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Reversible SUMOylation of FHY1 Regulates Phytochrome A Signaling in Arabidopsis 被引量:4
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作者 Gao-Ping Qu Hong Li +9 位作者 Xiao-Li Lin Xiangxiong Kong Zi-Liang Hu Yin Hua Jin Yu Liu Hang-Lin Song Dae Heon Kim Rongcheng Lin Jigang Li Jing Bo Jin 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2020年第6期879-893,共15页
In response to far-red light(FR),FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL 1(FHY1)transports the photoactivated phytochrome A(phyA),the primary FR photoreceptor,into the nucleus,where it initiates FR signaling in plants.Light promo... In response to far-red light(FR),FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL 1(FHY1)transports the photoactivated phytochrome A(phyA),the primary FR photoreceptor,into the nucleus,where it initiates FR signaling in plants.Light promotes the 26S proteasome-mediated degradation of FHY1,which desensitizes FR signaling,but the underlying regulatory mechanism remains largely unknown.Here,we show that reversible SUMOylation of FHY1 tightly regulates this process.Lysine K32(K32)and K103 are major SUMOylation sites of FHY1.We found that FR exposure promotes the SUMOylation of FHY1,which accelerates its degradation.Furthermore,we discovered that ARABIDOPSIS SUMO PROTEASE 1(ASP1)interacts with FHY1 in the nucleus under FR and facilitates its deSUMOylation.FHY1 was strongly SUMOylated and its protein level was decreased in the asp1-1 loss-of-function mutant compared with that in the wild type under FR.Consistently,asp1-1 seedlings exhibited a decreased sensitivity to FR,suggesting that ASP1 plays an important role in the maintenance of proper FHY1 levels under FR.Genetic analysis further revealed that ASP1 regulates FR signaling through an FHY1-and phyA-dependent pathway.Interestingly,We found that continuous FR inhibits ASP1 accumulation,perhaps contributing to the desensitization of FR signaling.Taken together,these results indicate that FR-induced SUMOylation and ASP1-dependent deSUMOylation of FHY1 represent a key regulatory mechanism that fine-tunes FR signaling. 展开更多
关键词 ARABIDOPSIS PHOTOMORPHOGENESIS fhy1 SUMO ASP1
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Arabidopsis FHY1 and FHY1-LIKE Are Not Required for Phytochrome A Signal Transduction in the Nucleus 被引量:3
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作者 Chiara Menon Cornelia Klose Andreas Hiltbrunner 《Plant Communications》 2020年第2期34-44,共11页
Photoreceptors of the phytochrome family control a multitude of responses in plants.Phytochrome A(phyA)is essential for far-red light perception,which is important for germination and seedling establishment in strong ... Photoreceptors of the phytochrome family control a multitude of responses in plants.Phytochrome A(phyA)is essential for far-red light perception,which is important for germination and seedling establishment in strong canopy shade.Translocation of phyA from the cytosol into nucleus is a key step in farred light signaling and requires FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL 1(FHY1)and FHY1-LIKE(FHL).FHY1/FHL bind to phyA downstream signaling components.Therefore,it has been suggested that FHY1/FHL also have a function in assembling phyA transcription factor complexes in the nucleus.Yet,in this study,we show that constitutively nuclear-localized phyA is active in the absence of FHY1 and FHL.Furthermore,an artificial FHY1,consisting of an SV40 NLS,a phyA binding site,and a YFP tag as spacer between them,complements the fhy1-3 fhl-1 double mutant.These findings show that FHY1 and FHL are not required for phyA downstream signaling in the nucleus.However,we found that lines expressing phyA-NLS-YFP are hypersensitive to red and far-red light and that slightly increased levels of constitutively nuclear-localized phyA result in photomorphogenic development in the dark.Thus,restricting phyA to the cytosol and inducing nuclear transport in light by interaction with FHY1/FHL might be important to suppress photomorphogenesis in the dark. 展开更多
关键词 PHYTOCHROME PHYA fhy1 FHL nuclear transport far-red light
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棉花FAR1/FHY3基因家族的全基因组分析 被引量:7
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作者 袁娜 王彤 +5 位作者 刘廷利 杨郁文 郭月 刘静 张保龙 杜建厂 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期1-11,共11页
【目的】FAR1/FHY3是1类起源于转座子酶的转录因子,在光敏色素A(phyA)信号通路的启动中起到非常重要的作用。通过对FAR1/FHY3家族进行全基因组学分析,为深入研究FAR1/FHY3在棉花光信号通路中的分子调控机理提供基础。【方法】利用生物... 【目的】FAR1/FHY3是1类起源于转座子酶的转录因子,在光敏色素A(phyA)信号通路的启动中起到非常重要的作用。通过对FAR1/FHY3家族进行全基因组学分析,为深入研究FAR1/FHY3在棉花光信号通路中的分子调控机理提供基础。【方法】利用生物信息学方法对亚洲棉(Gossypium arboreum L.)、雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii Ulbrich)和陆地棉(Gossypium hirsutum L.)中的FAR1/FHY3基因进行了全基因组鉴定和分析。【结果】共鉴定出88个FAR1/FHY3基因,其中陆地棉中数量最少。聚类分析将所有成员分为3个亚组。Ka/Ks值表明大部分基因都经历了负选择过程。转录组数据分析发现,大部分FAR1/FHY3基因在棉花叶片中表达,少数在茎、花瓣和花托中表达。陆地棉中的Gh FAR14在4种组织中均有较高水平的表达,且与拟南芥FHY3具有较高的同源性,推测其在陆地棉phyA信号通路的启动过程中可能起到关键作用。【结论】该研究结果有助于了解棉花FAR1/FHY3基因家族的进化与功能,为下一步深入研究该基因家族在棉花生长发育和响应红光信号通路中的分子调控机理提供基础。 展开更多
关键词 亚洲棉 雷蒙德氏棉 陆地棉 FAR1/FHY3 生物信息学
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油桃花芽自然休眠诱导期FAR1/FHY3基因的表达分析
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作者 郇蕾 王旭旭 +2 位作者 刘文海 李玲 高东升 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 2017年第2期229-235,共7页
FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL 3(FHY3)和它的同源基因FAR-RED-IMPAIREDRESPONSE 1(FAR1)参与远红光、脱落酸(Abscisic acid,ABA)对拟南芥种子休眠的调节,然而FHY3/FAR1在木本植物花芽休眠中的表达尚不清楚。本研究以八年生‘中油四号’... FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL 3(FHY3)和它的同源基因FAR-RED-IMPAIREDRESPONSE 1(FAR1)参与远红光、脱落酸(Abscisic acid,ABA)对拟南芥种子休眠的调节,然而FHY3/FAR1在木本植物花芽休眠中的表达尚不清楚。本研究以八年生‘中油四号’油桃花芽为材料,利用NCBI找出桃树上的FAR1/FHY3同源基因,测定了同源性最高的5个基因在休眠诱导期的表达,并在休眠诱导期分别用脱落酸及远红光处理桃树,荧光定量检测了基因的表达量变化。结果表明,桃中同源性最高的Prupe.3G186100、Prupe.3G186200、Prupe.4G115100、Prupe.3G186000 4个基因在休眠诱导期均有上调,且受ABA诱导表达上调,受远红光诱导表达下调,而Prupe.2G327900在休眠诱导期表达下调,受ABA诱导下调,受远红光诱导上调。我们推测,Pp FRSs基因可能通过不同的模式参与油桃花芽休眠诱导的调控。 展开更多
关键词 ABA 花芽休眠诱导 表达分析 远红光 FHY3/FAR1
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大豆phyA下游基因预测和表达分析及敲除载体构建 被引量:1
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作者 张婷 马丽欣 +2 位作者 刘俊 林晓雅 刘宝辉 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期309-318,共10页
为了进一步研究大豆光周期调控通路中E3和E4的下游基因,为获得其突变体植株奠定基础,以拟南芥远红光响应受体phyA下游的重要信号传递因子PIF3、LAF1、FHY1和FHL的序列作为参考序列,在Phytozome 12数据库中查找其相似序列,进行序列比对... 为了进一步研究大豆光周期调控通路中E3和E4的下游基因,为获得其突变体植株奠定基础,以拟南芥远红光响应受体phyA下游的重要信号传递因子PIF3、LAF1、FHY1和FHL的序列作为参考序列,在Phytozome 12数据库中查找其相似序列,进行序列比对和进化树分析,确定它们在大豆中的同源基因并采用qRT-PCR方法进行组织表达分析,使用CRISPR/Cas 9系统设计同源基因的敲除靶点并通过发根系统验证靶点的有效性。结果显示:AtPIF3在大豆中有6个同源基因,AtLAF1在大豆中有4个同源基因,AtFHL在大豆中有2个同源基因,而AtFHY1在大豆中没有同源基因。4个LAF1基因主要在顶端生长点表达,6个PIF3和2个FHL基因主要在荚中表达。共鉴定出12个有效靶点,能够分别将大豆中6个PIF3、4个LAF1和2个FHL基因成功敲除。研究结果为进一步获得稳定的大豆突变体材料和大豆phyA下游基因的功能研究提供了理论基础。 展开更多
关键词 大豆 PIF3 LAF1 FHL 组织表达分析 CRISPR/Cas9 基因敲除载体
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植物光敏色素PHYA、PHYB研究进展 被引量:6
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作者 张芳 张晓枫 +2 位作者 王进征 胡勇 刘祥林 《生物学通报》 北大核心 2011年第1期11-14,共4页
光是植物生长发育过程中一个重要的环境信号,光敏色素能够把外界的红光和远红光转变成生物体内的信号。介绍近年来光敏色素结构和其相互作用蛋白的研究进展。
关键词 光敏色素 fhy1/FHL PIFs COP1/SPA1
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番茄FAR1/FHY3转录因子家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量:5
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作者 陈渝 邓洁 +7 位作者 陈君愉 曾亭 余婷婷 黄千华 陈培超 刘庆 简伟 杨星勇 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1983-1995,共13页
FAR1/FHY3是由转座酶衍生的一类转录因子家族,它通过调控下游基因表达,进而在植物光响应、生长发育及逆境胁迫应答过程发挥重要作用,但当前有关FAR1/FHY3家族的研究主要集中在模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中。为了探究番茄(Lyc... FAR1/FHY3是由转座酶衍生的一类转录因子家族,它通过调控下游基因表达,进而在植物光响应、生长发育及逆境胁迫应答过程发挥重要作用,但当前有关FAR1/FHY3家族的研究主要集中在模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中。为了探究番茄(Lycopersicon esculentum) FAR1/FHY3基因家族的进化和功能,该研究通过全基因组分析鉴定到27个FAR1/FHY3基因,并利用生物信息学手段和荧光定量PCR技术(qRTPCR)对其展开分析。结果表明,该基因家族可分为7个亚家族,与拟南芥和玉米(Zea mays)具有相似分类,不同亚族之间基因结构存在显著差异;该家族成员在4、5和12号以外的所有染色体上均呈现不均衡分布,并且存在4个串联重复的基因簇;组织表达分析表明,个别亚族之间存在组织表达相似性,多数组织中均存在相对高表达基因,特别是第I亚族基因在果实发育及成熟过程特异高表达;qRT-PCR结果表明大多数成员能被NaCl、PEG6000胁迫诱导表达,而被ABA处理所抑制,特别是SlFAR1-22、SlFAR1-23和SlFAR1-25基因能够分别被PEG6000胁迫诱导上调表达28.06、14.25和9.09倍,暗示FAR1/FHY3家族在胁迫应答过程具有重要作用。该研究结果可为进一步解析该家族成员在番茄生长发育及胁迫应答过程中的功能机制奠定基础。 展开更多
关键词 番茄 FAR1/FHY3 转录因子 生物信息学 胁迫应答
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FHY3 and FAR1 Integrate Light Signals with the miR156-SPL Module-Mediated Aging Pathway to Regulate Arabidopsis Flowering 被引量:8
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作者 Yurong Xie Qin Zhou +7 位作者 Yongping Zhao Quanquan Li Yang Liu Mengdi Ma Baobao Wang Rongxin Shen Zhigang Zheng Haiyang Wang 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2020年第3期483-498,共16页
In response to competition for light from their neighbors,shade-intolerant plants flower precociously to ensure reproductive success and survival.However,the molecular mechanisms underlying this key developmental swit... In response to competition for light from their neighbors,shade-intolerant plants flower precociously to ensure reproductive success and survival.However,the molecular mechanisms underlying this key developmental switch are not well understood.Here,we show that a pair of Arabidopsis transcription factors essential for phytochrome A signaling,FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL3(FHY3)and FAR-RED IMPAIRED RESPONSE1(FAR1),regulate flowering time by integrating environmental light signals with the miR156-SPL module-mediated aging pathway.We found that FHY3 and FAR1 directly interact with three flowering-promoting SQUAMOSA-PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE(SPL)transcription factors,SPL3,SPL4,and SPL5,and inhibit their binding to the promoters of several key flowering regulatory genes,including FRUITFUL(FUL),LEAFY(LFY),APETALA1(AP1),and MIR172C,thus downregulating their transcript levels and delaying flowering.Under simulated shade conditions,levels of SPL3/4/5 proteins increase,whereas levels of FHY3 and FAR1 proteins decline,thus releasing SPL3/4/5 from FHY3/FAR1 inhibition to allow activation of FUL,LFY,AP1,and MIR172C and,consequently,early flowering.Taken together,these results unravel a novel mechanism whereby plants regulate flowering time by integrating environmental cues(such as light conditions)and an internal developmental program(the miR156-SPL module-mediated aging pathway). 展开更多
关键词 ARABIDOPSIS FHY3/FAR1 SPL3/4/5 FUL/LFY/AP1 MIR172C flowering time
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