一株石油降解菌TDYN1基因组测序及分析

从天津市大港油田附近土壤中分离的新型细菌Falsochrobactrum TDYN1。基于lllumina Hiseq 2000平台对TDYN1进行de novo测序分析,用GO、COG、KEGG、NR以及Swiss-Prot数据库进行基因组基本功能注释。结果表明:TDYN1的基因组测序总长度3 076 677 bp,共得到23个Scaffold, GC含量为55.96%,编码基因共3 465个,其中能够注释到GO、COG、KEGG、NR以及Swiss-Prot的基因数目分别为1 689、2 998、1 946、3 197以及2 513个;同时,预测到TDYN1拥有与石油烃代谢相关的代谢通路,该菌株具有能够降解二[口恶]英、多环芳烃、硝基甲苯等的能力。通过对TDYN1的全基因组测序和特异性功能基因分析,为进一步对菌株TDYN1的石油烃降解机制及应用研究奠定理论依据,为生产功能菌提供参考数据。