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中国土拉弗朗西斯菌B型亚种新亚型的发现与溯源分析
1
作者
王艳华
乔富宇
+2 位作者
曹菊
彭遥
夏连续
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期983-987,共5页
目的对于北京市1例疑似土拉热病例,进行实验室诊断和溯源分析。方法2012年7月19日北京市报告1例疑似土拉热病例。从病例血液样本中提取基因组DNA后,采用土拉弗朗西斯菌(土拉菌)3种特异基因(fopA,tul4和16SrRNA)和两种基因分型引...
目的对于北京市1例疑似土拉热病例,进行实验室诊断和溯源分析。方法2012年7月19日北京市报告1例疑似土拉热病例。从病例血液样本中提取基因组DNA后,采用土拉弗朗西斯菌(土拉菌)3种特异基因(fopA,tul4和16SrRNA)和两种基因分型引物(C1C4和RD1),进行PCR检测并对扩增子测序。另外两个实验室分别平行进行Tfopa的PCR扩增和测序。同时采用4个靶位点(fopA、ISFtul2、23kDa和tul4)进行荧光定量PCR检测,并采用11个规范的SNP和4个插入/缺失进行系统进化分析。结果3种特异基因均得到阳性扩增,测序后得到的片段大小分别为409、407和1053bp,经序列比对,显示病例感染的是土拉菌。两种基因分型引物扩增后分别得到了151和924bp的序列,根据片段长度可判定病例感染的土拉菌为B型亚种。另外两个实验室对TfopA的PCR扩增和测序,均得到了阳性结果。4个靶位点的荧光定量PCR检测也均得到了阳性结果,fopA、1SFtul2、23kDa和tul4位点的ct值分别为30、25、28和30。系统进化分析显示,本研究中土拉菌和俄罗斯来源的土拉菌聚在一个分支上,为B3亚型。结论该病例确定为土拉热病例,本研究在中国发现了土拉菌B型亚种的一个新亚型。
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关键词
弗朗西丝菌
土拉热
多态性
单核苷酸
系统进化
原文传递
题名
中国土拉弗朗西斯菌B型亚种新亚型的发现与溯源分析
1
作者
王艳华
乔富宇
曹菊
彭遥
夏连续
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室
北京市西城区疾病预防控制中心传染病预防控制科
北京大学第一医院呼吸内科
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期983-987,共5页
基金
国家自然科学基金(81473032)
文摘
目的对于北京市1例疑似土拉热病例,进行实验室诊断和溯源分析。方法2012年7月19日北京市报告1例疑似土拉热病例。从病例血液样本中提取基因组DNA后,采用土拉弗朗西斯菌(土拉菌)3种特异基因(fopA,tul4和16SrRNA)和两种基因分型引物(C1C4和RD1),进行PCR检测并对扩增子测序。另外两个实验室分别平行进行Tfopa的PCR扩增和测序。同时采用4个靶位点(fopA、ISFtul2、23kDa和tul4)进行荧光定量PCR检测,并采用11个规范的SNP和4个插入/缺失进行系统进化分析。结果3种特异基因均得到阳性扩增,测序后得到的片段大小分别为409、407和1053bp,经序列比对,显示病例感染的是土拉菌。两种基因分型引物扩增后分别得到了151和924bp的序列,根据片段长度可判定病例感染的土拉菌为B型亚种。另外两个实验室对TfopA的PCR扩增和测序,均得到了阳性结果。4个靶位点的荧光定量PCR检测也均得到了阳性结果,fopA、1SFtul2、23kDa和tul4位点的ct值分别为30、25、28和30。系统进化分析显示,本研究中土拉菌和俄罗斯来源的土拉菌聚在一个分支上,为B3亚型。结论该病例确定为土拉热病例,本研究在中国发现了土拉菌B型亚种的一个新亚型。
关键词
弗朗西丝菌
土拉热
多态性
单核苷酸
系统进化
Keywords
franeisella tularemia
Polymorphism,single nueleotide
Phylogeography
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国土拉弗朗西斯菌B型亚种新亚型的发现与溯源分析
王艳华
乔富宇
曹菊
彭遥
夏连续
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
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