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Selection and Evaluation of Optimal Reference Genes for Quantitative Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction Analyses of Gene Expression in Human Spermatozoa
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作者 Luo Chun-Hai Tang Yun-Ge +3 位作者 Hong Shi-Hao Tang Yuan Zhang Ying Sun Fei 《Reproductive and Developmental Medicine》 CSCD 2020年第4期212-218,共7页
Objective:Optimal reference genes are critical for accurate normalization and reliable interpretation of gene expression quantification data.Recently,several strategies have been utilized for validating reference gene... Objective:Optimal reference genes are critical for accurate normalization and reliable interpretation of gene expression quantification data.Recently,several strategies have been utilized for validating reference genes in different human tissues.However,no universal reference genes have been described that accurately summarize transcriptional activity in human spermatozoa.Methods:Using quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-qPCR),we evaluated ten commonly used candidate reference genes between two groups of human cryopreserved donor sperm with different pregnancy rates.We assessed the stability of reference genes using three different algorithms,namely geNorm,NormFinder,and BestKeeper.We then identified the most stable reference genes.Results:Male-enhanced antigen 1(MEA1)was identified as the most stably expressed reference gene,followed by testis-enhanced gene transcript(TEGT).Conclusions:We comprehensively identified MEA1 and TEGT as the most stably expressed reference genes for the normalization of gene expression data in human spermatozoa. 展开更多
关键词 Human Spermatozoa quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction Reference Gene
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基于直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测方法的建立
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作者 李浪 古莉冰 +6 位作者 朱丽 何建安 叶颖 张然 李华文 李福缘 顾大勇 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第3期358-364,共7页
目的建立基于直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术的寨卡病毒快速检测方法。方法采用特殊功能的DNA聚合酶,以及优选PCR增强剂,以此建立直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测5种样本(全血、血清、唾液、咽拭子和尿)的方法。结果... 目的建立基于直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术的寨卡病毒快速检测方法。方法采用特殊功能的DNA聚合酶,以及优选PCR增强剂,以此建立直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测5种样本(全血、血清、唾液、咽拭子和尿)的方法。结果5种样本检测限分别为血清103 PFU/mL,尿、咽拭子和唾液102 PFU/mL,全血104 PFU/mL,标准曲线的拟合优度的可决系数均在0.98以上,扩增效率均在90%~110%;寨卡病毒核酸成功扩增,非寨卡病毒核酸均未能扩增;尿、全血和唾液样本的重复性实验中106 PFU/mL和102 PFU/mL两个浓度的6个重复Ct值的变异系数均<5%。该研究建立的直扩RT-PCR技术的寨卡病毒检测方法与常规RT-PCR技术的检测结果一致,8个寨卡病毒样本,均只检测出2个血清样本,其余62个非寨卡病毒样本及12个阴性样本均未得到扩增。结论成功建立基于直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测方法,该方法简便快捷且灵敏度高、特异度强。 展开更多
关键词 寨卡病毒 直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应技术 DNA聚合酶
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饮食习惯与肥胖患儿性早熟的相关性分析 被引量:1
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作者 连学刚 高兰平 《临床研究》 2024年第1期190-192,共3页
目的探讨饮食习惯与肥胖患儿性早熟的相关性分析。方法选取苏州市吴中人民医院2019年3月至2022年3月期间收治的72例性早熟肥胖患儿作为观察组,另选取同期体检的健康肥胖儿童71例作为常规组。采用实时-逆转录荧光定量聚合酶链反应(RT-qP... 目的探讨饮食习惯与肥胖患儿性早熟的相关性分析。方法选取苏州市吴中人民医院2019年3月至2022年3月期间收治的72例性早熟肥胖患儿作为观察组,另选取同期体检的健康肥胖儿童71例作为常规组。采用实时-逆转录荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测两组外周血miR-125b水平,分析患儿饮食习惯。通过比较两组肥胖儿童的外周血miR-125b、饮食习惯,采用Logistic回归分析法分析外周血miR-125b、饮食习惯与肥胖患儿性早熟的关系。结果观察组外周血miR-125b表达水平高于常规组,差异有统计学意义(P<0.05)。观察组饮食没规律、荤多素少、高添加剂食品占比均高于常规组,差异有统计学意义(P<0.05)。观察组女性患儿、不良饮食习惯占比高于常规组,且经多因素分析显示外周血miR-125b表达水平、女性、不良饮食习惯是肥胖患儿性早熟的独立危险因素,差异有统计学意义(P<0.05)。结论肥胖患儿性早熟外周血miR-125b表达水平高于健康肥胖儿童,不良饮食习惯高于健康肥胖儿童,外周血miR-125b表达水平偏高、不良饮食习惯偏低均为肥胖患儿性早熟的影响因素。 展开更多
关键词 肥胖儿童 不良饮食习惯 微小核糖核酸-125b 实时-逆转录荧光定量聚合酶链反应
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实时荧光定量RT-PCR分析非小细胞肺癌SATB1的表达和临床病理意义 被引量:32
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作者 周来勇 刘芳 +3 位作者 童健 陈群请 张福伟 郭琳琅 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期534-537,共4页
目的检测非小细胞肺癌组织中SATB1 mRNA的表达,探讨SATB1表达与非小细胞肺癌发生、发展的关系及其临床病理意义。方法用TRIZOL提取非小细胞肺癌组织和正常肺组织总RNA后,将其反转录为cDNA,以实时荧光定量RT-PCR方法检测非小细胞肺癌组... 目的检测非小细胞肺癌组织中SATB1 mRNA的表达,探讨SATB1表达与非小细胞肺癌发生、发展的关系及其临床病理意义。方法用TRIZOL提取非小细胞肺癌组织和正常肺组织总RNA后,将其反转录为cDNA,以实时荧光定量RT-PCR方法检测非小细胞肺癌组织及正常肺组织中SATB1 mRNA的表达,分析SATB1基因表达与临床病理参数的相关性。结果癌组织中SATB1 mRNA表达量为正常组织13倍,两者差异显著(P<0.001),其中有、无转移组分别为正常组织23.63倍和5.57倍。结论SATB1 mRNA的表达水平可能与非小细胞肺癌发生发展及淋巴转移有关,有望成为判断非小细胞肺癌预后的一个指标。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 SATB1 mRNA 实时荧光定量rt-pcr
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实时荧光定量RT-PCR检测结直肠癌中外周血端粒酶逆转录酶mRNA的表达及其临床意义 被引量:4
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作者 司君利 亓玉琴 +1 位作者 周长宏 刘吉勇 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2008年第36期4066-4070,共5页
目的:建立外周血端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA表达量检测的实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测结直肠癌患者hTERT mRNA的表达并探讨其对结直肠癌微转移的诊断价值.方法:用实时荧光定量RT-PCR技术检测53例结直肠癌患者和21... 目的:建立外周血端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA表达量检测的实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测结直肠癌患者hTERT mRNA的表达并探讨其对结直肠癌微转移的诊断价值.方法:用实时荧光定量RT-PCR技术检测53例结直肠癌患者和21名健康人的外周血标本hTERT mRNA表达情况,分析其表达与肿瘤临床病理特征的关系并应用接受者操作特征曲线(ROC曲线)分析hTERT mRNA检测对结直肠癌的诊断价值.结果:结直肠癌组外周血hTERT mRNA表达水平显著高于正常对照组(t'=7.953,P<0.05),其表达与肿瘤淋巴结转移、血行转移和TNM分期相关(t'/t=2.334,2.149,2.460,均P<0.05).hTERT mRNA诊断结直肠癌的ROC曲线下面积0.91,诊断界值为Ct≤32.结论:应用实时荧光定量RT-PCR技术克服了传统PCR只能定性检测而不能定量检测的缺点;外周血hTERT mRNA可作为诊断结直肠癌微转移的标记物. 展开更多
关键词 结直肠癌 微转移 外周血端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA 实时荧光定量逆转录聚合酶链反应
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大鼠TGF-β1 mRNA表达水平的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法的建立 被引量:12
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作者 陈英剑 胡成进 赵苗青 《中国实验诊断学》 2005年第2期279-281,共3页
目的 建立检测大鼠TGF- β1mRNA表达水平的SYBRGreenⅠ荧光定量RT- PCR方法。方法 摸索SYBRGreenⅠ工作液的配制方法,筛选PCR反应液,优化反应中引物和MgCl2 的浓度,以actin为对照,建立大鼠TGF -β1mR NA表达水平的SYBRGreenⅠ荧光定量... 目的 建立检测大鼠TGF- β1mRNA表达水平的SYBRGreenⅠ荧光定量RT- PCR方法。方法 摸索SYBRGreenⅠ工作液的配制方法,筛选PCR反应液,优化反应中引物和MgCl2 的浓度,以actin为对照,建立大鼠TGF -β1mR NA表达水平的SYBRGreenⅠ荧光定量RT PCR方法并检测大鼠肾皮质TGF -β1mRNA表达水平。结果 SYBRGreenⅠ工作液,4 0倍水溶液稳定性好,最佳反应稀释度为1∶1 0 0 0 0。大鼠TGF β1表达水平的SYBRGreen荧光定量PCR方法,TGF- β1和actin的最佳MgCl2 反应浓度分别为2 5mM和3 5mM ,引物浓度分别为0 . 8μM和0. 5μM ,特异扩增产物的熔解温度分别为88 1和88 .6℃,因此选择在85℃时收集荧光信号。正常大鼠TGF- β1的Ct值在2 9 0 3,actin的Ct值在2 4 .86 ,扩增效率分别为0 . 995和1 . 0 8。结论 通过优化反应条件和特异性分析,成功地建立了特异、敏感的大鼠TGF- β1mRNASYBRGreenⅠ荧光定量RT PCR。SYBRGreenⅠ荧光定量PCR快速、敏感、特异、经济,可以满足临床和科研的需要。 展开更多
关键词 TGF-β1 mRNA SYBR Green 荧光定量rt-pcr
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实时荧光定量RT-PCR检测肝细胞肝癌中B-myb的表达及其临床意义 被引量:1
7
作者 吴华 曹骥 +7 位作者 杨春 李丽萍 欧超 潘南海 段小娴 李瑗 苏建家 岳惠芬 《广西医学》 CAS 2007年第11期1663-1666,共4页
目的建立B-myb mRNA表达量检测的实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测肝细胞肝癌(HCC)中B-myb的表达并分析其临床意义。方法用实时荧光定量聚合酶链反应技术检测70例HCC患者癌组织、癌旁肝组织及18例正常肝组织中B-myb mRNA的表... 目的建立B-myb mRNA表达量检测的实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测肝细胞肝癌(HCC)中B-myb的表达并分析其临床意义。方法用实时荧光定量聚合酶链反应技术检测70例HCC患者癌组织、癌旁肝组织及18例正常肝组织中B-myb mRNA的表达情况。结果B-myb mRNA在肝癌组织(0.0375±0.0168)及癌旁肝组织(0.0353±0.0128)中的表达水平明显高于在正常肝组织(0.0265±0.0099)中的表达水平(P<0.05),而在肝癌组织及癌旁肝组织中的表达水平差异无统计学意义(P>0.05)。B-myb在人肝癌组织中的表达与临床分期、肝外转移及术后复发明显有关,而与门静脉癌栓、肿瘤个数、肿瘤直径、血清AFP水平及分化程度无明显关系。结论该方法克服了传统PCR只能定性检测而不能定量检测的缺点,为研究B-myb在HCC中的表达提供了定量方法。B-myb可能与肝癌的发生、发展有关。 展开更多
关键词 肝细胞肝癌 B-MYB 实时荧光定量聚合酶链反应
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定量RT-PCR法检测CK20 mRNA、CEAmRNA在胃肠道肿瘤外周血中的表达 被引量:3
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作者 娄柏松 《齐齐哈尔医学院学报》 2008年第9期1032-1034,共3页
目的检测胃癌、大肠癌、健康人外周血CK20 mRNA、CEA mRNA的表达,探讨其临床意义。方法用定量RT-PCR法检测外周血白细胞中CK20mRNA、CEA mRNA的含量,肿瘤组30人,健康对照组23人。结果试验结果显示肿瘤组CEA mRNA、CK20 mRNA表达水平明... 目的检测胃癌、大肠癌、健康人外周血CK20 mRNA、CEA mRNA的表达,探讨其临床意义。方法用定量RT-PCR法检测外周血白细胞中CK20mRNA、CEA mRNA的含量,肿瘤组30人,健康对照组23人。结果试验结果显示肿瘤组CEA mRNA、CK20 mRNA表达水平明显高于健康对照组(P=0.000、P=0.000)。分组比较中IV期CK20 mRNA明显高于I~III期,P为0.000,差异显著;IV期与I~III期CEA mRNA没有差别。肿瘤组其中之一阳性28人,阳性率93.75%;两指标同时阳性22人,阳性率73.33%。结论本试验胃癌、大肠癌外周血检测CEA mRNA敏感性和特异性高于CK20 mRNA,但CEA mRNA数值高低与分期无关,CK20 mRNA的表达量与肿瘤分期有关。两指标联合检测未提高阳性率。 展开更多
关键词 荧光定量逆转录多聚酶链反应 胃肠道恶性肿瘤 细胞角蛋白20信使核糖核酸 癌胚抗原信使核糖核酸
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实时荧光定量RT-PCR与ELISA检测孕妇血清风疹病毒的比较分析 被引量:2
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作者 赵立红 《泰山医学院学报》 CAS 2011年第5期358-360,共3页
目的应用TaqMan实时荧光定量RT-PCR技术定量检测孕妇血清标本中风疹病毒RNA,并与ELISA法比较其敏感度与特异度,为孕妇早期风疹病毒检测提供迅速准确的方法。方法收集126例已确诊风疹病毒阳性孕妇血清标本与107例女性健康查体者血清标本... 目的应用TaqMan实时荧光定量RT-PCR技术定量检测孕妇血清标本中风疹病毒RNA,并与ELISA法比较其敏感度与特异度,为孕妇早期风疹病毒检测提供迅速准确的方法。方法收集126例已确诊风疹病毒阳性孕妇血清标本与107例女性健康查体者血清标本,同时进行实时荧光定量RT-PCR核酸检测与风疹病毒ELISA法IgM抗体检测,比较两种方法的敏感度与特异度。结果以细胞培养法为金标准,实时荧光定量RT-PCR法敏感度为92.9%,特异度为98.1%。ELISA IgM抗体法的敏感度和特异度分别为97.6%,86.9%。两种方法的敏感度无显著性差异(p>0.05),实时荧光定量RT-PCR法的特异度明显高于ELISA IgM抗体法(p<0.01)。结论实时荧光定量RT-PCR简便快捷、敏感性高、特异性高、定量准确,在临床风疹病毒基因检测中具有很大的应用潜力。 展开更多
关键词 风疹病毒 核酸 逆转录-聚合酶链反应 荧光定量聚合酶链反应 酶联免疫吸附测定 免疫球蛋白M
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构建hnRNP B1相对定量的FQ RT-PCR检测方法
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作者 常珍 沈佐君 操乐杰 《临床输血与检验》 CAS 2007年第2期111-114,共4页
目的建立一种荧光定量逆转录聚合酶链反应(FQ RT-PCR)检测肺癌患者外周血hnRNP B1mRNA表达的相对定量方法。方法以hnRNP B1为待测基因,以β-actin为参照进行检测,建立标准曲线,确定实时RT-PCR的扩增效率;优化反应条件,使扩增效率接近10... 目的建立一种荧光定量逆转录聚合酶链反应(FQ RT-PCR)检测肺癌患者外周血hnRNP B1mRNA表达的相对定量方法。方法以hnRNP B1为待测基因,以β-actin为参照进行检测,建立标准曲线,确定实时RT-PCR的扩增效率;优化反应条件,使扩增效率接近100%,检测待检标本hnRNP B1和β-actin的循环阈值(Ct)。结果该法检测的最低拷贝数为103,线性范围为103~107拷贝,批内和批间变异系数(CV)分别为3.4%和11.3%。结论该方法具有灵敏、特异、数据处理简便可靠等特点,为其他肿瘤患者外周血中肿瘤细胞的检测提供了方法学启示。 展开更多
关键词 荧光定量聚合酶链反应 异质性胞核核糖核蛋白B1 肺癌
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Allglo探针与TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测猴免疫缺陷病毒的比较 被引量:1
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作者 吴胜男 谢延峥 +1 位作者 刘翠华 何金洋 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1496-1501,共6页
目的比较Allglo探针和TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测SIV的灵敏度下限和重复性。方法把SIV标准品进行梯度稀释成6个浓度,每个浓度同时提取12个标本进行批内差异分析,每个标本提取12次进行批间差异分析之后进行逆转录并用TaqMan探针和All... 目的比较Allglo探针和TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测SIV的灵敏度下限和重复性。方法把SIV标准品进行梯度稀释成6个浓度,每个浓度同时提取12个标本进行批内差异分析,每个标本提取12次进行批间差异分析之后进行逆转录并用TaqMan探针和Allglo探针进行定量PCR检测。批内差异分析者每个标本同时进行逆转录和上机检测,批间差异分析者分12次进行逆转录和检测,对这两种探针的PCR结果利用ABI7300定量PCR仪所携带的软件和相关的统计学方法进行分析。结果 TaqMan探针和Allglo探针法检测SIV标准品的灵敏度下限均为50 copies/m L。重复性结果显示:批内结果差异分析显示Allglo探针法最大变异系数为0.63%,最小变异系数为0.33%,TaqMan探针法最大变异系数为1.33%,最小变异系数为0.2%;批间结果差异分析显示Allglo探针法最大变异系数为1.77%,最小变异系数为0.95%,TaqMan探针法最大变异系数为1.86%,最小变异系数为1.03%。结论在荧光定量RT-PCR法检测猴免疫缺陷病毒中,Allglo探针法可能优于TaqMan探针法。 展开更多
关键词 Allglo探针 TAQMAN探针 猴免疫缺陷病毒 实时荧光定量PCR
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hMLH1及hPMS2 mRNA在胃癌组织中荧光定量RT-PCR的检测及其临床意义 被引量:1
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作者 潘光松 刘希双 杨堃 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2010年第24期2599-2603,共5页
目的:探讨DNA错配修复基因hMLH1及hPMS2在胃癌组织中的表达水平及其临床意义.方法:应用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术对40例胃癌患者的癌组织、40例癌旁胃炎组织及21例慢性胃炎患者的慢性胃炎组织hMLH1 mRNA及hPMS2 mRNA... 目的:探讨DNA错配修复基因hMLH1及hPMS2在胃癌组织中的表达水平及其临床意义.方法:应用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术对40例胃癌患者的癌组织、40例癌旁胃炎组织及21例慢性胃炎患者的慢性胃炎组织hMLH1 mRNA及hPMS2 mRNA进行定量检测,以三磷酸甘油醛脱氢酶基因(hGAPDH)为内参照.结果:胃癌组织、癌旁组织、慢性胃炎组织中hMLH1 mRNA的相对含量分别是7.23±11.91,3.80±5.13,2.01±1.25,三组相比差异有统计学意义(F=3.272,均P=0.042),胃癌组织中hMLH1 mRNA含量明显高于其他两组,癌旁组织中含量明显高于慢性胃炎组织中的含量(均P<0.05);各组织中hPMS2 mRNA的相对含量分别是0.43±0.35,0.55±0.39,0.32±0.15,3组相比差异有统计学意义(F=3.349,均P=0.039),胃癌组织与癌旁组织中hPMS2mRNA的含量差异无统计学意义,但均高于慢性胃炎组织中的含量(均P<0.05).除hMLH1 mRNA含量在有、无淋巴结转移的胃癌组织中有显著差异(均P<0.05)外,在胃癌组织中hMLH1 mRNA及hPMS2 mRNA相对含量受肿瘤直径、浸润深度、淋巴结转移的影响不大(均P>0.05).结论:胃癌组织和癌旁组织与慢性胃炎组织相比存在hMLH1及hPMS2 mRNA转录差异,这种基因的转录差异可能与胃癌的发生有关,而与胃癌的发展关系不显著. 展开更多
关键词 HMLH1 MRNA hPMS2 MRNA 胃癌 DNA错配修复基因 实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应
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荧光定量RT-PCR快速检测乙型流感病毒核酸的价值分析 被引量:3
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作者 王瑾 《中国现代药物应用》 2020年第17期54-56,共3页
目的分析用荧光定量逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)快速检测乙型流感病毒核酸的临床价值。方法 104例乙型流感样患者作为研究对象,所有病例均采集咽拭子,均符合乙型流感的诊断标准。根据对乙型流感病毒检测方式的不同分为对照组和观察组... 目的分析用荧光定量逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)快速检测乙型流感病毒核酸的临床价值。方法 104例乙型流感样患者作为研究对象,所有病例均采集咽拭子,均符合乙型流感的诊断标准。根据对乙型流感病毒检测方式的不同分为对照组和观察组,每组52例。对照组采用免疫学检测,观察组采用荧光定量RT-PCR检测。对比两组的检测敏感性,检测时间。结果观察组的检测敏感性为98.08%,高于对照组的82.69%,差异具有统计学意义(P<0.05)。观察组的检测时间为(11.2±2.1)min,短于对照组的(17.5±2.4)min,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论荧光定量RT-PCR检测乙型流感病毒核酸可以明显提高对乙型流感病毒的检测敏感性,且检测时间短于免疫学检测,值得临床大力推广。 展开更多
关键词 荧光定量逆转录-聚合酶链式反应 快速检测 乙型流感病毒 价值分析
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肝癌患者血清中lncRNA HOTAIR表达与临床病理特征的相关性及诊断价值 被引量:1
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作者 郭冬萌 吴玉卓 《实用癌症杂志》 2023年第5期737-740,共4页
目的分析血清长链非编码RNA HOX转录反义RNA(IncRNA HOTAIR)在肝癌患者中的表达与临床诊断意义。方法选取100例肝癌患者为研究对象,并将其纳入肝癌组,另选取同期收治的80例肝硬化患者纳入肝硬化组,同时选取同期行体检的75例健康体检者... 目的分析血清长链非编码RNA HOX转录反义RNA(IncRNA HOTAIR)在肝癌患者中的表达与临床诊断意义。方法选取100例肝癌患者为研究对象,并将其纳入肝癌组,另选取同期收治的80例肝硬化患者纳入肝硬化组,同时选取同期行体检的75例健康体检者纳入对照组。采集3组5 ml静脉血,以实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测对比3组血清IncRNA HOTAIR相对表达量。同时,收集肝癌患者的年龄、性别等一般资料,分析血清IncRNA HOTAIR与其临床病理特征的关系;另外绘制受试者工作曲线(ROC),分析血清IncRNA HOTAIR在肝癌中的诊断效能。结果肝癌组的IncRNA HOTAIR相对表达量[(2.53±0.58)]高于肝硬化组[(0.81±0.25)]与对照组[(0.20±0.05)],差异有统计学意义(P<0.05)。IncRNA HOTAIR表达与肝癌患者的TNM分期、血管侵犯、肝外转移有关,差异有统计学意义(P<0.05);IncRNA HOTAIR表达与患者的年龄、性别、肿瘤数目无关,差异无统计学意义(P>0.05)。ROC结果显示:血清IncRNA HOTAIR诊断肝癌的AUC为0.901(95%CI:0.852~0.949),具有较高的诊断价值。结论肝癌患者血清内IncRNA HOTAIR呈高表达,其表达水平与患者TNM分期、血管侵犯、肝外转移相关,可能参与肝癌的发生、发展,在肝癌中具有较高的临床诊断意义。 展开更多
关键词 肝癌 实时荧光定量逆转录聚合酶链反应 相对表达量
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阿龙山病毒及松岭病毒多重实时荧光定量RT-PCR快速检测方法的建立
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作者 李德 殷启凯 +10 位作者 侯泽英 王瑞晨 张维嘉 付士红 何英 聂凯 梁国栋 许松涛 李樊 李兴洲 王环宇 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2024年第1期74-78,共5页
目的 建立一种多重实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(多重实时qRT-PCR)法,用于阿龙山病毒(Alongshan virus,ALSV)及松岭病毒(Songling virus,SGLV)核酸的快速检测。方法 针对ALSV NS 3基因和SGLV S基因保守区设计特异性引物及TaqMan探... 目的 建立一种多重实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(多重实时qRT-PCR)法,用于阿龙山病毒(Alongshan virus,ALSV)及松岭病毒(Songling virus,SGLV)核酸的快速检测。方法 针对ALSV NS 3基因和SGLV S基因保守区设计特异性引物及TaqMan探针,建立针对2种病毒的多重实时qRT-PCR检测方法,评价方法的特异性、灵敏度和重复性,并应用蜱标本对该方法进行应用评价。结果 该检测方法与森林脑炎病毒等其他6种虫媒病毒无交叉反应,灵敏度达1×101拷贝/μl,重复性检测的循环阈值(Ct)变异系数均<2.00%;运用该方法,从2019年黑龙江省采集的30组蜱标本中检出2组ALSV阳性,1组SGLV阳性。经验证,该方法与普通PCR方法检测结果的一致性为100%。结论 建立了敏感性高、特异性好的ALSV和SGLV多重实时qRT-PCR快速检测方法。 展开更多
关键词 阿龙山病毒 松岭病毒 多重实时荧光定量反转录聚合酶链式反应 核酸检测
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miRNA-647在乳腺癌中的作用研究
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作者 高宇 金春明 +3 位作者 邓梦 丁鑫哲 张航 徐春艳 《中国医药科学》 2023年第9期42-45,共4页
目的探讨miRNA-647(miR-647)在乳腺癌(BC)发展中的作用。通过对BC组织和BC细胞两方面验证miR-647在BC中表达情况和作用研究。方法运用实时荧光定量聚合酶反应(qRT-PCR)对miR-647在BC组织及其细胞系中的表达水平进行测定分析。然后为进... 目的探讨miRNA-647(miR-647)在乳腺癌(BC)发展中的作用。通过对BC组织和BC细胞两方面验证miR-647在BC中表达情况和作用研究。方法运用实时荧光定量聚合酶反应(qRT-PCR)对miR-647在BC组织及其细胞系中的表达水平进行测定分析。然后为进一步研究miR-647对BC细胞生物学作用,通过细胞计数试剂盒-8实验(CCK-8)、细胞划痕实验对细胞增殖和迁移能力进行分析,同时采用流式细胞术对过表达的miR-647影响细胞增殖和凋亡程度进行测定。结果BC组织中miR-647表达水平低于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。miR-647在BC细胞系中表达水平显著低于正常细胞系,并且在MCF-7中表达最少,差异有统计学意义(P<0.05)。miR-647过表达显著抑制了BC细胞增殖能力、迁移能力,并且促进凋亡,差异有统计学意义(P<0.05)。结论miR-647在乳腺癌中异常表达并且抑制BC细胞的恶性特征,在BC进程中发挥作用。 展开更多
关键词 乳腺癌 miR-647 实时荧光定量聚合酶反应 凋亡
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碳青霉烯类抗生素耐药铜绿假单胞菌外排泵和外膜孔蛋白表达水平的研究 被引量:12
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作者 李红玲 廖康 +2 位作者 陈亚岗 俞云松 李兰娟 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2008年第6期414-418,共5页
目的探讨我国临床分离的碳青霉烯类抗生素耐药铜绿假单胞菌外排泵MexAB-OprM和外膜孔蛋白OprD2表达水平及其与碳青霉烯类抗生素耐药性之间的关系。方法收集我国15个省市28所医院临床分离的铜绿假单胞菌655株,琼脂稀释法测定该菌加入外... 目的探讨我国临床分离的碳青霉烯类抗生素耐药铜绿假单胞菌外排泵MexAB-OprM和外膜孔蛋白OprD2表达水平及其与碳青霉烯类抗生素耐药性之间的关系。方法收集我国15个省市28所医院临床分离的铜绿假单胞菌655株,琼脂稀释法测定该菌加入外排泵抑制剂羟基氰氯苯腙(CCCP)前后对亚胺培南和美罗培南的MIC;RT-PCR检测外排泵MexAB-OprM和孔蛋白OprD2的表达水平;十二烷基硫酸钠-聚丙酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和蛋白印迹(Western-blot)检测外膜孔蛋白OprD2。结果收集到的655株铜绿假单胞菌菌株对亚胺培南和美罗培南敏感率分别为52.5%和59.2%,加入CCCP前后其对亚胺培南和美罗培南的敏感率无明显变化;52.0%(51/98)美罗培南耐药株MexAB-OprM显著高表达(P<0.05),43.7%(59/135)亚胺培南耐药株OprD2显著低表达(P<0.05),14.8%(20/135)亚胺培南耐药株OprD2表达缺失;SDS-PAGE和Western-blot显示与标准菌株PAO1相比,OprD2表达水平减低菌株ZZ20显影减低,表达缺失菌株BJ1不显影。结论MexAB-OprM表达升高和OprD2表达降低甚至缺失是我国铜绿假单胞菌对美罗培南和亚胺培南耐药的重要机制。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 外排泵 外膜孔蛋白 羟基氰氯苯腙 实时荧光定量反转录聚合酶链反应
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“荧光定量PCR溶解曲线法”监测人TCRβ链CDR3谱系漂移技术的建立 被引量:9
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作者 马锐 罗荣 +1 位作者 孙万邦 姚新生 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期446-451,共6页
目的建立"荧光定量PCR溶解曲线分析技术"监测人外周血T细胞TCRβ链CDR3谱系漂移(单/寡/多克隆增生)。方法提取4例正常人、9例大肠癌患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell-PBMC)中的总RNA,逆转录成cDNA,以2... 目的建立"荧光定量PCR溶解曲线分析技术"监测人外周血T细胞TCRβ链CDR3谱系漂移(单/寡/多克隆增生)。方法提取4例正常人、9例大肠癌患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell-PBMC)中的总RNA,逆转录成cDNA,以26个人TRBV基因家族设计上游引物,共同的TRBC基因设计下游引物,荧光定量PCR(FQ-PCR)扩增26个TRBV基因各家族CDR3谱系,溶解曲线法分析各家族CDR3谱系的单/寡/多克隆增生。结果正常人外周血T细胞TCRβ链26个家族CDR3表达频率不一致,各家族PCR产物的"溶解曲线谱型图"(melting curve spectratyping)呈现溶点不同的CDR3多态性,为多克隆增生的高斯分布;9例大肠癌患者的外周血TCRβ链CDR3谱系的26个家族CDR3表达频率不一致,有的患者部分家族呈缺失状态,患者各家族PCR产物的"溶解曲线谱型图"上,多数家族为多克隆增生的高斯分布,但每个患者均出现数量不等的单克隆和寡克隆增生家族。结论"荧光定量PCR溶解曲线分析TCR CDR3谱系漂移技术",方法稳定简便,能较好的监测正常人和临床样本外周血T细胞TCRβ链CDR3谱系漂移(单/寡/多克隆增生)。 展开更多
关键词 T淋巴细胞受体 互补决定区3 荧光定量PCR 溶解曲线
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应用反转录PCR和实时荧光定量PCR技术判定现场物证生物属性 被引量:3
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作者 许炎 张晨 +5 位作者 徐庆文 黄江平 刘亚楠 邹凯南 平原 周怀谷 《法医学杂志》 CAS CSCD 2013年第4期259-262,共4页
目的探寻分子生物学方法判定刑事案件现场物证的生物属性的可行性。方法取30份现场生物检材,其中血液(斑)、唾液(斑)、精液(斑)各10份,分别进行常规检验法和分子生物学方法,通过DNA-RNA共提取技术,将其中的mRNA运用反转录PCR(reverse tr... 目的探寻分子生物学方法判定刑事案件现场物证的生物属性的可行性。方法取30份现场生物检材,其中血液(斑)、唾液(斑)、精液(斑)各10份,分别进行常规检验法和分子生物学方法,通过DNA-RNA共提取技术,将其中的mRNA运用反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)技术反转录成cDNA,根据3种生物检材不同的目标基因设计3对特异性引物,进行实时荧光定量PCR扩增,通过熔解曲线测定不同的熔解温度(Tm)和不同长度的扩增片段来区分生物检材。结果血液(斑)的Tm值为(84.5±0.2)℃,片段长度177 bp;唾液(斑)的Tm值为(76.9±0.3)℃,片段长度134 bp;精液(斑)的Tm值为(88.5±0.2)℃,片段长度294 bp。结论与常规检验法比较,联合应用RT-PCR和实时荧光定量PCR技术判定检材的生物属性特异性强、灵敏度高、结果稳定可靠,可应用于日常法医物证检验。 展开更多
关键词 法医遗传学 反转录PCR 实时荧光定量PCR 血液 唾液 精液
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实时荧光定量PCR检测结直肠腺癌患者组织中广泛型线粒体肌酸激酶基因的表达 被引量:4
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作者 钱琤 于嘉屏 +3 位作者 王爱华 顾鹏飞 邓安梅 仲人前 《现代检验医学杂志》 CAS 2008年第2期6-8,共3页
目的建立检测人广泛型线粒体肌酸激酶(ubiquitous mitochondrial creatine kinase,uMtCk)mRNA荧光定量的方法,并检测了结直肠腺癌病人肿瘤组织和癌旁组织中uMtCk基因表达的水平。方法基于TaqMan荧光探针技术,以GAPDH作为内参,建... 目的建立检测人广泛型线粒体肌酸激酶(ubiquitous mitochondrial creatine kinase,uMtCk)mRNA荧光定量的方法,并检测了结直肠腺癌病人肿瘤组织和癌旁组织中uMtCk基因表达的水平。方法基于TaqMan荧光探针技术,以GAPDH作为内参,建立实时荧光定量RT-PCR方法,并检测了30名结直肠腺癌病人肿瘤组织和癌旁组织uMtCk mRNA的表达。结果30倒结直肠肿瘤患者肿瘤组织中有uMtCk mRNA的表达,范围为7.4×10^5-5.3×10^8拷见/μg RNA,均值为(9.4±5.7)×10^6拷贝/μg RNA;30例癌旁组织uMtCk表达为4.5×10^3-6.9×10^5拷贝/μg RNA,均值为(8.6±3.4)×10^4拷贝/μg RNA。结论成功地建立了人uMtCk基因表达含量的荧光定量检测方法,检测结果可用绝对拷贝数表示,定量准确可靠。且结直肠腺癌病人肿瘤组织uMtCk mRNA的含量是升高的,提示uMtCk mRNA含量的检测有助于结直肠腺癌病人临床诊断。 展开更多
关键词 广泛型线粒体肌酸激酶 荧光定量反转录 聚合酶链反应 结直肠腺癌
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