3个品系塞北兔微卫星DNA遗传多样性研究

为了研究塞北兔的遗传多样性,试验采用微卫星DNA标记技术,对3个品系共计167只塞北兔在8个微卫星座位的遗传变异参数进行了分析。结果表明:8个微卫星座位基因型分布均处于Hardy-Weinberg平衡状态;在SOL33、L7C11、7L1B10、SAT12、SOL44和SOL03等6个微卫星座位上3个品系塞北兔的等位基因数、多态信息含量、期望杂合度等参数值均较大。说明样本具有代表性,SOL33、L7C11、7L1B10、SAT12、SOL44和SOL03这6个微卫星座位能够准确反映塞北兔群体遗传多样性,是有效的遗传标记。

福建黄兔微卫星标记的遗传多样性分析

为了从DNA分子水平揭示福建黄兔群体遗传多态性和遗传结构，选择16个微卫星标记检测了40只福建黄兔的遗传变异及多态性。结果表明，在福建黄兔群体中，16个微卫星位点共检测到了100个等位基因，各位点的等位基因数在3～13，平均等位基因数为6．25个，平均有效等位基因数为4．2652。各位点平均基因频率取样方差V（pij）为8．7611×10^-3。16个微卫星位点观察杂合度（Ho）在0．4893～0．8801，平均H。为0．7227；各位点期望杂合度（He）在0．4959～0．8914，平均He为0．7324；各位点多态信息含量（PIC）变动范围为0．3814～0．8679，平均PIC为0．6766，其中有14个位点处于高度多态（PIC〉0．5），16个微卫星位点的平均固定指数（F）为0．0132。经卡方检验，在这16个微卫星位点上，群体偏离Hardy-Weinberg平衡的程度不大。

福建黄兔的遗传多态性及分类

用8个微卫星标记对福建黄兔的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果表明:(1)8个微卫星标记在所检测的福建黄兔群体中都表现出较丰富的多态性,在6个群体微卫星标记的平均多态信息含量(PIC)为0.6622(0.5723～0.7222),各群体的PIC差异不显著;全部群体平均杂合度为0.6857(0.5904～0.7267)。这显示黄兔群体的多态信息含量、杂合度等指标有较好的一致性,说明福建黄兔品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性。(2)根据奈氏标准遗传距离,并进行UPGMA聚类分析,结果显示6个群体间的遗传变异不大。福建黄兔地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;从遗传距离及聚类分析结果表明这些群体黄兔属于同一个地方品种。

福建黄牛的遗传多态性及分类

用8个微卫星标记对福建黄牛的等位基因频率、多态信息含量(PIC)、遗传杂合度(H)和有效等位基因数(E)等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究.结果表明:(1)8个微卫星标记在所检测的福建黄牛群体中都表现出较丰富的多态性,4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因,每个微卫星标记平均检测到7.2个等位基因(3-11);8个微卫星标记的PIC平均为0.6471(0.3942-0.8062),各群体的PIC差异不显著;全部群体的H为0.2930;各群体的E平均为3.37(3.03-3.84).这显示黄牛群体的等位基因频率、PIC、H和E等指标有较好的一致性,说明福建黄牛品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性.(2)根据Ne i氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析的结果显示,4个群体间的遗传变异不大.福建黄牛地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;遗传距离及聚类分析结果表明,这些群体黄牛属于同一个地方品种.

美系獭兔和苏Ⅰ系粗毛型长毛兔的遗传多样性分析

采用15个微卫星标记,对美系獭兔和苏Ⅰ系粗毛型长毛兔进行了遗传多样性分析。结果显示:在美系獭兔和苏Ⅰ系粗毛型长毛兔群体中,15个微卫星座位均表现出较好的多态性。美系獭兔的平均等位基因数和有效等位基因数分别为4.6000±1.0556和3.5520±0.9703个,群体期望杂合度和多态信息含量平均值分别为0.7067±0.1030和0.6501±0.1050,群体内近交系数平均值为-0.2580±0.0033;苏Ⅰ系粗毛型长毛兔的平均等位基因数和有效等位基因数分别为5.1333±1.2459和3.7506±0.8081个,群体期望杂合度和多态信息含量平均值分别为0.7270±0.0709和0.6750±0.0824,群体内近交系数平均值为-0.2300±0.003。表明两个家兔群体的微卫星座位有丰富的遗传多样性。

闽南黄牛的微卫星多态性研究

用8个微卫星标记对闽南黄牛的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果:8个微卫星标记在所检测的闽南黄牛群体中都表现出较丰富的多态性,在4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因,每个微卫星标记平均检测到7．2个等位基因(3～11);8个微卫星标记的平均多态信息含量(PIC)为0．6471,各群体的平均多态信息含量(PIC)差异不显著;全部群体平均杂合度为0．2930;各群体平均有效等位基因数为3．37。此表明闽南黄牛在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;根据奈氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析,结果表明4个群体间的遗传变异不大。

微卫星标记及在兔遗传育种中的应用

阐述了微卫星标记在兔遗传连锁图谱绘制、群体遗传结构分析、揭示遗传多样性、预测杂交优势等方面的应用。

广西三黄鸡的遗传多样性及保种效果分析

广西三黄鸡肉嫩味美,是中国应用广泛、开发利用最好的著名地方品种。为了准确评价广西三黄鸡的遗传多样性和保种效果,以广西自治区内4个保种场314个样品为研究材料,用18个微卫星标记和线粒体DNA D-loop区(mtDNA)联合分析广西三黄鸡群体的遗传多样性。微卫星标记结果表明:共检测到144个等位基因,平均等位基因数为8个,期望杂合度(HE)为0.6798,观察杂合度(HO)为0.5605,多态信息含量(PIC)为0.6393。线粒体DNA D-loop区结果表明:在检测序列中,共发现31个变异位点,17种单倍型,群体平均核苷酸多态性和单倍型多态性分别为0.01379,0.644;网络中介图表明广西三黄鸡具有5个血统来源,主要起源是东亚和云南或云南周边地区地方鸡血统,但在存在少量外来商业鸡种血统。本研究结果表明,广西三黄鸡具有较为丰富的遗传多样性,个别保种场需进一步提纯保种。