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基于大量ChIP数据集的果蝇顺式调控模块的从头预测
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作者 李婷 张少强 《天津师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2018年第2期73-76,共4页
通过整合果蝇已有的ChIP数据集,采用模体发现算法FisherNet及高性能并行的模体聚类算法CLIMP对果蝇的顺式调控模块进行从头预测.与已知的顺式调控模块进行比对分析,结果表明该方法预测结果覆盖了数据集中已知顺式调控模块的82.93%,证明... 通过整合果蝇已有的ChIP数据集,采用模体发现算法FisherNet及高性能并行的模体聚类算法CLIMP对果蝇的顺式调控模块进行从头预测.与已知的顺式调控模块进行比对分析,结果表明该方法预测结果覆盖了数据集中已知顺式调控模块的82.93%,证明该方法具有一定的普适性.与较新的DePCRM算法进行比较,结果表明本算法在从头预测顺式调控模块上速度更快、精度更高. 展开更多
关键词 ChIP数据集 果蝇 顺式调控模块 模体 fishernet CLIMP
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