非小细胞肺癌矮小同源盒基因2和Ras相关结构域蛋白家族1A基因甲基化的意义

目的:探究矮小同源盒基因(SHOX2)和Ras相关结构域蛋白家族1A(RASSF1A)基因甲基化与非小细胞肺癌(NSCLC)浸润、转移的关系。方法:采用甲基化特异性PCR法(MSP)分析NSCLC及其相应癌旁组织中SHOX2和RASSF1A基因启动子区甲基化状态,分析其甲基化状态与患者临床病理特征的关系。结果:NSCLC癌组织中SHOX2和RASSF1A基因启动子区甲基化率分别为68.97%(80/116)、33.62%(39/116),明显高于癌旁正常组织中的12.93%(15/116)、10.34%(12/116)(P<0.05);SHOX2和RASSF1A基因甲基化分布情况与NSCLC患者性别、年龄、吸烟史、肿瘤直径、分化程度无关(P>0.05),与其TNM分期、病理分型、淋巴结转移以及患者生存时间有关(P<0.05),TNM分期中Ⅲa+Ⅲb期患者SHOX2基因甲基化率明显高于Ⅰ+Ⅱ期患者(P<0.05),鳞癌患者基因甲基化率明显高于腺癌患者(P<0.05),有淋巴结转移患者基因甲基化率明显高于无淋巴结转移患者(P<0.05),生存时间<2年患者基因甲基化率明显高于生存时间≥2年患者(P<0.05);TNM分期中Ⅲa+Ⅲb期患者RASSF1A基因甲基化率明显高于Ⅰ+Ⅱ期患者(P<0.05),腺癌患者基因甲基化率明显高于鳞癌患者(P<0.05),有淋巴结转移患者基因甲基化率明显高于无淋巴结转移患者(P<0.05),生存时间<2年患者基因甲基化率明显高于生存时间≥2年患者(P<0.05)。结论:SHOX2和RASSF1A基因启动子区甲基化可能是NSCLC发生浸润以及转移的原因之一,检测SHOX2和RASSF1A基因启动子区甲基化可为NSCLC的诊断及预后评估提供参考价值。

联合SHOX2、RASSF1A及CEA构建的列线图模型对肺癌发生的预测价值

目的 联合矮小同源盒基因2(Short stature homeobox gene 2,SHOX2)、RAS相关结构域家族1亚型A(RAS association domain family 1,isoform A,RASSF1A)及癌胚抗原(Carcinoembryonic antigen,CEA)构建预测肺癌发生的列线图模型,并确定该模型的预测价值。方法 选择2020年1月至2022年12月在新疆医科大学第一附属医院就诊的88例肺癌患者及肺良性肿瘤患者219名。比较两组患者的人口统计学和临床特征信息以及支气管肺泡灌洗液(Bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中SHOX2和RASSF1A基因的甲基化水平。进行单因素分析及多因素Logistic回归分析筛选出影响肺癌发生的变量构建列线图,并评估其预测效能。结果 肺癌患者中SHOX2阳性36例(41.4%),RASSF1A阳性30例(34.5%)。肺癌患者CEA、细胞角蛋白19片段(Cytokeratin 19 fragment,CYFRA21-1)、鳞状上皮细胞癌抗原(Squamous cell carcinoma antigen,SCCA)、胃泌素释放肽前体(Pro-gastrinreleasing peptide,Pro-GRP)水平与肺良性肿瘤患者比较差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析显示,SHOX2、RASSF1A和CEA为肺癌发生的独立危险因素(P<0.05),基于上述独立风险因素所构建的列线图模型显示出良好的区分能力(AUC=0.926),具有较好的一致性且获益良好。结论 联合SHOX2、RASSF1A和CEA构建的列线图模型对肺癌发生具有较高的预测价值,可为肺癌的早期诊断提供依据。

基于TCGA数据库分析FHOD1在结肠腺癌中表达的诊断及预后评估价值

目的基于癌症基因图谱(TCGA)数据库分析Formin家族同源结构域1基因(FHOD1)在结肠腺癌(COAD)组织中的表达水平及其对COAD患者的诊断及预后评估价值。方法以TCGA数据库为发现数据库(检索时间段为2006年1月1日至2021年2月1日),以基因表达谱数据动态分析(GEPIA)数据库为外部验证的数据库。使用R软件(3.6.3版本)下载TCGA数据库中COAD level 3 HTSeq-FPKM格式的RNAseq数据库并进行基因ID转换,罗列所有患者的FHOD1的表达数据及对应的临床病理资料。绘制散点图进行FHOD1在COAD组织和癌旁正常组织中的差异化表达分析;绘制受试者工作特性曲线研究FHOD1表达对COAD的诊断价值;检索GEPIA数据库并绘制生存曲线,分析FHOD1表达与COAD患者生存时间的关系;采用单因素与多因素Cox回归模型分析临床参数与COAD预后的关系。结果COAD组织中FHOD1 mRNA的表达量显著高于癌旁正常组织中的表达量(17.76±6.84 vs 11.51±3.27),差异有统计学意义(P<0.05);受试者工作特性曲线分析结果表明,FHOD1对COAD有较好的诊断价值(曲线下面积=0.7835,95%可信区间=0.7307~0.8363,P<0.0001);在分析FHOD1表达与COAD临床病理特征时发现,FHOD1的高表达与COAD的淋巴结转移密切相关(P<0.05);GEPIA数据库检测了FHOD1与COAD患者的预后关系,结果显示FHOD1的高表达与COAD患者较低的总体生存率(OS)密切相关(P<0.05);单因素分析结果显示M分期、TNM分期是COAD患者OS的独立预后因素(P<0.05);多因素Cox比例回归风险模型结果显示,年龄、TNM分期及FHOD1高表达是COAD患者OS的独立预后因素(P<0.05)。结论FHOD1在COAD组织中高表达,并有潜力成为结肠癌诊断和预后评估的新型生物学标志物。

叉头转录因子-1在神经系统疾病的相关研究

叉头（FOx）转录因子是2000年命名的一个新的蛋白质家族，其中研究最深入的是。亚家族（FoxO）。FoxO是长寿基因DAF．16（DauerFormation-16）在哺乳动物中最相近的同源基因，而DAF．16最早发现于秀丽隐形线虫。FoxO蛋白因其特色的“又头框”DNA结合结构域而命名。

脓毒症急性肺损伤患者RhoA/ROCK1和NF-κB/NLRP3信号通路及其下游信号分子的变化

目的 分析Ras同源基因家族成员A(RhoA)/Rho激酶1(ROCK1)、核因子κB(NF-κB)/核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRP3)信号通路及其下游信号分子在脓毒症患者急性肺损伤(ALI)中的变化。方法 回顾性分析海口市第四人民医院2018年1月-2020年12月122例脓毒症患者临床资料,其中41例并发ALI(ALI组),81例无ALI(非ALI组),并纳入32名健康体检者作为对照组。脓毒症患者均于入院24 h内收集外周静脉血标本,对照组则收集体检当日外周静脉血。比较3组外周血单个核细胞(PBMCs)NF-κB、NLRP3信使核糖核酸(mRNA)表达水平,并记录NF-κB/NLRP3信号通路上游基因(RhoA、ROCK1)、下游基因[半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶-1(caspase-1)]mRNA表达水平及下游炎症因子[白细胞介素-1β(IL-1β)、IL-18];根据肺损伤预测评分(LIPS)将41例并发ALI的脓毒症患者分为LIPS≥7分组,LIPS<7分组,比较两组上述基因mRNA、炎症因子水平,并评估脓毒症并发ALI患者LIPS评分与上述基因mRNA、炎症因子表达水平的相关性。结果 ALI组LIPS评分高于非ALI组(P<0.05)。ALI组与非ALI组PBMCs NF-κB、NLRP3、RhoA、ROCK1、caspase-1 mRNA相对表达水平及血清IL-1β、IL-18高于对照组(P<0.05),ALI组高于非ALI组(P<0.05)。脓毒症并发ALI患者中,LIPS≥7分组PBMCs NF-κB、NLRP3、RhoA、ROCK1、caspase-1 mRNA相对表达水平及血清IL-1β、IL-18高于LIPS<7分组(P<0.05);Pearson相关性分析显示,LIPS评分与上述各基因mRNA及炎症因子均呈正相关(r=0.389、0.472、0.511、0.539、0.518、0.469、0.457,P均<0.05)。结论 Rho/ROCK、NF-κB/NLRP3信号通路及其下游信号分子可能共同参与了脓毒症ALI的发生发展,临床可针对该发生机制探寻治疗新方向。