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加权基因共表达网络分析筛选结肠腺癌预后相关的免疫标志物
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作者 何翔 万首伟 +1 位作者 贺强 侯吉学 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期509-515,共7页
目的寻找结肠腺癌(COAD)免疫相关预后标志物,以期能够准确预测COAD患者预后。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析COAD患者免疫相关差异基因,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)与COX回归分析得到风险模型,根据风险值的中位值将患... 目的寻找结肠腺癌(COAD)免疫相关预后标志物,以期能够准确预测COAD患者预后。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析COAD患者免疫相关差异基因,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)与COX回归分析得到风险模型,根据风险值的中位值将患者分为高、低风险组,比较两者预后,在基因表达数据集(GEO)数据库中验证模型。结果通过分析共得到1015个免疫相关差异基因。COX回归分析得到由维甲酸受体相关孤核受体C(RORC)、富含亮氨酸重复序列Fli-I相互作用蛋白2(LRRFIP2)、半乳糖凝集素4(LGALS4)构成的风险模型,高风险组较低风险组预后较差并在GEO中得到验证,通过单因素与多因素COX分析发现模型可作为COAD患者独立预后风险模型。结论通过免疫相关预后差异基因建立模型,可以预测COAD患者预后。 展开更多
关键词 结肠腺癌 免疫相关基因 维甲酸受体相关孤核受体C(RORC) 富含亮氨酸重复序列fli-i相互作用蛋白2(LRRFIP2) 半乳糖凝集素4(LGALS4/galectin-4) 癌症基因组图谱(TCGA) 预后
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CXCL4对人真皮微血管内皮细胞的功能及分泌血管舒缩因子的影响
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作者 姜智星 杨森 +2 位作者 陈琛 梁敏锐 邹和建 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期665-669,共5页
目的:探讨CXCL4对人真皮微血管内皮细胞(HDMEC)增殖能力、血管形成能力及相关因子表达的影响。方法:采用梯度浓度CXCL4干预HDMEC,通过CCK-8检测细胞增殖能力,血管形成实验观察CXCL4对HDMEC血管形成能力的影响,通过RT-PCR检测内皮素-1、F... 目的:探讨CXCL4对人真皮微血管内皮细胞(HDMEC)增殖能力、血管形成能力及相关因子表达的影响。方法:采用梯度浓度CXCL4干预HDMEC,通过CCK-8检测细胞增殖能力,血管形成实验观察CXCL4对HDMEC血管形成能力的影响,通过RT-PCR检测内皮素-1、Fli-1、AT1R、ETAR的mRNA水平。并使用CXCL4拮抗剂观察能否抑制CXCL4对HDMEC上述功能的影响。结果:HDMEC上可表达CXCL4特异性受体CXCR3。CXCL4可抑制HDMEC增殖及血管形成数目,且呈剂量依赖关系。CXCL4显著上调HDEMC中内皮素-1、AT1R基因的mRNA水平(P<0.05),下调Fli-1基因的mRNA水平(P<0.05),对ETAR的mRNA水平无影响。且CXCL4拮抗剂可逆转CXCL4对HDMEC的上述影响。结论:CXCL4能抑制HDMEC的增殖及血管形成,提高ET-1、AT1R的mRNA水平,降低Fli-1的mRNA水平,且呈浓度依赖性。 展开更多
关键词 CXCL4 系统性硬化症 内皮素-1 FLI-1 AT1R
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提取CO Ⅰ基因片段鉴定嗜尸性蝇类 被引量:2
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作者 郑武 杨堃 +3 位作者 郭燕红 刘丹 黄和鸣 肖顺 《中国法医学杂志》 CSCD 2017年第2期168-170,共3页
目的通过扩增蝇类COⅠ基因片段,结合形态学特征鉴定嗜尸性蝇类的种类。方法运用改良平衡酚—tris饱和酚法提取蝇类DNA,进行COⅠ序列扩增和测序,与数据库序列进行比对和分析。结果改良平衡酚—tris饱和酚提取DNA方法可获得有效的蝇类DNA... 目的通过扩增蝇类COⅠ基因片段,结合形态学特征鉴定嗜尸性蝇类的种类。方法运用改良平衡酚—tris饱和酚法提取蝇类DNA,进行COⅠ序列扩增和测序,与数据库序列进行比对和分析。结果改良平衡酚—tris饱和酚提取DNA方法可获得有效的蝇类DNA,并可应用于COⅠ基因片段扩增,进而进行蝇类种类的鉴定。结论平衡酚—Tris饱和酚法提取的噬尸性蝇类虫体DNA作为模板,用于COⅠ序列扩增,测序后与数据库目的序列分析比对,可准确鉴定嗜尸性蝇类的种类;和传统的昆虫形态学特征鉴定方法比较,该体系更准确,应用范围更广。 展开更多
关键词 法医昆虫学 嗜尸性蝇类 鉴定 DNA提取 细胞色素氧化酶亚基Ⅰ
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