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Functional characterization of a Δ6 fatty acid desaturase gene and its 5′-upstream region cloned from the arachidonic acid-rich microalga Myrmecia incisa Reisigl(Chlorophyta) 被引量:1
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作者 ZHANG Li CAO Haisheng +1 位作者 NING Pu ZHOU Zhigang 《Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2018年第6期2308-2321,共14页
It is suggested that Δ6 fatty acid desaturase(FAD) plays a critical role in the biosynthesis of polyunsaturated fatty acids in plants and microalgae. But why does it adapt to the changed environments such as nitrogen... It is suggested that Δ6 fatty acid desaturase(FAD) plays a critical role in the biosynthesis of polyunsaturated fatty acids in plants and microalgae. But why does it adapt to the changed environments such as nitrogen starvation is seldom understood. One Δ6 FAD gene( MiD6 fad) from an arachidonic acidrich microalga M yrmecia incisa Reisigl(Chlorophyta) was first heterologously expressed in S accharomyces cerevisiae for the identification of function. The fatty acid profile of transgenic yeast detected by gas chromatography-mass spectrometry illustrated that the enzyme MiD6 FAD could convert linoleic and ?-linolenic acids to γ-linolenic and stearidonic acids, respectively, demonstrating that M iD6 fad encoded a Δ6 FAD. A 1 965-bp fragment of the cloned 2 347-bp 5′-upstream region of M iD6 fad was next subcloned and fused upstream with green fluorescent protein(GFP) gene to replace the GAL1 promoter of the vector pYES2. The generated construct was transformed into S. cerevisiae for function determination. Confocal microscopic images of the transformed line illustrated that this inserted fragment could drive GFP expression, which was further verified by fluorescence intensity quantification and Western blot analysis using antiGFP antibody. The conversion efficiency(approximately 2%-3%) of MiD6 FAD was much lower than the reported ? 3 FAD and Δ6 elongase in this microalga, suggesting that MiD6 FAD catalysed the possible ratelimiting step for ArA biosynthesis. The presence of several putative c is-acting regulatory elements in this identified promoter sheds new light on the regulation mechanism research of Δ6 FAD transcription for the ArA production in M. incisa in changing environmental factors. 展开更多
关键词 arachidonic acid(ArA) fatty acid desaturase(fad) green fl uorescent protein(GFP) green MICROALGA Saccharomyces cerevisiae 5′-upstream region(5′-USR)
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Origin and evolution of fatty acid desaturase genes in oil crop Brassica napus
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作者 Wei Zhao Lunwen Qian +2 位作者 Mei Guan Jun Liu Chunyun Guan 《Oil Crop Science》 CSCD 2022年第4期200-208,共9页
Fatty acid(FA)desaturases,as the key enzymes in lipid metabolism,are responsible for biosynthesis of the unsaturated fatty FAs,which play important roles in maintaining cell membrane integrity and multiple stress resp... Fatty acid(FA)desaturases,as the key enzymes in lipid metabolism,are responsible for biosynthesis of the unsaturated fatty FAs,which play important roles in maintaining cell membrane integrity and multiple stress responses.Although attention has been drawn to some plant FA desaturase genes,their global landscape in oil crops is still lacking.Here,we performed systematic characterization and phylogenomic synteny network analyses of the FA desaturase gene family in polyploid oil crop B.napus and other 54 species covering major streptophyte lineages.A total of 1653 FA desaturase genes were identified from these plant genomes.Based on the broad-scale family phylogeny and functional domains,we proposed a unified eight-group classification system for angiosperm FA desaturases,and found that the origin of genes responsible for FA desaturation evolved early and some genes were absent in different species.Phylogenomic analyses revealed deeply conserved syntenic relationships within each of the eight FA desaturase groups.B.napus contains up to 93 FA desaturase genes from the eight groups.Recurrent duplication events in Brassicaceae contributed to the expansion of FA desaturase genes in B.napus,leading to further functional diversification.These FA desaturase genes exhibited spatio-temporal specific expression patterns in different tissues of B.napus,and a set of FA desaturase genes seem to be orchestrated by key transcriptional factors during seed development,such as zf-HD,B3,GATA3,PEI1,NFYA7,YAB1 and YAB2.Altogether,our data have inferred the evolutionary trajectory of this important gene family across distinct plant lineages,providing theoretical basis for future manipulation of FA desaturase genes to improve the seed oil quality of B.napus. 展开更多
关键词 Brassica napus fatty acid desaturase GENOME EVOLUTION gene family
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Effect of Dietary Lipid on the Growth, Fatty Acid Composition and Δ5 Fads Expression of Abalone(Haliotis discus hannai Ino) Hepatopancreas 被引量:1
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作者 LI Mingzhu MAI Kangsen +6 位作者 AI Qinghui HE Gen XU Wei ZHANG Wenbing ZHANG Yanjiao ZHOU Huihui LIUFU Zhiguo 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2015年第2期317-324,共8页
This study investigated the effect of dietary lipid on the growth, fatty acid composition and Δ5 fatty acyl desaturase genes(Fads) expression of juvenile abalone(Haliotis discus hannai Ino) hepatopancreas. Six purifi... This study investigated the effect of dietary lipid on the growth, fatty acid composition and Δ5 fatty acyl desaturase genes(Fads) expression of juvenile abalone(Haliotis discus hannai Ino) hepatopancreas. Six purified diets were formulated to contain tripalmitin(TP), olive oil(OO, 72.87% 18:1n-9), grape seed oil(GO, 68.67% 18:2n-6), linseed oil(LO, 70.48% 18:3n-3), ARA oil(AO, 41.81% ARA) or EPA oil(EO, 44.09% EPA and 23.67% DAH). No significant difference in survival rate was observed among abalone fed with different diets. Weight gain rate(WGR) and daily growth rate of shell length(DGRSL) were significantly increased in abalone fed with diets containing OO, AO and EO, but decreased in abalone fed with LO diet(P < 0.05) in comparison with those fed with TP. High level of dietary 18:2n-6 resulted in higher content of n-6 polyunsaturated fatty acids(PUFAs) in abalone fed with GO than those fed with TP, OO, LO and EO(P < 0.05). n-3 PUFAs in abalone fed with LO was significantly higher than those in abalone fed with TP, OO, GO and AO(P < 0.05). The highest contents of 20:1n-9 and 22:1n-9 were observed in abalone fed with OO. The expression of Δ5 Fads in hepatopancreas of abalone was enhanced by high concentration of 18:3n-3 and suppressed by dietary LC-PUFAs; however it was not affected by dietary high concentration of 18:1n-9 or 18:2n-6. These results provided valuable information for understanding the synthesis of LC-PUFAs and nutritional regulation of Δ5 Fads expression in abalone. 展开更多
关键词 desaturase fatty acid gene expression fish oil vegetable oil
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Cloning and characterization of a stearoyl-ACP desaturase gene from Jatropha curcas 被引量:4
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作者 罗通 马丹炜 +4 位作者 徐莺 邓骛远 肖猛 卿人韦 陈放 《Journal of Shanghai University(English Edition)》 CAS 2007年第2期182-188,共7页
Using degenerate primers and RT-PCR, RACE techniques, a 1491 bp cDNA segment of stearoyl-acyl carrier protein desaturase (SAD) is cloned from developing seeds of Jatropha curcas L. The segment contains a 1191 bp of ... Using degenerate primers and RT-PCR, RACE techniques, a 1491 bp cDNA segment of stearoyl-acyl carrier protein desaturase (SAD) is cloned from developing seeds of Jatropha curcas L. The segment contains a 1191 bp of complete open reading frame (ORF). Analysis in the BLAST on NCBI shows that Jatropha curcas SAD (JSAD) gene encodes a protein precursor composed of a signal peptide of 33 amino acids and a mature peptide of 363 amino acids. The homological analysis shows that JSAD has high level of homology both in nucleotide sequence and in amino acid sequence to other plants SADs. The nucleotide and peptide identity of JSAD to Ricinus communis SAD (RSAD) is up to 89% and 96.2% respectively. Molecular modeling of JSAD indicates that its three-dimensional structure strongly resembled the crystal structure of RSAD. 展开更多
关键词 Jatropha curcas stearoyl-acyl carrier protein desaturase fatty acid gene cloning bioinformatics analysis
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薏苡ClSAD、ClFAD2基因单倍型鉴定与相关脂肪酸关联分析
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作者 尚昆 付瑜华 +3 位作者 李秀诗 蒙秋伊 杨玲玲 朱加保 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1756-1766,共11页
薏苡仁油是薏苡仁主要功能性物质之一,脂肪酸是其重要组成部分。以中国9个省份的190份薏苡种质为材料,检测其种仁硬脂酸、油酸、亚油酸含量,分析ClSAD、ClFAD2基因序列多态性并鉴定单倍型,进行脂肪酸含量单倍型关联分析。结果表明,不同... 薏苡仁油是薏苡仁主要功能性物质之一,脂肪酸是其重要组成部分。以中国9个省份的190份薏苡种质为材料,检测其种仁硬脂酸、油酸、亚油酸含量,分析ClSAD、ClFAD2基因序列多态性并鉴定单倍型,进行脂肪酸含量单倍型关联分析。结果表明,不同薏苡种质种仁3种脂肪酸含量存在广泛变异,变异系数为15.84%~23.05%,遗传多样性指数为5.22~5.23,其中油酸含量最高,硬脂酸含量最低,各脂肪酸组分间呈极显著正相关。ClSAD和ClFAD2内部各有14个和3个SNP,分别鉴定到5个单倍型组合,ClSAD基因单倍型Hap3和ClFAD2基因单倍型Hap1分别与参考基因组一致。ClSAD基因单倍型Hap3与硬脂酸含量显著关联且具有负效应,利于硬脂酸向油酸转化。ClFAD2基因单倍型Hap1利于亚油酸的积累,而Hap2与亚油酸酸含量显著关联且具有负效应,不利于亚油酸的合成。在2个基因内部各鉴定到1个关键SNP位点,分别是形成SAD和FAD2酶活性差异的关键位点。研究结果将为高油薏苡优良品种的选育、分子标记开发和相关分子机制解析提供理论基础。 展开更多
关键词 薏苡 脂肪酸 单倍型 硬脂酸脱饱和酶SAD基因 油酸脱饱和酶fad2基因
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番茄FAD基因家族的鉴定与表达分析
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作者 张明亚 庞胜群 +3 位作者 刘玉东 苏永峰 牛博文 韩琼琼 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期150-162,共13页
【目的】脂肪酸脱氢酶(fatty acid desaturase,FAD)是一类催化植物不饱和脂肪酸合成的关键酶,在植物生长发育及逆境胁迫响应中起重要作用。鉴定番茄SlFAD基因家族,为番茄SlFAD基因家族功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】采用生... 【目的】脂肪酸脱氢酶(fatty acid desaturase,FAD)是一类催化植物不饱和脂肪酸合成的关键酶,在植物生长发育及逆境胁迫响应中起重要作用。鉴定番茄SlFAD基因家族,为番茄SlFAD基因家族功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法,对其基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、基因结构、系统发育树和表达模式等方面进行研究。【结果】在番茄基因组中共鉴定出26个SlFAD基因,可分为4个亚族;理化性质分析显示SlFAD蛋白的氨基酸个数在119-912个之间,分子量介于13288.27-102522.25 Da,SlFAD蛋白在番茄中主要以碱性蛋白的性质存在,大部分SlFAD家族成员为稳定蛋白和亲水性蛋白;亚细胞定位预测SlFAD基因家族成员主要存在于内质网;基因特征分析显示同一亚族间的成员具有较为相似的基因结构和保守基序;启动子顺式作用元件分析显示数量最多的是光响应与激素响应相关的元件;染色体定位显示26个SlFAD家族成员共分布在10条染色体上,6号和12号染色体上成员最多;二级结构预测显示26个SlFADs家族成员均以α-螺旋和β-转角为主;转录组数据及RT-qPCR分析表明SlFAD1、SlFAD4和SlFAD18基因在成熟花药中高度表达,SlFAD23在根尖中高度表达,说明SlFAD1、SlFAD4和SlFAD18可能参与花药发育,SlFAD23可能参与根尖发育;低温胁迫下,SlFAD6和SlFAD21表达量被抑制,说明SlFAD6和SlFAD21可能与低温响应有关系,SlFAD1和SlFAD14在低温胁迫初期显著上调,随后又被抑制,说明该基因在低温胁迫初期发挥重要作用。【结论】SlFAD基因家族在番茄根尖、叶片、花药的生长发育过程及低温胁迫中发挥重要作用。 展开更多
关键词 番茄 脂肪酸脱氢酶 fad基因家族 生物信息学 表达分析
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楤木属FAD2基因家族的鉴定及生物信息学分析
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作者 燕敬利 王孟豪 +3 位作者 刘艳艳 杨莹 王旭飞 曹亚男 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期488-498,共11页
聚炔类化合物(PAs)是一类主要由桔梗类植物产生、具生物活性的植物特异性防御物质。其上游合成步骤由脂肪酸去饱和酶2(FAD2)催化。本文以PA的主要来源植物之一,桔梗类的五加科楤木属(Aralia)为研究对象,对楤木(A.elata(Miq.)Seem.)和龙... 聚炔类化合物(PAs)是一类主要由桔梗类植物产生、具生物活性的植物特异性防御物质。其上游合成步骤由脂肪酸去饱和酶2(FAD2)催化。本文以PA的主要来源植物之一,桔梗类的五加科楤木属(Aralia)为研究对象,对楤木(A.elata(Miq.)Seem.)和龙眼独活(A.fargesii Franch.)的FAD2基因家族进行鉴定,并对其保守基序、结构域、染色体分布、基因共线性、进化关系、分子演化速率以及表达情况进行分析。结果显示,楤木属的FAD2基因家族经历了广泛扩张,这可能是通过全基因组加倍/片段重复实现的;不同功能的FAD2保守基序完全一致,但楤木属不同生活型(草本vs.木本)代表物种FAD2的保守基序却产生了分化;楤木中可能有4个不同功能的FAD2基因,其在不同组织中的表达情况不同。本研究可为后续楤木属的物种鉴定、聚炔类物质合成新基因的挖掘以及桔梗类植物具高度多样化PAs分子机制的揭示提供参考。 展开更多
关键词 聚炔类化合物 脂肪酸去饱和酶2 楤木属 分子演化速率 功能基因
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茶树△12-脂肪酸去饱和酶基因FAD2和FAD6的克隆与表达分析 被引量:11
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作者 陈丹 俞滢 +4 位作者 岳川 王鹏杰 陈静 陈桂信 叶乃兴 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期541-550,共10页
本研究在茶树转录组测序的基础上,以铁观音茶树的芽叶为材料,采用RT-PCR技术,克隆了茶树不饱和脂肪酸合成途径中的关键限速酶—△12-FAD(12-脂肪酸去饱和酶)基因的包含完整ORF的cDNA序列(CsFAD2和CsFAD6)。生物信息学分析结果表明,CsFAD... 本研究在茶树转录组测序的基础上,以铁观音茶树的芽叶为材料,采用RT-PCR技术,克隆了茶树不饱和脂肪酸合成途径中的关键限速酶—△12-FAD(12-脂肪酸去饱和酶)基因的包含完整ORF的cDNA序列(CsFAD2和CsFAD6)。生物信息学分析结果表明,CsFAD2的全长为1 184 bp,其开放阅读框(ORF)长度1 149 bp,编码382个氨基酸,定位于内质网上,其氨基酸序列与油茶FAD2的同源性最高达97%;CsFAD6的全长为1 425 bp,其ORF长度为1 311 bp,编码436个氨基酸,定位于叶绿体上,其氨基酸序列与葡萄FAD6同源性达81%。荧光定量PCR结果表明,铁观音茶树幼苗在4℃低温胁迫处理72 h过程中,这两个基因的表达均受低温的诱导,其表达量随着处理时间的延长而升高,在处理48 h时,表达量水平最高;在100 g·L-1的PEG胁迫处理12 h过程中,这两个基因的表达均受PEG胁迫处理的诱导;在ABA(100μmol·L-1)胁迫处理72 h过程中,在处理6~24 h期间,CsFAD2的表达量显著升高,而CsFAD6的表达不受ABA处理的影响,CsFAD6的表达量在处理72 h时显著降低;在Na Cl(250 mmol·L-1)胁迫72 h过程中,CsFAD2的表达量全程降低,而CsFAD6在处理24~72 h期间表达量显著升高。 展开更多
关键词 茶树 △12-脂肪酸去饱和酶 非生物胁迫 基因表达
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花生FAD基因家族的全基因组鉴定与表达模式分析 被引量:7
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作者 阮建 单雷 +4 位作者 李新国 郭峰 孟静静 万书波 彭振英 《山东农业科学》 2018年第6期1-9,共9页
脂肪酸去饱和酶(FAD)是合成不饱和脂肪酸的关键酶,在植物维持各项生命活动、应对生物与非生物胁迫方面具有重要作用。本研究对花生基因组中的FAD基因家族进行鉴定与生物信息学分析,并利用花生转录组数据对花生FAD(Ah FAD)基因的表达模... 脂肪酸去饱和酶(FAD)是合成不饱和脂肪酸的关键酶,在植物维持各项生命活动、应对生物与非生物胁迫方面具有重要作用。本研究对花生基因组中的FAD基因家族进行鉴定与生物信息学分析,并利用花生转录组数据对花生FAD(Ah FAD)基因的表达模式及可变剪接形式进行分析。结果显示,在花生基因组中共有31个Ah FAD基因,分为6类,Ah SAD基因亚家族有12条序列,AhFAD2有6条序列,Ah FAD3有4条序列,Ah FAD4/5有3条序列,Ah FAD6有2条序列,Ah FAD7/8有4条序列。聚类分析表明,Ah FAD有两大分支:游离Ah SAD分支和膜结合Ah FAD分支;膜结合Ah FAD分支中Ah FAD4/5起源最早,ω-3 Ah FAD由ω-6Ah FAD进化而来;单双子叶聚类于不同分支。表达模式分析表明,Ah SAD、AhFAD2和Ah FAD3在种子中表达水平较高,Ah FAD4/5、Ah FAD6、Ah FAD7/8在叶中表达量最高。可变剪接分析表明,Ah FAD亚家族之间可变剪接形式差异明显,其中有12个Ah FAD基因发生了可变剪接。TTS和TSS是发生最多的可变剪接事件,其次是IR,最少的是AE和ES。 展开更多
关键词 花生 脂肪酸去饱和酶(fad) 生物信息学分析 表达模式 可变剪接
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亚麻荠FAD2-1和FAD3-1编码蛋白的生物信息学分析 被引量:4
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作者 刘宝玲 孙岩 +4 位作者 高昌勇 苑丽霞 薛金爱 李润植 张莉 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2016年第4期242-250,共9页
△-12脂肪酸脱氢酶FAD2(fatty acid desaturase 2)和△-15脂肪酸脱氢酶FAD3(fatty acid desaturase 3)是控制亚油酸(18∶2;ω-6)和亚麻酸(18∶3;ω-3)合成的限速酶,亦在植物抵御低温等环境胁迫反应中起重要作用。本文利用生物信息学工... △-12脂肪酸脱氢酶FAD2(fatty acid desaturase 2)和△-15脂肪酸脱氢酶FAD3(fatty acid desaturase 3)是控制亚油酸(18∶2;ω-6)和亚麻酸(18∶3;ω-3)合成的限速酶,亦在植物抵御低温等环境胁迫反应中起重要作用。本文利用生物信息学工具分析了亚麻荠(Camelina sativa)FAD2-1和FAD3-1编码蛋白的理化性质、二硫键、磷酸化位点、高级结构、保守域和功能系统进化等特征。结果表明,FAD2-1和FAD3-1编码蛋白理论pI相近(分别为8.39和8.42),然而前者不稳定系数(40.04)显著高于后者(29.46)。FAD2-1蛋白的磷酸化位点为23个,多于FAD3磷酸化位点(18个),预示FAD2-1更易受翻译后调控。这两种蛋白均含有3个保守的组氨酸富集区(Hisbox),且在C端含有内质网滞留信号,赋予其定位于内质网和催化双键形成的活性。FAD2-1的a-螺旋比例(45.31%)高于FAD3-1(33.16%),然而后者无规则卷曲比例(51.93%)大于前者(44.53%)。3D结构模拟显示,FAD2-1和FAD3-1功能域大小和构象存在差异,这可能影响到底物选择性和催化效率。这些结果为全面解析亚麻荠种子油脂合成和ω-3族脂肪酸富集的分子机理提供了科学参考。 展开更多
关键词 亚麻荠 ω-3与ω-6族脂肪酸 脂肪酸脱饱和酶(fad) 生物信息学分析
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武定鸡和大围山微型鸡脂肪酸含量及FADSFADS2基因表达差异研究 被引量:4
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作者 李凯 豆腾飞 +6 位作者 荣华 徐志强 佟荟全 段小花 葛长荣 贾俊静 李琦华 《中国家禽》 北大核心 2018年第5期13-16,共4页
脂肪酸是影响家鸡肉品质的重要风味物质,Δ6-脂肪酸脱氢酶基因(FADS2)是不饱和脂肪酸生物合成过程中的关键酶。研究以武定鸡和大围山微型鸡为研究对象,检测肌肉组织中脂肪酸含量及FADS2基因表达量,比较不同鸡种脂肪酸含量及FADS2基因表... 脂肪酸是影响家鸡肉品质的重要风味物质,Δ6-脂肪酸脱氢酶基因(FADS2)是不饱和脂肪酸生物合成过程中的关键酶。研究以武定鸡和大围山微型鸡为研究对象,检测肌肉组织中脂肪酸含量及FADS2基因表达量,比较不同鸡种脂肪酸含量及FADS2基因表达差异。结果显示,整体上,武定鸡腿肌中饱和脂肪酸(SFA)、单不饱和脂肪酸(MUFA)、不饱和脂肪酸(USFA)、多不饱和脂肪酸(PUFA)、必需脂肪酸(EFA)及总脂肪酸含量和FADS2 m RNA表达量均显著高于大围山微型鸡,且在部位和周龄上存在显著差异。研究表明,武定鸡风味比大围山微型鸡优良,FADS2基因是影响家鸡肉品质的重要候选基因。 展开更多
关键词 武定鸡 大围山微型鸡 脂肪酸含量 △6-脂肪酸脱氢酶基因
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马铃薯腐烂茎线虫脂肪酸去饱和酶新基因(Dd-FAD)的克隆与序列分析 被引量:2
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作者 邵颖 万景旺 +4 位作者 冯辉 朱华 程兆榜 周益军 魏利辉 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第6期1507-1509,共3页
马铃薯腐烂茎线虫(DitylenchusdestructorThorne)是垫刃目中一类重要的植物病原线虫,在中国主要为害甘薯和马铃薯,此外还危害中药材当归、薄荷和人参等¨剖。目前,马铃薯腐烂茎线虫病在中国北京、天津、山东、河北、河南、江... 马铃薯腐烂茎线虫(DitylenchusdestructorThorne)是垫刃目中一类重要的植物病原线虫,在中国主要为害甘薯和马铃薯,此外还危害中药材当归、薄荷和人参等¨剖。目前,马铃薯腐烂茎线虫病在中国北京、天津、山东、河北、河南、江苏、浙江、福建、辽宁、甘肃等省市均有发生,已经成为危害中国甘薯生产的重要病害。 展开更多
关键词 马铃薯腐烂茎线虫 脂肪酸去饱和酶 基因克隆
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花生AhFAD2-1基因启动子及5'-UTR内含子功能验证及其低温胁迫应答 被引量:2
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作者 石磊 苗利娟 +6 位作者 黄冰艳 高伟 张忠信 齐飞艳 刘娟 董文召 张新友 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1703-1711,共9页
Δ^(12)-脂肪酸脱氢酶基因(FAD2)催化油酸生成亚油酸,是决定油酸亚油酸比值的关键基因。高油酸花生对低温更加敏感,暗示FAD2在低温响应中发挥作用。为探索花生FAD2的低温胁迫应答,本研究分析了花生FAD2-1A/B的基因结构,从普通油酸花生... Δ^(12)-脂肪酸脱氢酶基因(FAD2)催化油酸生成亚油酸,是决定油酸亚油酸比值的关键基因。高油酸花生对低温更加敏感,暗示FAD2在低温响应中发挥作用。为探索花生FAD2的低温胁迫应答,本研究分析了花生FAD2-1A/B的基因结构,从普通油酸花生品种豫花9326中克隆了FAD2-1A/B启动子和内含子,并通过转化拟南芥验证了功能及其对冷胁迫的应答。结果表明,AhFAD2-1A/B包含2个外显子和1个位于5'-UTR的内含子;AhFAD2-1A/B基因启动子功能较弱,仅AhFAD2-1B启动子在子叶期幼苗的子叶叶尖中观察到蓝色;AhFAD2-1假基因5'侧翼序列具有启动子活性,可调控基因在子叶、下胚轴、种子中表达。AhFAD2-1内含子序列具有启动子的功能,驱动基因在幼苗下胚轴及子叶中表达,同时还有提高基因表达效率和扩大表达范围的功能,是AhFAD2-1基因表达调控必需元件;包含5'-UTR内含子的AhFAD2-1A/B启动子的调控序列功能受低温胁迫抑制。 展开更多
关键词 花生 Δ^(12)-脂肪酸脱氢酶基因(fad2) 启动子 内含子介导增强 冷胁迫 GUS报告基因
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红景天苷提取工艺优化及对FADS1基因表达的影响
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作者 罗毅皓 万玉慧 孙万成 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2018年第18期27-31,共5页
利用响应面分析,进行三因素三水平Box-Benhnken中心组合试验,确定红景天苷最佳提取温度50.6℃、时间1.7 h、液料比1∶22.2(g/m L);与此同时进行Hep G2肝癌细胞的培养,待细胞生长到对数时期,将浓度为0.5 mg/L和1.5 mg/L的红景天苷加入到... 利用响应面分析,进行三因素三水平Box-Benhnken中心组合试验,确定红景天苷最佳提取温度50.6℃、时间1.7 h、液料比1∶22.2(g/m L);与此同时进行Hep G2肝癌细胞的培养,待细胞生长到对数时期,将浓度为0.5 mg/L和1.5 mg/L的红景天苷加入到细胞中继续培养24 h;对不同浓度组细胞进行总RNA提取,经过反转录后,利用实时定量荧光聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测技术,探究红景天苷对细胞脂肪代谢相关的脂肪酸去饱和酶1(fatty acid desaturase 1,FADS1)基因表达的影响。结果可知,加入红景天苷1.5 mg/L的试验组相比较0.5 mg/L的对照组,试验组中FADS1基因的相对表达量是对照组的2.35倍,说明红景天苷可以有效促进细胞脂肪合成多不饱和脂肪酸,验证其可能具有降脂的作用。 展开更多
关键词 红景天苷 脂肪代谢 脂肪酸去饱和酶1基因 响应面分析 工艺优化
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花生FAD2基因家族表达分析及其对低温胁迫的响应 被引量:14
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作者 薛晓梦 李建国 +6 位作者 白冬梅 晏立英 万丽云 康彦平 淮东欣 雷永 廖伯寿 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1586-1594,共9页
为了探究FAD2在花生低温响应中的作用,本研究从普通油酸花生中花16(ZH16)和高油酸花生中花413(ZH413)中克隆得到花生AhFAD2家族的全部基因,共7个。通过分析这些基因的表达模式发现,在ZH16和ZH413中各FAD2基因表达模式相似,AhFAD2-1A/B... 为了探究FAD2在花生低温响应中的作用,本研究从普通油酸花生中花16(ZH16)和高油酸花生中花413(ZH413)中克隆得到花生AhFAD2家族的全部基因,共7个。通过分析这些基因的表达模式发现,在ZH16和ZH413中各FAD2基因表达模式相似,AhFAD2-1A/B主要在花和发育的种子中表达,AhFAD2-3A/B主要在营养组织中表达,AhFAD2-4A/B主要在根和花中表达,表明AhFAD2基因在花生不同发育阶段和不同组织中发挥各自的生物学功能。在15℃下发芽6d发现,ZH413的发芽率未显著下降,而ZH16的发芽率显著下降。种子萌发过程中,AhFAD2-1A/B和AhFAD2-4A/B均受低温诱导表达。在ZH16中AhFAD2-1A/B在低温诱导第6天开始显著上调表达,而在ZH413中第1天显著上调表达;在ZH16中AhFAD2-4A/B在低温诱导第3天出现显著上调表达,之后表达量下降,但在ZH413中第1天就显著上调表达,且始终维持在高水平表达。基于以上研究结果推测,高油酸花生在受到低温胁迫时,AhFAD2-1A/B编码蛋白失活,但AhFAD2-4A/B的高量表达在一定程度上弥补了这部分功能。同时也说明AhFAD2-1A/B功能的缺失并不是决定花生耐寒性的主要因素。本研究的开展为培育抗寒的高油酸花生品种奠定了理论基础,为高油酸花生在高纬度、高海拔地区推广提供了理论支持。 展开更多
关键词 脂肪酸脱氢酶(fad2) 基因克隆 低温胁迫 基因表达
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缺刻缘绿藻FAD基因的序列特征及其相对转录量对氮饥饿的响应 被引量:3
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作者 刘凡 李慧 +2 位作者 李春阳 欧阳珑玲 周志刚 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期729-740,共12页
为探讨缺刻缘绿藻(Myrmecia incisa)花生四烯酸(20:4 6,AA)合成过程中一系列脂肪酸去饱和酶(FAD)的作用,本研究克隆了12、6及5 FAD基因的cDNA全长序列(GenBank登录号分别为JN205757、JN205755和JN205756)及其相应的DNA序列。它们的cDNA... 为探讨缺刻缘绿藻(Myrmecia incisa)花生四烯酸(20:4 6,AA)合成过程中一系列脂肪酸去饱和酶(FAD)的作用,本研究克隆了12、6及5 FAD基因的cDNA全长序列(GenBank登录号分别为JN205757、JN205755和JN205756)及其相应的DNA序列。它们的cDNA全长分别为1 806 bp、2 674 bp及2 318 bp,其中ORF长为1 137bp、1 443 bp和1 446 bp,分别编码由378、480和481个氨基酸组成的蛋白;通过其cDNA与DNA序列的比对,发现12、6及5 FAD基因分别具有4、5和7个内含子,其剪切位点均符合"GT-AG"规则。Δ12、Δ6和Δ5 FAD编码蛋白均富含疏水性氨基酸,约占各自氨基酸组成的52.8%、46.6%及50.9%。密码子的偏好性与缺刻缘绿藻其他基因保持一致。推测这3个FAD基因编码蛋白都存在4个跨膜区,而12和5 FAD还各有一个明显不跨膜的疏水区;都具有FAD家族各自相对保守的3个组氨酸簇基序。基于缺刻缘绿藻和其他物种相应的FAD基因编码蛋白序列所构建的Neighbor-joining(NJ)系统进化树,表明Δ12、Δ6、Δ5及ω3 FAD分别隶属于各自的分支,其中,Δ12与ω3 FAD的亲缘关系较近,而Δ6与Δ5 FAD具有较近的亲缘关系。利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,Q-RT-PCR)分析这3个FAD基因在缺刻缘绿藻缺氮培养96 h后又恢复氮培养72 h过程中的相对转录量,结果表明这3个基因的相对转录量都受到氮信号的调控,它们随着氮饥饿培养时间延长明显上升,而氮恢复培养后迅速并显著地下降到氮饥饿胁迫前的水平。结合已知脂肪酸成分在此过程中的变化,推测这3个基因对缺刻缘绿藻AA的合成和积累都起着重要的作用,而Δ6 FAD的作用可能更关键。 展开更多
关键词 缺刻缘绿藻 脂肪酸去饱和酶 基因克隆 实时荧光定量PCR 氮饥饿
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油葵脂肪酸去饱和酶基因HaFAD2-1的克隆与功能鉴定 被引量:2
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作者 何早柯 周茜萍 +3 位作者 王梦瑶 朱新霞 祝建波 孙黎 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期-,共7页
为研究油葵FAD2-1基因在脂肪酸合成中的催化功能,利用RT-PCR技术,从油葵品种新葵杂4号未成熟种子中克隆HaFAD2-1基因的全长cDNA序列。将该基因序列构建穿梭表达载体pYES2-HaFAD2-1,并转化到营养缺陷型酿酒酵母菌株INVSc1中。将重组酵母... 为研究油葵FAD2-1基因在脂肪酸合成中的催化功能,利用RT-PCR技术,从油葵品种新葵杂4号未成熟种子中克隆HaFAD2-1基因的全长cDNA序列。将该基因序列构建穿梭表达载体pYES2-HaFAD2-1,并转化到营养缺陷型酿酒酵母菌株INVSc1中。将重组酵母诱导培养后对其总脂肪酸进行GC-MS分析。结果显示,HaFAD2-1基因编码一个长378个氨基酸的脂肪酸去饱和酶蛋白,分子质量43 719,等电点(pI)为8.38,具有3个高度保守的组氨酸簇。脂肪酸甲酯气相色谱分析结果表明HaFAD2-1基因在酿酒酵母中获得表达,能将油酸转化为亚油酸,证明克隆得到的HaFAD2-1具有完整的催化功能。 展开更多
关键词 油葵 脂肪酸去饱和酶 基因克隆 酿酒酵母转化 功能分析
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FADS 1基因对猪不饱和脂肪酸含量的影响研究 被引量:1
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作者 张天天 华再东 +3 位作者 任红艳 顾浩 周彬 毕延震 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期451-459,共9页
【目的】研究脂肪酸去饱和酶1(fatty acid desaturases 1,FADS1)基因对不饱和脂肪酸代谢的调控作用,为揭示其分子机制提供参考。【方法】利用PCR扩增猪FADS 1基因的CDS区,将目的基因与pcDNA3.1(-)骨架载体连接获得重组表达载体pcDNA3.1-... 【目的】研究脂肪酸去饱和酶1(fatty acid desaturases 1,FADS1)基因对不饱和脂肪酸代谢的调控作用,为揭示其分子机制提供参考。【方法】利用PCR扩增猪FADS 1基因的CDS区,将目的基因与pcDNA3.1(-)骨架载体连接获得重组表达载体pcDNA3.1-FLAG-FADS1,将重组表达载体瞬时转染宁乡猪肾成纤维细胞,转染后24、48 h分别收集细胞,利用实时荧光定量PCR和Western blotting检测FADS 1基因的表达情况,经过遗传霉素(geneticin,G418)筛选之后获得稳定表达FADS 1基因的细胞系,命名为1-4^(#)。利用甘油三酯检测试剂盒检测野生型和1-4^(#)细胞甘油三酯含量变化;利用气相色谱质谱法(gas chromatography-mass spectrometer,GC-MS)检测野生型和1-4^(#)细胞不饱和脂肪酸含量变化情况。【结果】成功获得过表达载体pcDNA3.1-FLAG-FADS1,在转录水平和蛋白水平检测均有过表达效果。通过G418筛选出1株稳定过表达FADS 1基因的单克隆细胞。甘油三酯含量测定结果显示,与野生型宁乡猪肾成纤维细胞相比,过表达FADS1的宁乡猪肾成纤维细胞中甘油三酯的含量显著降低(P<0.05)。不饱和脂肪酸检测结果显示,过表达FADS1后,总脂肪酸的含量极显著升高(P<0.01),提高1.8倍,多不饱和脂肪酸(polyunsaturated fatty acid,PUFA)中ω-3 PUFA、ω-6 PUFA含量均极显著升高(P<0.01),二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid,EPA)、二十二碳五烯酸(docosapentaenoic acid,DPA)、二十二碳六烯酸(docosahexaenoic acid,DHA)的相对含量极显著提高(P<0.01),ω-3/ω-6值显著提高(P<0.05)。【结论】成功构建超表达载体pcDNA3.1-FLAG-FADS1,并在宁乡猪肾成纤维细胞中成功筛选到了1株稳定超表达FADS 1基因的单克隆细胞1-4^(#),经检测,FADS 1基因超表达能显著降低细胞中甘油三酯含量、提高ω-3 PUFA含量及占比,提高ω-3/ω-6值。 展开更多
关键词 FASD 1基因 过表达 脂肪酸 ω-3 ω-6
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拟南芥AtFAD6基因突变体的构建 被引量:3
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作者 徐雪珍 郑月萍 +1 位作者 张夏婷 宋孜元 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期1125-1130,共6页
运用优化后的CRISPR/Cas9基因编辑载体,创建了2个不同的拟南芥脂肪酸去饱和酶6基因(AtFAD6)突变体,其AtFAD6基因的保守位点氨基酸序列均发生变化,同时终止密码子被提前引入,基因功能丧失。脂肪酸组分分析结果显示,这2种突变体的叶片中... 运用优化后的CRISPR/Cas9基因编辑载体,创建了2个不同的拟南芥脂肪酸去饱和酶6基因(AtFAD6)突变体,其AtFAD6基因的保守位点氨基酸序列均发生变化,同时终止密码子被提前引入,基因功能丧失。脂肪酸组分分析结果显示,这2种突变体的叶片中单不饱和脂肪酸16∶1和18∶1大量积累,多不饱和脂肪酸16∶3和18∶3含量则大幅下降,同时伴随着叶片发黄、地上部生物量显著降低、抽薹提前2~3 d的表型变化。多不饱和脂肪酸18∶3作为茉莉酸合成的前体物质,其含量的下降致使突变体中茉莉酸信号标记基因AtVSP1在叶片中的表达量有所降低,而茎中的表达量提高了40%以上。所获得的2个AtFAD6功能丧失型突变体为进一步研究脂类代谢与植物生长发育之间的关系提供了重要的遗传材料。 展开更多
关键词 拟南芥 CRISPR/Cas9 脂肪酸去饱和酶(fad) 基因突变体
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Generation of fad2 transgenic mice that produce omega-6 fatty acids 被引量:1
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作者 CHEN Qing1, LIU Qing2, WU ZhiFang1, WANG ZongYi3 & GOU KeMian1 1 State Key Laboratory for Agrobiotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China 2 Blackmountain Laboratory, CSIRO Plant Industry, Canberra, Australia 3 College of Animal Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100193, China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2009年第11期1048-1054,共7页
Fatty acid desaturase-2 (FAD2) introduces a double bond in position 12 in oleic acid (18:1) to form linoleic acid (18:2 n-6) in higher plants and microbes. A new transgenic expression cassette, containing CMV promoter... Fatty acid desaturase-2 (FAD2) introduces a double bond in position 12 in oleic acid (18:1) to form linoleic acid (18:2 n-6) in higher plants and microbes. A new transgenic expression cassette, containing CMV promoter/fad2 cDNA/SV40 polyA, was constructedto produce transgenic mice. Among 63 healthy offspring, 10 founders (15.9%) integrated the cotton fad2 transgene into their genomes, as demonstrated by PCR and Southern blotting analysis. All founder mice were fertile and heterozygous fad2 female and nontransgenic littermates were used for fatty acid analysis using gas chromatography. One fad2 transgenic line showed substantial differences in the fatty acid profiles and the level of linoleic acid was increased 19% (P<0.05) in transgenic muscles compared to their nontransgenic littermates. Moreover, it exhibited an 87% and a 9% increase (P<0.05) in arachidonic acid (20:4 n-6) in muscles and liver, compared to their nontransgenic littermates. The results indicate that the plant fad2 gene can be functionally expressed in transgenic mice and may playan active role in conversion of oleic acid into linoleic acid. 展开更多
关键词 fatty acid desaturase fad2 TRANSGENIC mouse oleic acid linoleic acid arachidonic acid
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