目的:通过网络药理学方法研究扶正化瘀降浊通络方治疗慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)的药效成分、作用靶点及信号通路,拟阐明其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharm...目的:通过网络药理学方法研究扶正化瘀降浊通络方治疗慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)的药效成分、作用靶点及信号通路,拟阐明其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)等数据库和文献挖掘获取扶正化瘀降浊通络方组方中药的活性成分,利用Pharmmapper筛选化学成分潜在靶点;在GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)检索CRF相关靶点。将扶正化瘀降浊通络方活性成分相关靶点与CRF靶点上传Venny 2.1.0平台进行映射,交集靶点即为扶正化瘀降浊通络方治疗CRF的潜在靶点,并绘制靶点韦恩图。将潜在靶点导入STRING数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络并分析。使用Cytoscape等软件构建“药物-成分-靶点”网络并筛选核心成分。借助DAVID数据库对靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。利用Cytoscape 3.7.2软件构建“信号通路-靶点”网络及“药物-核心成分-核心靶点-信号通路”网络。结果:通过TCMSP数据库筛选得到316个活性成分及相关靶点2263个,通过Genecards、OMIM获得7806个CRF靶点,将二者进行映射筛选出潜在靶点635个。PPI网络分析筛选得到20个核心靶点。GO富集分析共涉及506个条目,包含分子功能98项,细胞成分50项,生物过程358项。KEGG富集分析得到105条信号通路。结论:蒽醌类、黄酮类等成分可能是关键药效成分,可通过调节磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)、转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)等通路减少细胞凋亡、抑制细胞外基质合成,延缓肾脏纤维化。展开更多
文摘目的:通过网络药理学方法研究扶正化瘀降浊通络方治疗慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)的药效成分、作用靶点及信号通路,拟阐明其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)等数据库和文献挖掘获取扶正化瘀降浊通络方组方中药的活性成分,利用Pharmmapper筛选化学成分潜在靶点;在GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)检索CRF相关靶点。将扶正化瘀降浊通络方活性成分相关靶点与CRF靶点上传Venny 2.1.0平台进行映射,交集靶点即为扶正化瘀降浊通络方治疗CRF的潜在靶点,并绘制靶点韦恩图。将潜在靶点导入STRING数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络并分析。使用Cytoscape等软件构建“药物-成分-靶点”网络并筛选核心成分。借助DAVID数据库对靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。利用Cytoscape 3.7.2软件构建“信号通路-靶点”网络及“药物-核心成分-核心靶点-信号通路”网络。结果:通过TCMSP数据库筛选得到316个活性成分及相关靶点2263个,通过Genecards、OMIM获得7806个CRF靶点,将二者进行映射筛选出潜在靶点635个。PPI网络分析筛选得到20个核心靶点。GO富集分析共涉及506个条目,包含分子功能98项,细胞成分50项,生物过程358项。KEGG富集分析得到105条信号通路。结论:蒽醌类、黄酮类等成分可能是关键药效成分,可通过调节磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)、转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)等通路减少细胞凋亡、抑制细胞外基质合成,延缓肾脏纤维化。