目的利用生物信息分析FZDs基因家族(FZD1~FZD10)在原发性肝癌中的作用。方法肝癌样本mRNA表达数据取自The Cancer Genome Atlas(TCGA),采用仙桃学术、GEPIA数据库、Kaplan-Meier Plotter数据库、cBioPortal数据库全面分析FZDs基因家族...目的利用生物信息分析FZDs基因家族(FZD1~FZD10)在原发性肝癌中的作用。方法肝癌样本mRNA表达数据取自The Cancer Genome Atlas(TCGA),采用仙桃学术、GEPIA数据库、Kaplan-Meier Plotter数据库、cBioPortal数据库全面分析FZDs基因家族在原发性肝癌中的表达及表达与肝癌分期和预后的关系,并进一步分析其基因突变水平和相关基因的通路富集。结果在肝癌组织中FZD1、FZD8的mRNA表达水平降低(P<0.05),FZD2、FZD3、FZD4、FZD5、FZD6、FZD10表达水平升高(P<0.05),且FZDs基因家族成员之间表达存在相关性。FZD1、FZD2、FZD6、FZD7、FZD8、FZD10表达与肝癌分期密切相关(P<0.05)。FZD1、FZD5、FZD6、FZD7高表达,FZD4、FZD9、FZD10低表达与肝癌患者预后不良相关(P<0.05)。此外,原发性肝癌中FZDs基因家族的总突变频率为29.78%,且所有基因均有突变发生。GO和KEGG富集分析发现FZDs基因家族在原发性肝癌作用的机制可能与Wnt信号通路、Hippo信号通路、干细胞多能干性调控相关信号通路和mTOR信号通路有关。结论FZDs基因家族成员可作为肝癌潜在治疗靶点和预后预测标记物,在原发性肝癌发生发展中起着关键作用。展开更多
文摘目的利用生物信息分析FZDs基因家族(FZD1~FZD10)在原发性肝癌中的作用。方法肝癌样本mRNA表达数据取自The Cancer Genome Atlas(TCGA),采用仙桃学术、GEPIA数据库、Kaplan-Meier Plotter数据库、cBioPortal数据库全面分析FZDs基因家族在原发性肝癌中的表达及表达与肝癌分期和预后的关系,并进一步分析其基因突变水平和相关基因的通路富集。结果在肝癌组织中FZD1、FZD8的mRNA表达水平降低(P<0.05),FZD2、FZD3、FZD4、FZD5、FZD6、FZD10表达水平升高(P<0.05),且FZDs基因家族成员之间表达存在相关性。FZD1、FZD2、FZD6、FZD7、FZD8、FZD10表达与肝癌分期密切相关(P<0.05)。FZD1、FZD5、FZD6、FZD7高表达,FZD4、FZD9、FZD10低表达与肝癌患者预后不良相关(P<0.05)。此外,原发性肝癌中FZDs基因家族的总突变频率为29.78%,且所有基因均有突变发生。GO和KEGG富集分析发现FZDs基因家族在原发性肝癌作用的机制可能与Wnt信号通路、Hippo信号通路、干细胞多能干性调控相关信号通路和mTOR信号通路有关。结论FZDs基因家族成员可作为肝癌潜在治疗靶点和预后预测标记物,在原发性肝癌发生发展中起着关键作用。
