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上皮性卵巢癌组织中FOXC1 mRNA表达变化及其启动子区甲基化情况观察 被引量:4
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作者 李倩 任琛琛 +4 位作者 杨立 薛景戈 白杨 张娟 黄玲 《山东医药》 CAS 北大核心 2015年第38期21-23,共3页
目的观察卵巢上皮性肿瘤中FOXC1 mRNA表达变化及其启动子区甲基化情况。方法选择30例上皮性卵巢癌(A组)、14例交界性卵巢上皮性肿瘤(B组)和21例良性卵巢上皮性肿瘤患者(C组),取其手术切除卵巢组织标本,用RT-PCR法检测FOXC1 mRNA,用甲基... 目的观察卵巢上皮性肿瘤中FOXC1 mRNA表达变化及其启动子区甲基化情况。方法选择30例上皮性卵巢癌(A组)、14例交界性卵巢上皮性肿瘤(B组)和21例良性卵巢上皮性肿瘤患者(C组),取其手术切除卵巢组织标本,用RT-PCR法检测FOXC1 mRNA,用甲基化特异聚合酶链反应方法(MSP)结合琼脂糖凝胶电泳检测FOXC1基因启动子区甲基化状态及频率。结果 A、B、C组FOXC1 mRNA相对表达量分别为0.38±0.16、0.61±0.18、1.19±0.17,A组低于B组,B组低于C组(P均<0.05)。A组卵巢癌组织中FOXC1 mRNA相对表达量与临床分期及分化程度无关,与淋巴结转移有关(P<0.05)。A、B、C组卵巢组织中FOXC1基因启动子区甲基化频率分别为66.7%、50.0%、9.5%,A组高于B组,B组高于C组(P均<0.05)。A组FOXC1基因启动子区甲基化、未甲基化者FOXC1 mRNA相对表达量分别为0.32±0.14、0.45±0.17,P<0.05。结论上皮性卵巢癌组织中FOXC1 mRNA表达下降,FOXC1 mRNA表达与上皮性卵巢癌淋巴结转移有关。FOXC启动子区甲基化状态与其mRNA表达抑制相关。 展开更多
关键词 上皮性卵巢癌 叉头框转录因子 foxc1基因 DNA甲基化 基因表达
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沉默FOXC1基因对鼻咽癌细胞系5-8F凋亡和周期的影响 被引量:4
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作者 易世江 陈柏林 +3 位作者 申一鸣 陈莹 刘鹏 雷迅 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第21期3517-3520,共4页
目的:探讨沉默叉头框C1(forkhead boxC1,FOXC1)基因对鼻咽癌细胞系5-8F凋亡和细胞周期的影响。方法:利用si RNA技术在5-8F细胞中沉默FOXC1基因,通过流式细胞仪检测细胞凋亡和周期的变化,应用Western blot方法检测相关蛋白Bcl-2、CyclinD... 目的:探讨沉默叉头框C1(forkhead boxC1,FOXC1)基因对鼻咽癌细胞系5-8F凋亡和细胞周期的影响。方法:利用si RNA技术在5-8F细胞中沉默FOXC1基因,通过流式细胞仪检测细胞凋亡和周期的变化,应用Western blot方法检测相关蛋白Bcl-2、CyclinD1的表达。结果:FOXC1基因沉默后5-8F细胞的凋亡率明显增高,且Bcl-2蛋白表达减弱(P<0.05),处于G1期的细胞数减少,处于S期的细胞数增多,同时降低了CyclinD1蛋白的表达(P<0.05)。结论:沉默FOXC1基因可能通过下调Bcl-2表达促进5-8F细胞凋亡,又可能通过调节CyclinD1的表达影响5-8F细胞周期分布,这说明FOXC1在鼻咽癌进展中的作用值得进一步研究。 展开更多
关键词 鼻咽癌 foxc1 基因沉默 BCL-2 CYCLIND1
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沉默FOXC1基因对人胰腺癌细胞增殖的影响 被引量:3
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作者 喻超 江建新 孙诚谊 《世界华人消化杂志》 CAS 2015年第11期1712-1720,共9页
目的:研究小干扰RNA(small interfering R N A,s i R N A)沉默人胰腺癌Capan-2、PANC-1细胞中叉头框蛋白C1(fork head box C1,FOXC1)基因对胰腺癌细胞增殖能力的影响及作用机制.方法:以胰腺癌细胞、原发胰腺癌组织为研究对象,实时定量... 目的:研究小干扰RNA(small interfering R N A,s i R N A)沉默人胰腺癌Capan-2、PANC-1细胞中叉头框蛋白C1(fork head box C1,FOXC1)基因对胰腺癌细胞增殖能力的影响及作用机制.方法:以胰腺癌细胞、原发胰腺癌组织为研究对象,实时定量逆转录聚合酶链反应(quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction,q RT-PCR)检测FOXC1 m RNA在胰腺癌细胞及组织中的表达情况;将人胰腺癌细胞分为2组:FOXC1s i R N A组(实验组)、N C s i R N A组(阴性对照组),脂质体转染法将FOXC1 si RNA转染入胰腺癌细胞,q RT-PCR、Western blot技术检测胰腺癌细胞FOXC1 m RNA及蛋白表达变化,5-乙炔基-2'-脱氧尿苷(5-ethynyl-2'-deoxyuridine,Ed U)细胞增殖法检测各组胰腺癌细胞增殖情况;流式细胞技术(flow cytometry,FCM)检测各组胰腺癌细胞的周期分布,Western blot技术分析周期相关蛋白P21、P53、Cyclin D1蛋白表达情况.结果:q RT-PCR结果提示:相比正常胰腺上皮细胞和癌旁胰腺组织,FOXC1 m RNA在胰腺癌细胞及胰腺癌组织中表达较高(P<0.05);q RT-P C R及Westernblo t结果显示FOXC1 si RNA有效沉默了胰腺癌细胞F O X C1基因的转录和表达,E d U细胞增殖实验提示:沉默了胰腺癌细胞F O X C1基因表达后,胰腺癌细胞胞的增殖能力明显下降,较阴性对照组,差异有统计学意义(P<0.05);F C M结果显示:沉默了胰腺癌细胞FOXC1基因表达后胰腺癌细胞被阻滞在G0/G1期,较阴性对照组,差异有统计学意义(P<0.05);Western blot结果显示:较阴性对照组,P21、P53表达水平无明显变化,Cyclin D1表达水平下降,差异有统计学意义(P<0.05).结论:FOXC1 si RNA能够有效沉默人胰腺癌Capan-2、PANC-1细胞FOXC1基因的表达,抑制其增殖,将细胞周期阻滞于G0/G1期,提示FOXC1影响细胞增殖可能是通过调控细胞周期实现的,其机制可能是部分通过调控细胞周期蛋白Cyclin D1的表达而实现. 展开更多
关键词 foxc1基因 小干扰RNA 胰腺癌 增殖
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利用GEO结肠癌芯片数据分析FOXC1及其相关基因的表达与意义
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作者 马红梅 刘曙光 许伟珊 《国际医药卫生导报》 2018年第23期3535-3538,共4页
目的 探讨叉头框C1(forkhead box C1,FOXC1)在结肠癌的表达水平与临床病理特征及预后的关系,并分析预测与其表达密切相关的基因及其参与的生物过程。方法 利用高通量基因表达(Gene expression omnibus,GEO)数据库中结肠癌基因芯片数据分... 目的 探讨叉头框C1(forkhead box C1,FOXC1)在结肠癌的表达水平与临床病理特征及预后的关系,并分析预测与其表达密切相关的基因及其参与的生物过程。方法 利用高通量基因表达(Gene expression omnibus,GEO)数据库中结肠癌基因芯片数据分析FOXC1与临床病理特征及预后的相关性,采用R2平台,筛选出与FOXC1表达显著相关的基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书通路分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析。结果 FOXC1的表达与肿瘤分化程度有关(χ2=7.919,P=0.019)。Kaplan-Meier法分析显示FOXC1的表达与患者的总生存期有相关性(P=0.045)。采用R2平台检测出与FOXC1表达显著相关基因共608个(其中正相关387个、负相关221个),对GO及KEGG通路分析后发现FOXC1高表达的肿瘤样本富集到其中564相关基因,主要涉及到血管生成、细胞增生、凋亡、细胞粘附、蛋白磷酸化信号传导、转录因子结合和上皮间质转化等多个肿瘤发生、发展过程。肿瘤信号通路主要涉及Wnt信号通路。结论 FOXC1表达在结肠癌中是一种不良预后因素,可作为判断预后的标志物。FOXC1表达相关的基因参与了多个结肠癌生物过程和信号通路,可为结肠癌分子标志物的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 基因表达 foxc1 基因芯片
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FOXC1基因新突变致Axenfeld-Rieger综合征伴脑白质病变和皮肤淀粉样变
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作者 贾红艳 彭楚芝 +2 位作者 张冉冉 焦永红 王涛 《眼科》 CAS 2024年第3期187-192,共6页
目的分析Axenfeld-Rieger综合征(ARS)一家系的临床及遗传学特征。设计家系调查研究。研究对象北京同仁医院Axenfeld-Rieger综合征一家系3人。方法对家系成员进行详细眼科检查及全身检查。采集受检者外周静脉血,提取DNA,对先证者进行全... 目的分析Axenfeld-Rieger综合征(ARS)一家系的临床及遗传学特征。设计家系调查研究。研究对象北京同仁医院Axenfeld-Rieger综合征一家系3人。方法对家系成员进行详细眼科检查及全身检查。采集受检者外周静脉血,提取DNA,对先证者进行全外显子组测序(WES),对筛选出的可疑致病基因突变进行Sanger测序验证以及家系共分离验证。主要指标眼部检查结果、全身体格检查结果、突变基因型、颅脑MRI。结果收集先证者及其父母3个样本。先证者表现为双眼前节发育异常、左眼球震颤、左眼斜视、左眼青光眼、左眼高度近视眼底表现和左眼后巩膜葡萄肿。全身检查提示左耳混合性耳聋、轻度主动脉瓣关闭不全、皮肤淀粉样变。颅脑MRI提示双侧多发脑白质病变。先证者同时还具有内眦距增宽、鼻根宽而扁平等颅面特征。先证者父亲具有与先证者相似的眼前节表现和全身异常。基因检测及生物信息学分析结果提示先证者及其父亲均存在FOXC1基因未报道的新插入变异NM_001453:c.1043_1044insGGCGCTC,p.(Tyr353fs)(chr6:1611723T>TGGCGCTC,hg19),GWAS、1000g、ESP、GnomeAD、ExAC、HGMD数据库中均未收录该变异,ACMG(美国医学遗传学与基因组学学会)遗传变异分类标准与指南评估该变异位点为致病变异,该变异推测会导致截短蛋白的产生。正常表型家系成员未检测到该变异,符合家系遗传共分离。结论FOXC1基因新的插入突变c.1043_1044insGGCGCTC(p.Tyr353fs)是该家系疾病表型的致病原因。同时,这也是ARS患者首次报道合并脑白质病变和皮肤淀粉样变的表型,拓宽了该疾病的基因型和表型谱。 展开更多
关键词 AXENFELD-RIEGER综合征 foxc1基因
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Identification of a novel frameshift mutation in PITX2 gene in a Chinese family with Axenfeld-Rieger syndrome 被引量:5
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作者 Hou-fa YIN Xiao-yun FANG +5 位作者 Chong-fei JIN Jin-fu YIN Jin-yu LI Su-juan ZHAO Qi MIAO Feng-wei SONG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2014年第1期43-50,共8页
Objective: Axenfeld-Rieger syndrome (ARS) is phenotypically and genetically heterogeneous. In this study we identified the underlying genetic defect in a Chinese family with ARS. Methods: A detailed family history... Objective: Axenfeld-Rieger syndrome (ARS) is phenotypically and genetically heterogeneous. In this study we identified the underlying genetic defect in a Chinese family with ARS. Methods: A detailed family history and clinical data were recorded. The ocular phenotype was documented using slit-lamp photography and systemic anomalies were also documented where available. The genomic DNA was extracted from peripheral blood leukocytes. All coding exons and intron-exon junctions of paired-like homeodomain transcription factor 2 (PITX2) gene and the forkhead box C1 (FOXC1) gene were amplified by polymerase chain reaction (PCR) and screened for mutation by direct DNA sequencing. Variations detected in exon 5 of PITX2 were further evaluated with cloning sequencing. The exon 5 of PITX2 was also sequenced in 100 healthy controls, unrelated to the family, for comparison. Structural models of the wild type and mutant homeodomain of PITX2 were investigated by SWISS-MODEL. Results: Affected individuals exhibited variable ocular phenotypes, whereas the systemic anomalies were similar. After direct sequencing and cloning sequencing, a heterozygous deletion/insertion mutation c. 198_201delinsTTTCT (p.M661fs*133) was revealed in exon 5 of PITX2. This mutation co-segregated with all affected individuals in the family and was not found either in unaffected family members or in 100 unrelated controls. Conclusions: We detected a novel frameshift mutation p.M661fs*133 in PITX2 in a Chinese family with ARS. Although PITX2 mutations and polymorphisms have been re- ported from various ethnic groups, we report for the first time the identification of a novel deletion/insertion mutation that causes frameshift mutation in the homeodomain of PITX2 protein. 展开更多
关键词 Axenfeld-Rieger syndrome PITX2 gene foxc1 gene Frameshift mutation HOMEODOMAIN
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东北地区原发性闭角型青光眼家系PITX2基因和FOXC1基因突变筛查
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作者 李元媛 周欣荣 +1 位作者 原慧萍 康杨 《眼科》 CAS 2011年第1期54-57,共4页
目的通过分子遗传学研究筛查原发性闭角型青光眼家系PITX2基因和FOXC1基因突变情况。设计实验研究。研究对象东北地区原发性闭角型青光眼4个家系13例患者和24例健康成员。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增PITX2基因和FOXC1基因所有编码外... 目的通过分子遗传学研究筛查原发性闭角型青光眼家系PITX2基因和FOXC1基因突变情况。设计实验研究。研究对象东北地区原发性闭角型青光眼4个家系13例患者和24例健康成员。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增PITX2基因和FOXC1基因所有编码外显子,直接测序法筛查致病突变。主要指标PITX2基因、FOXC1基因序列。结果所分析的4个家系13例患者基因组DNA中均未检测到PITX2基因、FOXC1基因突变。结论 PITX2基因和FOXC1基因不是中国东北地区该原发性闭角型青光眼家系的致病病因。 展开更多
关键词 PITX2基因 foxc1基因 原发性闭角型青光眼
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基于权重基因共表达分析的结肠癌肝转移相关基因挖掘与验证 被引量:2
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作者 高博 陈卓妙语 王秋生 《中华结直肠疾病电子杂志》 2020年第4期363-369,共7页
目的挖掘结肠癌肝转移过程中的核心基因模块和分子靶点,并验证其对临床预后及结肠癌转移能力的影响。方法基于GEO数据库结肠癌肝转移测序样本,利用权重基因共表达网络分析(WGCNA)技术筛选转移相关基因模块。利用MCODE软件进一步挖掘结... 目的挖掘结肠癌肝转移过程中的核心基因模块和分子靶点,并验证其对临床预后及结肠癌转移能力的影响。方法基于GEO数据库结肠癌肝转移测序样本,利用权重基因共表达网络分析(WGCNA)技术筛选转移相关基因模块。利用MCODE软件进一步挖掘结肠癌肝转移相关核心子模块并分析其功能。基于TCGA数据库,进行子模块基因对结肠癌预后影响的大临床样本验证。分子生物学方法验证子模块基因对结肠癌细胞系HCT116迁移和侵袭能力的影响。结果WGCNA分析筛选出5个基因模块,其中模块1与结肠癌肝转移关系密切。模块1共包含4个核心子模块,主要参与G蛋白偶联受体信号调节、表观遗传学调控、mRNA的剪接调节等功能。大临床样本验证发现子模块4中的FOXC1基因与结肠癌患者生存率密切相关。敲减FOXC1在HCT116细胞中的表达后,HCT116的迁移能力(t=3.123,P=0.035)和侵袭能力(t=2.936,P=0.043)受到显著抑制。结论本研究筛选出的结肠癌肝转移相关子模块可能具有重要的促转移作用,子模块基因FOXC1与结肠癌患者较差的生存率相关并具有促结肠癌转移能力。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 结肠癌肝转移 WGCNA分析 基因模块 foxc1 肿瘤侵袭
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