香港牡蛎糖原合酶与糖原磷酸化酶基因多态性研究及糖原含量性状相关分子标记挖掘

香港牡蛎是我国南方沿海地区的主要经济贝类,糖原含量是衡量其品质高低的重要指标之一。本研究在转录组测序基础上,以三墩群体(SD,60只个体)和大风江群体(DFJ,90只个体)为研究对象,采用ELISA方法检测每个香港牡蛎糖原含量,并利用片段长度差异等位基因特异性PCR(Fragment length discrepant allele specific PCR,FLDAS-PCR)技术开展糖原合酶和糖原磷酸化酶基因多态性研究,开发单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)标记。结果共开发25个SNPs,其中4个SNPs(Ch_GS680,Ch_GS1248,Ch_GP992和Ch_GP1962)在实验群体中分型成功,SPSS关联分析显示SNP位点Ch_GS680与糖原含量显著关联(P<0.05),暗示其可作为香港牡蛎糖原含量性状的潜在分子标记,研究结果为高糖原含量香港牡蛎新品种的分子标记辅助选育奠定了基础。

片段长度差异等位基因特异性PCR研究贵州汉族群体EsD多态性

目的探讨建立检测EsD点突变rs9778的片段长度差异等位基因特异性PCR技术(Fragment length discrepant allele specific PCR,FLDAS-PCR),并调查贵州汉族群体遗传学参数。方法针对EsD基因点突变(NCBI Reference SNP ID:rs9778),设计片段长度差异等位基因特异性PCR引物进行扩增,经丙烯酰胺凝胶电泳分离、银染显带后分型,并调查175例贵州省汉族无关群体等位基因数。结果片段长度差异等位基因特异性PCR技术对EsD-rs9778亚型的3种基因型分型明确。贵州省汉族人群EsD-rs9778 A/G基因频率分别为0.651和0.349,基因型频率分别为1/1 0.434、1/2 0.434和2/2 0.132,Ho 0.434、He 0.457、PIC 0.351、DP 0.599、PEt 0.176 PEd 0.103,基因型分布符合HardyWeinberg平衡。结论片段长度差异等位基因特异性PCR技术对EsD-rs9778亚型的3种基因型分型明确,该位点多态性有实际应用价值。