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水曲柳结构域重新甲基化酶DRM基因片段的克隆及同源性分析
被引量:
1
1
作者
曾凡锁
梁楠松
+1 位作者
王璇
詹亚光
《安徽农业科学》
CAS
2013年第24期9934-9937,9950,共5页
[目的]克隆并分析水曲柳结构域重新甲基化酶(DRM)基因片段。[方法]根据GenBank上已发表的DRM氨基酸序列,采取CODEHOP方法设计合成1对简并引物,采用RT-PCR技术对水曲柳DRM基因进行扩增,将PCR产物与pMD 18-T连接后转化至E.coli JM109感受...
[目的]克隆并分析水曲柳结构域重新甲基化酶(DRM)基因片段。[方法]根据GenBank上已发表的DRM氨基酸序列,采取CODEHOP方法设计合成1对简并引物,采用RT-PCR技术对水曲柳DRM基因进行扩增,将PCR产物与pMD 18-T连接后转化至E.coli JM109感受态细胞,检测阳性克隆,测序并进行序列分析。[结果]克隆得到的DRM基因cDNA序列长802 bp,由267个氨基酸残基组成,命名为FmadrmA。序列比对表明FmadrmA与参考的12个物种的DRM在氨基酸水平上表现出较高的同源性,其与山葡萄、番茄、黄瓜、野草莓、大豆、苜蓿、玉米、烟草、拟南芥、毛果杨、水稻和乌拉尔图小麦的DRM同源性分别为61%、54%、51%、50%、60%、48%、43%、44%、37%、42%、42%和39%。系统进化树分析表明同源的DRM蛋白可大致聚为3类,而水曲柳与其他植物的亲缘关系较远。[结论]该试验成功获得了水曲柳FmadrmA基因片段,并对其进行了同源性分析,为进一步研究结构域重新甲基化酶基因及分析其表达特性奠定了基础。
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关键词
水曲柳
fmadrma
基因克隆
序列分析
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职称材料
题名
水曲柳结构域重新甲基化酶DRM基因片段的克隆及同源性分析
被引量:
1
1
作者
曾凡锁
梁楠松
王璇
詹亚光
机构
东北林业大学生命科学学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2013年第24期9934-9937,9950,共5页
基金
国家科技计划课题(2012BAD21B0201-07)
国家自然科学基金(31270697)
文摘
[目的]克隆并分析水曲柳结构域重新甲基化酶(DRM)基因片段。[方法]根据GenBank上已发表的DRM氨基酸序列,采取CODEHOP方法设计合成1对简并引物,采用RT-PCR技术对水曲柳DRM基因进行扩增,将PCR产物与pMD 18-T连接后转化至E.coli JM109感受态细胞,检测阳性克隆,测序并进行序列分析。[结果]克隆得到的DRM基因cDNA序列长802 bp,由267个氨基酸残基组成,命名为FmadrmA。序列比对表明FmadrmA与参考的12个物种的DRM在氨基酸水平上表现出较高的同源性,其与山葡萄、番茄、黄瓜、野草莓、大豆、苜蓿、玉米、烟草、拟南芥、毛果杨、水稻和乌拉尔图小麦的DRM同源性分别为61%、54%、51%、50%、60%、48%、43%、44%、37%、42%、42%和39%。系统进化树分析表明同源的DRM蛋白可大致聚为3类,而水曲柳与其他植物的亲缘关系较远。[结论]该试验成功获得了水曲柳FmadrmA基因片段,并对其进行了同源性分析,为进一步研究结构域重新甲基化酶基因及分析其表达特性奠定了基础。
关键词
水曲柳
fmadrma
基因克隆
序列分析
Keywords
Fraxinus mandshurfca
fmadrma
Gene cloning
Sequence analysis
分类号
S979.212 [农业科学—捕捞与储运]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水曲柳结构域重新甲基化酶DRM基因片段的克隆及同源性分析
曾凡锁
梁楠松
王璇
詹亚光
《安徽农业科学》
CAS
2013
1
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