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确定肿瘤基因表达谱特征基因方法的研究
被引量:
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1
作者
张玉春
郝平波
+1 位作者
王明宇
肖宇
《沈阳理工大学学报》
CAS
2011年第1期34-38,共5页
分析了目前基因表达谱提取特征基因所采用的方法,提出了Fisher权函数和主成份分析结合离散余弦变换的混合特征基因提取方法,以多元Logistic回归分析作为分类器进行肿瘤分类检测。该方法具有以下特点:根据基因表达数据维数高样本量小的特...
分析了目前基因表达谱提取特征基因所采用的方法,提出了Fisher权函数和主成份分析结合离散余弦变换的混合特征基因提取方法,以多元Logistic回归分析作为分类器进行肿瘤分类检测。该方法具有以下特点:根据基因表达数据维数高样本量小的特点,使用Fisher权函数对数据进行预处理,简单有效地得到特征基因候选集;利用离散余弦变换(Discrete Cosine Transform,DCT)的能量压缩特性,提高特征基因主成份的显现效果,有效提取特征基因信息。实验结果表明,该方法对结肠癌数据集的CV识别准确率高达95.20%.
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关键词
结肠癌
fisher权函
离散余弦变换
主成份分析
Logistic判别
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职称材料
题名
确定肿瘤基因表达谱特征基因方法的研究
被引量:
1
1
作者
张玉春
郝平波
王明宇
肖宇
机构
沈阳理工大学
齐齐哈尔二机床(集团)有限责任公司
出处
《沈阳理工大学学报》
CAS
2011年第1期34-38,共5页
基金
国家自然科学基金资助(11004138)
文摘
分析了目前基因表达谱提取特征基因所采用的方法,提出了Fisher权函数和主成份分析结合离散余弦变换的混合特征基因提取方法,以多元Logistic回归分析作为分类器进行肿瘤分类检测。该方法具有以下特点:根据基因表达数据维数高样本量小的特点,使用Fisher权函数对数据进行预处理,简单有效地得到特征基因候选集;利用离散余弦变换(Discrete Cosine Transform,DCT)的能量压缩特性,提高特征基因主成份的显现效果,有效提取特征基因信息。实验结果表明,该方法对结肠癌数据集的CV识别准确率高达95.20%.
关键词
结肠癌
fisher权函
离散余弦变换
主成份分析
Logistic判别
Keywords
colon cancer
fisher
weight function
DCT
principle component analysis
logistic discriminate
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
确定肿瘤基因表达谱特征基因方法的研究
张玉春
郝平波
王明宇
肖宇
《沈阳理工大学学报》
CAS
2011
1
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