佝偻病患儿维生素D受体基因BsmI和FokI位点多态性与骨密度相关性研究

目的分析佝偻病患儿维生素D受体(VDR)基因Bsml和Fokl位点多态性与骨密度(BMD)的相关性。方法选取2017年1—12月于烟台市烟台山医院儿科就诊的佝偻病患儿50例作为研究组,另选择同期在医院体检的健康婴儿50例作为健康对照组,采用聚合酶链反应(PCR)和基因测序法检测VDR基因BsmI和FokI位点多态性,采用BMD-1000A超声波骨密度仪检测左胫骨中段骨密度,自动生化分析仪检测血清钙和磷,酶联免疫法检测血清25-(OH)D3水平,采用全血干化学法检测骨碱性磷酸酶(B-ALP)。结果研究组血钙、骨密度以及25-(OH)D3明显低于健康对照组,而血磷和B-ALP明显高于健康对照组,差异具有统计学意义(t/P=6. 578/0. 000,8. 489/0. 000,4.489/0.000,2.936/0.004,5.358/0.000);研究组和健康对照组在FokI位点上的基因型ff、Ff以及FF差异具有统计学意义(χ2=6.979,P=0.031),而在BsmI位点上基因型BB和bb+Bb分布上无统计学意义(χ2=0. 102,P=0.749);FokI位点携带FF基因型个体的佝偻病发生风险高于携带ff+Ff基因型个体,差异具有统计学意义(OR=3.918,95%CI 1. 174~8.918,P=0.045),而BsmI位点基因型BB与bb+Bb个体相比,佝偻病发病风险差异无统计学意义(P>0.05);2组骨密度和25-(OH)D3在不同基因型个体间差异均具有统计学意义(P<0.05),而不同基因型间血钙、血磷以及B-ALP差异无统计学意义(P>0.05)。两两比较结果显示FF基因型个体骨密度和25-(OH)D3水平均明显低于携带Ff和ff基因型个体(P<0.05)。结论婴幼儿佝偻病VDR基因FokI位点多态性与骨密度、25-(OH)D3水平密切相关,FF基因型可能是佝偻病发生的遗传危险因素。

孕妇VDR基因FokI位点多态性与胎儿孤立性股骨短小的相关性

目的:研究孕妇VDR基因FokI位点多态性与胎儿孤立性股骨短小的相关性。方法:选取2018年6月至2020年1月在温州市中心医院产检的120例胎儿孤立性股骨短小的孕妇作为观察组,随机选取120例产检无异常的孕妇作为对照组。PCR-焦磷酸测序法检测孕妇VDR基因FokI位点多态性。ELISA法检测孕妇血清及新生儿脐血25-羟维生素D水平。分析孕妇VDR基因FokI位点多态性与胎儿孤立性股骨短小的相关性。结果:观察组VDR基因FokI位点TT基因型37例,孕妇及新生儿脐血25-羟维生素D分别为(35.14±11.89)nmol/L和(35.42±11.78)nmol/L;TC型63例,孕妇及新生儿脐血25-羟维生素D分别为(43.28±14.00)nmol/L和(45.71±13.67)nmol/L;CC型20例,孕妇及新生儿脐血25-羟维生素D分别为(55.14±13.71)nmol/L和(55.85±16.07)nmol/L。对照组VDR基因FokI位点TT基因型28例,孕妇及新生儿脐血25-羟维生素D分别为(36.00±9.67)nmol/L和(38.71±9.57)nmol/L;TC型57例,孕妇及新生儿脐血25-羟维生素D分别为(44.57±10.73)nmol/L和(47.71±13.27)nmol/L;CC型35例,孕妇及新生儿脐血25-羟维生素D分别为(54.00±8.58)nmol/L和(57.57±10.17)nmol/L(P<0.05)。观察组携带T等位基因的比例(83.33%)大于对照组(70.83%)(P<0.05)。结论:孕妇VDR基因FokI位点多态性与胎儿孤立性股骨短小有一定的相关性,VDR基因FokI位点T基因可能是孤立性股骨短小发生的易感因素。

草鱼基因组随机扩增多态性引物及多态性位点的筛选

为了建立草鱼基因组DNA多态性分析的指标体系,应用RAPD技术,从180条10碱基随机引物中筛选出了31条能扩增出多态性DNA片段的引物。用这31条多态性引物共扩增出了327条重复性好、带型清晰、分辨率高的谱带。扩增产物的片段大小范围在400—2000 bp之间。单一引物扩增条带为5—14条。用这些多态性引物在草鱼基因组DNA中检测到了93个多态性位点,并对这些多态性位点上的等位基因频率进行了统计分析。这31条多态性引物和所检测到的93个多态性位点初步为草鱼基因组的多态性分析提供了可靠的分析指标体系。

婴儿粪便长双歧杆菌的分离与多样性分析

本研究旨在分析婴儿粪便长双歧杆菌的多样性,采用改良MRS培养基从哈尔滨地区健康婴儿粪便中分离双歧杆菌,采用生理生化实验结合16S rDNA和热应激蛋白60基因(heat-shock protein 60,hsp60)同源性分析鉴定分离株,利用同源性分析及随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphism DNA,RAPD)、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术进一步分析长双歧杆菌多态性。实验从11个婴儿体内分离得到18株厌氧的细菌菌株,经形态学分析、生理生化实验、16S rDNA测序及hsp60测序实验发现,其中7株为长双歧杆菌长亚种,3株为长双歧杆菌婴儿亚种。RAPD和MLST结果表明:7株长双歧杆菌长亚种为6个基因型,3株长双歧杆菌婴儿亚种为2个基因型,上述结果说明不同人源婴儿粪便长双歧杆菌基因型差异较大。

RAPD标记在中国对虾Fenneropenaeus chinensis单对交配亲本及其子一代的分离方式

利用RAPD标记对中国对虾单对交配亲本及其子一代(全同胞家系)的分离方式进行了研究。100个RAPD随机引物扩增结果的统计分析表明，标记在F1代的分离方式可归为3类，即符合孟德尔遗传比例、偏离孟德尔遗传比例和异常分离。符合孟德尔遗传的情况又包括：不分离，亲本均有而在子代不分离的标记(代表了亲本基因型的3种组合：AA×AA、AA×Aa、Aa×AA)和亲本中呈多态而在子代中不分离的标记(代表了亲本基因型的2种组合：AA×aa、aa×AA)；亲本中呈多态而在子代中1：1分离(代表了亲本基因型的2种组合：Aa×aa、aa×Aa)；亲本均有而在子代中3：1分离(代表了亲本基因型的1种组合：Aa×Aa)。偏分离的标记包括，亲本中呈多态而在子代中偏离1：1分离的标记和亲本均有而在子代中偏离3：1分离的标记。异常分离的标记为在F1代出现双亲均不具备的标记。3种分离位点出现的频率分别为89．3％，7．4％和2．8％。其中呈1：1和3：1孟德尔分离规律的位点占分离位点总数的69．5％。母本特有标记和父本特有标记中符合孟德尔分离(1：1)分别占分离位点总数的27．8％和19．5％。本研究结果证明RAPD标记结合“双假测交构想”构建中国对虾遗传连锁图谱的可行性。

褐沙蒿遗传分化的研究

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法,对5个褐沙蒿(ArtemisiaintramongolicaH.C.Fu)种群的遗传分化进行了研究.结果表明,15个引物共扩增出283个位点,其中多态位点有269个,多态位点百分率达95.1%.各种群的多态位点百分率较高,在84.1%～89.0%之间,除正镶白旗种群略高外,其他均比较接近.各种群间有一定的遗传分化,基因分化系数Gst=0.1204,表明87.96%的遗传变异存在于种群内.基因流N m=3.6524>1,说明褐沙蒿种群间存在着广泛的基因交流.聚类分析显示,褐沙蒿种群之间的遗传距离与地理距离有一定的相关性.

利用RAPD研究桂林桂花品种间的亲缘关系(英文)

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,从100个随机引物中筛选出扩增效果较好的20个引物,分 析桂林市23个桂花品种的基因组多态性。20个随机引物共检测到193个位点,其中多态位点114个,占 59.1%。并进行了聚类分析,构建出树状聚类图,将这些品种划分为4个品种群,与传统分类学结果一致。结 果表明,以基因型而不是以表现型为基础,分析桂花品种间的区别是可能的。该技术为解决桂林市的桂花品 种分类问题提供了重要依据。