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高通量测序技术在低频突变检测中的应用 被引量:2
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作者 栾洋 尤馨悦 杨劲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期126-139,共14页
体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的... 体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的出现,可以实现任意物种全基因组上变异的直接检测,克服传统突变检测技术的诸多局限性。但是常规NGS由于测序错误率较高从而限制了其在低频突变检测上的应用,基于分子一致性测序策略进行错误矫正的高准确性NGS测序技术作为有效的低频突变检测工具,有望在环境诱变剂的评价与研究、细胞与基因治疗药物风险评估、人群健康风险监测和生命科学基础研究领域发挥重要作用。本文对比经典突变检测方法,对基于NGS的低频突变检测技术研究进展进行综述,并对应用前景进行展望,以期为该技术的进一步开发、研究和在相关领域的应用提供参考。 展开更多
关键词 高通量测序技术 低频突变 分子一致性测序 突变 风险评估
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PTEN基因突变Cowden综合征相关单侧多中心乳腺癌及同时性、异时性双侧乳腺癌3例 被引量:1
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作者 姚儒 杨旭 +8 位作者 屈洋 连杰 张家慧 黄欣 陈畅 任新瑜 潘博 周易冬 孙强 《协和医学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第4期916-920,共5页
10号染色体上磷酸酶和张力蛋白同源物(phosphatase and tensin-homolog deleted on chromosome 10,PTEN)是重要的抑癌基因,其突变可引发PTEN错构瘤肿瘤综合征(PTEN hamartoma tumor syndrome,PHTS),常被称为Cowden综合征,是较为罕见的... 10号染色体上磷酸酶和张力蛋白同源物(phosphatase and tensin-homolog deleted on chromosome 10,PTEN)是重要的抑癌基因,其突变可引发PTEN错构瘤肿瘤综合征(PTEN hamartoma tumor syndrome,PHTS),常被称为Cowden综合征,是较为罕见的遗传性肿瘤综合征,其与早发性、多发性乳腺癌高度相关。本文报道3例PTEN基因突变相关单侧多中心乳腺癌及同时性、异时性双侧乳腺癌患者,并总结其临床表现、病理特征、诊治经验及随访情况,旨在为临床医生更好地诊治PTEN基因突变相关乳腺癌及Cowden综合征人群提供借鉴。 展开更多
关键词 PTEN基因突变 乳腺癌 双侧乳腺癌 Cowden综合征
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基于随机突变的电商平台信用监管弹性研究 被引量:1
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作者 危小超 佘其平 聂规划 《管理工程学报》 CSSCI CSCD 北大核心 2024年第1期266-280,共15页
本文集成随机突变理论和弹性理论,探讨了电商平台信用监管的弹性测度问题。首先,构建监管部门和平台企业信用监管演化博弈模型,引入白噪声和It^o随机微分方程建立随机动力系统;进一步,结合随机突变理论,用极限概率密度函数描述系统的均... 本文集成随机突变理论和弹性理论,探讨了电商平台信用监管的弹性测度问题。首先,构建监管部门和平台企业信用监管演化博弈模型,引入白噪声和It^o随机微分方程建立随机动力系统;进一步,结合随机突变理论,用极限概率密度函数描述系统的均衡表现,引入弹性指标定量表述系统均衡态改变前对扰动的吸收能力,仿真模拟系统参数变化对弹性的影响。研究表明:(1)监管主体从积极监管到消极监管的结构性突变源于变量组合经过分歧点集合时产生的自组织相变;(2)监管系统弹性演化过程与随机突变过程一致,突变的发生会导致监管弹性迅速改变;(3)上级政府惩罚力度对弹性影响显著,两者呈“U”形关系;在满足“突变”临界值约束下,超额收益对弹性有负向影响,监管主体协同度和公众媒体参与度对弹性有正向影响。本研究将电商平台信用监管研究拓展到弹性研究领域,为平台监管预警和政策优化提供思路;同时,为弹性理论和突变论的集成提供方法论尝试。 展开更多
关键词 电商平台 信用监管 随机突变理论 弹性
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北海地区遗传性乳腺癌和健康遗传高危人群BRCA1和BRCA2基因突变研究 被引量:1
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作者 程学远 高雪原 +1 位作者 陈洁清 刘家麒 《吉林医学》 CAS 2024年第3期528-531,共4页
目的:探讨北海地区遗传性乳腺癌和健康遗传高危人群乳腺癌易感基因(BRCA)1和BRCA2基因突变特征。方法:选取北海市人民医院普通外科收治的50例遗传性乳腺癌患者及150例健康遗传性高危人群,PCR-DNA直接测序法检测BRCA1、BRCA2的全编码外... 目的:探讨北海地区遗传性乳腺癌和健康遗传高危人群乳腺癌易感基因(BRCA)1和BRCA2基因突变特征。方法:选取北海市人民医院普通外科收治的50例遗传性乳腺癌患者及150例健康遗传性高危人群,PCR-DNA直接测序法检测BRCA1、BRCA2的全编码外显子基因序列。结果:50例遗传性乳腺癌患者中共有8例BRCA1/2基因突变,总突变率为16%;其中BRCA1突变占12.0%,BRCA2突变占4.0%。三阴性乳腺癌患者BRCA1/2基因突变率为57.1%(4/7),高于非三阴性乳腺癌患者的9.3%(4/43),差异有统计学意义(P<0.05)。150例健康遗传性高危人群存在2例致病性突变,均位于BRCA1的11外显子,突变率为1.3%(2/150)。结论:北海地区女性遗传性乳腺癌存在BRCA1和BRCA2基因突变,与三阴乳腺癌有关,突变类型以碱基置换突变为主;健康遗传高危人群也存在BRCA1突变。 展开更多
关键词 遗传性乳腺癌 基因突变 BRCA1 BRCA2
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玉米矮秆突变体20F421的表型鉴定及遗传分析
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作者 刘忠祥 周文期 +5 位作者 李永生 王晓娟 杨彦忠 连晓荣 何海军 周玉乾 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期22-29,共8页
矮秆资源是农作物矮化育种的物质基础,发掘矮秆基因资源对培育矮秆新品种具有重要作用。为了明确^(252)CF裂变快中子辐射诱变玉米自交系KWS49筛选得到的矮秆突变体20F421的遗传特性和矮化机理,以20F421为材料分别与玉米自交系PH6WC、B73... 矮秆资源是农作物矮化育种的物质基础,发掘矮秆基因资源对培育矮秆新品种具有重要作用。为了明确^(252)CF裂变快中子辐射诱变玉米自交系KWS49筛选得到的矮秆突变体20F421的遗传特性和矮化机理,以20F421为材料分别与玉米自交系PH6WC、B73、Mo17及KWS49杂交构建F_(1)和F_(2)分离群体,分析矮秆性状的遗传模式,并以(20F421/B73)F_(2)为定位群体,采用混池转录组测序(bulked segregant RNA-seq,BSR-seq)方法初步定位突变基因。结果表明,与KWS49相比,20F421的植株高度为95.2 cm,降低47.89%;穗位高度为23.9 cm,降低64.54%;茎秆节间长度显著缩短、叶片较直立密生,自交结实良好。遗传分析表明,F2分离群体野生型(高秆)与突变型(矮秆)植株性状分离比例符合3∶1,表明该突变体受单个核隐性基因控制;BSR-seq结果将突变基因定位在1号染色体177~255 Mb之间。通过与B73参考基因组进行比对发现,该区间内含有矮秆基因Br2,将20F421与br2突变体杂交进行等位性检测,F_(1)和F_(2)的株高均没有发生性状分离,表现为突变体20F421和br2表型,推测20F421的矮秆突变基因为矮秆基因Br2的等位突变。研究结果为进一步精细定位、克隆突变基因奠定基础,也为解析玉米矮化机理和培育矮秆玉米新品种提供重要基因资源和理论支撑。 展开更多
关键词 玉米 矮杆 突变 表型鉴定 遗传分析
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脊髓H3K27M突变型与野生型星形细胞分化弥漫性中线胶质瘤MRI特征
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作者 王海阔 张杰 +4 位作者 张耀武 郑广浩 李俊杰 王永志 贾文清 《中国医学影像技术》 CSCD 北大核心 2024年第6期815-819,共5页
目的观察脊髓H3K27M突变型与野生型星形细胞分化弥漫性中线胶质瘤(DMG)MRI特征。方法回顾性分析91例经病理确诊脊髓星形细胞分化DMG患者,根据H3K27M状态分为突变组(n=44)和野生组(n=47);观察组间临床和MRI表现差异,采用logistic回归分... 目的观察脊髓H3K27M突变型与野生型星形细胞分化弥漫性中线胶质瘤(DMG)MRI特征。方法回顾性分析91例经病理确诊脊髓星形细胞分化DMG患者,根据H3K27M状态分为突变组(n=44)和野生组(n=47);观察组间临床和MRI表现差异,采用logistic回归分析筛选H3K27M突变的影响因素。结果突变组瘤周水肿和脊髓空洞发生率均小于野生组(P均<0.05),其余组间差异均无统计学意义(P均>0.05)。将所有临床及MRI参数纳入logistic回归分析,结果显示其均非H3K27M突变的影响因素(P均>0.05)。结论脊髓H3K27M突变型星形细胞分化DMG瘤周水肿和脊髓空洞发生率均低于野生型,但尚不足以作为预测DMG发生H3K27M突变的影响因素。 展开更多
关键词 脊髓 胶质瘤 突变 磁共振成像
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奥希替尼联合培美曲塞、顺铂治疗EGFR突变阳性晚期非小细胞肺癌的临床效果 被引量:1
7
作者 穆艳艳 张敬伟 +1 位作者 袁小笋 徐赟 《河南医学研究》 CAS 2024年第1期141-144,共4页
目的分析奥希替尼联合培美曲塞、顺铂对表皮生长因子受体(EGFR)突变阳性晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的疗效。方法选取2020年2月至2022年2月南阳市中心医院收治的148例EGFR突变阳性晚期NSCLC患者,按随机数表法分为靶向治疗组与化疗组,各74... 目的分析奥希替尼联合培美曲塞、顺铂对表皮生长因子受体(EGFR)突变阳性晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的疗效。方法选取2020年2月至2022年2月南阳市中心医院收治的148例EGFR突变阳性晚期NSCLC患者,按随机数表法分为靶向治疗组与化疗组,各74例。化疗组接受培美曲塞、顺铂治疗,靶向治疗组接受奥希替尼联合培美曲塞、顺铂治疗。对比两组疾病控制率、T淋巴细胞亚群(CD4^(+)、CD8^(+))、血管生成指标[细胞质胸苷激酶(TK1)、血管内皮生长因子(VEGF)]、血清肿瘤标志物[癌胚抗原(CEA)、糖类抗原50(CA50)、糖类抗原125(CA125)]、卡氏功能状态评分(KPS)、不良反应发生率。结果靶向治疗组疾病控制率[60.81%(45/74)]较化疗组[44.59%(33/74)]高(P<0.05)。治疗后,靶向治疗组CD4^(+)较化疗组高,CD8^(+)较化疗组低(P<0.05)。治疗后,靶向治疗组TK1、VEGF较化疗组低(P<0.05)。治疗后,靶向治疗组血清CEA、CA50、CA125水平较化疗组低(P<0.05)。治疗后,靶向治疗组KPS评分较化疗组高(P<0.05)。两组不良反应发生率差异无统计学意义(P>0.05)。结论奥希替尼联合培美曲塞、顺铂治疗EGFR突变阳性晚期NSCLC,能改善免疫功能,抑制血管生成,降低肿瘤标志物水平,提高疾病控制率,改善机体功能状况,且安全性良好。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 表皮生长因子受体 突变 奥希替尼 培美曲塞 顺铂
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抗枯萎病宝岛蕉早花突变体的筛选与鉴定
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作者 赵明 龙芳 +7 位作者 武鹏 莫天利 黄相 苏祖祥 魏守兴 邹瑜 张欣 林志城 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期540-550,共11页
【目的】筛选鉴定抗枯萎病香蕉品种宝岛蕉的早花突变体,为进一步利用突变体株系选育适应性更广的香蕉新品种提供参考依据。【方法】利用多代组织培养繁育结合田间种植对比试验,依据生育期短、抗病性强、株高矮、株产高和遗传稳定筛选目... 【目的】筛选鉴定抗枯萎病香蕉品种宝岛蕉的早花突变体,为进一步利用突变体株系选育适应性更广的香蕉新品种提供参考依据。【方法】利用多代组织培养繁育结合田间种植对比试验,依据生育期短、抗病性强、株高矮、株产高和遗传稳定筛选目标,从宝岛蕉早花突变后代中筛选优良株系,以宝岛蕉为对照,按照香蕉种质资源描述规范对优良突变株系的形态特征和生物学特性等进行观察鉴定,测定分析植株球茎生长点部位碳、氮营养累积以及成花相关激素吲哚乙酸(IAA)、玉米素(ZR)、赤霉素(GA)和脱落酸(ABA)含量差异,通过ISSR分子标记检测突变体及其野生型之间的遗传变异和亲缘关系。以宝岛蕉和主栽品种(桂蕉6号及巴西蕉)为对照,利用伤根浸菌法进行苗期抗病性鉴定,并在广西和海南开展区域种植试验及田间抗病性鉴定。【结果】筛选获得优良突变株系0523(简称0523),其新植蕉平均株高280.0 cm,假茎基围80.5 cm、中围60.0 cm,较宝岛蕉分别减小14.0%、5.8%和11.8%,新抽总叶片数26~29片;果实营养品质和单株产量与宝岛蕉无显著差异(P>0.05,下同)。0523球茎生长点碳氮比较宝岛蕉显著提高19.0%(P<0.05,下同),GA和IAA含量显著降低24.8%和22.6%,ABA和ZR含量与宝岛蕉相比略有增加,差异不显著。抗病性苗期鉴定结果显示0523为中抗且偏强,抗性水平与宝岛蕉相比略有提高,桂蕉6号为高感。突变株系0523与宝岛蕉的多态性比率为8.8%,遗传相似系数为0.95,二者存在差异。0523在广西和海南各试验点第1、2造蕉平均发病率分别为4.5%和3.5%,较主栽品种降低87.8%和94.1%,各试验点发病率均显著低于主栽品种。0523第1、2造蕉的生育期较宝岛蕉显著缩短,与主栽品种无显著差异。【结论】突变株系0523具有抗枯萎病、早熟、矮化、适应性广等优良性状,可用来培育大面积推广的香蕉新品种,或作为亲本育种材料应用于香蕉育种研究。 展开更多
关键词 早花突变 抗枯萎病 选育 香蕉
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基于BSA-seq技术定位黄瓜黄绿叶色突变基因
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作者 娄丽娜 羊杏平 +7 位作者 朱凌丽 姚协丰 徐建 张曼 刘广 侯茜 刘金秋 徐锦华 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第9期1711-1718,共8页
为明确课题组从地方收集的黄瓜黄绿叶色突变体中黄绿叶色突变基因,本研究利用绿叶(野生型)与黄绿叶色(突变体)黄瓜材料为亲本,配制正反杂交一代及二代分离群体,在分析黄绿叶色突变基因遗传规律的基础上,利用BSA-seq技术对双亲及F 2代叶... 为明确课题组从地方收集的黄瓜黄绿叶色突变体中黄绿叶色突变基因,本研究利用绿叶(野生型)与黄绿叶色(突变体)黄瓜材料为亲本,配制正反杂交一代及二代分离群体,在分析黄绿叶色突变基因遗传规律的基础上,利用BSA-seq技术对双亲及F 2代叶色极端混池进行测序,筛选黄瓜黄绿叶色突变性状的关联标记及候选基因。结果表明,绿叶色对黄绿叶色为完全显性,黄绿叶色突变基因为隐性基因。突变性状关联分析(SNP-index检测)得到1个与黄绿叶色突变相关的候选区域,位于黄瓜1号染色体上,总长度18484 bp。该候选区域共有118个与黄绿叶色突变相关的SNP位点;候选区域共注释到3个基因,其中CsaV3_1G032820基因为黄瓜黄绿叶色突变最可能相关基因。本研究结果可为黄瓜黄绿叶色突变基因克隆和分子标记辅助育种提供基础。 展开更多
关键词 黄瓜 黄绿叶色突变 BSA-seq 基因定位
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142例GJB2双等位基因突变患儿基因型与听力表型的差异分析
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作者 阮宇 文铖 +5 位作者 程晓华 张伟 谢锦各 李悦 邓琳 黄丽辉 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 CSCD 2024年第9期569-573,共5页
目的分析GJB2双等位基因突变患儿不同基因型的听力表型差异,为临床提供参考。方法2012年8月~2024年3月在首都医科大学附属北京同仁医院确诊为GJB2双等位基因突变患儿142例,所有患儿均接受新生儿听力筛查、耳聋基因筛查及听力诊断检查。... 目的分析GJB2双等位基因突变患儿不同基因型的听力表型差异,为临床提供参考。方法2012年8月~2024年3月在首都医科大学附属北京同仁医院确诊为GJB2双等位基因突变患儿142例,所有患儿均接受新生儿听力筛查、耳聋基因筛查及听力诊断检查。根据突变位点类型分为三组,分别为T/T组(截断/截断突变,59例)、T/NT组(截断/非截断突变,50例)及NT/NT组(非截断/非截断突变,33例),分析三组基因型、新生儿听力筛查结果、首诊月龄及听力诊断结果。结果T/T组基因型以c.235delC/c.235delC为主(57.63%),T/NT组以c.235delC/c.109G>A为主(74.00%),NT/NT组以c.109G>A/c.109G>A为主(96.97%)。新生儿听力筛查未通过率为80.28%,其中T/T组未通过率89.83%,显著高于T/NT组70.00%(P=0.009)。首诊月龄为(3.70±1.56)个月,三组差异无统计学意义(P>0.05)。142例中,确诊听力损失104例(73.24%),听力正常38例(26.76%);T/T组听力损失占比100.00%,显著高于T/NT组52.00%(P<0.001)及NT/NT组57.58%(P<0.001)。听力损失侧别,104例中,双侧听力损失86例(82.69%),单侧听力损失18例(17.31%);T/T组双侧听力损失占比100.00%,显著高于T/NT组57.69%(P<0.001)及NT/NT组63.16%(P<0.001)。听力损失104例(190耳)中,听力损失程度以轻度至中度为主(63.16%),其次为极重度(24.74%)及重度(12.10%)。其中T/T组以重度至极重度听力损失为主(58.47%),T/NT组及NT/NT组均以轻度听力损失为主(58.54%及74.19%),差异具有统计学意义(P<0.001)。结论本研究T/T组所有患儿首诊均确诊为双侧听力损失,以重度及极重度听力损失为主;T/NT组及NT/NT组首诊确诊双侧或单侧听力损失分别为52.00%及57.58%,以轻度听力损失为主。 展开更多
关键词 耳聋 等位基因 突变 听力损失 基因型 GJB2基因 双等位基因突变 听力表型
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LncRNA BANCR表达与TSHR甲基化在BRAFV600E突变的甲状腺乳头状癌中的研究
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作者 于波 徐宁 +6 位作者 杨博 孙玺媛 姚佳兴 樊伟业 李松埔 窦福林 李扬 《世界肿瘤研究》 CAS 2024年第1期13-19,共7页
目的:探讨长链非编码RNA BANCR表达及TSHR甲基化与BRAFV600E突变的甲状腺乳头状癌的关系。方法:收集60例BRAFV600E突变的甲状腺乳头状癌(PTC)患者癌组织样本60例和癌旁正常甲状腺组织样本60例(简称癌旁组织),上述所有PTC患者已采用荧光... 目的:探讨长链非编码RNA BANCR表达及TSHR甲基化与BRAFV600E突变的甲状腺乳头状癌的关系。方法:收集60例BRAFV600E突变的甲状腺乳头状癌(PTC)患者癌组织样本60例和癌旁正常甲状腺组织样本60例(简称癌旁组织),上述所有PTC患者已采用荧光定量PCR (QPCR)检测分析上述各样本BANCR基因的表达水平,并应用甲基化特异性聚合酶链反应(Methylation-Specific Polymerase chain reac-tion, MSP)法检测上述各样本中TSHR基因启动子甲基化情况,并分析上述癌组织和癌旁组织中各样本基因表达水平和TSHR甲基化情况与BRAFV600E突变的PTC患者的临床病理特征之间的关系。结果:癌组织组:BANCR相对表达量为(1.55 ± 1.62),高表达率为66.67%,癌旁组织组分别为(0.74 ± 0.63和30%),癌组织显著高于癌旁组织(P < 0.05)。癌组织中,BANCR高表达与肿瘤的颈部淋巴结转移存在显著相关性(P < 0.05)。癌组织组中TSHR甲基化的发生率为93.3% (56/60),癌旁组织组中TSHR甲基化的发生率为18.3% (11/60),TSHR甲基化PTC患者例数显著高于非甲基化PTC患者,差异均具有统计学意义(P均 < 0.01)。癌组织中BANCR的表达水平及TSHR甲基化以及两者联合检测阳性例数均显著高于癌旁组织,差异具有统计学差异(P均 < 0.05),BANCR高表达联合TSHR甲基化对BRAFV600E突变的PTC诊断的灵敏度、特异性和准确性较单项检测均出现上升趋势,但仅灵敏度与单一检测相比差异具有统计学意义(P < 0.05)。结论:BANCR高表达和TSHR甲基化均与BRAFV600E突变的PTC患者颈部淋巴结转移密切相关,与肿瘤的进展相关并提示不良预后。且BANCR高表达联合TSHR甲基化对BRAFV600E突变的PTC临床诊断具有较佳的灵敏度。 展开更多
关键词 BANCR高表达 TSHR甲基化 基因突变 BRAFV600E突变
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Amivantamab联合lazertinib一线治疗EGFR敏感突变晚期NSCLC:评MARIPOSA研究 被引量:1
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作者 谢聪颖 刘嘉淇 《循证医学》 2024年第1期20-25,共6页
1文献来源Cho BC,Felip E,Spira AI,et al.Amivantamab plus lazertinib versus osimertinib as first⁃line treatment in patients with EGFR⁃mutated,advanced non⁃small cell lung cancer(NSCLC):primary results from MARIPOSA,a ph... 1文献来源Cho BC,Felip E,Spira AI,et al.Amivantamab plus lazertinib versus osimertinib as first⁃line treatment in patients with EGFR⁃mutated,advanced non⁃small cell lung cancer(NSCLC):primary results from MARIPOSA,a phaseⅢ,global,randomized,controlled trial[J].Ann Oncol,2023,34(2S):S1306. 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 EGFR突变 amivantamab lazertinib 一线治疗
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基于花粉形态学筛选猕猴桃突变体的研究
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作者 何利钦 张茜 +4 位作者 庄启国 鲁松 王明忠 陈绪玲 王丽华 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第15期178-186,共9页
花粉形态特征可作为猕猴桃属植物的分类依据。现有的研究方法需要使用扫描电镜测量花粉形态的多项特征,不能满足猕猴桃遗传育种工作的需求。为了探究一种基于猕猴桃花粉形态筛选突变体的新方法,以39份不同猕猴桃花粉为试验材料(包含雌... 花粉形态特征可作为猕猴桃属植物的分类依据。现有的研究方法需要使用扫描电镜测量花粉形态的多项特征,不能满足猕猴桃遗传育种工作的需求。为了探究一种基于猕猴桃花粉形态筛选突变体的新方法,以39份不同猕猴桃花粉为试验材料(包含雌株花粉15份、雄株花粉23份、突变体两性花花粉1份),运用扫描电镜在较低倍数(1 000×)下观察,选取5项特征指标进行测量,对供试样本进行主成分分析和正态分布分析。结果表明,39份样本均为N3C4P5型,赤道面观均为三裂圆形,具3条萌发沟;主成分分析中PC1、PC2贡献的总方差为96.27%;载荷图表明,在较低倍数下5个花粉形态指标具有一定的差异性;得分图表明,样本中的雌株花粉和雄株花粉存在明显分离,它们的形态学相似度不大,极轴长度与赤道轴长度的比值(P/E)与赤道轴长度(E)二者夹角最大,具有区分意义;P/E的正态分布曲线轴须图将数据结果可视化,根据样本的区间差异筛选离群的突变体,筛选出突变体材料4份。 展开更多
关键词 猕猴桃 花粉形态 扫描电镜 突变
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一株拟南芥宽叶形突变体atscamp的分离鉴定
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作者 郝雪峰 贾晓宇 +2 位作者 曹海艳 亢春霞 裴雁曦 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期232-238,共7页
叶片是主要的光合作用器官,选育利于光合作用的叶片形态已成为重要的育种目标。atscamp是从拟南芥(Arabidopsis thaliana)突变体库(约6000株系)中筛选获得的1株叶片宽大突变体。Tail-PCR分析该突变体为AT1G11180位点的插入,该基因位点编... 叶片是主要的光合作用器官,选育利于光合作用的叶片形态已成为重要的育种目标。atscamp是从拟南芥(Arabidopsis thaliana)突变体库(约6000株系)中筛选获得的1株叶片宽大突变体。Tail-PCR分析该突变体为AT1G11180位点的插入,该基因位点编码1个分泌载体膜蛋白(SCAMP)。RT-PCR检测显示,该基因转录表达水平基本为零。进一步研究发现,该突变体叶片的宽度和叶面积极显著大于野生型植株(P<0.01),但是冠幅基本保持不变;同时atscamp突变体叶绿素含量增加,叶绿素最大荧光、PSⅡ潜在光化学效率显著增加(P<0.05);相应地,突变体植株蒸腾系数(Tr)、净光合速率(Pn)和叶片水分利用效率(WUE)显著增加(P<0.05)。拟南芥AT1G11180基因的时空特异性表达分析显示,该基因仅在叶片中高表达,在其他器官中表达量很低;且随着植物发育成熟,该基因表达量逐渐增加。研究结果表明AtSCAMP基因在叶形发育中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 拟南芥 AtSCAMP基因 叶形 突变
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西瓜果实网条突变体的转录组分析
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作者 王志强 杜慧莹 +4 位作者 李程 郭松 田梅 杨万邦 于蓉 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1385-1395,共11页
以条纹自交系西瓜(TD)和网条突变体西瓜(WT)为材料,通过分离群体的条纹性状比例探索西瓜的条性状遗传基础;以转录组测序及表达差异分析为基础,探索网条突变体西瓜在不同发育阶段的表达谱变化,筛选出条纹自交系与网条突变体西瓜之间表达... 以条纹自交系西瓜(TD)和网条突变体西瓜(WT)为材料,通过分离群体的条纹性状比例探索西瓜的条性状遗传基础;以转录组测序及表达差异分析为基础,探索网条突变体西瓜在不同发育阶段的表达谱变化,筛选出条纹自交系与网条突变体西瓜之间表达差异显著的基因57个,主要富集于光合作用天线蛋白通路、生物碱生物合成通路、氨基酸代谢通路等7种代谢途径;通过加权基因共表达网络对核心基因的进一步分析,初步挖掘出部分网条突变体西瓜中有关生物胁迫抗性的基因变化情况,进一步筛选确定西瓜深绿条纹基因(ClGS,watermelon dark-green stripe)、类半胱氨酸蛋白酶抑制剂5编码基因、UDP-葡萄糖基转移酶编码基因、类长春碱合成酶编码基因、叶绿素a-b结合蛋白编码基因可能是决定西瓜网条果皮性状的核心基因;qRT-PCR验证结果表明,条纹自交系西瓜与网条突变体西瓜在基因表达上存在明显差异。本研究为西瓜不同果皮条纹育种提供了新的种质资源,也为阐明西瓜不同果皮条纹性状形成的分子调控机制提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 西瓜 果皮条纹 转录组 加权基因共表达网络 突变
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ALK突变晚期非小细胞肺癌靶向治疗耐药后帕博利珠单抗治疗的新探索 被引量:2
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作者 程琳 魏亚兰 田霞 《国际医药卫生导报》 2024年第6期908-912,共5页
目的探索间变性淋巴瘤激酶(ALK)突变晚期非小细胞肺癌(NSCLC)靶向治疗耐药后帕博利珠单抗治疗的效果。方法本方案采用前瞻性、对照、单中心、随机、单盲临床研究方法设计。选择2020年3月至2022年7月在西安高新医院就诊的95例ALK突变晚期... 目的探索间变性淋巴瘤激酶(ALK)突变晚期非小细胞肺癌(NSCLC)靶向治疗耐药后帕博利珠单抗治疗的效果。方法本方案采用前瞻性、对照、单中心、随机、单盲临床研究方法设计。选择2020年3月至2022年7月在西安高新医院就诊的95例ALK突变晚期NSCLC靶向治疗耐药后患者,以随机数字表法分为对照组和试验组。对照组入组47例,脱落2例,最终45例纳入分析;试验组入组48例,脱落2例,最终46例纳入分析。对照组男29例,女16例;年龄(56.85±8.67)岁;ⅢB期12例,Ⅳ期33例;鳞癌12例,腺癌33例。试验组男26例,女20例;年龄(55.02±8.23)岁;ⅢB期15例,Ⅳ期31例;鳞癌10例,腺癌36例。对照组接受阿来替尼治疗,试验组在对照组基础上接受帕博利珠单抗治疗。21 d为1个治疗周期,两组均治疗3个周期。比较两组治疗前后基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、血清细胞角蛋白19片段抗原21-1(CYFRA21-1)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、糖类抗原9(CA9)、内皮抑素(ES)、血管内皮生长因子(VEGF)、自然杀伤(NK)细胞、CD8^(+)、CD4^(+)水平,临床疗效,药物不良反应;记录两组患者生存情况。采用独立样本t检验、配对t检验、χ^(2)检验。结果治疗后,两组CYFRA21-1、NSE、CA9、MMP-9、VEGF、CD8^(+)水平均低于治疗前(均P<0.05),且试验组均低于对照组(均P<0.05);两组ES、CD4^(+)、NK水平均高于治疗前(均P<0.05),且试验组均高于对照组(均P<0.05)。试验组总有效率高于对照组[78.26%(36/46)比57.78%(26/45)](χ^(2)=4.396,P=0.036)。两组药物不良反应总发生率比较差异无统计学意义(χ^(2)=0.385,P=0.535)。随访1年,试验组失访1例,对照组失访2例,随访率为97.70%。试验组的1年总生存率为55.56%(25/45),对照组的1年总生存率为34.88%(15/43)。两组患者总生存期(OS)曲线比较差异有统计学意义(Log-rankχ^(2)=7.805,P=0.005)。结论帕博利珠单抗治疗ALK突变晚期NSCLC靶向治疗耐药后患者疗效显著,可改善免疫功能,降低肿瘤标志物水平,提高生存率,改善血管生成调节因子水平,且不会明显增加药物不良反应的发生率。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 晚期 间变性淋巴瘤激酶突变 帕博利珠单抗 阿来替尼 安全性
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PTPN11基因突变急性髓系白血病患者临床特征及预后分析
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作者 陶千山 薛婉莹 +5 位作者 谢蓓蓓 张青 王会平 翟志敏 秦慧 董毅 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第8期1483-1488,1494,共7页
目的 探讨PTPN11基因突变急性髓系白血病(AML)患者的临床特征及预后情况。方法 选取经医院初次诊断、治疗并行二代测序(NGS)检测的成人AML患者115例,收集包括疾病特征、治疗效果、长期预后、免疫细胞亚群以及白血病干细胞等数据,分析PTP... 目的 探讨PTPN11基因突变急性髓系白血病(AML)患者的临床特征及预后情况。方法 选取经医院初次诊断、治疗并行二代测序(NGS)检测的成人AML患者115例,收集包括疾病特征、治疗效果、长期预后、免疫细胞亚群以及白血病干细胞等数据,分析PTPN11基因突变AML患者的临床特征及预后情况。结果 初诊成人AML中PTPN11基因突变率为9.57%,突变位点主要发生在3号外显子区域,突变类型均为点突变。与PTPN11基因野生型组相比,PTPN11基因突变组首次诱导治疗期间早期病死率高(18.18%vs 4.00%,P=0.048),完全缓解率低(33.33%vs 67.71%,P=0.039),复发率高(83.33%vs 42.31%,P=0.043),中位总生存时间短(9月vs 20月,P=0.026),效应性T细胞比例低[(1.39±0.12)%vs(3.56±0.46)%,P=0.038],白血病干细胞比例高[(13.82±3.66)%vs(3.87±1.40)%,P=0.021]。结论 PTPN11基因突变是AML的不良预后标志物,该类患者早期病死率高、完全缓解率低、复发率高、中位总生存时间短,且体内效应性T细胞比例低、白血病干细胞比例高。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 基因突变 PTPN11 预后
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奥希替尼联合培美曲塞/铂类对表皮生长因子受体合并TP53基因突变的非小细胞肺癌疗效及预后分析 被引量:1
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作者 王伟 周伟 《中国肿瘤外科杂志》 CAS 2024年第2期143-147,共5页
目的探究奥希替尼联合培美曲塞/铂类对EGFR合并TP53突变的非小细胞肺癌(NSCLC)疗效及预后分析。方法选取中国人民解放军联勤保障部队第904医院在2016年1月至2022年6月间诊治的80例表皮生长因子受体合并TP53基因突变的NSCLC患者纳入本次... 目的探究奥希替尼联合培美曲塞/铂类对EGFR合并TP53突变的非小细胞肺癌(NSCLC)疗效及预后分析。方法选取中国人民解放军联勤保障部队第904医院在2016年1月至2022年6月间诊治的80例表皮生长因子受体合并TP53基因突变的NSCLC患者纳入本次研究,随机数字法分为对照组(40例)和研究组(40例)。对照组行奥希替尼治疗,研究组行奥希替尼联合培美曲塞/铂类化疗治疗。对两组临床疗效、血清指标水平、用药安全性以及预后进行对比分析。结果研究组总缓解率(ORR)和疾病控制率(DCR)均优于对照组(P<0.05)。治疗后,两组细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)、癌胚抗原(CEA)水平均低于治疗前(P<0.05),研究组低于对照组(P<0.05)。治疗后,两组白细胞介素4(IL-4)、血管内皮生长因子(VEGF)、细胞间黏附分子-1(ICAM-1)水平均低于治疗前(P<0.05),研究组低于对照组(P<0.05)。两组不良反应差异无统计学意义(P>0.05)。研究组随访1年后的生存率明显高于对照组(P<0.05)。治疗后,两组生存质量测定表(EORTC QLQ-C30)评分高于治疗前(P<0.05),研究组高于对照组(P<0.05)。结论奥希替尼联合培美曲塞/铂类化疗方案用于EGFR合并TP53基因突变的NSCLC的临床治疗,可有效发挥抗肿瘤效果,下调炎症水平,提升疗效,改善患者预后,且用药具有较高安全性,不会明显增加不良反应。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 EGFR合并TP53基因突变 培美曲塞 顺铂 奥希替尼 疗效 预后
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猪微小RNA⁃15b前体突变对其生物学加工过程及前体脂肪细胞分化的影响
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作者 龙熙 孙文阳 +4 位作者 潘红梅 张亮 陈四清 涂志 郭宗义 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1892-1903,共12页
基于在猪微小RNA⁃15b(miR⁃15b)前体(pre⁃miR⁃15b)基因位点第58位碱基上发现了1个C>T突变(+58C>T),本试验旨在探究此突变对微小RNA(miRNA)生物学加工过程以及对猪前体脂肪细胞分化的影响。试验通过构建野生型(pmR⁃miR⁃15bW)和突变... 基于在猪微小RNA⁃15b(miR⁃15b)前体(pre⁃miR⁃15b)基因位点第58位碱基上发现了1个C>T突变(+58C>T),本试验旨在探究此突变对微小RNA(miRNA)生物学加工过程以及对猪前体脂肪细胞分化的影响。试验通过构建野生型(pmR⁃miR⁃15bW)和突变型(pmR⁃miR⁃15bM)miR⁃15b过表达载体,分别转染猪原代前体脂肪细胞进行miR⁃15b的过表达试验,然后利用实时荧光定量PCR对比2组细胞pre⁃miR⁃15b和miR⁃15b成熟体的表达量,在体外细胞水平明确+58C>T对miR⁃15b生物学加工过程的影响;随后,诱导转染了不同基因型miR⁃15b过表达载体(pmR⁃miR⁃15bW和pmR⁃miR⁃15bM)的猪前体脂肪细胞成脂分化,利用实时荧光定量PCR对比2组细胞miR⁃15b靶基因叉头框蛋白O1(FOXO1)(可抑制脂肪细胞分化)以及成脂分化相关基因的相对表达量,同时结合油红O染色,明确此突变对猪前体脂肪细胞分化的影响。结果表明:2组细胞miR⁃15b初级转录本(pri⁃miR⁃15b)的表达量没有显著差异(P>0.05),而突变组pre⁃miR⁃15b、miR⁃15b和微小RNA⁃16(miR⁃16)表达量极显著低于野生组(P<0.01);突变组分化前FOXO1相对表达量极显著高于野生组(P<0.01),分化后成脂分化相关基因固醇调节元件结合蛋白-1c(SREBP⁃1c)和过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)相对表达量极显著低于野生组(P<0.01),脂肪细胞蛋白2(aP2)相对表达量低于野生组(P>0.05);油红O染色结果表明突变组细胞脂滴含量明显低于野生组。综上可知,+58C>T阻碍了pri⁃miR⁃15b到pre⁃miR⁃15b的生物学加工过程,导致miR⁃15b成熟体表达量下降,其靶基因FOXO1相对表达量增高,从而抑制猪前体脂肪细胞分化。 展开更多
关键词 miR⁃15b 突变 前体脂肪细胞 成脂分化
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KRAS单突变及KRAS/TP53共突变在肺腺癌中的治疗及预后分析
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作者 张珊珊 李玉梅 +1 位作者 黄柱华 毕明宏 《包头医学院学报》 CAS 2024年第5期33-38,54,共7页
目的:比较Kristen鼠肉瘤致癌基因(kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌患者不同突变状态、分子分型的治疗及其预后。方法:收集2019年04月-2022年04月于蚌埠医学院第一附属医院确诊且接受一线治疗的晚期KRAS突变肺腺... 目的:比较Kristen鼠肉瘤致癌基因(kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌患者不同突变状态、分子分型的治疗及其预后。方法:收集2019年04月-2022年04月于蚌埠医学院第一附属医院确诊且接受一线治疗的晚期KRAS突变肺腺癌患者资料,统计TP53共突变情况、分子分型并分析其治疗预后的相关性。结果:随访至2022年4月,KRAS/TP53共突变患者相较于KRAS单突变的患者,中位无进展生存期(median progression-free survival,mPFS)明显缩短(HR=0.613,95%CI:0.396-0.951,P=0.029),差异有统计学意义;化疗联合抗血管生成治疗对比单纯化疗mPFS明显延长,差异有统计学意义(HR=0.593,95%CI:0.355-0.990,P=0.038);化疗联合免疫治疗组对比单纯化疗mPFS明显延长,差异有统计学意义(HR=0.426,95%CI:0.247-0.736,P=0.02);化疗联合抗血管生成治疗组相较于化疗联合免疫治疗组mPFS对比,差异无统计学意义(HR=0.648,95%CI:0.371-1.130,P=0.126)。结论:TP53为晚期KRAS突变肺腺癌患者不良预后因素;G12C和非G12C不同分子分型间的治疗及预后无明显差异;化疗联合免疫或抗血管生成治疗对比单纯化疗可延长晚期肺腺癌患者的PFS,但联合治疗组之间的PFS无明显差异。 展开更多
关键词 肺腺癌 KRAS突变 一线治疗
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