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题名采用多样性选择的量子粒子群双向聚类算法
被引量:3
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作者
陈佳瑜
李梁
罗云
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机构
重庆理工大学计算机科学与工程学院
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2018年第9期42-46,共5页
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基金
重庆市应用开发计划项目(No.CSTC2013yykf A40002)
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文摘
双向聚类已成为分析基因表达数据的一种重要工具,可以同时从基因和条件两个方向寻找具有相同表达波动的簇。但双向聚类是一种多目标优化的局部搜索算法,处理繁杂的基因数据时容易陷入局部最优。为提高算法的全局搜索能力,提出了一种多样性选择的量子粒子群双向聚类算法(Diversify-Optional QPSO,DOQPSO)。算法首先采用DOQPSO处理基因数据,然后用改进的FLOC算法进行贪心迭代寻找双向聚类,以求得更为理想的结果。算法通过实验仿真,并与FLOC算法和QPSO算法进行比较,结果证明DOQPSO双向聚类算法具有更好的全局寻优能力,且聚类效果更佳。
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关键词
双向聚类
基因表达数据
量子粒子群算法
多样性选择
floc算法
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Keywords
biclustering
gene expression
Quantum-behaved Particle Swarm Optimization(QPSO)
diversified options
flexible overlapped biclustering(floc)
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分类号
TP301
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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