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基于结构B因子分析指导的头孢菌素C酰化酶动力学稳定性改造
被引量:
2
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作者
刘新花
杨广宇
+2 位作者
邓子新
谢渊
刘天罡
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1405-1415,共11页
【目的】筛选Pseudomonas sp.SE83 acy Ⅱ定点饱和突变库,获得动力学稳定性提高的头孢菌素C(CPC)酰化酶突变体,并对突变酶进行初步的结构-功能关系分析。【方法】靶标酶Pseudomonas sp.SE83 acy Ⅱ与Pseudomonas diminuta N176具有较高...
【目的】筛选Pseudomonas sp.SE83 acy Ⅱ定点饱和突变库,获得动力学稳定性提高的头孢菌素C(CPC)酰化酶突变体,并对突变酶进行初步的结构-功能关系分析。【方法】靶标酶Pseudomonas sp.SE83 acy Ⅱ与Pseudomonas diminuta N176具有较高的同源性,通过分析N176的结构B因子,构建CPC酰化酶SE83定点饱和突变库;基于pH指示剂显色法,采用Biomek FX^P自动工作站建立CPC酰化酶高通量筛选方法,获得优良突变酶,对其活性、稳定性等酶学性质进行表征;利用SWISS-MODEL对突变体进行同源建模,探讨突变体结构与功能的关系。【结果】通过B因子分析和同源结构比对,共找出9个靶标位点;经过3轮筛选,发现R218及K226位点突变显著提高酶的热稳定性,其中最显著的R218Q和K226V在40°C的半衰期分别为野生型的3.77和2.77倍,催化效率k_(cat)/K_m分别为野生型的1.8和3.1倍。同源建模分析表明氢键作用和疏水相互作用的增加可能是突变体稳定性提高的原因。【结论】B因子指导的酶分子改造是一种高效可靠的动力学稳定性改造策略,突变体R218Q和K226V均可提高CPC酰化酶的稳定性和催化效率,对进一步的CPC酰化酶分子改造具有一定的参考价值和指导意义。
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关键词
头孢菌素C酰化酶
半衰期
动力学稳定性
B因子
Biomek
FX^P
高通量
筛选
原文传递
题名
基于结构B因子分析指导的头孢菌素C酰化酶动力学稳定性改造
被引量:
2
1
作者
刘新花
杨广宇
邓子新
谢渊
刘天罡
机构
武汉大学药学院组合生物合成与新药发现教育部重点实验室
武汉瀚海新酶生物科技有限公司
湖北省合成微生物技术工程实验室武汉生物技术研究院
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1405-1415,共11页
基金
国家自然科学基金项目(No.31670090)~~
文摘
【目的】筛选Pseudomonas sp.SE83 acy Ⅱ定点饱和突变库,获得动力学稳定性提高的头孢菌素C(CPC)酰化酶突变体,并对突变酶进行初步的结构-功能关系分析。【方法】靶标酶Pseudomonas sp.SE83 acy Ⅱ与Pseudomonas diminuta N176具有较高的同源性,通过分析N176的结构B因子,构建CPC酰化酶SE83定点饱和突变库;基于pH指示剂显色法,采用Biomek FX^P自动工作站建立CPC酰化酶高通量筛选方法,获得优良突变酶,对其活性、稳定性等酶学性质进行表征;利用SWISS-MODEL对突变体进行同源建模,探讨突变体结构与功能的关系。【结果】通过B因子分析和同源结构比对,共找出9个靶标位点;经过3轮筛选,发现R218及K226位点突变显著提高酶的热稳定性,其中最显著的R218Q和K226V在40°C的半衰期分别为野生型的3.77和2.77倍,催化效率k_(cat)/K_m分别为野生型的1.8和3.1倍。同源建模分析表明氢键作用和疏水相互作用的增加可能是突变体稳定性提高的原因。【结论】B因子指导的酶分子改造是一种高效可靠的动力学稳定性改造策略,突变体R218Q和K226V均可提高CPC酰化酶的稳定性和催化效率,对进一步的CPC酰化酶分子改造具有一定的参考价值和指导意义。
关键词
头孢菌素C酰化酶
半衰期
动力学稳定性
B因子
Biomek
FX^P
高通量
筛选
Keywords
CPC acylase
Half-life
Kinetic stability
B factor
Biomek FX^P high throughput screening
分类号
Q55 [生物学—生物化学]
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于结构B因子分析指导的头孢菌素C酰化酶动力学稳定性改造
刘新花
杨广宇
邓子新
谢渊
刘天罡
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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参考文献
引证文献
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