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特异种质烟草HZNH的Fe-SOD基因的克隆与表达 被引量:9
1
作者 高健 许晓风 陈学平 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期840-845,共6页
A new Fe-SOD gene from a native Chinese tobacco germplasm namely HZNH has been successfully cloned and expressed. Full-length cDNA sequences of the Fe-SOD gene was obtained by employing the 5′ and 3′end RACE method ... A new Fe-SOD gene from a native Chinese tobacco germplasm namely HZNH has been successfully cloned and expressed. Full-length cDNA sequences of the Fe-SOD gene was obtained by employing the 5′ and 3′end RACE method from the HZNH′s cDNA library. The full sequence was 1145 bp in length, including 170 bp of 5′untranslated region, 288 bp of 3′untranslated region and 687 bp of coding region. The coding region encoded a peptide of 228 amino acid residues, in which there was a signal peptide with 26 amino acids and a mature peptide of 202 amino acids. The full-length cDNA sequence was compared with all other reported plants’ Fe-SOD genes’. The result of Blast analysis showed that they shared high homology(>80%) ,the highest one was to N. plumbaginifolia’s with the homology as high as 97.69%. This cDNA was constructed into the prokaryotic expression vector, pQE30a/FeSOD, and transformed into E.coli M15 which was induced with IPTG. SDS-PAGE showed that 27 kD proteins was expressed. The soluble proteins showed the Fe-SOD enzyme activities on PAGE-based isozyme spectrum indicating that this expressed soluble protein is indeed the Fe-SOD enzyme. 展开更多
关键词 sod基因 基因克隆 特异种质 超氧阴离子自由基 CUZN-sod MN-sod 超氧化物歧化酶 烟草 fe-sod 自身免疫疾病
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荔枝古树胚性愈伤组织Fe-SOD成员基因克隆及生物信息学分析 被引量:3
2
作者 练从龙 赖钟雄 +2 位作者 卢秉国 林玉玲 冯新 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期74-81,共8页
为了解Fe-SOD在荔枝古树胚性愈伤组织保存中的分子机制,选择荔枝古树"宋荔"花药诱导而来的胚性愈伤组织为试验材料,采用同源克隆和RACE方法,获得荔枝Fe-SOD的两个转录本和基因组序列,并对该基因组的内含子进行分析。克隆获得... 为了解Fe-SOD在荔枝古树胚性愈伤组织保存中的分子机制,选择荔枝古树"宋荔"花药诱导而来的胚性愈伤组织为试验材料,采用同源克隆和RACE方法,获得荔枝Fe-SOD的两个转录本和基因组序列,并对该基因组的内含子进行分析。克隆获得长1 285 bp含有完整开放阅读框的荔枝Fe-SOD核酸序列,其编码1个含有250个氨基酸的蛋白质,将该序列命名为LcFe-SOD7a。生物信息学分析结果表明:该蛋白为稳定的、亲水的、含跨膜结构域的偏酸性蛋白质,定位于微体(过氧化物酶体)和细胞质,具有多样的磷酸化位点。LcFe-SOD7a基因组序列长2 284 bp,含7个内含子,其中第4个内含子较长,达920 bp。同时还得到其中的1条内含子驻留型可变剪接基因,该可变剪接基因提前终止,仅编码207个氨基酸的蛋白质,将该可变剪接基因命名为LcFe-SOD7b。 展开更多
关键词 荔枝古树 胚性愈伤组织 fe—sod 克隆 可变剪接 生物信息学分析
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马铃薯抗逆基因Fe-SOD的克隆与序列分析 被引量:6
3
作者 武新娟 魏峭嵘 +1 位作者 石瑛 王凤义 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期17-20,共4页
文章以马铃薯克新19号为材料,提取植株叶片总DNA,利用同源序列法,根据GenBank中已登陆番茄的Fe-SODmRNA序列,设计1对引物,经PCR扩增获得了大小为1413bp的片段。序列分析表明,预测其含有4个外显子和3个内含子,编码了145个氨基酸序列,分... 文章以马铃薯克新19号为材料,提取植株叶片总DNA,利用同源序列法,根据GenBank中已登陆番茄的Fe-SODmRNA序列,设计1对引物,经PCR扩增获得了大小为1413bp的片段。序列分析表明,预测其含有4个外显子和3个内含子,编码了145个氨基酸序列,分子质量为16.255ku,等电点为5.88。其编码的氨基酸序列包含了两个Fe-SOD蛋白的保守结构域,与NCBI数据库中其他植物的Fe-SOD蛋白同源性很高,与番茄中58~203相关片段同源性高达93.79%。该基因已在GenBank上注册,登录号为EU545469。 展开更多
关键词 马铃薯 fe—sod 克隆 序列分析
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玉米ZmSOD基因克隆及其在干旱胁迫下的表达
4
作者 李玉华 赵振华 +3 位作者 吴征 白佳田 王烁莹 王同朝 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1097-1106,共10页
为探讨超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因在玉米抗逆反应中的作用,研究选用2个抗旱性有明显差别的玉米品种为试验材料,采用RT-PCR、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)及二维凝胶电泳(2-DE)耦联的基质辅助激光解吸电离/飞行时间质谱(... 为探讨超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因在玉米抗逆反应中的作用,研究选用2个抗旱性有明显差别的玉米品种为试验材料,采用RT-PCR、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)及二维凝胶电泳(2-DE)耦联的基质辅助激光解吸电离/飞行时间质谱(MALDI-TOF)法,对ZmSOD基因的序列结构及其在干旱胁迫下的表达特性进行分析。结果表明:(1)从干旱敏感品种‘登海605’(DH605)和抗旱品种‘蠡玉35’(LY35)玉米叶片中分别成功克隆出ZmSOD1和ZmSOD2基因。DH605中ZmSOD1开放阅读框(ORF)全长456 bp,编码151个氨基酸,编码的蛋白等电点为5.76,分子量为15.05 kD。LY35中ZmSOD2 ORF全长459 bp,编码152个氨基酸,编码的蛋白等电点为5.65,分子量为15.11 kD;ZmSOD1和ZmSOD2是亲水性稳定蛋白,都含有Cu/Zn-SOD结构域,蛋白序列N端无信号肽及无跨膜结构域。同源性和系统进化分析表明,玉米ZmSOD和谷子Cu/Zn-SOD2的亲缘关系最近,相似性高达96.05%。(2)在干旱条件下,ZmSOD1在DH605中转录水平明显降低,LY35中ZmSOD2转录水平显著升高;2-DE耦联的质谱分析显示:ZmSOD1在DH605中表达量明显降低,LY35中ZmSOD2表达量无显著性变化,却检测到Mn-SOD蛋白表达量显著增加。(3)相关分析显示,干旱条件下,DH605叶片中ZmSOD1转录水平和其蛋白丰度及SOD酶活性呈极显著性正相关,LY35叶片中ZmSOD2转录水平与SOD酶活性呈显著性正相关。研究结果为进一步探索SOD基因在调节玉米抗性以及逆境胁迫应答过程中的作用机制提供了基础。 展开更多
关键词 玉米 Zmsod 基因克隆 表达分析 干旱胁迫 sod活性
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蜡样芽孢杆菌M22Fe-SOD基因克隆及其分析 被引量:1
5
作者 彭旭 王勇军 +3 位作者 王爽 付学池 王琦 梅汝鸿 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期479-486,共8页
通过筛选蜡样芽孢杆菌M 22基因组文库,得到约3.9 kb的基因组片段。BLAST结果显示:其中包含1条长度为915 bp、编码304个氨基酸的超氧化物歧化酶(SOD)基因,其与Bacillus thuringiensis和Bacillus anthracis中的sodF基因同源性高达95%。此s... 通过筛选蜡样芽孢杆菌M 22基因组文库,得到约3.9 kb的基因组片段。BLAST结果显示:其中包含1条长度为915 bp、编码304个氨基酸的超氧化物歧化酶(SOD)基因,其与Bacillus thuringiensis和Bacillus anthracis中的sodF基因同源性高达95%。此sodF基因能互补恢复大肠杆菌SOD缺陷型菌株QC871在10μmol/L paraquat中的生长能力。对重组表达蛋白的抑制实验表明,此SOD基因为Fe-SOD。利用pET-30b(+)构建表达载体pET-sodF并转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,经IPTG诱导后,SOD融合蛋白表达量显著增加。构建自杀载体p299-8,同源重组突变蜡样芽孢杆菌M 22sodF基因后,突变体抗氧化能力未显著降低。 展开更多
关键词 蜡样芽孢杆菌 超氧化物歧化酶(sod) 基因克隆
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白菜型冬油菜铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)基因的克隆及其在低温条件下的表达 被引量:26
6
作者 曾秀存 刘自刚 +7 位作者 史鹏辉 许耀照 孙佳 方彦 杨刚 武军艳 孔德晶 孙万仓 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期636-643,共8页
超氧化物歧化酶(SOD)是一种逆境条件下清除细胞内活性氧的关键酶,而铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)是该酶系中最主要的活性氧清除剂,与植物的抗逆性关系密切。本研究根据已发表的十字花科植物Cu/Zn-SOD基因的编码区设计引物,采用RT-PCR... 超氧化物歧化酶(SOD)是一种逆境条件下清除细胞内活性氧的关键酶,而铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)是该酶系中最主要的活性氧清除剂,与植物的抗逆性关系密切。本研究根据已发表的十字花科植物Cu/Zn-SOD基因的编码区设计引物,采用RT-PCR克隆超强抗寒冬油菜陇油7号Cu/Zn-SOD的cDNA序列,该基因全长459 bp。生物信息学分析表明,该基因与甘蓝型油菜(Brassica napus)Cu/Zn-SOD基因同源性高达99%,编码1个亲水性稳定蛋白,无跨膜结构域和信号肽,具有胞质Cu/Zn-SOD超基因家族特有的序列特征和保守结构区域。半定量RT-PCR以及SOD酶活性分析表明,低温诱导条件下Cu/Zn-SOD基因差异表达,在白菜型冬油菜适应低温胁迫过程中发挥重要作用。超强抗寒冬油菜陇油6号品种低温诱导蛋白的SDS-PAGE分析以及蛋白串联质谱技术鉴定表明,Cu/Zn-SOD是受低温诱导表达的抗逆基因。 展开更多
关键词 白菜型冬油菜 CU Zn—sod基因克隆 低温 表达分析 sod活性 低温诱导蛋白
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吴茱萸SOD基因片段克隆和SNP分析 被引量:5
7
作者 吴波 高丹 +2 位作者 潘超美 罗光明 张寿文 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1206-1211,共6页
根据GenBank已报道的多种植物Cu/Zn-SOD基因和Mn/Fe-SOD基因的保守区域,分别设计了两对用于克隆10种吴茱萸属植物Cu/Zn-SOD基因和Mn/Fe-SOD基因核心片段的简并引物。试验所得的Cu/Zn-SOD基因片段长度为375 bp,Mn/Fe-SOD基因片段长度为42... 根据GenBank已报道的多种植物Cu/Zn-SOD基因和Mn/Fe-SOD基因的保守区域,分别设计了两对用于克隆10种吴茱萸属植物Cu/Zn-SOD基因和Mn/Fe-SOD基因核心片段的简并引物。试验所得的Cu/Zn-SOD基因片段长度为375 bp,Mn/Fe-SOD基因片段长度为429 bp,分别编码125个和143个氨基酸残基。使用DAM-BE和DNAStar5.0生物统计软件对序列进行同源性比对,10种吴茱萸属植物与其他多种植物的Cu/Zn-SOD基因核苷酸序列同源性大于74%,氨基酸序列同源性大于79%;Mn/Fe-SOD基因的核苷酸序列同源性大于78%,氨基酸序列同源性大于81%。在所克隆的Cu/Zn-SOD基因片段中有21个核苷酸SNPs位点,导致6个氨基酸位点变异,多态性频率为1SNP/17.9 bp,核苷酸和氨基酸变异度分别为5.6%和4.8%;在所克隆的Mn/Fe-SOD基因片段中有17个核苷酸SNPs位点,导致3个氨基酸位点变异,多态性频率为1SNP/25.2 bp,核苷酸和氨基酸变异度分别为4.0%和2.1%。采用Neighbour-Joining聚类法,对10种吴茱萸属植物的Cu/Zn-SOD基因片段的核苷酸序列进行聚类分析,构建了精确遗传聚类图谱。 展开更多
关键词 吴茱萸 sod 基因克隆 SNP
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甜菜夜蛾核多角体病毒sod基因的克隆及原核表达 被引量:5
8
作者 张海元 牛国栋 +1 位作者 洪靖君 张忠信 《中国病毒学》 CSCD 2003年第6期576-580,共5页
甜菜夜蛾核型多角体病毒中国株(Spotoptera exigua MNPV-Z)超氧化物歧化酶基因(sod)业已被克隆及在大肠杆菌中进行了表达,证明了SeMNPV-Z的sod基因产物确有SOD活性,其活力单位约为291.19U/mL培养液。DNA测序结果表明SeMNPV-Z的sod基因编... 甜菜夜蛾核型多角体病毒中国株(Spotoptera exigua MNPV-Z)超氧化物歧化酶基因(sod)业已被克隆及在大肠杆菌中进行了表达,证明了SeMNPV-Z的sod基因产物确有SOD活性,其活力单位约为291.19U/mL培养液。DNA测序结果表明SeMNPV-Z的sod基因编码151个氨基酸,与人的sod1基因的核苷酸的同源性为50%,与LdNPV、HaSNPV、HcNPV、AcNPV和BmNPV的sod基因的同源性分别为64%、63%、63%、65%、63%。 展开更多
关键词 甜菜夜蛾核多角体病毒 sod基因 克隆 原核表达 基因表达
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柑橘类植物SOD基因片段的克隆和SNP分析 被引量:3
9
作者 吴波 刘勇 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第22期11719-11721,11724,共4页
[目的]对柑橘类植物遗传多样性进行精确分析研究。[方法]根据已报道的各种植物Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列上前后2个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从岭南沙田柚、柠檬等6种柑橘类植物中克隆得到长426bp的Mn/Fe-SOD基因片段... [目的]对柑橘类植物遗传多样性进行精确分析研究。[方法]根据已报道的各种植物Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列上前后2个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从岭南沙田柚、柠檬等6种柑橘类植物中克隆得到长426bp的Mn/Fe-SOD基因片段,并对所得序列进行了SNP分析。[结果]柑橘类植物核苷酸同源性高达97.2%,与其他植物Mn/Fe-SOD基因核苷酸序列的同源性都在77.7%以上;经过氨基酸序列推导,每个基因片段分别编码142个氨基酸,6个基因片段的氨基酸同源性为97.9%,与其他植物Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列同源性在79.0%以上。在Mn/Fe-SOD基因片段中有18个核苷酸位点存在SNPs,导致3个氨基酸位点发生变异,多态性频率为1SNP/23.7bp,核苷酸变异度为4.23%,氨基酸变异度为2.38%。[结论]该研究为丰富构建柑橘类植物基因图谱标记和抗逆性状的遗传标记奠定了基础。 展开更多
关键词 柑橘类植物 sod 基因克隆 SNP 序列分析
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油茶SOD基因片段克隆及序列分析 被引量:2
10
作者 郭春兰 张露 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期417-421,共5页
根据已报道的多种植物Cu/Zn-SOD和Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列的保守区域分别设计简并引物,以油茶(Camellia oleifera)叶片总RNA为模板,通过RT-PCR分别扩增得到一个375bp的Cu/Zn-SOD基因片段和一个429bp的Mn/Fe-SOD基因片段。将片段序列... 根据已报道的多种植物Cu/Zn-SOD和Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列的保守区域分别设计简并引物,以油茶(Camellia oleifera)叶片总RNA为模板,通过RT-PCR分别扩增得到一个375bp的Cu/Zn-SOD基因片段和一个429bp的Mn/Fe-SOD基因片段。将片段序列在NCBI网站上进行同源性比对,表明本研究克隆的结果均与多种植物的Cu/Zn-SOD和Mn/Fe-SOD基因存在亲缘关系,因而认为所克隆的基因片段就是油茶SOD基因;并运用DNAStar5.0软件分别进行序列分析,推导的氨基酸序列分别为125个残基和143个残基;具有所有植物SOD基因共有的保守区域;与多种植物Cu/Zn-SOD基因的核苷酸和氨基酸序列的同源性均分别在80%和84%以上,与其他植物的Mn/Fe-SOD基因的核苷酸和氨基酸序列的同源性都在84%和86%以上。 展开更多
关键词 油茶 sod 基因克隆 序列分析
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柞蚕核型多角体病毒sod基因核心序列的克隆与分析 被引量:1
11
作者 徐家萍 王文兵 +1 位作者 陈克平 赵远 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期190-193,共4页
根据多种鳞翅目昆虫NPVsod基因的保守区序列设计引物,克隆了柞蚕NPV的sod基因中300个核苷酸的核心区序列。通过同源性比较发现,柞蚕NPV的sod基因与云杉卷叶蛾(Choristioneurefumiferana)和黄杉毒蛾(Orgyiapseudotsugata)NPV的sod基因的... 根据多种鳞翅目昆虫NPVsod基因的保守区序列设计引物,克隆了柞蚕NPV的sod基因中300个核苷酸的核心区序列。通过同源性比较发现,柞蚕NPV的sod基因与云杉卷叶蛾(Choristioneurefumiferana)和黄杉毒蛾(Orgyiapseudotsugata)NPV的sod基因的同源性较高,分别为80 1%和76 6%,而与家蚕NPV和苜蓿尺蠖NPV的同源性相对较远。 展开更多
关键词 柞蚕核型多角体病毒 sod基因 核心序列 克隆
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福州旗山野生蕉(Musa spp.,AB Group)试管苗Mn-SOD基因克隆及生物信息学分析 被引量:1
12
作者 张锐 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第11期2215-2222,共8页
以旗山野生蕉(Musa spp.,AB group)试管苗幼嫩叶片为材料,利用RT-PCR结合RACE技术克隆获得野生蕉试管苗Mn-SOD基因c DNA序列。结果表明:旗山野生蕉Mn-SOD的c DNA全长序列共831 bp,其中5′UTR为137 bp,3′UTR为151 bp,3′端含有17个poly... 以旗山野生蕉(Musa spp.,AB group)试管苗幼嫩叶片为材料,利用RT-PCR结合RACE技术克隆获得野生蕉试管苗Mn-SOD基因c DNA序列。结果表明:旗山野生蕉Mn-SOD的c DNA全长序列共831 bp,其中5′UTR为137 bp,3′UTR为151 bp,3′端含有17个poly(A)尾。开放阅读框(ORF)共有543个碱基组成,编码181个氨基酸。蛋白理化性质预测结果显示:Mn-SOD蛋白分子量为20 108.8 u,等电点7.92,属于碱性蛋白。 展开更多
关键词 旗山野生蕉(Musa spp. AB Group) 试管苗 基因克隆 Mn—sod基因 生物信息学分析
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桔小实蝇超氧化物歧化酶基因SOD3的克隆及表达分析
13
作者 申建梅 陈炳翰 +4 位作者 李森 廖泓之 柯智 柳建良 胡黎明 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2015年第4期767-772,共6页
采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和快速扩增c DNA末端(RACE)技术克隆桔小实蝇SOD3基因,并命名为Bdor SOD3。Bdor SOD3阅读框全长531 bp,编码176个氨基酸,第1-20位氨基酸为其信号肽区域;该蛋白序列与桔小实蝇的另外一种SOD蛋白AGE8977... 采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和快速扩增c DNA末端(RACE)技术克隆桔小实蝇SOD3基因,并命名为Bdor SOD3。Bdor SOD3阅读框全长531 bp,编码176个氨基酸,第1-20位氨基酸为其信号肽区域;该蛋白序列与桔小实蝇的另外一种SOD蛋白AGE89778.1序列的一致性最高,达98.7%;采用Swiss-model在线软件模拟构建Bdor SOD3蛋白的三维结构;采用半定量PCR方法,研究Bdor SOD3基因大肠杆菌诱导后的表达情况,结果表明,Bdor SOD3在处理与对照的24 h、48 h都有表达,但Bdor SOD3在处理后48 h表达量明显升高,结果暗示Bdor SOD3与桔小实蝇蛹对大肠杆菌的免疫机制有关。 展开更多
关键词 桔小实蝇 sod3 基因克隆 半定量PCR
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吴茱萸Cu/Zn-SOD基因全长cDNA克隆与序列分析
14
作者 吴波 罗光明 +1 位作者 高丹 张寿文 《中药材》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1385-1388,共4页
目的:克隆获得与吴茱萸抗逆性密切相关的Cu/Zn-SOD基因cDNA全长序列。方法:采用RACE技术获得了该基因的开放阅读框(ORF)和3,5,端非编码区。结果:该基因全长717 bp,ORF区为459 bp,编码152个氨基酸,GenBank登录号为JQ285851。结论:该基因... 目的:克隆获得与吴茱萸抗逆性密切相关的Cu/Zn-SOD基因cDNA全长序列。方法:采用RACE技术获得了该基因的开放阅读框(ORF)和3,5,端非编码区。结果:该基因全长717 bp,ORF区为459 bp,编码152个氨基酸,GenBank登录号为JQ285851。结论:该基因为吴茱萸Cu/Zn-SOD基因cDNA全长序列,与其它植物的Cu/Zn-SOD基因具有较高的同源性。 展开更多
关键词 吴茱萸 CU Zn—sod基因克隆 RACE 序列分析
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新西兰白兔SOD1基因编码区克隆及生物信息学分析
15
作者 邓小亮 马文康 +2 位作者 洪玮 付欣 谭茵 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第8期2236-2245,共10页
试验旨在克隆新西兰白兔SOD1基因CDS区并对其进行生物信息学分析。根据GenBank中穴兔SOD 1基因序列(登录号:NM_001082627.2)设计特异性引物,利用RT-PCR技术扩增并克隆新西兰白兔SOD 1基因完整的CDS区序列,测序鉴定后与其他物种进行同源... 试验旨在克隆新西兰白兔SOD1基因CDS区并对其进行生物信息学分析。根据GenBank中穴兔SOD 1基因序列(登录号:NM_001082627.2)设计特异性引物,利用RT-PCR技术扩增并克隆新西兰白兔SOD 1基因完整的CDS区序列,测序鉴定后与其他物种进行同源性比对并构建系统进化树,使用SOPMA、SWISS-MODEL、ExPASy、ProtParam等软件和在线工具对蛋白序列进行分析,并预测蛋白分子的亚细胞定位及互作网络。结果显示,新西兰白兔SOD 1基因CDS区长度为459 bp,A、T、C、G碱基含量分别为24.84%、18.95%、23.09%和33.12%,GC含量大于AT含量,编码153个氨基酸。同源性比对结果发现,新西兰白兔与穴兔、卷尾猴、人、黑猩猩、普通狨、骆驼、家犬、猕猴、野猪、小鼠的同源性分别为99.8%、85.2%、85.0%、84.7%、84.1%、83.9%、83.9%、83.7%、83.2%和81.3%。系统进化树结果显示,新西兰白兔和穴兔进化关系最近,并单独聚成一个分支。新西兰白兔SOD1蛋白分子质量为15.7 ku,理论等电点(pI)为5.86,分子式为C672H1084N200O221S5,不稳定指数为23.79,脂肪系数为78.89,平均亲水指数(GRAVY)为-0.276;属水溶性蛋白,无信号肽及跨膜区。SOD1蛋白包含5个潜在的磷酸化修饰位点和3个潜在的糖基化位点;在45-120位氨基酸处存在1个保守的活性中心;二级结构以无规则卷曲为主,占53.59%;三级结构建模显示蛋白易形成同源二聚体。亚细胞定位结果显示,细胞质、细胞核和线粒体分别占65.2%、26.1%和8.7%;SOD1蛋白在体内能与SOD2、PRDX1、PRDX3、PRDX4、DERL1等分子形成互作网络。本试验结果为进一步深入研究SOD 1基因的功能及探索其与相关疾病的关系提供了参考依据。 展开更多
关键词 新西兰白兔 sod1基因 克隆 生物信息学 预测
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耐碱Mn-SOD基因克隆与真核表达载体的构建
16
作者 陈红漫 马晶 +1 位作者 訾晓男 阚国仕 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2008年第3期80-83,共4页
以高产耐碱Mn-SOD产生菌Bacillussp.110-2总DNA为模板,通过PCR扩增得到耐碱Mn-SOD基因,编码一个完整的开放阅读框,共202个氨基酸,含18个碱性氨基酸,包括12个赖氨酸和6个精氨酸。与地衣芽孢杆菌同源性为99%,与极端耐碱芽孢杆菌(Bacillus ... 以高产耐碱Mn-SOD产生菌Bacillussp.110-2总DNA为模板,通过PCR扩增得到耐碱Mn-SOD基因,编码一个完整的开放阅读框,共202个氨基酸,含18个碱性氨基酸,包括12个赖氨酸和6个精氨酸。与地衣芽孢杆菌同源性为99%,与极端耐碱芽孢杆菌(Bacillus halodurans)同源性为78.7%。克隆片段酶切后,插入到巴斯德毕赤酵母表达载体pPIC9K中,获得毕赤酵母真核表达载体pPIC9K-SOD。 展开更多
关键词 耐碱Mn—sod 基因克隆 真核表达载体构建
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节杆菌A. pascens DMDC12中SOD基因的克隆和序列分析
17
作者 叶艳华 何冰芳 应汉杰 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2008年第5期29-33,共5页
根据基因库中细菌SOD的基因保守序列和Arthrobacter pascens DMDC12的N-末端氨基酸序列设计引物,采用PCR技术,以A.pascens DMDC12基因组为模板,克隆了A.pascens DMDC12中Mn-SOD的567 bp的基因片段;再结合该基因片段和A.pascens DMDC12中... 根据基因库中细菌SOD的基因保守序列和Arthrobacter pascens DMDC12的N-末端氨基酸序列设计引物,采用PCR技术,以A.pascens DMDC12基因组为模板,克隆了A.pascens DMDC12中Mn-SOD的567 bp的基因片段;再结合该基因片段和A.pascens DMDC12中SOD的N-末端氨基酸序列的有关信息,设计包含该sod完整ORF区域的引物,成功扩增了A.pascens DMDC12中Mn-SOD的基因序列,新sod序列(sodAP)已提交Gen-Bank(收录号DQ779150)。利用生物学软件对该序列进行分析表明,该sodAP序列的ORF区域全长651 bp,编码216个氨基酸;该序列和Arthrobacter sp.FB24的SOD基因序列同源性为86%。 展开更多
关键词 A.pascens DMDC12菌株 Mn—sod sodAP 基因克隆
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葛仙米中SOD基因的克隆及在大肠杆菌中的表达
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作者 汪滢 章秀 +1 位作者 吴双秀 王全喜 《上海师范大学学报(自然科学版)》 2008年第3期301-304,共4页
采用PCR技术从葛仙米(Nostoc sphaeroides)总DNA中克隆了一段基因序列,该序列与基因库中已公布的编码普通念珠藻(Nostoc commnue)超氧化物歧化酶的氨基酸序列同源性为98%.将该基因插入含T7启动子的质粒pET-32a(+)中构建表达质粒pET-sod... 采用PCR技术从葛仙米(Nostoc sphaeroides)总DNA中克隆了一段基因序列,该序列与基因库中已公布的编码普通念珠藻(Nostoc commnue)超氧化物歧化酶的氨基酸序列同源性为98%.将该基因插入含T7启动子的质粒pET-32a(+)中构建表达质粒pET-sod,然后将该表达质粒转入大肠杆菌BL21中进行蛋白表达,表达菌株用1mmol/LIPTG诱导表达数小时后,产生较多重组的蛋白,且该蛋白以可溶性蛋白形式存在.SDS-PAGE分析表明:在相对分子量约为22kd的位置有一条明显蛋白质带.将诱导表达后的蛋白通过亲和层析的方法进行蛋白纯化;NBT光还原法测定表达产物的比活力,每毫克纯化蛋白约为2550U. 展开更多
关键词 葛仙米 sod基因克隆 诱导表达
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“台农甜蜜桃”胚性愈伤组织SOD基因家族的克隆与序列分析 被引量:1
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作者 汤燕姗 赖钟雄 +1 位作者 赖呈纯 林玉玲 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2013年第10期1925-1934,共10页
以"台农甜蜜桃"胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR和RACE法,首次从台农甜蜜桃中克隆出较为完整的包括Fe-SOD、Mn-SOD、Cu/Zn-SOD 3类型20条的SOD基因家族的全长序列,各成员核酸长度范围在858~1 234bp之间,共编码4种不同的蛋白。... 以"台农甜蜜桃"胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR和RACE法,首次从台农甜蜜桃中克隆出较为完整的包括Fe-SOD、Mn-SOD、Cu/Zn-SOD 3类型20条的SOD基因家族的全长序列,各成员核酸长度范围在858~1 234bp之间,共编码4种不同的蛋白。生物学分析学分析表明,SOD家族蛋白均为稳定的跨膜蛋白,均含有SOD典型的保守结构域,且在进化上高度保守,但在磷酸化位点上各蛋白差异较大,且3′UTR及5′UTR均具有多态性,可能通过以丝氨酸为主的磷酸化方式,改变酶活性及蛋白构象来参与对桃生长发育的调控。 展开更多
关键词 sod基因家族 克隆 序列分析
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副结核分枝杆菌SOD基因的克隆与序列分析 被引量:3
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作者 曾凡利 胡玉庆 +2 位作者 徐凤宇 王春芳 姜秀云 《中国兽药杂志》 2008年第3期1-3,共3页
以副结核分枝杆菌C-2染色体DNA为模板,以SOD基因特异性引物进行PCR扩增,获得约620 bp的DNA片段。将PCR产物克隆至pGEM-T Vector中,通过α-互补法筛选和质粒酶切及序列分析鉴定,成功构建出重组质粒pGEM-T-SOD,为进一步研究SOD基因及其表... 以副结核分枝杆菌C-2染色体DNA为模板,以SOD基因特异性引物进行PCR扩增,获得约620 bp的DNA片段。将PCR产物克隆至pGEM-T Vector中,通过α-互补法筛选和质粒酶切及序列分析鉴定,成功构建出重组质粒pGEM-T-SOD,为进一步研究SOD基因及其表达产物的免疫生化特性奠定基础。 展开更多
关键词 副结核分枝杆菌 sod基因 克隆 序列分析
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