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磁螺菌MSR-1磁小体缺失突变株NM21 Tn5侧翼序列的克隆及功能分析
被引量:
1
1
作者
李峰
李颖
+2 位作者
姜伟
王珍芳
李季伦
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期892-897,共6页
利用mini-Tn5 lacZ2对磁螺菌(Magnetospirillum gryphiswaldense)MSR-1进行转座插入突变,获得磁小体缺失突变株NM21.通过锚定PCR从NM21中克隆出Tn5插入位点的侧翼序列,获得长3073bp的DNA片段,其中含有3个ORF,Tn5插入在ORF1中,互补实验...
利用mini-Tn5 lacZ2对磁螺菌(Magnetospirillum gryphiswaldense)MSR-1进行转座插入突变,获得磁小体缺失突变株NM21.通过锚定PCR从NM21中克隆出Tn5插入位点的侧翼序列,获得长3073bp的DNA片段,其中含有3个ORF,Tn5插入在ORF1中,互补实验证明该片段与磁小体合成相关.对ORF1编码的蛋白进行同源比较和功能分析,发现ORF1编码的蛋白中部有4个跨膜螺旋,与其同源性较高的序列全部为二价阳离子转运蛋白.BLAST软件分析表明,ORF1编码的蛋白具有COG0053和PRK09509结构域,与FieF和MMT1等二价阳离子转运蛋白家族CDF(cation diffusion facilitator)有相同的结构域,推测其为磁小体膜上Fe2+的转运蛋白,且可能在去除Fe2+对细胞毒害的过程中起着重要作用.
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关键词
M.gryphiswaldense
磁小体缺失突变株
基因克隆
功能分析
Fe^
2
+
转运
蛋白
原文传递
题名
磁螺菌MSR-1磁小体缺失突变株NM21 Tn5侧翼序列的克隆及功能分析
被引量:
1
1
作者
李峰
李颖
姜伟
王珍芳
李季伦
机构
农业生物技术国家重点实验室
淮北煤炭师范学院生命科学学院
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期892-897,共6页
基金
国家自然科学基金(批准号:30570023)
安徽省淮北市科研计划(编号:070114)资助项目
文摘
利用mini-Tn5 lacZ2对磁螺菌(Magnetospirillum gryphiswaldense)MSR-1进行转座插入突变,获得磁小体缺失突变株NM21.通过锚定PCR从NM21中克隆出Tn5插入位点的侧翼序列,获得长3073bp的DNA片段,其中含有3个ORF,Tn5插入在ORF1中,互补实验证明该片段与磁小体合成相关.对ORF1编码的蛋白进行同源比较和功能分析,发现ORF1编码的蛋白中部有4个跨膜螺旋,与其同源性较高的序列全部为二价阳离子转运蛋白.BLAST软件分析表明,ORF1编码的蛋白具有COG0053和PRK09509结构域,与FieF和MMT1等二价阳离子转运蛋白家族CDF(cation diffusion facilitator)有相同的结构域,推测其为磁小体膜上Fe2+的转运蛋白,且可能在去除Fe2+对细胞毒害的过程中起着重要作用.
关键词
M.gryphiswaldense
磁小体缺失突变株
基因克隆
功能分析
Fe^
2
+
转运
蛋白
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
磁螺菌MSR-1磁小体缺失突变株NM21 Tn5侧翼序列的克隆及功能分析
李峰
李颖
姜伟
王珍芳
李季伦
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009
1
原文传递
已选择
0
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参考文献
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