤维细胞生长因子 (hFGF13)蛋白并检测其活性。方法 :通过RT PCR从流产胎儿脑组织中钓取hFGF13cDNA ,将其克隆入pYEX4T 1载体质粒。在酵母细胞表达GST hFGF13融合蛋白。以细胞增殖实验测定酵母表达蛋白粗... 目的 :用酵母细胞表达重组人成纤维细胞生长因子 (hFGF13)蛋白并检测其活性。方法 :通过RT PCR从流产胎儿脑组织中钓取hFGF13cDNA ,将其克隆入pYEX4T 1载体质粒。在酵母细胞表达GST hFGF13融合蛋白。以细胞增殖实验测定酵母表达蛋白粗提物的活性。结果 :GST hFGF13融合蛋白在酵母细胞中得到表达 ;GST hFGF13融合蛋白能刺激NIH3T3细胞的增殖 ,而且此活性能够被FGFR1细胞外段所拮抗。结论 :所获得的重组hFGF13能与FGFR1特异性结合 ,并具有促有丝分裂活性。 展开更多
关键词 人成纤维细胞生长因子13 酵母细胞 基因表达
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p53调控成纤维细胞生长因子13的表达对A549细胞增殖的影响
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作者 赵倩文 唐铖铖 +4 位作者 雷静静 张欣然 李豆豆 曾文先 路宏朝 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期567-574,共8页
目的研究在非小细胞型肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)发展进程中,p53通过调控人成纤维细胞生长因子13(fibroblast growth factor 13,FGF13)的表达对细胞增殖的影响,并探讨其相关分子机制。方法以人正常肺上皮细胞BEAS-2B和NSCL... 目的研究在非小细胞型肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)发展进程中,p53通过调控人成纤维细胞生长因子13(fibroblast growth factor 13,FGF13)的表达对细胞增殖的影响,并探讨其相关分子机制。方法以人正常肺上皮细胞BEAS-2B和NSCLC A549细胞为研究对象,对A459细胞进行单独干扰p53和FGF13后,采用CCK8法检测对细胞增殖的影响;qPCR和Western blot法检测p53干扰后对相关因子和蛋白表达的影响;流式细胞术检测对细胞周期的影响。进一步采用p53和FGF13联合干扰,验证对A549细胞增殖的影响。结果p53干扰后,A549细胞增殖明显加快(P<0.01),细胞周期抑制因子p21蛋白表达水平显著降低(P<0.01),CyclinE和FGF13蛋白表达水平显著升高(P均<0.01)。FGF13表达降低后,G1期细胞数量升高14%,S期细胞数量降低10%;p21基因mRNA转录水平显著升高,CDK2基因mRNA转录水平显著下降,而细胞周期蛋白CyclinE表达水平明显降低(P均<0.01)。超表达FGF13后,p21基因mRNA转录水平明显降低,而CyclinE蛋白表达水平上调3倍(P均<0.01),表明FGF13在A549细胞中发挥促增殖的作用。进一步的单干扰或联合干扰表达证明,p53通过抑制FGF13的表达降低CyclinE蛋白的表达。结论FGF13作为一个促癌因子,受到肿瘤抑制蛋白p53的直接调控,通过细胞周期抑制因子p21通路,共同影响A549细胞周期中G1/S检控点。 展开更多
关键词 非小细胞型肺癌 成纤维细胞生长因子13 P53 细胞增殖 细胞周期
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