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中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)黄、渤海3个野生地理群遗传多样性的微卫星DNA分析
被引量:
16
1
作者
刘萍
孟宪红
+3 位作者
何玉英
孔杰
李健
王清印
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期252-257,共6页
运用微卫星DNA技术 ,以中国对虾渤海湾群体 (BH)、辽东湾群体 (LD)和海州湾群体(HZ)的 3个野生群共计 60个个体为实验材料 ,进行了 7个基因位点的遗传参数分析。同时对7对微卫星引物的多态性信息含量 (PIC)进行了评估 ,EN0 0 2 1位点提...
运用微卫星DNA技术 ,以中国对虾渤海湾群体 (BH)、辽东湾群体 (LD)和海州湾群体(HZ)的 3个野生群共计 60个个体为实验材料 ,进行了 7个基因位点的遗传参数分析。同时对7对微卫星引物的多态性信息含量 (PIC)进行了评估 ,EN0 0 2 1位点提供的信息含量低于 0 5 ,其他 6对微卫星引物的PIC值均在 0 5以上 ,适于应用于中国对虾的群体分析。结果表明 ,这7个微卫星位点在中国对虾 3个地理群 60个样品的分析中共获得了 5 6个等位基因 ,对 3个野生群体的 7个基因位点共计 2 1个群体位点进行了杂合度观测值 (Ho)和杂合度期望值 (He)计算 ;在Hardy Weinberg平衡条件下 ,进行了P检验 ,发现BH和HZ各有 1个群体位点发生平衡偏离 ,而LD有 1个群体位点发生平衡偏离 ,还有 2个群体位点已发生显著平衡偏离。但除此之外 ,对 3个地理群间的遗传分化指数Fst值进行的计算结果表明 ,BH和LD之间遗传分化较弱 ,HZ与另 2个地理群间则产生了中等程度的分化。从变异贡献率来看 ,有 92 83%的遗传变异来自个体之间 ,只有 7 1 7%的遗传变异来自群体之间。经过UPGMA聚类 ,发现BH群体和LD群体的亲缘关系较近 ,而HZ群体与前两者亲缘关系较远。
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关键词
中国对虾
地理群体
微卫星
dna
多态性分析
下载PDF
职称材料
微卫星技术对黄、渤海海域7个不同地理群体中国对虾的遗传结构和遗传分化研究
被引量:
12
2
作者
孟宪红
孔杰
+1 位作者
王清印
刘萍
《海洋水产研究》
CSCD
北大核心
2008年第5期1-10,共10页
采用微卫星DNA技术对黄、渤海海域7个不同地理群体的中国对虾进行了遗传结构和遗传分化研究。7个地理群体分别来自辽东湾(LD)、渤海湾(BH)、海州湾(HZ)、乳山湾(RS)、海洋岛(HYD)、朝鲜半岛西海岸(KW)以及朝鲜半岛南海岸(K...
采用微卫星DNA技术对黄、渤海海域7个不同地理群体的中国对虾进行了遗传结构和遗传分化研究。7个地理群体分别来自辽东湾(LD)、渤海湾(BH)、海州湾(HZ)、乳山湾(RS)、海洋岛(HYD)、朝鲜半岛西海岸(KW)以及朝鲜半岛南海岸(KS)。7对多态性良好的微卫星引物共检测到109个等位基因,群体平均期望杂合度(He)范围为0.810~0.864。49个群体位点中,只有15个符合Hardy—Weinberg平衡。UPGMA聚类分析显示,各地理群体亲缘关系与地理位置关系密切。根据各地理群体间遗传距离及AMOVA遗传分化检验结果,可将中国对虾分为3个独立种群,分别为中国沿岸黄、渤海群体、朝鲜半岛西海岸群体及朝鲜半岛南海群体;其中中国沿岸黄、渤海群体内部也发生了一定程度的遗传分化,但是否达到种群水平还有待于进一步验证。
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关键词
中国对虾
地理群体
遗传分化
微卫星
dna
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职称材料
题名
中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)黄、渤海3个野生地理群遗传多样性的微卫星DNA分析
被引量:
16
1
作者
刘萍
孟宪红
何玉英
孔杰
李健
王清印
机构
中国水产科学研究院黄海水产研究所
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期252-257,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目
30 2 71 0 38号
+3 种基金
国家重点基础研究发展规划项目
1 9990 1 2 0 0 7号
国家"86 3"计划资助项目
2 0 0 3AA6 0 30 2 1号
文摘
运用微卫星DNA技术 ,以中国对虾渤海湾群体 (BH)、辽东湾群体 (LD)和海州湾群体(HZ)的 3个野生群共计 60个个体为实验材料 ,进行了 7个基因位点的遗传参数分析。同时对7对微卫星引物的多态性信息含量 (PIC)进行了评估 ,EN0 0 2 1位点提供的信息含量低于 0 5 ,其他 6对微卫星引物的PIC值均在 0 5以上 ,适于应用于中国对虾的群体分析。结果表明 ,这7个微卫星位点在中国对虾 3个地理群 60个样品的分析中共获得了 5 6个等位基因 ,对 3个野生群体的 7个基因位点共计 2 1个群体位点进行了杂合度观测值 (Ho)和杂合度期望值 (He)计算 ;在Hardy Weinberg平衡条件下 ,进行了P检验 ,发现BH和HZ各有 1个群体位点发生平衡偏离 ,而LD有 1个群体位点发生平衡偏离 ,还有 2个群体位点已发生显著平衡偏离。但除此之外 ,对 3个地理群间的遗传分化指数Fst值进行的计算结果表明 ,BH和LD之间遗传分化较弱 ,HZ与另 2个地理群间则产生了中等程度的分化。从变异贡献率来看 ,有 92 83%的遗传变异来自个体之间 ,只有 7 1 7%的遗传变异来自群体之间。经过UPGMA聚类 ,发现BH群体和LD群体的亲缘关系较近 ,而HZ群体与前两者亲缘关系较远。
关键词
中国对虾
地理群体
微卫星
dna
多态性分析
Keywords
fenneropenaeus
chinensis
,
geographic
population
s,
microsatellite
dna
, Polymorphic analysis
分类号
Q347 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
微卫星技术对黄、渤海海域7个不同地理群体中国对虾的遗传结构和遗传分化研究
被引量:
12
2
作者
孟宪红
孔杰
王清印
刘萍
机构
中国海洋大学生命学院
农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所
出处
《海洋水产研究》
CSCD
北大核心
2008年第5期1-10,共10页
基金
国家高科技研究发展计划(863)项目(2006AA10A406)
国家自然科学基金项目(30500378)
农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室开放课题(实开2005-08)资助
文摘
采用微卫星DNA技术对黄、渤海海域7个不同地理群体的中国对虾进行了遗传结构和遗传分化研究。7个地理群体分别来自辽东湾(LD)、渤海湾(BH)、海州湾(HZ)、乳山湾(RS)、海洋岛(HYD)、朝鲜半岛西海岸(KW)以及朝鲜半岛南海岸(KS)。7对多态性良好的微卫星引物共检测到109个等位基因,群体平均期望杂合度(He)范围为0.810~0.864。49个群体位点中,只有15个符合Hardy—Weinberg平衡。UPGMA聚类分析显示,各地理群体亲缘关系与地理位置关系密切。根据各地理群体间遗传距离及AMOVA遗传分化检验结果,可将中国对虾分为3个独立种群,分别为中国沿岸黄、渤海群体、朝鲜半岛西海岸群体及朝鲜半岛南海群体;其中中国沿岸黄、渤海群体内部也发生了一定程度的遗传分化,但是否达到种群水平还有待于进一步验证。
关键词
中国对虾
地理群体
遗传分化
微卫星
dna
Keywords
fenneropenaeus chinensis geographic population genetic differentiation microsatellite dna
分类号
Q953.1 [生物学—动物学]
Q959.223.63 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)黄、渤海3个野生地理群遗传多样性的微卫星DNA分析
刘萍
孟宪红
何玉英
孔杰
李健
王清印
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2004
16
下载PDF
职称材料
2
微卫星技术对黄、渤海海域7个不同地理群体中国对虾的遗传结构和遗传分化研究
孟宪红
孔杰
王清印
刘萍
《海洋水产研究》
CSCD
北大核心
2008
12
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职称材料
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