牦牛FTL基因克隆、生物信息学及表达分析

旨在了解牦牛铁蛋白轻链(FTL)基因的结构与功能,以及在不同年龄段8个组织中的表达规律。以成年(36月龄)美仁牦牛肝脏组织cDNA为模板,克隆FTL基因的编码区序列,并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量(qRT-PCR)技术检测FTL基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、脂肪、睾丸中的相对表达量。结果表明,美仁牦牛FTL基因的CDS区为528 bp,共编码175个氨基酸,与野牦牛和牛的亲缘关系最近(99.8%);FTL蛋白为稳定亲水性分泌蛋白,不存在信号肽和跨膜结构,主要分布在细胞质中,蛋白的二级结构以α-螺旋为主,主要与FTH1、SCARA5、NCOA4等蛋白存在相互作用。qRT-PCR结果显示,FTL基因在成年牛的表达量依次为肝脏、肾脏、睾丸,脾脏、肺脏、脂肪、背最长肌、心脏,在7日龄犊牛的脂肪和背最长肌组织中表达最高,成年牛中肝脏组织表达量最高;通过2个阶段比对发现,脂肪、背最长肌和心脏组织的表达量随美仁牦牛年龄的增长呈下降趋势,而肺脏、脾脏、睾丸、肾脏和肝脏组织的表达量随年龄的增长而升高。

异丙酚通过miR-133a-3p/FTL轴调控GADD45A/JNK通路影响胃癌细胞增殖、迁移及凋亡

目的:探讨异丙酚是否通过miR-133a-3p/FTL轴调控GADD45A/JNK通路影响胃癌细胞的增殖、迁移及凋亡。方法:将胃癌MKN-28细胞系分为磷酸盐缓冲液(PBS)组、异丙酚组、miR-NC组、miR-133a-3p mimics组、anti-miR-NC组、anti-miR-133a-3p组、si-NC组、si-FTL组、异丙酚+anti-miR-NC+si-NC组、PBS+anti-miR-NC+si-NC组、异丙酚+anti-miR-133a-3p+si-NC组、异丙酚+anti-miR-133a-3p+si-FTL组。应用RT-qPCR检测miR-133a-3p和铁蛋白轻链(FTL)mRNA的表达水平;应用MTT法与克隆形成实验测细胞增殖;应用流式细胞术、蛋白质印迹法分别检测细胞凋亡及蛋白表达水平;应用双荧光素酶报告实验检测miR-133a-3p与FTL的靶向关系;应用划痕实验与Transwell侵袭实验检测细胞迁移和侵袭。结果:与PBS组比较,异丙酚组细胞活性、划痕愈合率、细胞克隆形成数、迁移、侵袭细胞数均减少(P<0.05);细胞凋亡率、p53、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、miR-133a-3p、GADD45A及p-JNK蛋白表达水平均升高(P<0.05),FTL表达水平降低(P<0.05)。双荧光素酶实验结果显示,miR-133a-3p靶向调控FTL。敲低FTL或过表达miR-133a-3p后,细胞凋亡率升高,细胞活性、划痕愈合率、细胞克隆形成数、迁移和侵袭细胞数降低;细胞中GADD45A、p-JNK、p53、Bax表达水平升高(P<0.05)。敲低FTL逆转了使用异丙酚及抑制miR-133a-3p表达对GADD45A/JNK信号通路以及MKN-28细胞恶性生物学行为的影响。结论:异丙酚可能通过miR-133a-3p/FTL轴调控GADD45A/JNK通路继而抑制胃癌细胞增殖、迁移,并促进细胞凋亡。

一种改进型的SSD FTL算法

SSD的FTL层是SSD的设计核心,其主要功能是负责将Flash映射为块设备,同时完成地址转换、垃圾回收,数据读写等操作.由于FTL算法性能的优劣直接决定了SSD的使用寿命,本文从该处着手,在深入分析了SSD写入机制的基础上,提出了改进型FTL算法.该算法通过内容感知技术,能够有效的减少重复写操作,延长SSD的使用寿命.

一种基于NAND Flash的FTL算法验证平台的设计与实现

闪存转换层(FTL)算法的设计与开发对于固态硬盘的整体性能至关重要,由于缺乏错误检测机制,目前现有的算法验证平台检验结果与真实结果差距较大.本文提出一种基于NAND Flash的FTL算法验证平台,通过建立基于NAND Flash存储系统的软件平台,模拟NAND Flash的操作特性,增加错误检测机制,模拟真实操作环境,完成FTL算法的验证.本文对软件平台的整体设计和核心模块进行了分析描述.最后,在该软件平台与真实闪存设备上运行FTL算法完成模拟实验,实验证明两者误差范围在7%以内.本文提出的一种基于NAND Flash的FTL算法验证平台为验证FTL算法提供了一种便捷工具,同时提高了存储系统的可靠性,缩短了算法开发的周期,降低了产品成本.

FTL-空间上的Fuzzy连续线性算子

本文将[1]中给出的fuzzy线性算子的定义作了适当的修改,使之更适合于在fuzzy拓扑线性空间(简称FTL-空间)中研究。我们证明了fuzzy线性算子的一个分解定理。在此基础上,研究了FTL-空间上fuzzy线性算子的连续性的一系列等价刻划,讨论了fuzzy线性算子的连续性与有界性的关系。最后,给出了FTL-空间上fuzzy连续线性算子族的一致有界原理。

山羊FTL基因克隆、序列分析和组织表达研究

为了探讨山羊体内铁蛋白轻链(ferritin light chain,FTL)的结构及生物学功能,试验利用RT-PCR技术克隆得到山羊FTL基因序列,通过在线软件分析其生物学特性,构建物种进化树揭示物种间亲缘关系;根据克隆获得的FTL基因序列,通过实时荧光定量PCR技术检测山羊FTL基因在不同组织中表达水平;复苏前期保存的山羊肌内前体脂肪细胞,利用实时荧光定量PCR技术检测FTL基因在诱导分化各时间点的相对表达量。结果表明:克隆获得的山羊FTL基因编码区(CDS)序列全长为745 bp,其中包括完整的大小为528 bp的ORF,共编码173个氨基酸;FTL蛋白有6个丝氨酸磷酸化位点,4个苏氨酸磷酸化位点,有23个带正电荷的赖氨酸和精氨酸残基,26个带负电荷的谷氨酸和天冬氨酸残基,无跨膜结构域;山羊FTL基因与牛进化亲缘关系最近;FTL基因在山羊体内各器官/组织中均有不同程度的表达,其中在肝脏中的相对表达量最高;FTL基因在24小时时相对表达量最高,24 h后的表达量呈不断下降的趋势。说明山羊FTL蛋白与脂肪代谢具有一定直接或间接关系。

AFTL:一种基于高级指令的闪存转换层

为了对多层次并行固态盘提供的多种并行性进行高效利用,提出一种基于冷热数据的FTL算法:AFTL,通过对高级指令多分组指令(multi-plane)和交错指令(interleave)的使用,达到并行性利用的最大化,冷热数据识别与内部数据迁移指令(copy-back)、多分组擦除指令的结合则大大降低了垃圾回收的成本,两者的组合最终使得整体性能获得进一步提升.仿真结果显示,在多种负载、多种不同通道数的情况下,相对于同样综合利用多种并行性的动态FTL算法,写响应时间平均减少15.3%,相对于DLOOP算法,写响应时间平均减少78.9%.

具有磨损均衡意识的混合固态硬盘FTL算法

在采用SLC(Single-Level-Cell)和MLC(Multi-Level-Cell)闪存的混合固态硬盘设计中,SLC和MLC之间的写数据分配和磨损均衡是混合固态硬盘闪存转换层设计的关键问题之一.针对此问题,提出一种具有磨损均衡意识的混合固态硬盘闪存转换层算法——WLAFTL(Wear Leveling Aware Flash Translation Layer).首先,它提出了一种动态的基于磨损均衡思想和请求大小融合的数据分配机制,即根据SLC和MLC的磨损速率来动态调整热数据识别阈值的大小,然后将小的写请求分配到SLC、大的写请求分配到MLC.其次,它提出了一种基于磨损均衡思想与数据先进先出(FIFO)调度策略融合的SLC冷数据回收/迁移机制,减少由SLC向MLC迁移的数据量.实验结果显示,与ComboFTL和CFTL算法相比,在使用相同地址映射机制的条件下,WLAFTL算法的平均响应时间分别平均有13.6%和12.7%的改善,总的擦除次数分别平均减少9.2%和20.4%,同时能够更好地实现SLC和MLC之间的磨损均衡.

针对固态驱动器的NFTL算法性能优化

用于闪存的NFTL算法随着闪存技术的发展表现出空间利用率低、擦除效率不高等不足,为保证读速度牺牲Flash读性能上的优势,而且不适用于固态驱动器。基于此,提出一种改进方案,利用增加内存中存放的包括有效位图和反向映射表等元数据的方式改进NFTL算法使其适用于固态驱动器,取得一定的性能提升。

项目管理在FTLS研发项目中的应用研究

在FTLS研发项目进度计划与控制研究中,对计划管理中的进度计划和控制计划,采用定量分析法和定性分析法进行研究。通过进行优化,在不影响费用、质量的前提下,对工期进行控制。进而在FTLS研发项目中,为应用项目管理提供参考依据,对于一般的研发项目同样具有借鉴意义。

无线传感器网络中FTL定位算法的设计与仿真实现

利用模糊数学思想将坐标问题转变成空间所属区域问题,提出了一种无线传感器网络中新的定位算法——模糊三角形(FTL)算法,并使用NS2仿真系统对该算法的设计进行仿真实现和性能分析.结果显示,FTL算法计算量小、计算精度高,可以满足无线传感器网络的定位精度、内存损耗以及硬件要求.

加工缝纫机机架用FTL

除铣削加工外，尚可在喷漆后进行孔的精加工和攻螺纹。月加工能力６０００件，比原来的ＤＮＣ提高了一倍多。投资总额为９亿日圆。

MFTL:一种基于固态盘系统非对齐更新数据的合并策略

基于NAND的闪存中由于其特殊的物理读写特性,使得固态盘内部广泛存在非对齐的数据存储,而这部分非对齐数据会导致系统产生额外的性能损耗和造成物理可用存储空间的浪费.基于固态盘中存在非对齐写更新操作提出一种MFTL缓存架构,其核心的思想是利用写更新数据存储不对齐的特性,通过重新设计页级映射的FTL将缓存中不同逻辑数据页存在的非对齐更新数据合并为闪存页规格的大小后写回至闪存阵列中,可以节省由于写更新操作导致的额外读取操作的同时也充分减少实际的闪存写入次数,因而降低了底层处理请求队列的负载压力和相应增加了闪存的物理可用容量.通过SSDsim实现并测试相关负载后实验结果表明,与原FTL系统相比,提出的MFTL结构能够省略100%的非对齐写更新导致的额外读操作开销,并且充分减少了固态盘写入次数,从而扩大了可用存储容量和提高固态盘的写性能.

形式化建模运行在NAND闪存上的DFTL算法

为了保证一种非常经典的适用大规模存储地NAND闪存上的DFTL算法的正确性,对DFTL算法采用了形式化建模的方法来建立一个高可信的形式化模型.根据DFTL算法提出者的设计,我们以此为依据,对DFTL算法的基本数据结构,读写操作和垃圾回收操作以及基本性质进行了形式化的建模和验证,并对文中提出的垃圾回收算法进行了适当的修改和优化,以证明垃圾回收算法的正确性.最后我们针对DFTL算法,设计了一个验证框架,在这个验证框架和形式化的NAND闪存模型的基础上,对DFTL算法的的一些基本性质进行了验证.

消化道肿瘤患者抗FTL自身抗体检测及诊断意义

目的探讨抗铁蛋白轻链(ferritin light chain,FTL)自身抗体(以下简称FTL抗体)在常见消化道肿瘤诊断中的价值。方法用ELISA法检测消化道癌症患者(食管癌、胃癌、原发性肝癌均为250例),慢性肝病患者(乙肝120例、丙肝54例、肝硬化58例)和113例正常人血清中的FTL抗体,比较不同组间FTL抗体含量及阳性率的差异。结果各癌症组FTL抗体含量均高于正常对照组(均P<0.001),其中肝癌组FTL抗体含量高于食管癌组和胃癌组(均P<0.001);肝癌组FTL抗体含量高于慢性肝病组(P=0.000),慢性肝病组FTL抗体含量高于正常对照组(P=0.000);食管癌、胃癌、肝癌、慢性肝病组FTL抗体阳性率分别为46.8%、48.4%、61.6%、32.3%,均高于正常对照组的0.9%(均P=0.000),其中肝癌组抗体阳性率高于食管癌、胃癌和慢性肝病组(均P<0.01),慢性肝病组抗体阳性率高于正常对照组(χ2=43.738,P=0.000);FTL抗体检测食管癌、胃癌、肝癌的灵敏度分别为46.8%、48.4%、61.6%,特异度均为99.1%。结论 FTL抗体在消化道肿瘤患者体内含量增高,对于诊断消化道肿瘤有一定意义。

靶向FTL基因的shRNA真核表达载体的构建及鉴定

目的:为了构建铁蛋白轻链(ferritin light chain,FTL)的短发夹小干扰RNA表达载体,并提供进一步研究FTL功能的平台。方法:针对小鼠FTL基因的特异性位点设计并合成特异性长度约65bp的短发夹状小干涉RNA(shRNA)寡核苷酸序列,退火形成双链后将其插入真核表达载体pRNA-U6.1/neo的限制性内切酶HindⅢ和Bam HⅠ之间中,构建成FTL基因的干扰载体(FTL shRNA)。经测序鉴定正确后,用lipofectamineTM2000将FTL shRNA及其对照空载体pRNA-U6.1/neo分别转染到小鼠腹腔单核巨噬细胞(RAW264.7)中,提取蛋白后利用Western blot技术检测细胞中FTL蛋白的表达。结果:得到与预期目的片段大小相似的重组载体,测序结果显示所构建的小鼠FTL shRNA质粒序列正确。细胞内的FTL表达被FTL shRNA成功干扰,效率高达80%。结论:实验成功构建了小鼠FTL基因的短发夹小RNA干扰表达载体FTL shRNA。

基于茫然传输协议的FATE联邦迁移学习方案

利用不同来源的数据参与机器学习模型的训练,能够使得训练出的模型的预测结果更加准确,然而大量的数据收集则会产生隐私方面的相关问题。FATE联邦迁移学习是一种基于同态加密的联邦学习框架,但FATE联邦迁移学习中同态加密计算复杂,收敛速度相对较慢,导致模型训练效率低。提出一种基于茫然传输协议的安全矩阵计算方案。通过实现矩阵加法和乘法及数乘的安全计算,完成参与两方交互下具有数据隐私保护特性机器学习模型的损失函数计算与梯度更新,并以此构造更高效的FATE联邦迁移学习算法方案。在此基础上,通过茫然传输扩展协议和通信批量处理,减少需要调用的茫然传输协议的数量,缩减通信轮数,从而降低茫然传输协议带来的通信消耗。性能分析结果表明,该方案的安全模型满足安全性和隐私保护性,并且具有一定的可扩展性,在局域网环境下,相比基于同态加密的方案,模型收敛的平均时间缩短约25%,并且随着数据样本特征维度的增加,该方案仍能保持稳定的收敛速度。

Flash文件系统的研究与设计

Flash文件系统(FFS)已经成为嵌入式系统中数据存储和数据管理的一个热点。对Flash文件系统结构和功能作了详细深入的研究分析,针对在无OS环境下的应用,提出了一个完整的设计方案。