长非编码反义RNA FMR1-AS1及其正义RNA FMR1在宫颈癌中的表达

目的:通过整合计算多中心样本研究长非编码反义RNA FMRP翻译调节因子1反义RNA 1 (FMRP translationalregulator1antisenseRNA1,FMR1-AS1)与相应正义RNAFMR1在宫颈癌中的表达。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库检索并下载宫颈癌相关高通量数据集。箱图和独立样本t检验用于比较宫颈癌组织与非癌宫颈组织中FMR1-AS1、FMR1的表达差异。整合计算标准化均数差(standard mean difference,SMD)用于综合探究FMR1-A S1、FMR1在宫颈癌中的表达水平。使用Pearson相关分析研究FMR1-AS1与FMR1表达的相关性。基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)用于研究相关的信号通路。结果:合并SMD的结果显示FMR1-AS1在宫颈癌组织中高表达(SMD=0.63,95%CI:0.15~1.11)。同时,合并1018例样本(678例宫颈癌组织,340例正常宫颈组织)的结果表明FMR1在宫颈癌组织中的表达显著高于正常宫颈组织(SMD=0.49,95%CI:0.32~0.67)。Pearson相关分析表明:FMR1-AS1与FMR1在宫颈癌组织中的表达呈显著正相关(Pearson’sr=0.4463,P<0.00001)。GSEA结果表明FMR1-AS1和FMR1可能参与基因表达调控相关通路。结论:FMR1-AS1与FMR1在宫颈癌组织中的表达显著上调且两者呈正相关,两者可能共同发挥促癌作用,值得进一步研究二者潜在的调控机制。