新的人突触相关蛋白(FRG4)多重序列及进化分析

运用热启动PCR末端延伸快速分离FRG4基因全长cDNA序列,经克隆测序后进行多重序列分析,FRG4与人突触相关蛋白(HomosapiensSynapse-associatedProtein,SAP1)有着高度的同源性(核酸同源性为99%,氨基酸同源性为87%),选取拥有BSD功能域的序列进行对齐分析。发现特别是130～220位氨基酸之间具有高度的同源性。说明在这一区域可能含有一重要的功能域,而预测到的BSD正好位于这一区域.进化分析。FRG4编码蛋白形成突触相关蛋白家族(SAP家族)一个独立的分支,FRG4的BSD功能域与SAP家族的PDZ,SH3,GK功能域比较。其同源性低于10%,说明在长期的进化过程中,FRG4编码蛋白已逐渐发生变异.可能是SAP家族中一种新的蛋白.