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成人牙周健康状况与fimA基因型牙龈卟啉单胞菌的相关性 被引量:20
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作者 赵蕾 吴亚菲 +2 位作者 杨禾 孟姝 欧阳玉玲 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期237-241,共5页
目的分析不同fimA基因型牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)在牙周健康人群和慢性牙周炎人群中的分布,探讨不同fimA基因型P.gingivalis与成人牙周状况的相关关系。方法收集牙周健康组(136例)和慢性牙周炎组(115例)的龈下菌斑样本,采用16SrRNA... 目的分析不同fimA基因型牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)在牙周健康人群和慢性牙周炎人群中的分布,探讨不同fimA基因型P.gingivalis与成人牙周状况的相关关系。方法收集牙周健康组(136例)和慢性牙周炎组(115例)的龈下菌斑样本,采用16SrRNAPCR法检测P.gingivalis,并根据各fimA基因型(Ⅰ~Ⅴ和Ⅰb)的特异性引物检测不同fimA基因型P.gingivalis菌株的分布,计算OR值和95%可信区间。结果牙周健康组和慢性牙周炎组龈下菌斑样本中P.gingivalis阳性率分别为22.1%和81.7%,多数样本中只检测到1种fimA基因型。牙周健康组中ⅠfimA型的检出率最高(占66.7%);慢性牙周炎组中则为ⅡfimA基因型(占43.6%),其次为Ⅳ和ⅠbfimA基因型。慢性牙周炎的发生与P.gingivalis的关系密切(OR=16.36),Ⅰ、Ⅰb、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、ⅤfimA基因型P.gingivalis与慢性牙周炎相关性的OR值分别为0.97、13.26、36.62、4.57、22.86、1.19;ⅡfimA基因型P.gingivalis与慢性牙周炎的相关性最强,其次为Ⅳ和Ⅰb型。结论P.gingivalis菌株的fimA基因型存在差异,特异性fimA基因型P.gingivalis可能与成人慢性牙周炎的发生关系密切。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 基因型 fima基因 牙周炎
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不同fimA基因型牙龈卟啉单胞菌在慢性牙周炎患者中的分布 被引量:12
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作者 郭永华 吴亚菲 +3 位作者 刘天佳 肖晓蓉 周斌 周雪平 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期99-102,共4页
目的 分析不同fimA基因型牙龈卟啉单胞菌(P .gingivalis)在慢性牙周炎患者中的分布状况。方法 收集10 1例慢性牙周炎患者的龈下菌斑,采用常规培养法和16SrRNAPCR检测P .gingivalis,并根据各fimA基因型的特异引物,用聚合酶链反应(PCR)... 目的 分析不同fimA基因型牙龈卟啉单胞菌(P .gingivalis)在慢性牙周炎患者中的分布状况。方法 收集10 1例慢性牙周炎患者的龈下菌斑,采用常规培养法和16SrRNAPCR检测P .gingivalis,并根据各fimA基因型的特异引物,用聚合酶链反应(PCR)检测不同fimA基因型菌株的分布。结果 16SrRNAPCR检测P .gingivalis阳性检出率为88 1%。大多数受检牙龈下菌斑中只检测出一种fimA基因型菌株(6 5 1% ) ,各fimA基因型的总检出率:ⅠfimA为2 4 7% ;ⅡfimA为4 3 8% ;ⅢfimA为15 7% ;ⅣfimA为4 0 4 % ;VfimA为3 4 %。结论 慢性牙周炎患者龈下菌斑中的牙龈卟啉单胞菌存在fimA基因多态性,ⅡfimA和ⅣfimA基因型P . 展开更多
关键词 聚合酶链反应 牙龈卟啉单胞菌 基因型 fima基因
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不同fimA基因型牙龈卟啉单胞菌在牙周健康人群中的分布 被引量:3
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作者 赵蕾 吴亚菲 +2 位作者 杨禾 欧阳玉玲 李从华 《口腔医学》 CAS 2007年第11期565-568,606,共5页
目的调查不同fimA基因型牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)在牙周健康人群中的分布情况。方法收集136例牙周健康者的龈下菌斑样本,采用16S rRNAPCR法检测P.gingivalis;并根据各fimA基因型特异性引物,用PCR法检测不同fimA基因型P.gingivalis... 目的调查不同fimA基因型牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)在牙周健康人群中的分布情况。方法收集136例牙周健康者的龈下菌斑样本,采用16S rRNAPCR法检测P.gingivalis;并根据各fimA基因型特异性引物,用PCR法检测不同fimA基因型P.gingivalis的分布。结果136例牙周健康者的龈下菌斑样本中携带P.gingivalis的阳性率为22.1%。大多数受检者龈下菌斑中只检测到1种fimA基因型P.gingivalis菌株(80.0%);5例样本检出了2种fimA型P.gingivalis(16.7%),且均为ⅠfimA型与其它fimA型P.gingivalis的联合检出。各fimA型P.gingivalis的检出情况:Ⅰ型(66.7%)、Ⅰb型(6.7%)、Ⅱ型(6.7%)、Ⅲ型(10%)、Ⅳ型(6.7%)、Ⅴ型(16.7%)。Ⅰ型的检出率明显高于其它各型,差异有统计学意义(P<0.05);其它各fimA型P.gingi-valis间的检出差异均无统计学意义。结论本研究条件下ⅠfimA型P.gingivalis在牙周健康人群中检出例数最高,提示:我国牙周状况不同人群携带的P.gingivalis菌株fimA基因型可能存在差异。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 基因型 fima基因 牙周状况
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感染根管中牙龈卟啉单胞菌fimA基因多态性研究 被引量:4
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作者 王畅 唐子圣 +7 位作者 漆正楠 毛骁俊 何剑亮 诸晓丹 邹岩 黄正蔚 何智妍 朱彩莲 《口腔医学》 CAS 2016年第1期18-21,33,共5页
目的研究根尖周炎患牙感染根管内牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)不同fimA基因型的分布情况。方法收集200例感染根管内样本,经DNA抽提后使用16S r DNA PCR方法检测P.gingivalis。在P.gingivalis检出阳性样本中,根据各fimA基因型的特异引物... 目的研究根尖周炎患牙感染根管内牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)不同fimA基因型的分布情况。方法收集200例感染根管内样本,经DNA抽提后使用16S r DNA PCR方法检测P.gingivalis。在P.gingivalis检出阳性样本中,根据各fimA基因型的特异引物,采用PCR检测不同fimA基因型菌株的分布,并通过Pearsonχ2检验对不同fimA基因型与临床症状进行相关性分析。结果感染根管中P.gingivalis的检出率为48%,其中79例样本只检测到1种fimA基因型P.gingivalis菌株(82.3%);12例样本检测到2种或2种以上fimA基因型P.gingivalis(12.5%)。各fimA基因型P.gingivalis的检出情况:Ⅰ型29.2%、Ⅰb型8.3%、Ⅱ型37.5%、Ⅲ型14.6%、Ⅳ型19.8%。各型fimA基因与临床症状之间无统计学相关性(P<0.05)。结论感染根管内P.gingivalis的fimA基因存在基因多态性,其中以fimAⅡ型P.gingivalis菌株检出率最高,其次为Ⅰ型和Ⅳ型。 展开更多
关键词 根尖周感染 感染根管 牙龈卟啉单胞菌 fima基因 基因多态性
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牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白fimA基因克隆和序列分析
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作者 梁平 谢红帼 +4 位作者 苟建重 石剑锋 饶国洲 李昂 司薇杭 《陕西医学杂志》 CAS 2009年第2期134-135,164,共3页
目的:扩增牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白fimA的基因片段并作鉴定。方法:采用PCR方法克隆牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白的fimA基因,且将基因片段插入pMD18-T Vector,通过限制性酶切和核苷酸序列分析鉴定。结果:克隆基因测序结果与Gene Bank核酸数据... 目的:扩增牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白fimA的基因片段并作鉴定。方法:采用PCR方法克隆牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白的fimA基因,且将基因片段插入pMD18-T Vector,通过限制性酶切和核苷酸序列分析鉴定。结果:克隆基因测序结果与Gene Bank核酸数据库中收录的Pg 381fimA的序列完全一致。结论:成功克隆了牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白fimA基因,为体外表达其活性蛋白提供了基础。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 牙龈卟啉单胞菌 菌毛 @fima基因
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迟钝爱德华菌环介导等温扩增检测方法研究
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作者 何亚鹏 李小龙 +5 位作者 刘鑫 张树林 杜迎春 李博 魏凯 邹强军 《水产养殖》 CAS 2023年第1期24-27,36,共5页
为了建立一套用于实验室及室外现场检测迟钝爱德华菌(Edwardsiella tarda,Et)的环介导等温扩增方法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),以迟钝爱德华菌的毒力基因fimA为靶基因设计特异性引物,以基因组DNA为模板,进行环介导... 为了建立一套用于实验室及室外现场检测迟钝爱德华菌(Edwardsiella tarda,Et)的环介导等温扩增方法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),以迟钝爱德华菌的毒力基因fimA为靶基因设计特异性引物,以基因组DNA为模板,进行环介导恒温扩增,并对其特异性、灵敏性和临床检测进行了试验。结果显示,迟钝爱德华菌阳性样本反应呈现为荧光绿色,阴性样本不变色。该LAMP方法的最适反应温度为63℃;特异性试验表明仅迟钝爱德华菌样本发生反应,而杀鲑气单胞菌、嗜水气单胞菌、温气单胞菌和豚鼠气单胞菌均不发生反应;敏感性试验表明,该LAMP方法可检出浓度为2.16×10^(-5)mg/L的迟钝爱德华菌的核酸。 展开更多
关键词 迟钝爱德华菌 环介导等温扩增 fima基因
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地图鱼迟钝爱德华氏菌病病原菌的鉴定及毒力基因的检测 被引量:12
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作者 赵飞 邹为民 +3 位作者 谭爱萍 罗理 姜兰 陆小萏 《大连水产学院学报》 CSCD 北大核心 2007年第6期403-408,共6页
从患病地图鱼Astronotus ocellatus肝脏组织中分离到菌株AO1,经人工感染试验证实其为致病菌。通过ATB Expression半自动细菌鉴定仪和常规生理生化特性的分析,初步鉴定该菌株为迟钝爱德华氏菌Ed-wardsiella tarda。测定菌株AO1的16S rRN... 从患病地图鱼Astronotus ocellatus肝脏组织中分离到菌株AO1,经人工感染试验证实其为致病菌。通过ATB Expression半自动细菌鉴定仪和常规生理生化特性的分析,初步鉴定该菌株为迟钝爱德华氏菌Ed-wardsiella tarda。测定菌株AO1的16S rRNA基因序列并进行分析,结果显示,该菌株与迟钝爱德华氏菌的同源性最高,达99.9%。因此,可鉴定该菌株为迟钝爱德华氏菌。根据迟钝爱德华氏菌的毒力基因菌毛亚基(fimA)基因序列设计引物,进行PCR扩增,得到383 bp序列,该序列与迟钝爱德华氏菌的fimA基因序列相似性达99.0%,进一步说明菌株AO1具有fimA基因,有一定的致病力。药物敏感试验结果表明,菌株AO1对阿米卡星、氧氟沙星、庆大霉素、新生霉素、氨苄西林、氨曲南、卡那霉素、头孢咪啉、诺氟沙星、环丙沙星、呋喃妥因、妥布霉素、氨苄青霉素13种抗生素较为敏感。 展开更多
关键词 地图鱼 迟钝爱德华氏菌 16SRRNA基因 fima基因
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牙鲆致病性迟钝爱德华菌毒力基因的检测及序列分析 被引量:3
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作者 朱文进 陈翠珍 +4 位作者 苏咏梅 葛慕湘 张艳英 靳晓敏 房海 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2014年第11期20-24,共5页
为探讨牙鲆致病性迟钝爱德华菌毒力基因携带与分布,以毒力基因为分子靶标研究其致病机理及建立快速检测方法,根据GenBank上的基因序列,设计2对引物扩增致病性迟钝爱德华菌毒力基因fimA和小肠结肠炎耶尔森菌毒力基因irp2,结果在7个供试... 为探讨牙鲆致病性迟钝爱德华菌毒力基因携带与分布,以毒力基因为分子靶标研究其致病机理及建立快速检测方法,根据GenBank上的基因序列,设计2对引物扩增致病性迟钝爱德华菌毒力基因fimA和小肠结肠炎耶尔森菌毒力基因irp2,结果在7个供试牙鲆病例的130株致病性迟钝爱德华菌中,irp2毒力基因的阳性率为46.15%(60/130),fimA毒力基因的阳性率为100%,且均与已发表的参考菌株相应序列高度同源,同源性分别为97.32%和97.59%。可见耶尔森菌强毒力岛(HPI)在牙鲆致病性迟钝爱德华菌中广泛分布,但不同病例分离菌株间存在差异;fimA毒力基因存在于所有的被检致病性迟钝爱德华菌中,可以作为快速检测致病性迟钝爱德华菌的标志物。 展开更多
关键词 牙鲆 迟钝爱德华菌fima irp2 毒力基因
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牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白的重组及表达 被引量:2
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作者 肖莉 林玉祥 葛颂 《国际口腔医学杂志》 CAS 北大核心 2015年第6期655-658,共4页
目的克隆Ⅱfi m A型牙龈卟啉单胞菌菌毛fi m A基因并使其在结肠埃希菌中正确表达。方法利用聚合酶链反应技术克隆Ⅱ型fi m A基因,经酶切和测序验证后构建原核表达质粒p ET-Fim A,使其在结肠埃希菌中表达,十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶... 目的克隆Ⅱfi m A型牙龈卟啉单胞菌菌毛fi m A基因并使其在结肠埃希菌中正确表达。方法利用聚合酶链反应技术克隆Ⅱ型fi m A基因,经酶切和测序验证后构建原核表达质粒p ET-Fim A,使其在结肠埃希菌中表达,十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳和Western blot鉴定表达产物。结果克隆基因测序结果与Gene Bank数据库中的序列呈现95%同源性,成功构建fi m A基因原核表达载体p ET-Fim A。结论高效表达出Ⅱfi m A型重组菌毛蛋白,并获得较高纯度,且具有免疫原性和免疫反应性。 展开更多
关键词 fima型牙龈卟啉单胞菌 重组菌毛 蛋白表达
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牙龈卟啉单胞菌临床菌株fimA基因变异性和表达频率及其重组表达产物的致炎作用 被引量:2
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作者 陈莉丽 吴梦婕 严杰 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期850-854,共5页
目的了解牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)fimA基因变异性,构建fimA基因原核表达系统,鉴定其表达产物(rFimA)的致炎作用,检测FimA在Pg临床菌株中表达频率,了解FimA与慢性牙周炎的关系。方法采用高保真PCR从6株Pg临床菌株中... 目的了解牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)fimA基因变异性,构建fimA基因原核表达系统,鉴定其表达产物(rFimA)的致炎作用,检测FimA在Pg临床菌株中表达频率,了解FimA与慢性牙周炎的关系。方法采用高保真PCR从6株Pg临床菌株中扩增fimA基因并测定其核苷酸序列。构建fimA基因原核表达系统,制备rFimA兔抗血清。采用Western blot鉴定rFimA抗原性和免疫反应性。建立ELISA检测38株Pg临床菌株FimA表达情况和97例慢性牙周炎患者212份龈下菌斑标本中的FimA。检测rFimA诱导人脐静脉内皮EVC-304细胞分泌IL-1I、L-8、TNF-α和细胞间黏附分子-1(ICAM-1)的作用。结果6株Pg临床菌株fimA基因核苷酸序列完全相同。所构建的原核表达系统rFimA产量高达细菌总蛋白的50%左右。rFimA可与Pg全菌抗血清发生结合反应,免疫家兔可获得高效价抗体。94.7%(36/38)菌株和91.5%(194/212)龈下菌斑标本ELISA结果阳性。1和10μg的rFimA作用EVC-304细胞48 h,其分泌的IL-1α水平升高(P<0.05);但作用12 h即可出现高水平的ICAM-1(P<0.05),未发现有诱导IL-8和TNF-α的作用(P>0.05)。结论fimA基因序列保守,在Pg临床菌株中有很高的表达频率。rFimA有良好的抗原性和免疫反应性,可作为Pg血清学检测试剂盒和Pg疫苗的候选抗原。rFimA有较强的诱导细胞分泌ICAM-1的作用。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 fima基因 克隆表达 检测 致炎作用
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致病性鸡大肠杆菌Ⅰ型菌毛fimA基因的克隆和同源性分析
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作者 李成梅 胡业结 +1 位作者 曾晓君 刘容珍 《仲恺农业工程学院学报》 CAS 2015年第2期1-4,共4页
根据Genbank已发表的致病性鸡大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)Ⅰ型菌毛fim A基因序列,设计并合成了位于fim A基因保守区的1对引物.应用PCR技术以鸡大肠杆菌标准株和分离株DNA为模板,扩增到片段长为549 bp的阳性产物;... 根据Genbank已发表的致病性鸡大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)Ⅰ型菌毛fim A基因序列,设计并合成了位于fim A基因保守区的1对引物.应用PCR技术以鸡大肠杆菌标准株和分离株DNA为模板,扩增到片段长为549 bp的阳性产物;经酶切、连接、转化和筛选,得到fim A基因,并克隆、测序;运用DNAStar软件对核酸序列分析,确定所扩增和克隆的DNA片段为fim A基因. 展开更多
关键词 致病性鸡大肠杆菌 ( AVIAN PATHOGENIC ESCHERICHIA coli APEC) Ⅰ型菌毛 fima基因 克隆 同源性分析
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慢性根尖周炎感染根管内牙龈卟啉单胞菌fimA基因多态性及其临床特点 被引量:2
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作者 贾希进 李海峰 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1346-1350,共5页
目的 探究慢性根尖周炎感染根管内牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)fimA基因多态性及其临床症状。方法 选择2015年7月-2019年12月于北京市昌平区医院牙体牙髓科就诊的155例(155颗)慢性根尖周炎患者作为研究对象,检测患牙根管内P.gingivali... 目的 探究慢性根尖周炎感染根管内牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)fimA基因多态性及其临床症状。方法 选择2015年7月-2019年12月于北京市昌平区医院牙体牙髓科就诊的155例(155颗)慢性根尖周炎患者作为研究对象,检测患牙根管内P.gingivalis感染情况及fimA基因多态性,记录患者疼痛、根尖区红肿、窦道等症状及体征,对根尖病变情况进行评价,测定根管组织液中白细胞介素(IL)-1β、IL-6水平,测定患牙菌斑指数(PLI)、探诊出血指数(BI)、牙周袋探诊深度(PD)、牙龈指数(GI)等牙周相关指标。结果 共检出P.gingivalis 72例,检出率为46.45%,P.gingivalis阳性组患者有症状比例高于P.gingivalis阴性组(P<0.05),60例患者检出fimA基因,其中基因型Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型、Ⅰ+Ⅰb型检出率分别为11.67%、31.67%、18.33%、25.00%、13.33%,fimAⅠ+Ⅰb型疼痛症状占比最高,fimAⅡ型渗出症状占比最高(P<0.05),fimAⅡ型基因型根管组织液IL-1β高于其他基因型(P<0.05),不同fimA基因型患者根尖周严重程度及牙周相关指数比较差异无统计学意义。结论 不同fimA基因型P.gingivalis感染患者临床症状存在一定差异,fimAⅠ+Ⅰb、Ⅱ型基因型与根尖周感染疼痛、渗出的发生具有相关性。 展开更多
关键词 慢性根尖周炎 根管 牙龈卟啉单胞菌 fima基因 临床症状
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