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G蛋白偶联受体34同源建模及其与lysoPS类似物对接研究
被引量:
2
1
作者
姜媛
肖冰茹
曹洪玉
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期722-729,共8页
G蛋白偶联受体34(GPR34)在肥大细胞、肿瘤组织和人体免疫器官中高度选择性表达,但因属于膜蛋白,其三维结构难以测定,不能从分子水平上分析其与药物作用情况。本文选用PDB数据库中与GPR34一级序列同源性最高的4NTJ为模版蛋白进行同源建模...
G蛋白偶联受体34(GPR34)在肥大细胞、肿瘤组织和人体免疫器官中高度选择性表达,但因属于膜蛋白,其三维结构难以测定,不能从分子水平上分析其与药物作用情况。本文选用PDB数据库中与GPR34一级序列同源性最高的4NTJ为模版蛋白进行同源建模,运用拉氏图和Profile-3D进行评估,通过加膜限制和loop区能量优化等方法最终得到合理并且可信度高的3D结构模型。最优模型Verify Score为124.97(期望Verify Score值区间为69.071 1~153.491),预测分析得到14个可能的活性位点。通过最陡下降法和共轭梯度法构建GPR34激动剂分子的最低能量结构,将激动剂分子与预测的蛋白3D结构模型上的活性位点进行分子模拟对接,根据对接模型比较不同激动剂分子与不同蛋白活性位点的相互作用。实验结果对设计GPR34激动剂分子和进一步研究GPR34的结构和功能具有理论指导意义。
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关键词
g
偶
联
蛋白
受体
34
同源建模
活性位点
分子对接
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职称材料
原发性肝癌患者癌组织GPCR34、NGF及其对患者预后的评估价值表达变化
被引量:
8
2
作者
刘大宁
张丽媛
《山东医药》
CAS
北大核心
2017年第24期56-58,共3页
目的探讨原发性肝癌组织G蛋白偶联受体34(GPCR34)、神经生长因子(NGF)表达变化及其对患者预后的评估价值。方法收集77例原发性肝癌患者的癌组织和癌旁正常组织标本,采用免疫组化法检测GPCR34、NGF表达,采用单因素及多因素Cox回归模型分...
目的探讨原发性肝癌组织G蛋白偶联受体34(GPCR34)、神经生长因子(NGF)表达变化及其对患者预后的评估价值。方法收集77例原发性肝癌患者的癌组织和癌旁正常组织标本,采用免疫组化法检测GPCR34、NGF表达,采用单因素及多因素Cox回归模型分析肝癌组织GPCR34、NGF表达与患者临床病理参数及中位生存时间的关系。结果 GPCR34主要表达于细胞膜,NGF主要表达于细胞质。肝癌组织GPCR34阳性57例(74.0%)、NGF阳性49例(63.6%),癌旁组织分别为25例(32.3%)、16例(20.8%),二者比较P均<0.05。肝癌组织GPCR34、NGF表达与肿瘤直径、临床分期、分化程度有关(P均<0.01)。单因素分析结果显示,肝癌患者中位生存时间与肿瘤直径、淋巴结转移、临床分期、分化程度、GPCR34和NGF表达均有关(P<0.05或<0.01)。多因素分析结果显示,淋巴结转移、临床分期、分化程度、GPCR34和NGF表达是肝癌患者中位生存时间的独立影响因素(P<0.05或<0.01)。结论肝癌组织GPCR34、NGF表达升高;GPCR34、NGF表达越高,患者预后越差,二者可以作为原发性肝癌患者预后评估的指标之一。
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关键词
原发性肝癌
g蛋白偶联受体34
神经生长因子
中位生存时间
预后评估
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职称材料
GPR34在原发性肝细胞癌中表达的临床意义
被引量:
4
3
作者
金仲田
李锟
+3 位作者
郁卫东
王福顺
朱继业
冷希圣
《中华普通外科杂志》
CSCD
北大核心
2013年第11期868-870,共3页
目的探讨G蛋白偶联受体34(G—proteincoupledreceptor34,GPR34)的表达与肝细胞癌发生发展的相关性。方法应用肝细胞癌组织芯片和免疫组织化学技术,检测GPR34蛋白在44例肝细胞癌组织中的表达,X2检验和Fisher检验及Spearman相关检验...
目的探讨G蛋白偶联受体34(G—proteincoupledreceptor34,GPR34)的表达与肝细胞癌发生发展的相关性。方法应用肝细胞癌组织芯片和免疫组织化学技术,检测GPR34蛋白在44例肝细胞癌组织中的表达,X2检验和Fisher检验及Spearman相关检验,分析GPR34表达与肝细胞癌临床病理特点的相关性,应用Kaplan—Meier方法计算肝细胞癌患者术后5年生存率及生存时间。结果GPR34在肝细胞癌组织中的表达比癌旁组织明显上调(P=0.003);GPR34表达与肝细胞癌大小(P=0.024)、小肝癌(P=0.030)和浸润深度(P=0.012)显著相关,与性别、年龄、肝硬化、组织分化程度及临床分期无明显相关性(P〉0.05);高表达和低表达GPR34的患者术后5年累积生存率分别为56.6%和66.0%,中位生存时间为59.0(95%凹:49.9~68.1)个月和65.0(95%CI:56.4~73.6)个月,Kaplan-Meier分析显示其差异有统计学意义(X2=5.617,P=0.018)。多因素分析显示,GPR34可以作为一个独立的预后评估因素(P=0.037)。结论GPR34在肝细胞癌组织中的表达上调,提示GPR34在其中具有促癌作用。GPR34表达上调与肝细胞癌大小、小肝癌、浸润深度和患者的生存时间相关。GPR34表达上调可以作为肝细胞癌预后不良评估的一个潜在影响因素。
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关键词
癌
肝细胞
基因表达
g蛋白偶联受体34
原文传递
题名
G蛋白偶联受体34同源建模及其与lysoPS类似物对接研究
被引量:
2
1
作者
姜媛
肖冰茹
曹洪玉
机构
大连大学生命科学与技术学院
大连大学医学院
出处
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期722-729,共8页
基金
国家自然科学基金项目(21601025,21571025)资助
大连市高层次创新人才项目(2017Q156)资助
大连大学大学生创新项目(202011258236)资助。
文摘
G蛋白偶联受体34(GPR34)在肥大细胞、肿瘤组织和人体免疫器官中高度选择性表达,但因属于膜蛋白,其三维结构难以测定,不能从分子水平上分析其与药物作用情况。本文选用PDB数据库中与GPR34一级序列同源性最高的4NTJ为模版蛋白进行同源建模,运用拉氏图和Profile-3D进行评估,通过加膜限制和loop区能量优化等方法最终得到合理并且可信度高的3D结构模型。最优模型Verify Score为124.97(期望Verify Score值区间为69.071 1~153.491),预测分析得到14个可能的活性位点。通过最陡下降法和共轭梯度法构建GPR34激动剂分子的最低能量结构,将激动剂分子与预测的蛋白3D结构模型上的活性位点进行分子模拟对接,根据对接模型比较不同激动剂分子与不同蛋白活性位点的相互作用。实验结果对设计GPR34激动剂分子和进一步研究GPR34的结构和功能具有理论指导意义。
关键词
g
偶
联
蛋白
受体
34
同源建模
活性位点
分子对接
Keywords
g
-coupled protein receptor
34
homolo
g
y modelin
g
active site
molecular dockin
g
分类号
O641.3 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
原发性肝癌患者癌组织GPCR34、NGF及其对患者预后的评估价值表达变化
被引量:
8
2
作者
刘大宁
张丽媛
机构
濮阳市人民医院
出处
《山东医药》
CAS
北大核心
2017年第24期56-58,共3页
文摘
目的探讨原发性肝癌组织G蛋白偶联受体34(GPCR34)、神经生长因子(NGF)表达变化及其对患者预后的评估价值。方法收集77例原发性肝癌患者的癌组织和癌旁正常组织标本,采用免疫组化法检测GPCR34、NGF表达,采用单因素及多因素Cox回归模型分析肝癌组织GPCR34、NGF表达与患者临床病理参数及中位生存时间的关系。结果 GPCR34主要表达于细胞膜,NGF主要表达于细胞质。肝癌组织GPCR34阳性57例(74.0%)、NGF阳性49例(63.6%),癌旁组织分别为25例(32.3%)、16例(20.8%),二者比较P均<0.05。肝癌组织GPCR34、NGF表达与肿瘤直径、临床分期、分化程度有关(P均<0.01)。单因素分析结果显示,肝癌患者中位生存时间与肿瘤直径、淋巴结转移、临床分期、分化程度、GPCR34和NGF表达均有关(P<0.05或<0.01)。多因素分析结果显示,淋巴结转移、临床分期、分化程度、GPCR34和NGF表达是肝癌患者中位生存时间的独立影响因素(P<0.05或<0.01)。结论肝癌组织GPCR34、NGF表达升高;GPCR34、NGF表达越高,患者预后越差,二者可以作为原发性肝癌患者预后评估的指标之一。
关键词
原发性肝癌
g蛋白偶联受体34
神经生长因子
中位生存时间
预后评估
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
GPR34在原发性肝细胞癌中表达的临床意义
被引量:
4
3
作者
金仲田
李锟
郁卫东
王福顺
朱继业
冷希圣
机构
北京大学人民医院肝胆外科
临床分子生物学研究所
出处
《中华普通外科杂志》
CSCD
北大核心
2013年第11期868-870,共3页
基金
国家自然科学基金资助项目(30872923)
北京大学人民医院研究与发展基金资助项目(RDB2011-25、2012-27)
文摘
目的探讨G蛋白偶联受体34(G—proteincoupledreceptor34,GPR34)的表达与肝细胞癌发生发展的相关性。方法应用肝细胞癌组织芯片和免疫组织化学技术,检测GPR34蛋白在44例肝细胞癌组织中的表达,X2检验和Fisher检验及Spearman相关检验,分析GPR34表达与肝细胞癌临床病理特点的相关性,应用Kaplan—Meier方法计算肝细胞癌患者术后5年生存率及生存时间。结果GPR34在肝细胞癌组织中的表达比癌旁组织明显上调(P=0.003);GPR34表达与肝细胞癌大小(P=0.024)、小肝癌(P=0.030)和浸润深度(P=0.012)显著相关,与性别、年龄、肝硬化、组织分化程度及临床分期无明显相关性(P〉0.05);高表达和低表达GPR34的患者术后5年累积生存率分别为56.6%和66.0%,中位生存时间为59.0(95%凹:49.9~68.1)个月和65.0(95%CI:56.4~73.6)个月,Kaplan-Meier分析显示其差异有统计学意义(X2=5.617,P=0.018)。多因素分析显示,GPR34可以作为一个独立的预后评估因素(P=0.037)。结论GPR34在肝细胞癌组织中的表达上调,提示GPR34在其中具有促癌作用。GPR34表达上调与肝细胞癌大小、小肝癌、浸润深度和患者的生存时间相关。GPR34表达上调可以作为肝细胞癌预后不良评估的一个潜在影响因素。
关键词
癌
肝细胞
基因表达
g蛋白偶联受体34
Keywords
Carcinoma, hepatocellular
g
ene expression
g
-protein-coupled receptor
34
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
G蛋白偶联受体34同源建模及其与lysoPS类似物对接研究
姜媛
肖冰茹
曹洪玉
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
下载PDF
职称材料
2
原发性肝癌患者癌组织GPCR34、NGF及其对患者预后的评估价值表达变化
刘大宁
张丽媛
《山东医药》
CAS
北大核心
2017
8
下载PDF
职称材料
3
GPR34在原发性肝细胞癌中表达的临床意义
金仲田
李锟
郁卫东
王福顺
朱继业
冷希圣
《中华普通外科杂志》
CSCD
北大核心
2013
4
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