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鸡FGF6基因生物学特性及其多态性与经济性状的关联分析
1
作者
曹玉珠
邢雨欣
+7 位作者
马乘霖
管宏波
贾其辉
康相涛
田亚东
李转见
刘小军
李红
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期1536-1550,共15页
旨在探究鸡成纤维细胞生长因子6(fibroblast growth factor 6,FGF6)基因的生物学特性,挖掘FGF6基因单核苷酸多态性(SNP)位点并分析其与经济性状的相关性,为后续研究鸡FGF6基因对生长性状的影响提供参考。本研究对FGF6蛋白序列进行生物...
旨在探究鸡成纤维细胞生长因子6(fibroblast growth factor 6,FGF6)基因的生物学特性,挖掘FGF6基因单核苷酸多态性(SNP)位点并分析其与经济性状的相关性,为后续研究鸡FGF6基因对生长性状的影响提供参考。本研究对FGF6蛋白序列进行生物信息学分析;基于768只固始鸡-安卡鸡F_2资源群的GBS数据及相关经济性状表型数据对FGF6基因包含启动子2 kb区域SNP位点进行筛选,并进行连锁不平衡和关联分析,探究FGF6基因SNP和单倍型与鸡经济性状的相关性。生物信息学分析结果显示,鸡FGF6氨基酸序列与火鸡同源性为91.26%;系统进化分析表明,鸡FGF6与火鸡亲缘关系最近,其次是绿海龟,与斑马鱼遗传距离最远;保守性分析显示不同物种间FGF6保守性较高。鸡FGF6蛋白为亲水性蛋白、存在1个跨膜区,主要定位于细胞质;其二级、三级结构相符。鸡FGF6蛋白被22个磷酸化位点和1个N-糖基化位点修饰;与其受体家族FGFR1~4和EGF存在互作关系。鸡FGF6基因启动子区域筛选到6个SNPs位点,均位于1号内含子上;多态性分析显示6个SNPs位点存在高多态性,其中5个处于哈代-温伯格平衡,呈强连锁状态(D′=1,r^(2)=1)。关联分析结果显示,rs73399071位点与F_2资源群不同阶段体重(BW)、胫长(SL)、胫围(SG)、体斜长(BSL)等17个生长性状指标显著相关(P<0.05),与全净膛重(EW)、半净膛重(SEW)、屠体重(CW)、胸肌重(BMW)等10个屠体性状指标显著相关(P<0.05),与肉质性状的关联未达到显著水平(P>0.05),与高密度脂蛋白(HDL)和胆碱酯酶(ChE)显著相关(P<0.05),CC基因型个体的大部分性状表型均值高于GG基因型个体;单倍型组合分析显示不同阶段CCTTCCTTCC组合个体的体重均高于其他单倍型组合个体。本研究结果为进一步探究鸡FGF6基因的功能提供理论参考,筛选到FGF6基因存在5个与固始鸡-安卡鸡F_2资源群体重、体尺、屠体性状和血液生化指标显著关联的SNPs位点,为鸡育种提供候选的分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。
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关键词
鸡
fgf
6
基因
生物信息学分析
连锁不平衡分析
单倍型
经济性状
关联分析
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职称材料
Kallmann综合征分子遗传学研究进展
被引量:
4
2
作者
付超
冯征
刘睿智
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期361-365,共5页
Kallmann综合征(KS)是一种临床和遗传异质性疾病,呈家族性或散发性发病。Ks是由胚胎时期嗅球、嗅束的异常发育致使GnRH-1神经细胞不能完成从鼻基板迁移至下丘脑这一过程所引起。GnRH分泌不足导致低促性腺激素性腺功能减退,嗅球、嗅...
Kallmann综合征(KS)是一种临床和遗传异质性疾病,呈家族性或散发性发病。Ks是由胚胎时期嗅球、嗅束的异常发育致使GnRH-1神经细胞不能完成从鼻基板迁移至下丘脑这一过程所引起。GnRH分泌不足导致低促性腺激素性腺功能减退,嗅球、嗅束的异常发育或缺如引起嗅觉丧失。除上述典型症状外,KS患者还可以表现出一些非生殖和非嗅觉表型。KS分子遗传学机制十分复杂,目前只有6个KS致病基因被鉴定。KAL1基因与KS的X连锁隐性遗传模式相关。成纤维细胞生长因子受体1基因(FGFR1/KAL2)和成纤维细胞生长因子8基因(FGFS/KAL6)与常染色体显性遗传模式有关。但是这6个基因的突变只能解释25%~30%的KS病例,提示还有其他KS致病基因有待发现。本文就KS致病基因的研究进展、临床诊断和治疗作一综述。
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关键词
kal
LMANN综合征
GnRH-1
kal
1
基因
fgf
R1
/kal
2
基因
PROKR2
/kal
3
基因
PROK2
/kal
4
基因
CHDT
/kal
5
基因
fgfs/kal6基因
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职称材料
肠缺血再灌注损伤后大鼠肝和肺组织bFGF和TGFβ基因表达的变化
被引量:
2
3
作者
杨银辉
付小兵
+1 位作者
孙同柱
蒋礼先
《华人消化杂志》
1998年第10期850-852,共3页
目的观察大鼠肠缺血再灌注损伤后肝和肺的损伤程度与内源性bFGF和TGFβmRNA表达量的变化规律,探讨两类生长因子在内脏损伤与修复中的作用.方法采用大鼠(n=16)肠系膜上动脉夹闭模型,(缺血45min,再灌注6h和...
目的观察大鼠肠缺血再灌注损伤后肝和肺的损伤程度与内源性bFGF和TGFβmRNA表达量的变化规律,探讨两类生长因子在内脏损伤与修复中的作用.方法采用大鼠(n=16)肠系膜上动脉夹闭模型,(缺血45min,再灌注6h和24h)用原位杂交方法检测内源性bFGF和TGFβmRNA表达水平.结果肠缺血45min再灌注6h时,对肝、肺的损伤最严重,而此时内源性bFGF和TGFβmRNA表达水平显著增高,达峰值;再灌注24h,肝,肺的损伤已基本恢复,内源性bFGF和TGFβmRNA表达量也基本恢复至正常水平.结论内源性bFGF和TGFβmRNA表达水平的变化与肝、肺的损伤程度呈正相关,表明这两类生长因子在内脏损伤后可能存在促进修复的作用.
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关键词
肠缺血
再灌注损伤
基因
表达
6
fgf
TGFΒ
原文传递
题名
鸡FGF6基因生物学特性及其多态性与经济性状的关联分析
1
作者
曹玉珠
邢雨欣
马乘霖
管宏波
贾其辉
康相涛
田亚东
李转见
刘小军
李红
机构
河南农业大学动物科技学院
河南省家禽育种国际联合实验室
河南省鸡种质资源创新与利用重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期1536-1550,共15页
基金
河南省重大科技专项(221100110200)
中原学者首席科学家工作室(30601985)。
文摘
旨在探究鸡成纤维细胞生长因子6(fibroblast growth factor 6,FGF6)基因的生物学特性,挖掘FGF6基因单核苷酸多态性(SNP)位点并分析其与经济性状的相关性,为后续研究鸡FGF6基因对生长性状的影响提供参考。本研究对FGF6蛋白序列进行生物信息学分析;基于768只固始鸡-安卡鸡F_2资源群的GBS数据及相关经济性状表型数据对FGF6基因包含启动子2 kb区域SNP位点进行筛选,并进行连锁不平衡和关联分析,探究FGF6基因SNP和单倍型与鸡经济性状的相关性。生物信息学分析结果显示,鸡FGF6氨基酸序列与火鸡同源性为91.26%;系统进化分析表明,鸡FGF6与火鸡亲缘关系最近,其次是绿海龟,与斑马鱼遗传距离最远;保守性分析显示不同物种间FGF6保守性较高。鸡FGF6蛋白为亲水性蛋白、存在1个跨膜区,主要定位于细胞质;其二级、三级结构相符。鸡FGF6蛋白被22个磷酸化位点和1个N-糖基化位点修饰;与其受体家族FGFR1~4和EGF存在互作关系。鸡FGF6基因启动子区域筛选到6个SNPs位点,均位于1号内含子上;多态性分析显示6个SNPs位点存在高多态性,其中5个处于哈代-温伯格平衡,呈强连锁状态(D′=1,r^(2)=1)。关联分析结果显示,rs73399071位点与F_2资源群不同阶段体重(BW)、胫长(SL)、胫围(SG)、体斜长(BSL)等17个生长性状指标显著相关(P<0.05),与全净膛重(EW)、半净膛重(SEW)、屠体重(CW)、胸肌重(BMW)等10个屠体性状指标显著相关(P<0.05),与肉质性状的关联未达到显著水平(P>0.05),与高密度脂蛋白(HDL)和胆碱酯酶(ChE)显著相关(P<0.05),CC基因型个体的大部分性状表型均值高于GG基因型个体;单倍型组合分析显示不同阶段CCTTCCTTCC组合个体的体重均高于其他单倍型组合个体。本研究结果为进一步探究鸡FGF6基因的功能提供理论参考,筛选到FGF6基因存在5个与固始鸡-安卡鸡F_2资源群体重、体尺、屠体性状和血液生化指标显著关联的SNPs位点,为鸡育种提供候选的分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。
关键词
鸡
fgf
6
基因
生物信息学分析
连锁不平衡分析
单倍型
经济性状
关联分析
Keywords
chicken
fgf
6
gene
bioinformatics analysis
linkage disequilibrium analysis
haplotype
economic traits
association analysis
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
Kallmann综合征分子遗传学研究进展
被引量:
4
2
作者
付超
冯征
刘睿智
机构
吉林大学白求恩第一医院生殖中心
出处
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期361-365,共5页
基金
吉林省科技厅资助项目(20080444-3)~~
文摘
Kallmann综合征(KS)是一种临床和遗传异质性疾病,呈家族性或散发性发病。Ks是由胚胎时期嗅球、嗅束的异常发育致使GnRH-1神经细胞不能完成从鼻基板迁移至下丘脑这一过程所引起。GnRH分泌不足导致低促性腺激素性腺功能减退,嗅球、嗅束的异常发育或缺如引起嗅觉丧失。除上述典型症状外,KS患者还可以表现出一些非生殖和非嗅觉表型。KS分子遗传学机制十分复杂,目前只有6个KS致病基因被鉴定。KAL1基因与KS的X连锁隐性遗传模式相关。成纤维细胞生长因子受体1基因(FGFR1/KAL2)和成纤维细胞生长因子8基因(FGFS/KAL6)与常染色体显性遗传模式有关。但是这6个基因的突变只能解释25%~30%的KS病例,提示还有其他KS致病基因有待发现。本文就KS致病基因的研究进展、临床诊断和治疗作一综述。
关键词
kal
LMANN综合征
GnRH-1
kal
1
基因
fgf
R1
/kal
2
基因
PROKR2
/kal
3
基因
PROK2
/kal
4
基因
CHDT
/kal
5
基因
fgfs/kal6基因
Keywords
kal
lmann syndrome
GnRH-1
kal
1
fgf
R1
/kal
2
PROKR2
/kal
3
PROK2/KAb4
CHITI
/kal
5
fgf
8/
kal
6
分类号
R596 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
肠缺血再灌注损伤后大鼠肝和肺组织bFGF和TGFβ基因表达的变化
被引量:
2
3
作者
杨银辉
付小兵
孙同柱
蒋礼先
出处
《华人消化杂志》
1998年第10期850-852,共3页
基金
国家杰出青年科学基金
文摘
目的观察大鼠肠缺血再灌注损伤后肝和肺的损伤程度与内源性bFGF和TGFβmRNA表达量的变化规律,探讨两类生长因子在内脏损伤与修复中的作用.方法采用大鼠(n=16)肠系膜上动脉夹闭模型,(缺血45min,再灌注6h和24h)用原位杂交方法检测内源性bFGF和TGFβmRNA表达水平.结果肠缺血45min再灌注6h时,对肝、肺的损伤最严重,而此时内源性bFGF和TGFβmRNA表达水平显著增高,达峰值;再灌注24h,肝,肺的损伤已基本恢复,内源性bFGF和TGFβmRNA表达量也基本恢复至正常水平.结论内源性bFGF和TGFβmRNA表达水平的变化与肝、肺的损伤程度呈正相关,表明这两类生长因子在内脏损伤后可能存在促进修复的作用.
关键词
肠缺血
再灌注损伤
基因
表达
6
fgf
TGFΒ
Keywords
intestinal ischemia
reperfusion injury
liver
lung
transforming growth factor β
fibroblast growth factor, basic
gene expression
分类号
R574 [医药卫生—消化系统]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸡FGF6基因生物学特性及其多态性与经济性状的关联分析
曹玉珠
邢雨欣
马乘霖
管宏波
贾其辉
康相涛
田亚东
李转见
刘小军
李红
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
Kallmann综合征分子遗传学研究进展
付超
冯征
刘睿智
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
下载PDF
职称材料
3
肠缺血再灌注损伤后大鼠肝和肺组织bFGF和TGFβ基因表达的变化
杨银辉
付小兵
孙同柱
蒋礼先
《华人消化杂志》
1998
2
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