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Sparse reconstruction for fluorescence molecular tomography via a fast iterative algorithm 被引量:3
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作者 Jingjing Yu Jingxing Cheng +1 位作者 Yuqing Hou Xiaowei He 《Journal of Innovative Optical Health Sciences》 SCIE EI CAS 2014年第3期50-58,共9页
Fluorescence molecular tomography(FMT)is a fast-developing optical imaging modalitythat has great potential in early diagnosis of disease and drugs development.However,recon-struction algorithms have to address a high... Fluorescence molecular tomography(FMT)is a fast-developing optical imaging modalitythat has great potential in early diagnosis of disease and drugs development.However,recon-struction algorithms have to address a highly ill-posed problem to fulfll 3D reconstruction inFMT.In this contribution,we propose an efficient iterative algorithm to solve the large-scalereconstruction problem,in which the sparsity of fluorescent targets is taken as useful a prioriinformation in designing the reconstruction algorithm.In the implementation,a fast sparseapproximation scheme combined with a stage-wise learning strategy enable the algorithm to dealwith the ill-posed inverse problem at reduced computational costs.We validate the proposed fastiterative method with numerical simulation on a digital mouse model.Experimental results demonstrate that our method is robust for different finite element meshes and different Poissonnoise levels. 展开更多
关键词 fluorescence molecular tomography sparse regularization reconstruction algorithm least absolute shrinkage and selection operator.
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A SIMULATION STUDY ON DYNAMIC-SAMPLING-MODE FOR FLUORESCENCE MOLECULAR TOMOGRAPHY 被引量:1
2
作者 ZHUN XU JING BAI 《Journal of Innovative Optical Health Sciences》 SCIE EI CAS 2009年第2期165-177,共13页
Fluorescence tomography can obtain a sufficient dataset and optimal three-dimensional imageswhen projections are captured over 360◦ by CCD camera. Herein a non-stop dynamic samplingmode for fluorescence tomography is ... Fluorescence tomography can obtain a sufficient dataset and optimal three-dimensional imageswhen projections are captured over 360◦ by CCD camera. Herein a non-stop dynamic samplingmode for fluorescence tomography is proposed in an attempt to improve the optical measurementspeed of the traditional imaging system and stability of the object to be imaged. A series ofsimulations are carried out to evaluate the accuracy of dataset acquired from the dynamicsampling mode. Reconstruction with the corresponding data obtained in the dynamic-modeprocess is also performed with the phantom. The results demonstrate the feasibility of suchan imaging mode when the angular velocity is set to the appropriate value, thus laying thefoundation for real experiments to verify the superiority in performance of this new imagingmode over the traditional one. 展开更多
关键词 fluorescence molecular tomography dynamic sampling mode SIMULATION
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Recent methodology advances in fluorescence molecular tomography
3
作者 Yu An Kun Wang Jie Tian 《Visual Computing for Industry,Biomedicine,and Art》 2018年第1期1-11,共11页
Molecular imaging(MI)is a novel imaging discipline that has been continuously developed in recent years.It combines biochemistry,multimodal imaging,biomathematics,bioinformatics,cell&molecular physiology,biophysic... Molecular imaging(MI)is a novel imaging discipline that has been continuously developed in recent years.It combines biochemistry,multimodal imaging,biomathematics,bioinformatics,cell&molecular physiology,biophysics,and pharmacology,and it provides a new technology platform for the early diagnosis and quantitative analysis of diseases,treatment monitoring and evaluation,and the development of comprehensive physiology.Fluorescence Molecular Tomography(FMT)is a type of optical imaging modality in MI that captures the three-dimensional distribution of fluorescence within a biological tissue generated by a specific molecule of fluorescent material within a biological tissue.Compared with other optical molecular imaging methods,FMT has the characteristics of high sensitivity,low cost,and safety and reliability.It has become the research frontier and research hotspot of optical molecular imaging technology.This paper took an overview of the recent methodology advances in FMT,mainly focused on the photon propagation model of FMT based on the radiative transfer equation(RTE),and the reconstruction problem solution consist of forward problem and inverse problem.We introduce the detailed technologies utilized in reconstruction of FMT.Finally,the challenges in FMT were discussed.This survey aims at summarizing current research hotspots in methodology of FMT,fromwhich future research may benefit. 展开更多
关键词 fluorescence molecular tomography Image reconstruction Photon propagation model Forward problem Inverse problem
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IN VIVO VALIDATION OF DUAL-MODALITY SYSTEM FOR SIMULTANEOUS POSITRON EMISSION TOMOGRAPHY AND OPTICAL TOMOGRAPHIC IMAGING
4
作者 XIN WANG BIN ZHANG +4 位作者 XU CAO FEI LIU SHUANGQUAN LIU BAOCI SHAN JING BAI 《Journal of Innovative Optical Health Sciences》 SCIE EI CAS 2011年第2期165-171,共7页
We report on tests of combined positron emission tomography(PET)andfluorescence molecular tomography(FMT)imaging system for in vivo investigation on small animals.A nude mouse was inoculated with MD-MB-231 breast canc... We report on tests of combined positron emission tomography(PET)andfluorescence molecular tomography(FMT)imaging system for in vivo investigation on small animals.A nude mouse was inoculated with MD-MB-231 breast cancer cells which expressed redfluorescent protein(RFP).For FMT system,reflective illumination mode was adopted with full-angle data acquisition.[18F]-Fluorodeoxyglucose([18F]-FDG)was used as radioactive tracer for PET.Both data were acquired simultaneously and then reconstructed separately before fusion.Fluorescent tomography results showed exactly where the tumor was located while PET results offered more metabolic information.Results confirmed feasibility for tumor detection and showed superiority to single modality imaging. 展开更多
关键词 Dual-modality imaging positron emission tomography fluorescence molecular tomography
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Tikhonov-regularization-based projecting sparsity pursuit method for fluorescence molecular tomography reconstruction 被引量:2
5
作者 Jiaju Cheng Jianwen Luo 《Chinese Optics Letters》 SCIE EI CAS CSCD 2020年第1期64-69,共6页
For fluorescence molecular tomography(FMT),image quality could be improved by incorporating a sparsity constraint.The L1 norm regularization method has been proven better than the L2 norm,like Tikhonov regularization.... For fluorescence molecular tomography(FMT),image quality could be improved by incorporating a sparsity constraint.The L1 norm regularization method has been proven better than the L2 norm,like Tikhonov regularization.However,the Tikhonov method was found capable of achieving a similar quality at a high iteration cost by adopting a zeroing strategy.By studying the reason,a Tikhonov-regularization-based projecting sparsity pursuit method was proposed that reduces the iterations significantly and achieves good image quality.It was proved in phantom experiments through time-domain FMT that the method could obtain higher accuracy and less oversparsity and is more applicable for heterogeneous-target reconstruction,compared with several regularization methods implemented in this Letter. 展开更多
关键词 fluorescence molecular tomography SPARSITY PURSUIT Tikhonov REGULARIZATION GOOD image quality high efficiency
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螺旋式激发的荧光分子断层成像 被引量:3
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作者 侯榆青 魏红娜 +2 位作者 易黄建 张旭 贺小伟 《西安电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第2期97-102,共6页
由于在实际中荧光探针的位置是未知的,因此获得的数据会不准确.为了克服这个缺点,提出一种基于螺旋式激发的荧光分子断层成像方式,它能在未知荧光目标具体位置的情况下,保证荧光目标受激发完全,从而确保了测量数据的准确性.通过设计非... 由于在实际中荧光探针的位置是未知的,因此获得的数据会不准确.为了克服这个缺点,提出一种基于螺旋式激发的荧光分子断层成像方式,它能在未知荧光目标具体位置的情况下,保证荧光目标受激发完全,从而确保了测量数据的准确性.通过设计非匀质仿体实验,验证了螺旋式激发方法在荧光分子断层成像中的可行性和有效性. 展开更多
关键词 荧光分子断层成像 螺旋式激发 成像系统 图像重建
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非接触式近红外荧光断层成像中光在自由空间中的传播模型及验证 被引量:4
7
作者 姚俊杰 胡刚 白净 《红外与毫米波学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第5期330-332,369,共4页
阐述了非接触式近红外荧光断层成像中光从介质表面出射后的传播.在Jorge Ripoll等人工作的基础上,考虑了镜头的空间透视效应,简化了光在自由空间中的能量传播模型,建立了介质表面光强与CCD探测强度的联系.仿体实验结果表明该模型能够有... 阐述了非接触式近红外荧光断层成像中光从介质表面出射后的传播.在Jorge Ripoll等人工作的基础上,考虑了镜头的空间透视效应,简化了光在自由空间中的能量传播模型,建立了介质表面光强与CCD探测强度的联系.仿体实验结果表明该模型能够有效应用于非接触式近红外荧光断层成像. 展开更多
关键词 近红外荧光断层成像 光的传播模型 非接触 空间透视
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一种新型的小动物四模态分子医学影像系统 被引量:3
8
作者 周坤 孟祥溪 +4 位作者 谢肇恒 李素莹 田涧 杨昆 任秋实 《中国医疗设备》 2015年第2期7-10,共4页
本文介绍了一种新型的小动物四模态分子影像系统的研发。该系统集成了计算机断层成像(computed tomography,CT)、正电子发射断层成像(positron emission tomography,PET)、单光子发射计算机断层成像(single-photon emission computed to... 本文介绍了一种新型的小动物四模态分子影像系统的研发。该系统集成了计算机断层成像(computed tomography,CT)、正电子发射断层成像(positron emission tomography,PET)、单光子发射计算机断层成像(single-photon emission computed tomography,SPECT)和荧光分子断层成像(fluorescence molecular tomography,FMT)四种模态。对小鼠肿瘤-炎症模型的成像结果显示,融合了各个模态的综合重建结果可以提供较单一模态更加丰富的结构、功能代谢信息。 展开更多
关键词 四模态 分子医学影像 CT PET SPECT 荧光分子断层成像 图像融合
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三维光学断层技术在活体成像中的应用 被引量:1
9
作者 李铸衡 张婳 +1 位作者 刘殿骏 王振新 《应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期1411-1419,共9页
三维光学断层成像(Three Dimensional Optical Tomography Imaging)是以光学探针标记的分子或细胞为成像源,在外部光源的激发下产生发射光,通过测量组织边界处的光强,结合光子在组织中的传播模型,来重建出组织内部发射光分布图像以及组... 三维光学断层成像(Three Dimensional Optical Tomography Imaging)是以光学探针标记的分子或细胞为成像源,在外部光源的激发下产生发射光,通过测量组织边界处的光强,结合光子在组织中的传播模型,来重建出组织内部发射光分布图像以及组织光学参数。三维光学断层成像能够提供目标物在生物体内的分布信息,克服平面成像的局限性。因此,在肿瘤检测、基因表达、蛋白质分子检测、揭示机体功能变化等方面有着很大的应用潜力。本文总结了光学相干断层成像(Optical Coherence Tomography,OCT)、荧光分子断层成像(Fluorescent Molecular Tomography,FMT)、生物自发光断层成像(Bioluminescence Tomography,BLT)、切伦科夫荧光断层成像(Cerenkov Luminescence Tomography,CLT)等三维光学断层活体成像技术的新进展,分析了其在实际应用中所面临的技术挑战并探讨了相应的解决方案。 展开更多
关键词 光学相干断层成像 荧光分子断层成像 生物自发光断层成像 切伦科夫荧光断层成像 多功能光学纳米探针
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肿瘤光学分子成像技术研究进展 被引量:1
10
作者 马文娟 刘佩芳 +1 位作者 胡从依 王红彬 《中国医学计算机成像杂志》 CSCD 北大核心 2015年第6期605-608,共4页
肿瘤光学分子成像技术是近年发展起来的新兴技术,在生命科学研究中占有重要地位。其原理为采用荧光报告基团或荧光染料标记的目的细胞,通过灵敏的光学成像仪器,检测活体生物体内细胞生物学行为。依对比度产生机制有两个主要模态:生物体... 肿瘤光学分子成像技术是近年发展起来的新兴技术,在生命科学研究中占有重要地位。其原理为采用荧光报告基团或荧光染料标记的目的细胞,通过灵敏的光学成像仪器,检测活体生物体内细胞生物学行为。依对比度产生机制有两个主要模态:生物体自发光成像和荧光层析成像。光学分子成像技术具有无创、可多次重复、实时活体成像、灵敏、安全等优势,但目前还在发展的初期,是分子影像学领域面临突破的重点研究方向,它的发展必将为生命科学和临床医学研究提供革命性的新方法和手段。 展开更多
关键词 肿瘤 分子成像 生物体自发光成像 荧光层析成像
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时域荧光分子层析图像重建的线性特征数据法 被引量:1
11
作者 张丽敏 阮平巧 +1 位作者 高峰 赵会娟 《光子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第2期345-350,共6页
通过扩展用于时域扩散光成像(Diffuse Optical Tomography,DOT)的广义脉冲谱技术,提出了一种用于时域荧光分子层析成像(Fluorescence Molecular Tomography,FMT)的线性特征数据图像重建算法.此算法能够同时重建荧光产率和荧光寿命,并且... 通过扩展用于时域扩散光成像(Diffuse Optical Tomography,DOT)的广义脉冲谱技术,提出了一种用于时域荧光分子层析成像(Fluorescence Molecular Tomography,FMT)的线性特征数据图像重建算法.此算法能够同时重建荧光产率和荧光寿命,并且利用模拟数据对此方法进行验证,证明了算法的有效性. 展开更多
关键词 荧光分子层析成像 图像重建技术 时间分辨成像
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应用ISODATA选取可行域的荧光分子断层成像 被引量:2
12
作者 侯榆青 胡跃林 +2 位作者 易黄建 焦璞 贺小伟 《光学精密工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第8期2074-2083,共10页
为了实现快速、准确、鲁棒的荧光分子断层成像(FMT)重建,有限投影FMT和可行域选取策略得到了越来越多的关注。为了解决现有的可行域选取方法中存在的参数设置困难以及多目标选取不准确的问题,从而提高有限投影FMT的重建质量,提出了应用... 为了实现快速、准确、鲁棒的荧光分子断层成像(FMT)重建,有限投影FMT和可行域选取策略得到了越来越多的关注。为了解决现有的可行域选取方法中存在的参数设置困难以及多目标选取不准确的问题,从而提高有限投影FMT的重建质量,提出了应用迭代自组织数据分析技术算法(ISODATA)的FMT可行域选取方法。首先采用ISODATA对初级重建结果聚类分区,然后在各分离的区域上分别选取可行域。为了验证提出的方法在应用中的可行性和有效性,设计了三目标荧光团重建的对比实验。实验结果显示,使用2个投影数据时,只有使用本文提出的方法可以准确地重建出三个荧光源的位置;使用4个投影数据时,重建的平均位置误差为0.18mm,荧光产额相对误差小于50%,而此时使用阈值法不能重建,使用区域收缩法的荧光产额相对误差为61.2%。即使在测量数据较少时,提出的方法也可以准确高效地选取可行域,提高有限投影FMT重建的精确度和鲁棒性。 展开更多
关键词 荧光分子断层成像 有限投影 可行域选取 迭代自组织数据分析技术算法
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近红外荧光散射断层成像的研究进展 被引量:7
13
作者 宋小磊 白净 《国外医学(生物医学工程分册)》 2005年第2期70-75,共6页
近红外荧光光学断层成像(FODT)是以合适的荧光探针作为标记物或对比剂,用特定波长的红光激发荧光染料,使其发出波长长于激发光的近红外荧光,通过测量媒质边界处有限点的荧光强度,考虑光子在组织中传播的散射特性,来重建出组织内部的荧... 近红外荧光光学断层成像(FODT)是以合适的荧光探针作为标记物或对比剂,用特定波长的红光激发荧光染料,使其发出波长长于激发光的近红外荧光,通过测量媒质边界处有限点的荧光强度,考虑光子在组织中传播的散射特性,来重建出组织内部的荧光光学特性的分布图像以及组织光学参数。这种成像方式具有无电离辐射、染料稳定、可长期监测和设备简单、成本低等优点,在肿瘤检测、基因表达、蛋白质分子检测和药物受体定位等方面有着很大的应用潜力。在给出近红外荧光散射断层成像典型系统的基础上,详述了近红外荧光在组织中的频域传播模型和重建算法;介绍了两家研究机构在此领域的研究进展;讨论了将该成像方法应用于临床的进一步的发展方向。 展开更多
关键词 医学成像 荧光散射断层成像 荧光分子断层成像
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基于三支决策的荧光分子断层成像重建结果后处理 被引量:2
14
作者 易黄建 梁嘉翔 李小南 《南京理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期387-392,共6页
为了去除荧光分子断层成像重建结果中的伪信息,该文利用三支决策理论对重建结果进行分类。将荧光分子断层成像重建结果看作论域,利用三支决策思想并设计阈值,将结果划分成3个互不相交的区域:荧光目标区域、背景区域和边界区域。将荧光... 为了去除荧光分子断层成像重建结果中的伪信息,该文利用三支决策理论对重建结果进行分类。将荧光分子断层成像重建结果看作论域,利用三支决策思想并设计阈值,将结果划分成3个互不相交的区域:荧光目标区域、背景区域和边界区域。将荧光目标区域和边界区域作为最终的重建结果。数字鼠仿真实验和真实物理仿体实验结果表明,基于三支决策的后处理方法能改善荧光分子断层成像重建图像质量。 展开更多
关键词 三支决策 荧光分子断层成像 不确定性
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组织仿体液中近红外荧光分子探针的3-D成像
15
作者 胡刚 姚俊杰 +1 位作者 宋小磊 白净 《航天医学与医学工程》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期135-138,共4页
目的研制荧光分子断层成像实验系统,获取组织仿体内近红外荧光探针的3-D图像。方法系统采用低温制冷CCD相机作为高灵敏弱光信号探测器,通过旋转目标物,得到各个角度的激发荧光场。组织内近红外光子传输遵循漫射近似理论,图像重建采用基... 目的研制荧光分子断层成像实验系统,获取组织仿体内近红外荧光探针的3-D图像。方法系统采用低温制冷CCD相机作为高灵敏弱光信号探测器,通过旋转目标物,得到各个角度的激发荧光场。组织内近红外光子传输遵循漫射近似理论,图像重建采用基于有限元的快速算法。结果荧光检测系统可以获取全周高密度原始数据,重建图像可再现漫射介质内的荧光目标物的位置与3-D形状。结论仿体液中荧光目标物重建结果良好,可作为在体动物光学断层成像平台。 展开更多
关键词 荧光分子断层成像 光学成像 3-D重建 组织仿体液
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基于Monte Carlo荧光分子断层成像前向问题的研究
16
作者 孙丹萍 张涛 +1 位作者 张永红 白净 《北京生物医学工程》 2009年第1期1-5,共5页
随着生物和光学技术的成熟,近红外荧光成像得到了飞速发展。荧光分子断层成像是以特定波长的光去激发荧光染料,使其吸收入射光,并发出波长长于入射光的近红外荧光。前向问题是进行光学成像研究的关键环节,可以指导实验以及重建算法... 随着生物和光学技术的成熟,近红外荧光成像得到了飞速发展。荧光分子断层成像是以特定波长的光去激发荧光染料,使其吸收入射光,并发出波长长于入射光的近红外荧光。前向问题是进行光学成像研究的关键环节,可以指导实验以及重建算法。本文提出了一种基于Monte Carlo方法的荧光分子断层成像的光子传输模型,重点研究了激发光激发荧光的过程以及光子在生物体内的传播过程,在已知激发光源、传播介质、荧光物质等参数的条件下,得到荧光光子在CCD探测器上的分布情况,并且分别用理论和实验两种方法对算法的仿真结果进行了验证。 展开更多
关键词 MONTE CARLO方法 荧光分子断层成像 激发荧光 光子传输
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基于近红外荧光蛋白的细菌体内成像研究
17
作者 瞿小英 李胜蓝 李卓权 《同济大学学报(医学版)》 CAS 2013年第2期40-42,共3页
目的建立表达iRFP的细菌株并且进行体内和体外成像。方法合成iRFP基因序列,构建pPLBV和pET-3a-iRFP质粒,转化质粒进入细菌,检测细菌激发和发射波长,分析细菌体外和体内荧光分子成像。结果转化含iRFP质粒的细菌的激发波长峰值为690 nm,... 目的建立表达iRFP的细菌株并且进行体内和体外成像。方法合成iRFP基因序列,构建pPLBV和pET-3a-iRFP质粒,转化质粒进入细菌,检测细菌激发和发射波长,分析细菌体外和体内荧光分子成像。结果转化含iRFP质粒的细菌的激发波长峰值为690 nm,发射波长峰值为713 nm,细菌可进行体外和体内荧光分子断层成像。结论本研究成功构建了表达iRFP的细菌,体内外成像可快速分析该细菌的数量变化和体内分布。 展开更多
关键词 近红外荧光蛋白 细菌 活体成像 荧光分子断层成像
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荧光分子断层成像系统的研究进展与比较 被引量:2
18
作者 陈延平 白净 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期463-468,共6页
荧光分子断层成像(FMT)利用具有特异性的荧光分子探针,在体成像、观测生物体内细胞和分子水平的变化。介绍FMT系统的国内外研究进展,从系统的复杂性、投影数目、光源-探测器(S-D)数据对集大小、重构图像的质量等方面,分析5种S-D几何结... 荧光分子断层成像(FMT)利用具有特异性的荧光分子探针,在体成像、观测生物体内细胞和分子水平的变化。介绍FMT系统的国内外研究进展,从系统的复杂性、投影数目、光源-探测器(S-D)数据对集大小、重构图像的质量等方面,分析5种S-D几何结构的特点。着重从实现方面,分析、比较已报道的几种FMT系统的特点,并对其多模态成像的可扩展性、临床应用的可能性等进行了总结与展望。 展开更多
关键词 荧光分子断层成像 荧光扩散光层析成像 分子成像 断层成像
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稀疏正则和自适应有限元的荧光分子断层成像 被引量:3
19
作者 程璟星 侯榆青 +2 位作者 董芳 贺小伟 余景景 《西安电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第2期174-179,共6页
提出了一种基于稀疏正则和自适应有限元方法的两阶重建算法,在初始网格和次级网格光源重建实验中,根据重建问题的特点,选用两种不同的稀疏正则化方法.通过仿真实验表明,所提出的方法在荧光分子断层成像重建应用方面具有可行性、稳定性... 提出了一种基于稀疏正则和自适应有限元方法的两阶重建算法,在初始网格和次级网格光源重建实验中,根据重建问题的特点,选用两种不同的稀疏正则化方法.通过仿真实验表明,所提出的方法在荧光分子断层成像重建应用方面具有可行性、稳定性和高效性. 展开更多
关键词 荧光分子断层成像 稀疏正则化 重建算法
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快速估计荧光分子断层成像中单个荧光物的深度 被引量:1
20
作者 陈延平 白净 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1516-1519,共4页
荧光分子断层成像支持在体无创研究长时间跨度的分子事件,满足21世纪系统化地观测生命过程的要求。在其复杂且耗时的重建中,先验信息有助于加快重建速度,提高重建图像的质量。文章将求解荧光物的深度作为待优化问题,由单幅荧光图像直接... 荧光分子断层成像支持在体无创研究长时间跨度的分子事件,满足21世纪系统化地观测生命过程的要求。在其复杂且耗时的重建中,先验信息有助于加快重建速度,提高重建图像的质量。文章将求解荧光物的深度作为待优化问题,由单幅荧光图像直接快速地估计深度信息。首先根据生物组织内的扩散模型和外推边界条件,推导出生物体边界上两点处荧光强度的比值Rf。然后用粒子群优化算法,在吸收系数和散射系数的估计区间内,由最小化生物体边界上两点处模型值RfM与测量值RfT之间的差,估计出荧光物的深度。不同尺寸荧光物的两个仿体实验的结果表明,所提出的方法不需要网格剖分和重建,能快速简单地估计出单个类似于球体的荧光物的深度。 展开更多
关键词 荧光分子断层成像 深度估计 外推边界 荧光扩散光层析成像 扩散光层析成像
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