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草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析
被引量:
12
1
作者
刘建成
段可
+3 位作者
李静
叶正文
苏建宇
高清华
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期1025-1031,共7页
利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异...
利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1893bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表汰佃存摹套分年组织中表达水平最高,日存叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响.
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关键词
草莓
NBS—LRR基因
同源克隆
基因结构
进化树
RT—PCR
下载PDF
职称材料
‘红颜’草莓体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族转录因子的表达分析及FaEREBP基因的克隆
被引量:
3
2
作者
高利梅
候羽
+1 位作者
姚允聪
姬谦龙
《北京农学院学报》
2015年第4期15-19,共5页
【目的】筛选并克隆‘红颜’草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.‘Benihopp’)体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族特异性表达的基因,以期为草莓体细胞胚发生的分子调控机理研究提供理论依据。【方法】以‘红颜’草莓非胚性愈伤组织、...
【目的】筛选并克隆‘红颜’草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.‘Benihopp’)体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族特异性表达的基因,以期为草莓体细胞胚发生的分子调控机理研究提供理论依据。【方法】以‘红颜’草莓非胚性愈伤组织、胚性愈伤组织以及体细胞胚为试验材料,应用RNA-seq测序技术,筛选出差异表达的AP2/EREBP转录因子,并通过qRT-PCR技术,检测上调转录因子在非胚性愈伤组织、胚性愈伤组织、体细胞胚以及幼苗根、茎、叶等组织中的表达量,以同源克隆技术获得特异性表达的转录因子FaEREBP。【结果】FaEREBP编码区核苷酸序列全长822bp,编码273个氨基酸,其表达水平在胚性愈伤组织和体细胞胚中显著高于其他组织。【结论】FaEREBP是‘红颜’草莓体细胞胚发生潜在的重要转录因子。
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关键词
'红颜’草莓
体细胞胚
RNA-SEQ
AP2/EREBP
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职称材料
灌溉方式对草莓光合特性和根系生长的影响
被引量:
8
3
作者
钱小琴
聂凡
+3 位作者
蔡永萍
盛新颖
聂敬全
洪萨丽
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2009年第13期113-118,共6页
以草莓丰香为材料,探讨三种灌溉方式(沟灌、滴灌、滴灌+半基质)对粘性土壤条件下草莓产量、光合生理指标和根系生长的影响。结果表明:与沟灌相比,滴灌+半基质方式和滴灌方式均能促进草莓的生长和增加其产量,单株产量分别增加36.89%和29....
以草莓丰香为材料,探讨三种灌溉方式(沟灌、滴灌、滴灌+半基质)对粘性土壤条件下草莓产量、光合生理指标和根系生长的影响。结果表明:与沟灌相比,滴灌+半基质方式和滴灌方式均能促进草莓的生长和增加其产量,单株产量分别增加36.89%和29.30%,开花期草莓叶片光合速率提高了41.56%和34.46%;在结果期,水分利用率提高了28.69%和24.65%,根冠比提高了51.78%和29.28%;滴灌+半基质方式和滴灌方式更有利于根系生长,开花期根体积提高了164.25%和78.72%、根鲜重提高了117.18%和84.07%、结果期根系活力提高了70.98%和48.38%;滴灌+半基质栽培灌溉方式是一种适宜粘性土壤草莓的灌溉方式。
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关键词
草莓丰香
灌溉模式
产量根系
光合特性
水分利用率
下载PDF
职称材料
题名
草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析
被引量:
12
1
作者
刘建成
段可
李静
叶正文
苏建宇
高清华
机构
宁夏大学生命科学学院
上海市农业科学院生物技术研究所
上海市农业科学院林木果树研究所
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期1025-1031,共7页
基金
上海农科院科技发展基金项目(农科发2008(02))
上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2008)第1-4号)
上海市科委自然科学基金项目(10ZR1426700),上海市科委青年科技启明星计划(09QA1405300)
文摘
利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1893bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表汰佃存摹套分年组织中表达水平最高,日存叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响.
关键词
草莓
NBS—LRR基因
同源克隆
基因结构
进化树
RT—PCR
Keywords
fragaria×
ananassa
duch.
cv.
Jiuxiang
NBS-LRR disease resistance gene
Homologouscloning
Gene organization
Phylogenetic tree
RT-PCR
分类号
S668.4 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
‘红颜’草莓体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族转录因子的表达分析及FaEREBP基因的克隆
被引量:
3
2
作者
高利梅
候羽
姚允聪
姬谦龙
机构
北京农学院植物科学与技术学院
北京农学院生物科学与工程学院
出处
《北京农学院学报》
2015年第4期15-19,共5页
基金
北京市自然科学基金项目
北京市教育委员会科技计划重点项目(KZ201210020018)
文摘
【目的】筛选并克隆‘红颜’草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.‘Benihopp’)体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族特异性表达的基因,以期为草莓体细胞胚发生的分子调控机理研究提供理论依据。【方法】以‘红颜’草莓非胚性愈伤组织、胚性愈伤组织以及体细胞胚为试验材料,应用RNA-seq测序技术,筛选出差异表达的AP2/EREBP转录因子,并通过qRT-PCR技术,检测上调转录因子在非胚性愈伤组织、胚性愈伤组织、体细胞胚以及幼苗根、茎、叶等组织中的表达量,以同源克隆技术获得特异性表达的转录因子FaEREBP。【结果】FaEREBP编码区核苷酸序列全长822bp,编码273个氨基酸,其表达水平在胚性愈伤组织和体细胞胚中显著高于其他组织。【结论】FaEREBP是‘红颜’草莓体细胞胚发生潜在的重要转录因子。
关键词
'红颜’草莓
体细胞胚
RNA-SEQ
AP2/EREBP
Keywords
fragaria×ananassa duch.cv.‘benihopp'
somatic embryo
RNA-seq
AP2/EREBP
分类号
S668.4 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
灌溉方式对草莓光合特性和根系生长的影响
被引量:
8
3
作者
钱小琴
聂凡
蔡永萍
盛新颖
聂敬全
洪萨丽
机构
安徽农业大学生命科学学院
安徽省农科院园艺研究所
出处
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2009年第13期113-118,共6页
基金
安徽省农引智项目及安徽省教育厅人才基金资助
文摘
以草莓丰香为材料,探讨三种灌溉方式(沟灌、滴灌、滴灌+半基质)对粘性土壤条件下草莓产量、光合生理指标和根系生长的影响。结果表明:与沟灌相比,滴灌+半基质方式和滴灌方式均能促进草莓的生长和增加其产量,单株产量分别增加36.89%和29.30%,开花期草莓叶片光合速率提高了41.56%和34.46%;在结果期,水分利用率提高了28.69%和24.65%,根冠比提高了51.78%和29.28%;滴灌+半基质方式和滴灌方式更有利于根系生长,开花期根体积提高了164.25%和78.72%、根鲜重提高了117.18%和84.07%、结果期根系活力提高了70.98%和48.38%;滴灌+半基质栽培灌溉方式是一种适宜粘性土壤草莓的灌溉方式。
关键词
草莓丰香
灌溉模式
产量根系
光合特性
水分利用率
Keywords
fragaria×
ananassa
duch
cv.
Toyonoka, irrigation pattern, yield, root, photosynthetic characteristics, WUE
分类号
S275 [农业科学—农业水土工程]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析
刘建成
段可
李静
叶正文
苏建宇
高清华
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
12
下载PDF
职称材料
2
‘红颜’草莓体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族转录因子的表达分析及FaEREBP基因的克隆
高利梅
候羽
姚允聪
姬谦龙
《北京农学院学报》
2015
3
下载PDF
职称材料
3
灌溉方式对草莓光合特性和根系生长的影响
钱小琴
聂凡
蔡永萍
盛新颖
聂敬全
洪萨丽
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2009
8
下载PDF
职称材料
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