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加权基因共表达网络分析筛选结肠腺癌预后相关的免疫标志物
1
作者
何翔
万首伟
+1 位作者
贺强
侯吉学
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期509-515,共7页
目的寻找结肠腺癌(COAD)免疫相关预后标志物,以期能够准确预测COAD患者预后。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析COAD患者免疫相关差异基因,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)与COX回归分析得到风险模型,根据风险值的中位值将患...
目的寻找结肠腺癌(COAD)免疫相关预后标志物,以期能够准确预测COAD患者预后。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析COAD患者免疫相关差异基因,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)与COX回归分析得到风险模型,根据风险值的中位值将患者分为高、低风险组,比较两者预后,在基因表达数据集(GEO)数据库中验证模型。结果通过分析共得到1015个免疫相关差异基因。COX回归分析得到由维甲酸受体相关孤核受体C(RORC)、富含亮氨酸重复序列Fli-I相互作用蛋白2(LRRFIP2)、半乳糖凝集素4(LGALS4)构成的风险模型,高风险组较低风险组预后较差并在GEO中得到验证,通过单因素与多因素COX分析发现模型可作为COAD患者独立预后风险模型。结论通过免疫相关预后差异基因建立模型,可以预测COAD患者预后。
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关键词
结肠腺癌
免疫相关基因
维甲酸受体相关孤核受体C(RORC)
富含亮氨酸重复序列
fli-i
相互作用蛋白2(LRRFIP2)
半乳糖凝集素4(LGALS4/galectin-4)
癌症基因组图谱(TCGA)
预后
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职称材料
CXCL4对人真皮微血管内皮细胞的功能及分泌血管舒缩因子的影响
2
作者
姜智星
杨森
+2 位作者
陈琛
梁敏锐
邹和建
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期665-669,共5页
目的:探讨CXCL4对人真皮微血管内皮细胞(HDMEC)增殖能力、血管形成能力及相关因子表达的影响。方法:采用梯度浓度CXCL4干预HDMEC,通过CCK-8检测细胞增殖能力,血管形成实验观察CXCL4对HDMEC血管形成能力的影响,通过RT-PCR检测内皮素-1、F...
目的:探讨CXCL4对人真皮微血管内皮细胞(HDMEC)增殖能力、血管形成能力及相关因子表达的影响。方法:采用梯度浓度CXCL4干预HDMEC,通过CCK-8检测细胞增殖能力,血管形成实验观察CXCL4对HDMEC血管形成能力的影响,通过RT-PCR检测内皮素-1、Fli-1、AT1R、ETAR的mRNA水平。并使用CXCL4拮抗剂观察能否抑制CXCL4对HDMEC上述功能的影响。结果:HDMEC上可表达CXCL4特异性受体CXCR3。CXCL4可抑制HDMEC增殖及血管形成数目,且呈剂量依赖关系。CXCL4显著上调HDEMC中内皮素-1、AT1R基因的mRNA水平(P<0.05),下调Fli-1基因的mRNA水平(P<0.05),对ETAR的mRNA水平无影响。且CXCL4拮抗剂可逆转CXCL4对HDMEC的上述影响。结论:CXCL4能抑制HDMEC的增殖及血管形成,提高ET-1、AT1R的mRNA水平,降低Fli-1的mRNA水平,且呈浓度依赖性。
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关键词
CXCL4
系统性硬化症
内皮素-1
FLI-1
AT1R
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职称材料
提取CO Ⅰ基因片段鉴定嗜尸性蝇类
被引量:
2
3
作者
郑武
杨堃
+3 位作者
郭燕红
刘丹
黄和鸣
肖顺
《中国法医学杂志》
CSCD
2017年第2期168-170,共3页
目的通过扩增蝇类COⅠ基因片段,结合形态学特征鉴定嗜尸性蝇类的种类。方法运用改良平衡酚—tris饱和酚法提取蝇类DNA,进行COⅠ序列扩增和测序,与数据库序列进行比对和分析。结果改良平衡酚—tris饱和酚提取DNA方法可获得有效的蝇类DNA...
目的通过扩增蝇类COⅠ基因片段,结合形态学特征鉴定嗜尸性蝇类的种类。方法运用改良平衡酚—tris饱和酚法提取蝇类DNA,进行COⅠ序列扩增和测序,与数据库序列进行比对和分析。结果改良平衡酚—tris饱和酚提取DNA方法可获得有效的蝇类DNA,并可应用于COⅠ基因片段扩增,进而进行蝇类种类的鉴定。结论平衡酚—Tris饱和酚法提取的噬尸性蝇类虫体DNA作为模板,用于COⅠ序列扩增,测序后与数据库目的序列分析比对,可准确鉴定嗜尸性蝇类的种类;和传统的昆虫形态学特征鉴定方法比较,该体系更准确,应用范围更广。
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关键词
法医昆虫学
嗜尸性蝇类
鉴定
DNA提取
细胞色素氧化酶亚基Ⅰ
原文传递
题名
加权基因共表达网络分析筛选结肠腺癌预后相关的免疫标志物
1
作者
何翔
万首伟
贺强
侯吉学
机构
石河子大学医学院第一附属医院胃肠乳腺外科
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期509-515,共7页
基金
国家自然科学基金(81660400)。
文摘
目的寻找结肠腺癌(COAD)免疫相关预后标志物,以期能够准确预测COAD患者预后。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析COAD患者免疫相关差异基因,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)与COX回归分析得到风险模型,根据风险值的中位值将患者分为高、低风险组,比较两者预后,在基因表达数据集(GEO)数据库中验证模型。结果通过分析共得到1015个免疫相关差异基因。COX回归分析得到由维甲酸受体相关孤核受体C(RORC)、富含亮氨酸重复序列Fli-I相互作用蛋白2(LRRFIP2)、半乳糖凝集素4(LGALS4)构成的风险模型,高风险组较低风险组预后较差并在GEO中得到验证,通过单因素与多因素COX分析发现模型可作为COAD患者独立预后风险模型。结论通过免疫相关预后差异基因建立模型,可以预测COAD患者预后。
关键词
结肠腺癌
免疫相关基因
维甲酸受体相关孤核受体C(RORC)
富含亮氨酸重复序列
fli-i
相互作用蛋白2(LRRFIP2)
半乳糖凝集素4(LGALS4/galectin-4)
癌症基因组图谱(TCGA)
预后
Keywords
colon adenocarcinoma
immune related genes(IREGs)
RAR related orphan receptor C(RORC)
leucine-rich repeat
fli-i
-interacting protein 2(LRRFIP2)
lectin galactoside-binding soluble 4(galectin 4)
TCGA
prognosis
分类号
R656.9 [医药卫生—外科学]
R857.3 [医药卫生—航空、航天与航海医学]
R735.35 [医药卫生—肿瘤]
R730.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
CXCL4对人真皮微血管内皮细胞的功能及分泌血管舒缩因子的影响
2
作者
姜智星
杨森
陈琛
梁敏锐
邹和建
机构
复旦大学附属华山医院风湿科
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期665-669,共5页
基金
国家自然青年科学基金项目(81501391)
文摘
目的:探讨CXCL4对人真皮微血管内皮细胞(HDMEC)增殖能力、血管形成能力及相关因子表达的影响。方法:采用梯度浓度CXCL4干预HDMEC,通过CCK-8检测细胞增殖能力,血管形成实验观察CXCL4对HDMEC血管形成能力的影响,通过RT-PCR检测内皮素-1、Fli-1、AT1R、ETAR的mRNA水平。并使用CXCL4拮抗剂观察能否抑制CXCL4对HDMEC上述功能的影响。结果:HDMEC上可表达CXCL4特异性受体CXCR3。CXCL4可抑制HDMEC增殖及血管形成数目,且呈剂量依赖关系。CXCL4显著上调HDEMC中内皮素-1、AT1R基因的mRNA水平(P<0.05),下调Fli-1基因的mRNA水平(P<0.05),对ETAR的mRNA水平无影响。且CXCL4拮抗剂可逆转CXCL4对HDMEC的上述影响。结论:CXCL4能抑制HDMEC的增殖及血管形成,提高ET-1、AT1R的mRNA水平,降低Fli-1的mRNA水平,且呈浓度依赖性。
关键词
CXCL4
系统性硬化症
内皮素-1
FLI-1
AT1R
Keywords
CXCIA
Systemic sclerosis
Endothelin-I
fli-i
ATI IR
分类号
R593.25 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
提取CO Ⅰ基因片段鉴定嗜尸性蝇类
被引量:
2
3
作者
郑武
杨堃
郭燕红
刘丹
黄和鸣
肖顺
机构
福州市刑事科学技术研究所
福建农林大学植物保护学院
出处
《中国法医学杂志》
CSCD
2017年第2期168-170,共3页
基金
福州市科技计划项目(NO.2012-S-139)
文摘
目的通过扩增蝇类COⅠ基因片段,结合形态学特征鉴定嗜尸性蝇类的种类。方法运用改良平衡酚—tris饱和酚法提取蝇类DNA,进行COⅠ序列扩增和测序,与数据库序列进行比对和分析。结果改良平衡酚—tris饱和酚提取DNA方法可获得有效的蝇类DNA,并可应用于COⅠ基因片段扩增,进而进行蝇类种类的鉴定。结论平衡酚—Tris饱和酚法提取的噬尸性蝇类虫体DNA作为模板,用于COⅠ序列扩增,测序后与数据库目的序列分析比对,可准确鉴定嗜尸性蝇类的种类;和传统的昆虫形态学特征鉴定方法比较,该体系更准确,应用范围更广。
关键词
法医昆虫学
嗜尸性蝇类
鉴定
DNA提取
细胞色素氧化酶亚基Ⅰ
Keywords
forensic entomology
sarcosaphagous flies
identification
DNA extraction
CO I
分类号
D919.1 [医药卫生—法医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
加权基因共表达网络分析筛选结肠腺癌预后相关的免疫标志物
何翔
万首伟
贺强
侯吉学
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
CXCL4对人真皮微血管内皮细胞的功能及分泌血管舒缩因子的影响
姜智星
杨森
陈琛
梁敏锐
邹和建
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
下载PDF
职称材料
3
提取CO Ⅰ基因片段鉴定嗜尸性蝇类
郑武
杨堃
郭燕红
刘丹
黄和鸣
肖顺
《中国法医学杂志》
CSCD
2017
2
原文传递
已选择
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