2012年广西首次检出诺如病毒GⅡ.4 Sydney变异株

目的了解2012年广西壮族自治区(广西)罗城县诺如病毒流行株基因型谱分布。方法 2012年收集323例5岁以下腹泻患儿粪便标本,反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)检测诺如病毒,对VP1区部分核苷酸序列进行测定并构建核苷酸系统进化树。结果检测323例病例粪便标本,诺如病毒阳性24份(7.43%);诺如病毒GⅠ基因组2份(8.33%),GⅠ.4和GⅠ.6各1份;GⅡ基因组22份(91.67%),GⅡ.6基因型1份(1/22),GⅡ.4基因型21份(21/22)。GⅡ.4中,18份(85.71%)属于2006b变异株簇,3份(14.29%)属于Sydney变异株簇。结论 2012年广西罗城县诺如病毒流行株基因型呈现多样性,以GⅡ.42006b变异株为优势流行株,首次检出GⅡ.4 Sydney变异株。

吉林省2012～2013年<5岁婴幼儿中检出诺如病毒GⅡ.4Sydney(悉尼)2012变异株

目的了解吉林省2012~2013年诺如病毒（Norovirus,NV）流行型别及感染状况。方法收集长春市儿童医院2012~2013年〈5岁住院腹泻患儿的粪便标本,采用逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）检测粪便标本中的NV,阳性标本进行核苷酸序列测定,构建系统进化树进行分析。结果检测粪便标本共770份,NV阳性139份,总阳性率为18.1%,其中2012年总阳性率为18.6%（72/387）,2013年总阳性率为17.5%（67/383）,〈2岁婴幼儿感染占总标本数的97.1%,全部为基因Ⅱ组（GenogroupⅡ,GⅡ）。PCR产物进行序列测定,取得测序结果的共97份,其中GⅡ.4型53份,占54.6%;GⅡ.3型41份,占42.3%;GⅡ.13型2份,占2.1%;GⅡ.6型1份,占1.0%。2012年检出GⅡ.4 Sydney（悉尼）2012变异株2份,占2012年阳性总数的4.9%;2013年检出26份,占2013年阳性总数的46.4%。结论吉林省存在多种NV基因型的感染,2013年流行优势株为GⅡ.4 Sydney2012变异株。

中国7个地区诺如病毒GⅡ．4／Sydney2012变异株分析

目的分析2012--2013年冬季中国地区诺如病毒新流行株GⅡ．4／Sydney2012的衣壳蛋白区核苷酸与氨基酸变异特点。方法对已获得的22份2012--2013年冬季北京地区GⅡ．4／Sydney2012株进行全衣壳蛋白区基因扩增。从GenBank检索中国其他地区的GⅡ．4／Sydney2012株衣壳蛋白区核苷酸序列。对获得的GⅡ．4／Sydney2012株的衣壳蛋白区核苷酸及氨基酸序列与往年GⅡ．4流行株进行系谱分析。结果获得中国7个地区（北京、上海、江苏、湖州、荆州、香港和台湾）的GⅡ．4／Sydney2012株资料共38份（至少包含完整VPl核苷酸序列）。GⅡ．4／Sydney2012株之间VPI核苷酸差异为0．1％～3．3％，氨基酸差异为0—3．1％。系谱分析发现GⅡ．4／Sydney2012株与Apeldoom2008和NewOrleans2009起自共同的分支。中国和悉尼GⅡ．4／Sydney2012代表株的A、D、E抗原表位氨基酸序列组合有两种：TSRN—GTT-SNT和TSRN．STT-SNT。结论GⅡ．4／Sydney2012株已在中国多个地区出现，各地区病毒株同源性较高。GⅡ．4／Sydney2012株的抗原表位氨基酸组合发生明显改变。

贵阳地区GⅡ．4型诺如病毒变异株的初步研究

目的了解贵阳地区GⅡ．4型诺如病毒变异株的组成及其点突变。方法监测2010年6-11月于贵阳地区哨点医院就诊的急性胃肠炎病例，收集粪便标本，采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（real-timeRT—PCR）初步鉴定，随机选取部分GⅡ型诺如病毒阳性标本，采用一步法RT—PCR对其VP1基因区克隆及测序，基因序列与国内外流行的GH．4型诺如病毒进行系统进化及氨基酸位点的突变分析。结果检测标本426份，有267份（62．68％）GⅡ型诺如病毒阳性，测序获得了9份GⅡ．4型诺如病毒VP1基因组序列，贵州省2010年流行的GH．4型诺如病毒包括2个变异株（GH．42008a和GⅡ．42008b新型变异株），亚型组间的VP1基因的同源性为95．90％～96．72％，亚型组内同源性为99．45％～100％，有2个氨基酸位点易发生突变。结论贵阳地区2010年夏秋季急性胃肠炎以诺如病毒GH型为主，并且变异株具有多样性。

江苏省近期急性胃肠炎暴发中诺如病毒分子特征分析

目的了解江苏省胃肠炎暴发疫情中诺如病毒（NOV）感染状况，并对其病原分子流行病学特征进行初步研究。方法收集江苏省2012年10月至2013年3月7起胃肠炎暴发疫情患者肛拭子标本共67份，采用实时荧光RT-PCR定性检测，NoV阳性标本用RT-PCR扩增其聚合酶区及VPl区基因片段进一步测序分型。结果7起疫情均为NoV感染引起的暴发，检测阳性率为67．2％（45／67）。全部45株阳性毒株序列分析表明7起疫情中除一起是由GII．3型感染引起外，其余6起均由新GⅡ．4感染引起，其中38株毒株与2012年澳大利亚参考株GII．4／Sydney株同源性均在99％以上。进一步对6株新型Sydney变异株的衣壳蛋白VPl区扩增测序，并与9株近年流行株的VPI区氨基酸序列比对，发现该6株毒株的VPl区部分氨基酸已出现突变，而氨基酸位点的突变是与病毒抗原性密切相关。结论江苏省7起疫情暴发聚集且感染毒株型别单一，说明已出现新NoV变异株，其原型株GlI．4／Sydney已在国外多地引起暴发和流行，提示该毒株将是今后防控监’钡ll的重点。

诺如病毒67株基因分型

目的了解2014年苏州地区诺如病毒的感染状况及其基因型别。方法收集2014年苏州大学附属儿童医院疑似病毒性腹泻粪便标本322份，反转录（RT ）‐PCR定性检测G Ⅰ和G Ⅱ组诺如病毒，采用聚合酶区（A区）及衣壳蛋白区（C区）引物对诺如病毒阳性标本进行RT‐PCR扩增以鉴定诺如病毒基因型别。通过对相同样本不同区域测序分析得到比较全面的诺如病毒分子特征。结果322份粪便标本中，检测到67株诺如病毒G Ⅱ基因组，未检测到G Ⅰ基因组。A区测序成功42株，G Ⅱ．e型35株，GⅡ．7型3株，G Ⅱ．17型2株，G Ⅱ．12型2株；C区测序成功53株，G Ⅱ．4‐2012Sydney型44株， G Ⅱ．6型4株，G Ⅱ．17型2株，G Ⅱ．3型2株，G Ⅱ．2型1株。结论2014年苏州地区的诺如病毒以G Ⅱ．4‐2012Sydney亚型为主，同时发现G Ⅱ．17型毒株、G Ⅱ．7／G Ⅱ．6和G Ⅱ．12／G Ⅱ．3重组毒株。

2013年海盐县诺如病毒流行株的监测和基因型分析

目的了解2013年海盐县诺如病毒流行株基因型谱分布。方法 2013年收集170例腹泻患者粪便标本,利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测诺如病毒核酸,挑选部分毒株进行核苷酸序列测定并构建系统进化树。结果检测170例腹泻患者粪便标本,诺如病毒阳性24份,检出率为14.12%;其中诺如病毒GⅠ基因组1份,占4.17%,序列测定为GⅠ.2基因型;GⅡ基因组23份,占95.83%,选4株进行序列测定,比对结果 1株属于GⅡ.4基因型2006b变异株,3株属于GⅡ.4基因型Sydney变异株。结论 2013年海盐县诺如病毒流行株基因型呈现多样性,以GⅡ.4 Sydney变异株为优势流行株,首次检出GⅠ基因组。